MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

Total Repeats: 4586

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_002944	TCGTC	2	10	1121980	1121989	0 %	40 %	20 %	40 %	41407167
1002	NC_002944	CCGCG	2	10	1122721	1122730	0 %	0 %	40 %	60 %	41407168
1003	NC_002944	GGCCG	2	10	1123463	1123472	0 %	0 %	60 %	40 %	41407168
1004	NC_002944	GGCGT	2	10	1126316	1126325	0 %	20 %	60 %	20 %	41407170
1005	NC_002944	GCGGA	2	10	1131490	1131499	20 %	0 %	60 %	20 %	41407175
1006	NC_002944	CCGGC	2	10	1131879	1131888	0 %	0 %	40 %	60 %	41407176
1007	NC_002944	CGGGC	2	10	1132546	1132555	0 %	0 %	60 %	40 %	41407177
1008	NC_002944	TCGAC	2	10	1133298	1133307	20 %	20 %	20 %	40 %	41407177
1009	NC_002944	GCGCT	2	10	1133802	1133811	0 %	20 %	40 %	40 %	41407178
1010	NC_002944	GCTGG	2	10	1134114	1134123	0 %	20 %	60 %	20 %	41407178
1011	NC_002944	GCCGC	2	10	1134712	1134721	0 %	0 %	40 %	60 %	41407179
1012	NC_002944	GCCGG	2	10	1134758	1134767	0 %	0 %	60 %	40 %	41407179
1013	NC_002944	GCCGG	2	10	1135677	1135686	0 %	0 %	60 %	40 %	41407180
1014	NC_002944	GACCC	2	10	1136183	1136192	20 %	0 %	20 %	60 %	41407181
1015	NC_002944	GCGAT	2	10	1137622	1137631	20 %	20 %	40 %	20 %	41407182
1016	NC_002944	CGGTG	2	10	1137913	1137922	0 %	20 %	60 %	20 %	41407182
1017	NC_002944	TCGGC	2	10	1138503	1138512	0 %	20 %	40 %	40 %	41407183
1018	NC_002944	CCGGG	2	10	1138911	1138920	0 %	0 %	60 %	40 %	41407183
1019	NC_002944	GAGAA	2	10	1142941	1142950	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_002944	CGGTG	2	10	1143004	1143013	0 %	20 %	60 %	20 %	41407188
1021	NC_002944	GCGCA	2	10	1144139	1144148	20 %	0 %	40 %	40 %	41407188
1022	NC_002944	CGGCC	2	10	1144955	1144964	0 %	0 %	40 %	60 %	41407189
1023	NC_002944	CGCGG	2	10	1145044	1145053	0 %	0 %	60 %	40 %	41407189
1024	NC_002944	GGGCT	2	10	1145318	1145327	0 %	20 %	60 %	20 %	41407189
1025	NC_002944	GGCCG	2	10	1146186	1146195	0 %	0 %	60 %	40 %	41407190
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1028	NC_002944	GGCCG	2	10	1148109	1148118	0 %	0 %	60 %	40 %	41407193
1029	NC_002944	CGGCC	2	10	1148373	1148382	0 %	0 %	40 %	60 %	41407193
1030	NC_002944	CGGCC	2	10	1149076	1149085	0 %	0 %	40 %	60 %	41407194
1031	NC_002944	GCACC	2	10	1151727	1151736	20 %	0 %	20 %	60 %	41407198
1032	NC_002944	CCCGG	2	10	1152471	1152480	0 %	0 %	40 %	60 %	41407198
1033	NC_002944	GCGCA	2	10	1154012	1154021	20 %	0 %	40 %	40 %	41407198
1034	NC_002944	CCGAC	2	10	1155542	1155551	20 %	0 %	20 %	60 %	41407199
1035	NC_002944	GACGG	2	10	1155637	1155646	20 %	0 %	60 %	20 %	41407199
1036	NC_002944	CAGCA	2	10	1155877	1155886	40 %	0 %	20 %	40 %	41407199
1037	NC_002944	GCCGG	2	10	1156130	1156139	0 %	0 %	60 %	40 %	41407200
1038	NC_002944	CCGGC	2	10	1157025	1157034	0 %	0 %	40 %	60 %	41407202
1039	NC_002944	GCGCC	2	10	1157266	1157275	0 %	0 %	40 %	60 %	41407202
1040	NC_002944	CGGCG	2	10	1158628	1158637	0 %	0 %	60 %	40 %	41407203
