MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

Total Repeats: 4586

Go To Repeat Summary Page

< Previous 1 2 3 4 5 6 7 8 910Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_002944	CACGT	2	10	4743994	4744003	20 %	20 %	20 %	40 %	41410375
4502	NC_002944	GCCGA	2	10	4744437	4744446	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4503	NC_002944	GACCA	2	10	4745027	4745036	40 %	0 %	20 %	40 %	41410376
4504	NC_002944	CGCGG	2	10	4749151	4749160	0 %	0 %	60 %	40 %	41410380
4505	NC_002944	GCCCC	2	10	4749408	4749417	0 %	0 %	20 %	80 %	41410380
4506	NC_002944	TCGGC	2	10	4749546	4749555	0 %	20 %	40 %	40 %	41410380
4507	NC_002944	CTCGC	2	10	4750490	4750499	0 %	20 %	20 %	60 %	41410382
4508	NC_002944	GGCCG	2	10	4750531	4750540	0 %	0 %	60 %	40 %	41410382
4509	NC_002944	CCGGC	2	10	4750762	4750771	0 %	0 %	40 %	60 %	41410382
4510	NC_002944	GGGCG	2	10	4755351	4755360	0 %	0 %	80 %	20 %	41410385
4511	NC_002944	GGCTG	2	10	4756046	4756055	0 %	20 %	60 %	20 %	41410386
4512	NC_002944	CGGCC	2	10	4756118	4756127	0 %	0 %	40 %	60 %	41410386
4513	NC_002944	GCCCA	2	10	4758775	4758784	20 %	0 %	20 %	60 %	41410389
4514	NC_002944	CGCGG	2	10	4758858	4758867	0 %	0 %	60 %	40 %	41410389
4515	NC_002944	GCTGC	2	10	4759359	4759368	0 %	20 %	40 %	40 %	41410390
4516	NC_002944	CGTCT	2	10	4760926	4760935	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4517	NC_002944	GCAGG	2	10	4760937	4760946	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4518	NC_002944	CGGCG	2	10	4761228	4761237	0 %	0 %	60 %	40 %	41410392
4519	NC_002944	CGGCC	2	10	4767219	4767228	0 %	0 %	40 %	60 %	41410396
4520	NC_002944	CAGCA	2	10	4767805	4767814	40 %	0 %	20 %	40 %	41410397
4521	NC_002944	GGGCG	2	10	4768113	4768122	0 %	0 %	80 %	20 %	41410397
4522	NC_002944	CGCGC	2	10	4769022	4769031	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4523	NC_002944	GCTGC	2	10	4769853	4769862	0 %	20 %	40 %	40 %	41410398
4524	NC_002944	GCGCC	2	10	4770572	4770581	0 %	0 %	40 %	60 %	41410400
4525	NC_002944	CATCG	2	10	4771293	4771302	20 %	20 %	20 %	40 %	41410400
4526	NC_002944	CGGCG	2	10	4772522	4772531	0 %	0 %	60 %	40 %	41410401
4527	NC_002944	CGTCT	2	10	4774022	4774031	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4528	NC_002944	GCCGC	2	10	4775675	4775684	0 %	0 %	40 %	60 %	41410403
4529	NC_002944	CGGTG	2	10	4776988	4776997	0 %	20 %	60 %	20 %	41410404
4530	NC_002944	CGGCG	2	10	4777394	4777403	0 %	0 %	60 %	40 %	41410405
4531	NC_002944	CGAGT	2	10	4778425	4778434	20 %	20 %	40 %	20 %	41410406
4532	NC_002944	TCCGC	2	10	4779009	4779018	0 %	20 %	20 %	60 %	41410406
4533	NC_002944	CGGCG	2	10	4779091	4779100	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4534	NC_002944	CGCAG	2	10	4779342	4779351	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4535	NC_002944	ACCCC	2	10	4779512	4779521	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
4536	NC_002944	GTCCG	2	10	4780532	4780541	0 %	20 %	40 %	40 %	41410408
4537	NC_002944	AGCCC	2	10	4781956	4781965	20 %	0 %	20 %	60 %	41410409
4538	NC_002944	GGTCG	2	10	4782056	4782065	0 %	20 %	60 %	20 %	41410409
4539	NC_002944	CGCGG	2	10	4783042	4783051	0 %	0 %	60 %	40 %	41410411
4540	NC_002944	GCTGG	2	10	4783554	4783563	0 %	20 %	60 %	20 %	41410411
4541	NC_002944	GACGG	2	10	4784304	4784313	20 %	0 %	60 %	20 %	41410412
