MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

Total Repeats: 4586

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_002944	GGCCG	2	10	1643476	1643485	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1502	NC_002944	CGGGT	2	10	1643835	1643844	0 %	20 %	60 %	20 %	41407599
1503	NC_002944	GCCGG	2	10	1644754	1644763	0 %	0 %	60 %	40 %	41407599
1504	NC_002944	GGTCG	2	10	1645748	1645757	0 %	20 %	60 %	20 %	41407600
1505	NC_002944	CTCGA	2	10	1647213	1647222	20 %	20 %	20 %	40 %	41407600
1506	NC_002944	CCCGG	2	10	1648233	1648242	0 %	0 %	40 %	60 %	41407600
1507	NC_002944	GCTCG	2	10	1649006	1649015	0 %	20 %	40 %	40 %	41407600
1508	NC_002944	GTTCA	2	10	1649746	1649755	20 %	40 %	20 %	20 %	41407601
1509	NC_002944	GGGCG	2	10	1652624	1652633	0 %	0 %	80 %	20 %	41407603
1510	NC_002944	CGGCG	2	10	1652829	1652838	0 %	0 %	60 %	40 %	41407603
1511	NC_002944	TCGGC	2	10	1655230	1655239	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1512	NC_002944	GGTCA	2	10	1655486	1655495	20 %	20 %	40 %	20 %	41407606
1513	NC_002944	CTTCA	2	10	1655942	1655951	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1514	NC_002944	GGCCC	2	10	1658172	1658181	0 %	0 %	40 %	60 %	41407608
1515	NC_002944	ATCGC	2	10	1660666	1660675	20 %	20 %	20 %	40 %	41407610
1516	NC_002944	CCGCG	2	10	1660946	1660955	0 %	0 %	40 %	60 %	41407610
1517	NC_002944	CGGCC	2	10	1661281	1661290	0 %	0 %	40 %	60 %	41407610
1518	NC_002944	CAGCC	2	10	1661837	1661846	20 %	0 %	20 %	60 %	41407611
1519	NC_002944	CTGGC	2	10	1664669	1664678	0 %	20 %	40 %	40 %	41407613
1520	NC_002944	ATGTC	2	10	1665595	1665604	20 %	40 %	20 %	20 %	41407614
1521	NC_002944	TCGGC	2	10	1666657	1666666	0 %	20 %	40 %	40 %	41407614
1522	NC_002944	CGGCC	2	10	1667188	1667197	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1523	NC_002944	GGCCG	2	10	1668945	1668954	0 %	0 %	60 %	40 %	41407616
1524	NC_002944	CGGGG	2	10	1669029	1669038	0 %	0 %	80 %	20 %	41407616
1525	NC_002944	CCGGC	2	10	1670086	1670095	0 %	0 %	40 %	60 %	41407617
1526	NC_002944	GGCAA	2	10	1670843	1670852	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1527	NC_002944	CAGGC	2	10	1672176	1672185	20 %	0 %	40 %	40 %	41407619
1528	NC_002944	GGCGA	2	10	1674136	1674145	20 %	0 %	60 %	20 %	41407620
1529	NC_002944	GCCGG	2	10	1674556	1674565	0 %	0 %	60 %	40 %	41407620
1530	NC_002944	TTGGG	2	10	1674941	1674950	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_002944	CCCGG	2	10	1675633	1675642	0 %	0 %	40 %	60 %	41407622
1532	NC_002944	CGCGG	2	10	1677532	1677541	0 %	0 %	60 %	40 %	41407625
1533	NC_002944	CGGTT	2	10	1677908	1677917	0 %	40 %	40 %	20 %	41407625
1534	NC_002944	TGACG	2	10	1679471	1679480	20 %	20 %	40 %	20 %	41407628
1535	NC_002944	GCGCC	2	10	1680884	1680893	0 %	0 %	40 %	60 %	41407628
1536	NC_002944	CGCGG	2	10	1680902	1680911	0 %	0 %	60 %	40 %	41407628
1537	NC_002944	GGACG	2	10	1682236	1682245	20 %	0 %	60 %	20 %	41407629
1538	NC_002944	GCCCG	2	10	1682348	1682357	0 %	0 %	40 %	60 %	41407629
1539	NC_002944	GGGCC	2	10	1683546	1683555	0 %	0 %	60 %	40 %	41407630
