MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

Total Repeats: 4586

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_002944	CATCG	2	10	2690722	2690731	20 %	20 %	20 %	40 %	41408492
2502	NC_002944	GCGCG	2	10	2692270	2692279	0 %	0 %	60 %	40 %	41408494
2503	NC_002944	TCGCT	2	10	2692519	2692528	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2504	NC_002944	ACGCG	2	10	2693216	2693225	20 %	0 %	40 %	40 %	41408495
2505	NC_002944	CGCGG	2	10	2695171	2695180	0 %	0 %	60 %	40 %	41408497
2506	NC_002944	GCCGC	2	10	2695602	2695611	0 %	0 %	40 %	60 %	41408498
2507	NC_002944	GCACC	2	10	2695717	2695726	20 %	0 %	20 %	60 %	41408498
2508	NC_002944	GCCCG	2	10	2696424	2696433	0 %	0 %	40 %	60 %	41408498
2509	NC_002944	GCGCC	2	10	2698149	2698158	0 %	0 %	40 %	60 %	41408499
2510	NC_002944	GGTCA	2	10	2698252	2698261	20 %	20 %	40 %	20 %	41408500
2511	NC_002944	TCGGG	2	10	2700027	2700036	0 %	20 %	60 %	20 %	41408501
2512	NC_002944	TGCGG	2	10	2701523	2701532	0 %	20 %	60 %	20 %	41408503
2513	NC_002944	GGCCG	2	10	2702854	2702863	0 %	0 %	60 %	40 %	41408504
2514	NC_002944	CGGCG	2	10	2703235	2703244	0 %	0 %	60 %	40 %	41408504
2515	NC_002944	ACCGC	2	10	2703961	2703970	20 %	0 %	20 %	60 %	41408505
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2517	NC_002944	CCCGG	2	10	2705355	2705364	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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2522	NC_002944	ATCCG	2	10	2711341	2711350	20 %	20 %	20 %	40 %	41408512
2523	NC_002944	CCAGC	2	10	2712257	2712266	20 %	0 %	20 %	60 %	41408512
2524	NC_002944	CAGCG	2	10	2712528	2712537	20 %	0 %	40 %	40 %	41408512
2525	NC_002944	CCGGC	2	10	2713144	2713153	0 %	0 %	40 %	60 %	41408512
2526	NC_002944	CCGGC	2	10	2713640	2713649	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2527	NC_002944	GGGGC	2	10	2714242	2714251	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
2528	NC_002944	CGCGA	2	10	2714589	2714598	20 %	0 %	40 %	40 %	41408514
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2530	NC_002944	CGGCC	2	10	2718427	2718436	0 %	0 %	40 %	60 %	41408518
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2536	NC_002944	TCGGC	2	10	2727389	2727398	0 %	20 %	40 %	40 %	41408529
2537	NC_002944	GCCCG	2	10	2727630	2727639	0 %	0 %	40 %	60 %	41408529
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2544	NC_002944	GCCGG	2	10	2737307	2737316	0 %	0 %	60 %	40 %	41408534
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2549	NC_002944	CCTGG	2	10	2739923	2739932	0 %	20 %	40 %	40 %	41408538
2550	NC_002944	GACGC	2	10	2740329	2740338	20 %	0 %	40 %	40 %	41408538
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2552	NC_002944	CTGGC	2	10	2742991	2743000	0 %	20 %	40 %	40 %	41408540
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2554	NC_002944	GCCGG	2	10	2746952	2746961	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2555	NC_002944	CGTCC	2	10	2747385	2747394	0 %	20 %	20 %	60 %	41408544
2556	NC_002944	CTGGC	2	10	2749568	2749577	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2557	NC_002944	CTCCC	2	10	2750416	2750425	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
2558	NC_002944	ACACC	2	10	2751102	2751111	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
2559	NC_002944	TGACG	2	10	2751414	2751423	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2560	NC_002944	CACGA	2	10	2751751	2751760	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2561	NC_002944	CCGCG	2	10	2753959	2753968	0 %	0 %	40 %	60 %	41408545
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2599	NC_002944	CCCCG	2	10	2796202	2796211	0 %	0 %	20 %	80 %	41408589
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