MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

Total Repeats: 4586

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_002944	CCCGG	2	10	2144291	2144300	0 %	0 %	40 %	60 %	41408040
2002	NC_002944	TCCGG	2	10	2146354	2146363	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2003	NC_002944	CGGCC	2	10	2147653	2147662	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2004	NC_002944	TCAGG	2	10	2148427	2148436	20 %	20 %	40 %	20 %	41408045
2005	NC_002944	GATCG	2	10	2149292	2149301	20 %	20 %	40 %	20 %	41408046
2006	NC_002944	GACCG	2	10	2150301	2150310	20 %	0 %	40 %	40 %	41408047
2007	NC_002944	TCGGC	3	15	2150746	2150760	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2008	NC_002944	AGCCG	2	10	2150949	2150958	20 %	0 %	40 %	40 %	41408048
2009	NC_002944	GCCCG	2	10	2152320	2152329	0 %	0 %	40 %	60 %	41408049
2010	NC_002944	CGGCC	2	10	2152375	2152384	0 %	0 %	40 %	60 %	41408049
2011	NC_002944	GCCCG	2	10	2152966	2152975	0 %	0 %	40 %	60 %	41408049
2012	NC_002944	CCGCG	2	10	2153014	2153023	0 %	0 %	40 %	60 %	41408049
2013	NC_002944	TGGGC	2	10	2155972	2155981	0 %	20 %	60 %	20 %	41408051
2014	NC_002944	CGTCG	2	10	2156608	2156617	0 %	20 %	40 %	40 %	41408052
2015	NC_002944	CGGCG	2	10	2156767	2156776	0 %	0 %	60 %	40 %	41408052
2016	NC_002944	CGGGT	2	10	2156867	2156876	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
2017	NC_002944	CGCGG	2	10	2157266	2157275	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2018	NC_002944	CCGAA	2	10	2160026	2160035	40 %	0 %	20 %	40 %	41408054
2019	NC_002944	TCGGC	2	10	2161179	2161188	0 %	20 %	40 %	40 %	41408055
2020	NC_002944	CCGCG	2	10	2161897	2161906	0 %	0 %	40 %	60 %	41408055
2021	NC_002944	GCCCG	2	10	2162027	2162036	0 %	0 %	40 %	60 %	41408055
2022	NC_002944	CCGGG	2	10	2162069	2162078	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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2030	NC_002944	GCCGA	2	10	2167936	2167945	20 %	0 %	40 %	40 %	41408062
2031	NC_002944	GCGTC	2	10	2168324	2168333	0 %	20 %	40 %	40 %	41408063
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2034	NC_002944	AGTTC	2	10	2170606	2170615	20 %	40 %	20 %	20 %	41408063
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2036	NC_002944	CGGCC	2	10	2173383	2173392	0 %	0 %	40 %	60 %	41408065
2037	NC_002944	GGTCG	2	10	2173553	2173562	0 %	20 %	60 %	20 %	41408065
2038	NC_002944	CGGGC	2	10	2174393	2174402	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2039	NC_002944	GCCGA	2	10	2175348	2175357	20 %	0 %	40 %	40 %	41408066
2040	NC_002944	TCCAC	2	10	2175898	2175907	20 %	20 %	0 %	60 %	41408066
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2043	NC_002944	CGACC	2	10	2177623	2177632	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
2044	NC_002944	GGCCG	2	10	2177984	2177993	0 %	0 %	60 %	40 %	41408068
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2052	NC_002944	CGCAA	2	10	2185846	2185855	40 %	0 %	20 %	40 %	41408077
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2056	NC_002944	GGCCG	2	10	2187496	2187505	0 %	0 %	60 %	40 %	41408078
2057	NC_002944	GCACC	2	10	2187594	2187603	20 %	0 %	20 %	60 %	41408079
2058	NC_002944	CGCGC	2	10	2187833	2187842	0 %	0 %	40 %	60 %	41408079
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2062	NC_002944	CGGCG	2	10	2190899	2190908	0 %	0 %	60 %	40 %	41408082
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2093	NC_002944	GACCT	2	10	2217149	2217158	20 %	20 %	20 %	40 %	41408106
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