1540	NC_002944	CGGTT	2	10	1689133	1689142	0 %	40 %	40 %	20 %	41407636
1541	NC_002944	CTCGG	2	10	1691379	1691388	0 %	20 %	40 %	40 %	41407639
1542	NC_002944	GCCGG	2	10	1691646	1691655	0 %	0 %	60 %	40 %	41407639
1543	NC_002944	ACCAC	2	10	1693644	1693653	40 %	0 %	0 %	60 %	41407643
1544	NC_002944	GCGCG	2	10	1694350	1694359	0 %	0 %	60 %	40 %	41407643
1545	NC_002944	GCCGG	2	10	1694527	1694536	0 %	0 %	60 %	40 %	41407643
1546	NC_002944	GCCGG	2	10	1694812	1694821	0 %	0 %	60 %	40 %	41407643
1547	NC_002944	ACCGC	2	10	1695364	1695373	20 %	0 %	20 %	60 %	41407643
1548	NC_002944	CGGCG	2	10	1697202	1697211	0 %	0 %	60 %	40 %	41407645
1549	NC_002944	CCAGC	2	10	1697313	1697322	20 %	0 %	20 %	60 %	41407645
1550	NC_002944	GCTCA	2	10	1698437	1698446	20 %	20 %	20 %	40 %	41407646
1551	NC_002944	GCCGC	2	10	1699773	1699782	0 %	0 %	40 %	60 %	41407646
1552	NC_002944	CCGAC	2	10	1700076	1700085	20 %	0 %	20 %	60 %	41407646
1553	NC_002944	GCGCG	2	10	1700602	1700611	0 %	0 %	60 %	40 %	41407647
1554	NC_002944	TCGCC	2	10	1701637	1701646	0 %	20 %	20 %	60 %	41407647
1555	NC_002944	GGCCG	2	10	1703666	1703675	0 %	0 %	60 %	40 %	41407648
1556	NC_002944	ATCGG	2	10	1705231	1705240	20 %	20 %	40 %	20 %	41407649
1557	NC_002944	CCCAG	2	10	1705825	1705834	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1558	NC_002944	ATCTC	2	10	1706158	1706167	20 %	40 %	0 %	40 %	41407650
1559	NC_002944	ACACG	2	10	1706387	1706396	40 %	0 %	20 %	40 %	41407650
1560	NC_002944	CGGGG	2	10	1709430	1709439	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
1561	NC_002944	CCAGC	2	10	1709534	1709543	20 %	0 %	20 %	60 %	41407654
1562	NC_002944	CGATC	2	10	1709891	1709900	20 %	20 %	20 %	40 %	41407654
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1564	NC_002944	GGCCG	2	10	1712003	1712012	0 %	0 %	60 %	40 %	41407655
1565	NC_002944	ACGCG	2	10	1712232	1712241	20 %	0 %	40 %	40 %	41407655
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1568	NC_002944	TGCCG	2	10	1717997	1718006	0 %	20 %	40 %	40 %	41407662
1569	NC_002944	GCGCC	2	10	1718093	1718102	0 %	0 %	40 %	60 %	41407662
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1571	NC_002944	GCGCG	2	10	1721629	1721638	0 %	0 %	60 %	40 %	41407665
1572	NC_002944	GTGTC	2	10	1721734	1721743	0 %	40 %	40 %	20 %	41407665
1573	NC_002944	CCGCG	2	10	1722661	1722670	0 %	0 %	40 %	60 %	41407666
1574	NC_002944	CCGCC	2	10	1723373	1723382	0 %	0 %	20 %	80 %	41407667
1575	NC_002944	CGTCG	2	10	1724342	1724351	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1576	NC_002944	CGGCG	2	10	1725149	1725158	0 %	0 %	60 %	40 %	41407669
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1579	NC_002944	CGCGC	2	10	1728305	1728314	0 %	0 %	40 %	60 %	41407671
1580	NC_002944	GGCCC	2	10	1728834	1728843	0 %	0 %	40 %	60 %	41407671
1581	NC_002944	CGGTC	2	10	1728853	1728862	0 %	20 %	40 %	40 %	41407671
1582	NC_002944	AGCAC	2	10	1730067	1730076	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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1587	NC_002944	CGGCC	2	10	1733653	1733662	0 %	0 %	40 %	60 %	41407674
