MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methanoculleus marisnigri JR1 chromosome

Total Repeats: 40755

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009051	GAA	2	6	58792	58797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178013
1002	NC_009051	GTT	2	6	59164	59169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126178014
1003	NC_009051	GTC	2	6	59240	59245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178014
1004	NC_009051	GCT	2	6	59329	59334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178014
1005	NC_009051	ATC	2	6	59342	59347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178014
1006	NC_009051	CCG	2	6	59349	59354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178014
1007	NC_009051	TCG	2	6	59364	59369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178014
1008	NC_009051	ATC	2	6	59387	59392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178014
1009	NC_009051	TCC	2	6	59478	59483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178014
1010	NC_009051	ATC	2	6	59501	59506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178014
1011	NC_009051	CTC	2	6	59528	59533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178014
1012	NC_009051	TGG	2	6	59574	59579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126178014
1013	NC_009051	TCA	2	6	59772	59777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178014
1014	NC_009051	CTC	2	6	59829	59834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178015
1015	NC_009051	TGA	2	6	59920	59925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178015
1016	NC_009051	AAC	2	6	59961	59966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126178015
1017	NC_009051	CGC	2	6	60287	60292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178015
1018	NC_009051	CGG	2	6	60344	60349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178015
1019	NC_009051	GGT	2	6	60434	60439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126178015
1020	NC_009051	CCG	2	6	60466	60471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178015
1021	NC_009051	TGC	2	6	60478	60483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178015
1022	NC_009051	AAG	2	6	60504	60509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178015
1023	NC_009051	TCA	2	6	60523	60528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178015
1024	NC_009051	CGT	2	6	60665	60670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178015
1025	NC_009051	CGA	2	6	60686	60691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178015
1026	NC_009051	TCG	2	6	60696	60701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178015
1027	NC_009051	GGA	2	6	60734	60739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178015
1028	NC_009051	GTC	3	9	60747	60755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178015
1029	NC_009051	GCC	2	6	60822	60827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178015
1030	NC_009051	CGA	2	6	60833	60838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178015
1031	NC_009051	CGG	2	6	60851	60856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178015
1032	NC_009051	TCG	3	9	60877	60885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178015
1033	NC_009051	TCG	2	6	60889	60894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178015
1034	NC_009051	ACG	2	6	60941	60946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178015
1035	NC_009051	TCA	2	6	60954	60959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178016
1036	NC_009051	CGG	2	6	60993	60998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178016
1037	NC_009051	CGT	2	6	61003	61008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178016
1038	NC_009051	CAT	2	6	61099	61104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178016
1039	NC_009051	CGG	2	6	61159	61164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178016
1040	NC_009051	GAC	4	12	61169	61180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178016
1041	NC_009051	GCG	2	6	61192	61197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178016
1042	NC_009051	CAG	2	6	61220	61225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178016
1043	NC_009051	GCT	2	6	61240	61245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178016
1044	NC_009051	TCG	2	6	61251	61256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178016
1045	NC_009051	GAA	2	6	61316	61321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178016
1046	NC_009051	TCC	2	6	61323	61328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178016
1047	NC_009051	CGG	2	6	61381	61386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178016
1048	NC_009051	GCA	3	9	61387	61395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178016
1049	NC_009051	TCC	2	6	61437	61442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178016
1050	NC_009051	CAT	2	6	61489	61494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178016
1051	NC_009051	CTC	2	6	61499	61504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178016
1052	NC_009051	GAG	2	6	61520	61525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178016
1053	NC_009051	CGT	2	6	61534	61539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178016
1054	NC_009051	TCG	2	6	61593	61598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178016
1055	NC_009051	GGA	2	6	61602	61607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178016
1056	NC_009051	TTC	2	6	61618	61623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178017
1057	NC_009051	GTC	2	6	61662	61667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178017
1058	NC_009051	CAT	2	6	61719	61724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178017
1059	NC_009051	GCG	2	6	61808	61813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178017
1060	NC_009051	GAC	2	6	61837	61842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178017
1061	NC_009051	CCG	2	6	61889	61894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178017
1062	NC_009051	TCG	2	6	61904	61909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178017
1063	NC_009051	GAT	2	6	61929	61934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178017
1064	NC_009051	CCG	2	6	61946	61951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178017
1065	NC_009051	CAG	2	6	62043	62048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178017
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1067	NC_009051	CAT	2	6	62160	62165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178017
1068	NC_009051	ACG	2	6	62195	62200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178017
1069	NC_009051	CGG	2	6	62287	62292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178017
1070	NC_009051	CGT	2	6	62298	62303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178017
1071	NC_009051	CTC	2	6	62395	62400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178017
1072	NC_009051	CGG	2	6	62556	62561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178017
1073	NC_009051	TCG	2	6	62603	62608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178017
1074	NC_009051	CGA	2	6	62633	62638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178017
1075	NC_009051	CCT	2	6	62640	62645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178017
1076	NC_009051	TCA	2	6	62675	62680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178017
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1079	NC_009051	TGA	2	6	62944	62949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178018
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1081	NC_009051	GCC	2	6	62966	62971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178018
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1083	NC_009051	CCG	2	6	63191	63196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178019
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1087	NC_009051	GAT	2	6	63270	63275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178019
1088	NC_009051	TCC	2	6	63326	63331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178019
1089	NC_009051	TCT	2	6	63407	63412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178019
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1093	NC_009051	CGA	2	6	63470	63475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178019
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1104	NC_009051	TGA	3	9	63923	63931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178020
1105	NC_009051	GCC	2	6	63951	63956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178020
1106	NC_009051	GCC	2	6	64274	64279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178021
1107	NC_009051	GCG	2	6	64294	64299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178021
1108	NC_009051	GCG	2	6	64318	64323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178021
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1114	NC_009051	GAA	2	6	64554	64559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178021
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1120	NC_009051	ACG	2	6	64801	64806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178021
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1491	NC_009051	CGG	2	6	88653	88658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178047
1492	NC_009051	CTG	2	6	88711	88716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178047
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