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1042	NC_002944	GCCGG	2	10	1159547	1159556	0 %	0 %	60 %	40 %	41407206
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1044	NC_002944	GGCCC	2	10	1160792	1160801	0 %	0 %	40 %	60 %	41407207
1045	NC_002944	GACGG	2	10	1164322	1164331	20 %	0 %	60 %	20 %	41407209
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1047	NC_002944	GCGGT	2	10	1165265	1165274	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1048	NC_002944	GTCGG	2	10	1165426	1165435	0 %	20 %	60 %	20 %	41407211
1049	NC_002944	GCGCC	2	10	1168625	1168634	0 %	0 %	40 %	60 %	41407214
1050	NC_002944	GCGCC	2	10	1169592	1169601	0 %	0 %	40 %	60 %	41407215
1051	NC_002944	CGGCG	2	10	1170956	1170965	0 %	0 %	60 %	40 %	41407216
1052	NC_002944	CTCGG	2	10	1172837	1172846	0 %	20 %	40 %	40 %	41407217
1053	NC_002944	GCGCC	2	10	1173595	1173604	0 %	0 %	40 %	60 %	41407217
1054	NC_002944	GGGCG	2	10	1175172	1175181	0 %	0 %	80 %	20 %	41407218
1055	NC_002944	CGACG	2	10	1175313	1175322	20 %	0 %	40 %	40 %	41407219
1056	NC_002944	GCCGG	2	10	1177687	1177696	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1057	NC_002944	GGCCG	2	10	1178016	1178025	0 %	0 %	60 %	40 %	41407223
1058	NC_002944	GGGCC	2	10	1178819	1178828	0 %	0 %	60 %	40 %	41407223
1059	NC_002944	GGGCC	2	10	1179002	1179011	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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1061	NC_002944	GCACG	2	10	1180395	1180404	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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1064	NC_002944	GCGCT	2	10	1183014	1183023	0 %	20 %	40 %	40 %	41407227
1065	NC_002944	CTGGT	2	10	1183371	1183380	0 %	40 %	40 %	20 %	41407227
1066	NC_002944	GCGAC	2	10	1183675	1183684	20 %	0 %	40 %	40 %	41407227
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1068	NC_002944	CCGGC	2	10	1184082	1184091	0 %	0 %	40 %	60 %	41407228
1069	NC_002944	GCCCG	2	10	1184703	1184712	0 %	0 %	40 %	60 %	41407228
1070	NC_002944	GCCGC	2	10	1185647	1185656	0 %	0 %	40 %	60 %	41407228
1071	NC_002944	ACCAC	2	10	1185902	1185911	40 %	0 %	0 %	60 %	41407229
1072	NC_002944	CGCTT	2	10	1186388	1186397	0 %	40 %	20 %	40 %	41407230
1073	NC_002944	GCCCG	2	10	1187061	1187070	0 %	0 %	40 %	60 %	41407230
1074	NC_002944	GGCGC	3	15	1187708	1187722	0 %	0 %	60 %	40 %	41407231
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1077	NC_002944	CCCGG	2	10	1188359	1188368	0 %	0 %	40 %	60 %	41407232
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1079	NC_002944	CGATC	2	10	1188779	1188788	20 %	20 %	20 %	40 %	41407232
1080	NC_002944	GCCGG	2	10	1189146	1189155	0 %	0 %	60 %	40 %	41407232
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1083	NC_002944	GCGCT	2	10	1191459	1191468	0 %	20 %	40 %	40 %	41407234
1084	NC_002944	GCGCC	2	10	1192231	1192240	0 %	0 %	40 %	60 %	41407235
