MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methanoculleus marisnigri JR1 chromosome

Total Repeats: 40755

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_009051	GAT	2	6	308940	308945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178278
5002	NC_009051	CCT	2	6	308972	308977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178278
5003	NC_009051	GAT	2	6	308997	309002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178278
5004	NC_009051	TCG	2	6	309016	309021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178278
5005	NC_009051	GGT	2	6	309047	309052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126178278
5006	NC_009051	GTC	2	6	309137	309142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178278
5007	NC_009051	GCC	2	6	309150	309155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178278
5008	NC_009051	GTC	2	6	309174	309179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178278
5009	NC_009051	CGA	2	6	309197	309202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178278
5010	NC_009051	CGG	2	6	309226	309231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178278
5011	NC_009051	CTC	2	6	309234	309239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178278
5012	NC_009051	GGC	2	6	309257	309262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178278
5013	NC_009051	TTC	2	6	309294	309299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178278
5014	NC_009051	TCG	2	6	309410	309415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178278
5015	NC_009051	GAG	2	6	309459	309464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178278
5016	NC_009051	CGC	2	6	309476	309481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178278
5017	NC_009051	CGA	2	6	309512	309517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178278
5018	NC_009051	TTC	2	6	309599	309604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178278
5019	NC_009051	CTC	2	6	309606	309611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178279
5020	NC_009051	CGG	2	6	309612	309617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178279
5021	NC_009051	CTC	2	6	309618	309623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178279
5022	NC_009051	CCG	2	6	309663	309668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178279
5023	NC_009051	GAC	2	6	309684	309689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178279
5024	NC_009051	TCG	2	6	309706	309711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178279
5025	NC_009051	CTT	2	6	309761	309766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178279
5026	NC_009051	GGT	4	12	309842	309853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126178279
5027	NC_009051	CAG	2	6	309896	309901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178280
5028	NC_009051	TCT	2	6	309973	309978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178280
5029	NC_009051	CGT	2	6	309994	309999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178280
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5031	NC_009051	CCA	2	6	310066	310071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126178280
5032	NC_009051	CGA	2	6	310246	310251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178280
5033	NC_009051	GCT	2	6	310716	310721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178281
5034	NC_009051	CGA	2	6	310782	310787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178281
5035	NC_009051	CGT	2	6	310819	310824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178281
5036	NC_009051	CCG	2	6	310872	310877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178281
5037	NC_009051	CTC	2	6	310915	310920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178281
5038	NC_009051	TCT	3	9	311016	311024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178281
5039	NC_009051	AGA	2	6	311076	311081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178281
5040	NC_009051	GGA	2	6	311118	311123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178281
5041	NC_009051	ACG	2	6	311180	311185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178281
5042	NC_009051	CGG	2	6	311192	311197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178281
5043	NC_009051	GAG	2	6	311288	311293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178281
5044	NC_009051	GAC	2	6	311306	311311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178281
5045	NC_009051	GAC	2	6	311344	311349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178281
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5047	NC_009051	CGA	2	6	311445	311450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178281
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5050	NC_009051	CGC	2	6	311921	311926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178282
5051	NC_009051	GAC	2	6	311979	311984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178282
5052	NC_009051	GCC	2	6	311991	311996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178282
5053	NC_009051	CGA	2	6	312035	312040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178282
5054	NC_009051	GCC	2	6	312120	312125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178282
5055	NC_009051	CAC	2	6	312168	312173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126178282
5056	NC_009051	CGA	2	6	312221	312226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178282
5057	NC_009051	CGA	3	9	312341	312349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178282
5058	NC_009051	TCG	2	6	312352	312357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178282
5059	NC_009051	CTG	2	6	312384	312389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178282
5060	NC_009051	GAG	2	6	312482	312487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178283
5061	NC_009051	GCA	2	6	312735	312740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178283
5062	NC_009051	TGC	2	6	312805	312810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178283
5063	NC_009051	CGG	2	6	312865	312870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178283
5064	NC_009051	GCC	2	6	312935	312940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178283
5065	NC_009051	GTT	3	9	313004	313012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126178283
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5067	NC_009051	TTC	2	6	313041	313046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178283
5068	NC_009051	GTG	2	6	313109	313114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126178283
5069	NC_009051	ATC	2	6	313149	313154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178283
5070	NC_009051	CCG	2	6	313200	313205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178283
5071	NC_009051	GCG	2	6	313245	313250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178283
5072	NC_009051	ATC	2	6	313305	313310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178283
5073	NC_009051	TGC	2	6	313382	313387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178283
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5077	NC_009051	GAT	2	6	313673	313678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178283
5078	NC_009051	ATG	2	6	313770	313775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178283
5079	NC_009051	TGA	2	6	313831	313836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178283
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5083	NC_009051	ATC	2	6	314129	314134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178284
5084	NC_009051	ACG	2	6	314153	314158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178284
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5086	NC_009051	GGT	2	6	314404	314409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126178284
5087	NC_009051	GTA	2	6	314539	314544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178284
5088	NC_009051	GAC	2	6	314656	314661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178284
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5090	NC_009051	TCG	2	6	314774	314779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178284
5091	NC_009051	GAA	2	6	314845	314850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178284
5092	NC_009051	CGC	2	6	314916	314921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178284
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5094	NC_009051	CCT	2	6	315198	315203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178285
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5100	NC_009051	GGA	2	6	315465	315470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178285
5101	NC_009051	TTC	2	6	315517	315522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178285
5102	NC_009051	CGA	2	6	315548	315553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178285
5103	NC_009051	CGG	2	6	315570	315575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178285
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5108	NC_009051	GCT	2	6	315942	315947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178285
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5111	NC_009051	GCC	2	6	316200	316205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178285
5112	NC_009051	GAG	2	6	316243	316248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178285
5113	NC_009051	CGA	2	6	316314	316319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178285
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5118	NC_009051	GAG	3	9	316565	316573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178286
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5473	NC_009051	GAT	2	6	337164	337169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178307
5474	NC_009051	CCT	2	6	337170	337175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178307
5475	NC_009051	TTC	2	6	337244	337249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178307
5476	NC_009051	CGC	2	6	337395	337400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178307
5477	NC_009051	TCC	2	6	337406	337411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178307
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