4542	NC_002944	CTGGA	2	10	4785051	4785060	20 %	20 %	40 %	20 %	41410412
4543	NC_002944	CGACC	2	10	4785368	4785377	20 %	0 %	20 %	60 %	41410412
4544	NC_002944	GCCCG	2	10	4785999	4786008	0 %	0 %	40 %	60 %	41410412
4545	NC_002944	CCCGG	2	10	4786483	4786492	0 %	0 %	40 %	60 %	41410413
4546	NC_002944	TGGGC	2	10	4786977	4786986	0 %	20 %	60 %	20 %	41410413
4547	NC_002944	ACCAC	2	10	4788518	4788527	40 %	0 %	0 %	60 %	41410416
4548	NC_002944	CGGCG	2	10	4788880	4788889	0 %	0 %	60 %	40 %	41410416
4549	NC_002944	GCGCG	2	10	4791048	4791057	0 %	0 %	60 %	40 %	41410418
4550	NC_002944	GCCGC	2	10	4792330	4792339	0 %	0 %	40 %	60 %	41410418
4551	NC_002944	CGCGT	2	10	4794052	4794061	0 %	20 %	40 %	40 %	41410419
4552	NC_002944	GATGC	2	10	4796186	4796195	20 %	20 %	40 %	20 %	41410419
4553	NC_002944	AGCAC	2	10	4796577	4796586	40 %	0 %	20 %	40 %	41410419
4554	NC_002944	GCCGC	2	10	4799285	4799294	0 %	0 %	40 %	60 %	41410422
4555	NC_002944	GGGCC	2	10	4799532	4799541	0 %	0 %	60 %	40 %	41410422
4556	NC_002944	TGCCC	2	10	4800687	4800696	0 %	20 %	20 %	60 %	41410423
4557	NC_002944	ACCTC	2	10	4800824	4800833	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
4558	NC_002944	CCAGG	2	10	4800965	4800974	20 %	0 %	40 %	40 %	41410424
4559	NC_002944	TGCGG	2	10	4801242	4801251	0 %	20 %	60 %	20 %	41410424
4560	NC_002944	GCGCT	2	10	4801674	4801683	0 %	20 %	40 %	40 %	41410424
4561	NC_002944	CGGCG	2	10	4801937	4801946	0 %	0 %	60 %	40 %	41410424
4562	NC_002944	CCGGT	2	10	4802467	4802476	0 %	20 %	40 %	40 %	41410424
4563	NC_002944	GCCGC	2	10	4807694	4807703	0 %	0 %	40 %	60 %	41410429
4564	NC_002944	CTCGG	2	10	4812941	4812950	0 %	20 %	40 %	40 %	41410433
4565	NC_002944	GCACC	2	10	4813348	4813357	20 %	0 %	20 %	60 %	41410433
4566	NC_002944	CCGCG	2	10	4813632	4813641	0 %	0 %	40 %	60 %	41410433
4567	NC_002944	CGCCC	2	10	4814398	4814407	0 %	0 %	20 %	80 %	41410433
4568	NC_002944	CCGCA	2	10	4814792	4814801	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
4569	NC_002944	CCGGC	2	10	4815713	4815722	0 %	0 %	40 %	60 %	41410434
4570	NC_002944	GCCGT	2	10	4818082	4818091	0 %	20 %	40 %	40 %	41410434
4571	NC_002944	ACGAC	2	10	4818233	4818242	40 %	0 %	20 %	40 %	41410434
4572	NC_002944	CGCGG	2	10	4818680	4818689	0 %	0 %	60 %	40 %	41410435
4573	NC_002944	GCGCT	2	10	4819331	4819340	0 %	20 %	40 %	40 %	41410436
4574	NC_002944	CCCGG	2	10	4819618	4819627	0 %	0 %	40 %	60 %	41410436
4575	NC_002944	GCCCC	2	10	4819819	4819828	0 %	0 %	20 %	80 %	41410436
4576	NC_002944	CCGGT	2	10	4820206	4820215	0 %	20 %	40 %	40 %	41410437
4577	NC_002944	TCACC	2	10	4821112	4821121	20 %	20 %	0 %	60 %	41410438
4578	NC_002944	CCGCG	2	10	4821438	4821447	0 %	0 %	40 %	60 %	41410439
4579	NC_002944	CGCTG	2	10	4821460	4821469	0 %	20 %	40 %	40 %	41410439
4580	NC_002944	CTGCG	2	10	4822233	4822242	0 %	20 %	40 %	40 %	41410439
4581	NC_002944	CCGGT	2	10	4823115	4823124	0 %	20 %	40 %	40 %	41410440
4582	NC_002944	GCCGG	2	10	4824576	4824585	0 %	0 %	60 %	40 %	41410441
4583	NC_002944	GCCCC	2	10	4826258	4826267	0 %	0 %	20 %	80 %	41410443
4584	NC_002944	GACCG	2	10	4826520	4826529	20 %	0 %	40 %	40 %	41410443
4585	NC_002944	CCGGT	2	10	4828643	4828652	0 %	20 %	40 %	40 %	41410446
4586	NC_002944	GGGCC	2	10	4828787	4828796	0 %	0 %	60 %	40 %	41410447

< Previous 1 2 3 4 5 6 7 8 910Next >