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1087	NC_002944	CCCGG	2	10	1195000	1195009	0 %	0 %	40 %	60 %	41407238
1088	NC_002944	GTTCG	2	10	1195439	1195448	0 %	40 %	40 %	20 %	41407238
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1090	NC_002944	CCGGG	2	10	1196340	1196349	0 %	0 %	60 %	40 %	41407239
1091	NC_002944	CCGCA	2	10	1196481	1196490	20 %	0 %	20 %	60 %	41407240
1092	NC_002944	GCCGT	2	10	1196833	1196842	0 %	20 %	40 %	40 %	41407240
1093	NC_002944	CGGTG	2	10	1197847	1197856	0 %	20 %	60 %	20 %	41407242
1094	NC_002944	CCGGG	2	10	1197909	1197918	0 %	0 %	60 %	40 %	41407242
1095	NC_002944	CCGAC	2	10	1199266	1199275	20 %	0 %	20 %	60 %	41407243
1096	NC_002944	GCCGC	2	10	1199288	1199297	0 %	0 %	40 %	60 %	41407243
1097	NC_002944	GCCGG	2	10	1200062	1200071	0 %	0 %	60 %	40 %	41407243
1098	NC_002944	GCCGC	2	10	1201369	1201378	0 %	0 %	40 %	60 %	41407244
1099	NC_002944	GCGCG	2	10	1204713	1204722	0 %	0 %	60 %	40 %	41407247
1100	NC_002944	GGCGA	2	10	1204787	1204796	20 %	0 %	60 %	20 %	41407247
1101	NC_002944	GCGCG	2	10	1205258	1205267	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1102	NC_002944	TGAAT	2	10	1205391	1205400	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_002944	CGCGG	2	10	1207270	1207279	0 %	0 %	60 %	40 %	41407249
1104	NC_002944	CGTGG	2	10	1208938	1208947	0 %	20 %	60 %	20 %	41407251
1105	NC_002944	GAAAA	2	10	1210524	1210533	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_002944	TCAGC	2	10	1210958	1210967	20 %	20 %	20 %	40 %	41407253
1107	NC_002944	TCACC	2	10	1211119	1211128	20 %	20 %	0 %	60 %	41407253
1108	NC_002944	ACGCC	2	10	1212168	1212177	20 %	0 %	20 %	60 %	41407254
1109	NC_002944	GCCCG	2	10	1212865	1212874	0 %	0 %	40 %	60 %	41407254
1110	NC_002944	GATCG	2	10	1213031	1213040	20 %	20 %	40 %	20 %	41407254
1111	NC_002944	GCCGG	2	10	1214146	1214155	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1112	NC_002944	CCACG	2	10	1216572	1216581	20 %	0 %	20 %	60 %	41407257
1113	NC_002944	CCGCA	2	10	1218116	1218125	20 %	0 %	20 %	60 %	41407259
1114	NC_002944	CGGGG	2	10	1219107	1219116	0 %	0 %	80 %	20 %	41407260
1115	NC_002944	GGGCC	2	10	1220374	1220383	0 %	0 %	60 %	40 %	41407261
1116	NC_002944	GCGCC	2	10	1221342	1221351	0 %	0 %	40 %	60 %	41407261
1117	NC_002944	GCTGG	2	10	1221746	1221755	0 %	20 %	60 %	20 %	41407261
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1121	NC_002944	CGGCC	2	10	1227754	1227763	0 %	0 %	40 %	60 %	41407267
1122	NC_002944	CGGCG	2	10	1227925	1227934	0 %	0 %	60 %	40 %	41407267
1123	NC_002944	GCAGG	2	10	1229239	1229248	20 %	0 %	60 %	20 %	41407268
1124	NC_002944	GCCGC	2	10	1229965	1229974	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1125	NC_002944	GCCGC	2	10	1231721	1231730	0 %	0 %	40 %	60 %	41407270
1126	NC_002944	GCCAA	2	10	1234215	1234224	40 %	0 %	20 %	40 %	41407274
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