1588	NC_002944	CCGGG	2	10	1735579	1735588	0 %	0 %	60 %	40 %	41407676
1589	NC_002944	GCTCG	2	10	1736536	1736545	0 %	20 %	40 %	40 %	41407676
1590	NC_002944	CCGGC	2	10	1737407	1737416	0 %	0 %	40 %	60 %	41407676
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1596	NC_002944	CATCC	2	10	1744372	1744381	20 %	20 %	0 %	60 %	41407683
1597	NC_002944	CCAGT	2	10	1745674	1745683	20 %	20 %	20 %	40 %	41407685
1598	NC_002944	CGGGG	2	10	1750013	1750022	0 %	0 %	80 %	20 %	41407691
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1600	NC_002944	GACCA	2	10	1751910	1751919	40 %	0 %	20 %	40 %	41407694
1601	NC_002944	CGCGT	2	10	1753767	1753776	0 %	20 %	40 %	40 %	41407694
1602	NC_002944	CGGGC	2	10	1754999	1755008	0 %	0 %	60 %	40 %	41407696
1603	NC_002944	GGCCT	2	10	1755631	1755640	0 %	20 %	40 %	40 %	41407697
1604	NC_002944	GGGCC	2	10	1757852	1757861	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1605	NC_002944	CCGGC	2	10	1758039	1758048	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1606	NC_002944	CCGAC	2	10	1758555	1758564	20 %	0 %	20 %	60 %	41407699
1607	NC_002944	GCGGG	2	10	1759447	1759456	0 %	0 %	80 %	20 %	41407699
1608	NC_002944	CGGCG	2	10	1760115	1760124	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1609	NC_002944	GCCCG	2	10	1761020	1761029	0 %	0 %	40 %	60 %	41407701
1610	NC_002944	GCGAC	2	10	1761315	1761324	20 %	0 %	40 %	40 %	41407701
1611	NC_002944	CGCCA	2	10	1762127	1762136	20 %	0 %	20 %	60 %	41407703
1612	NC_002944	CGGCG	2	10	1762216	1762225	0 %	0 %	60 %	40 %	41407703
1613	NC_002944	GGGCC	2	10	1763138	1763147	0 %	0 %	60 %	40 %	41407704
1614	NC_002944	GAGCG	2	10	1766074	1766083	20 %	0 %	60 %	20 %	41407708
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1616	NC_002944	CCCGG	2	10	1768814	1768823	0 %	0 %	40 %	60 %	41407711
1617	NC_002944	GCGAC	2	10	1770085	1770094	20 %	0 %	40 %	40 %	41407712
1618	NC_002944	GCCAC	2	10	1770265	1770274	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1619	NC_002944	CGCGG	2	10	1771312	1771321	0 %	0 %	60 %	40 %	41407715
1620	NC_002944	ACGCC	2	10	1772994	1773003	20 %	0 %	20 %	60 %	41407717
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1622	NC_002944	CGGCG	2	10	1775763	1775772	0 %	0 %	60 %	40 %	41407718
1623	NC_002944	GGCCG	2	10	1776521	1776530	0 %	0 %	60 %	40 %	41407719
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1625	NC_002944	GACCG	2	10	1778314	1778323	20 %	0 %	40 %	40 %	41407721
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1995	NC_002944	TCGGC	2	10	2139234	2139243	0 %	20 %	40 %	40 %	41408035
1996	NC_002944	GCCCA	2	10	2139487	2139496	20 %	0 %	20 %	60 %	41408035
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1998	NC_002944	CGCTG	2	10	2142342	2142351	0 %	20 %	40 %	40 %	41408039
1999	NC_002944	CCGGC	2	10	2142811	2142820	0 %	0 %	40 %	60 %	41408039
2000	NC_002944	TCGAC	2	10	2142987	2142996	20 %	20 %	20 %	40 %	41408039

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