MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 genome

Total Repeats: 44879

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021081	GCG	2	6	346	351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881634
2	NC_021081	GGC	2	6	358	363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881634
3	NC_021081	CCG	2	6	426	431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881634
4	NC_021081	CGT	2	6	457	462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881634
5	NC_021081	GCT	2	6	478	483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881634
6	NC_021081	TGC	2	6	486	491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881634
7	NC_021081	CTT	2	6	614	619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881635
8	NC_021081	CCA	2	6	743	748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881635
9	NC_021081	CGG	2	6	821	826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881636
10	NC_021081	GTT	2	6	832	837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881636
11	NC_021081	CTG	2	6	841	846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881636
12	NC_021081	CTT	2	6	852	857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881636
13	NC_021081	CCT	2	6	873	878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881636
14	NC_021081	GGC	2	6	913	918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881636
15	NC_021081	CTT	2	6	975	980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881636
16	NC_021081	GCT	2	6	996	1001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881636
17	NC_021081	CCA	2	6	1078	1083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881636
18	NC_021081	GGC	2	6	1375	1380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881636
19	NC_021081	GTA	2	6	1514	1519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881637
20	NC_021081	TCC	2	6	1539	1544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881637
21	NC_021081	TCC	2	6	1584	1589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881637
22	NC_021081	CCA	2	6	1627	1632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881637
23	NC_021081	GCA	2	6	1763	1768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881638
24	NC_021081	GCG	2	6	1792	1797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881638
25	NC_021081	CAC	2	6	1803	1808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881638
26	NC_021081	CAG	2	6	1917	1922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881638
27	NC_021081	GCC	2	6	1989	1994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881638
28	NC_021081	GCG	2	6	2012	2017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881638
29	NC_021081	GTT	2	6	2043	2048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881638
30	NC_021081	CCT	2	6	2103	2108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881639
31	NC_021081	CGG	2	6	2175	2180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881639
32	NC_021081	GTG	2	6	2241	2246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881639
33	NC_021081	CTG	2	6	2288	2293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881639
34	NC_021081	GTT	2	6	2318	2323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881639
35	NC_021081	GTA	2	6	2438	2443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881639
36	NC_021081	TGG	3	9	2458	2466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881639
37	NC_021081	CCG	2	6	2473	2478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881639
38	NC_021081	GCC	2	6	2498	2503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881639
39	NC_021081	TAA	2	6	2521	2526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482881639
40	NC_021081	GGT	2	6	2575	2580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881639
41	NC_021081	CTG	2	6	2681	2686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881639
42	NC_021081	TCC	2	6	2814	2819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881639
43	NC_021081	GCC	2	6	2886	2891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881639
44	NC_021081	GTA	2	6	3170	3175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881640
45	NC_021081	GTA	2	6	3209	3214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881640
46	NC_021081	CAC	2	6	3332	3337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881640
47	NC_021081	CAC	2	6	3377	3382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881640
48	NC_021081	GCC	2	6	3434	3439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881640
49	NC_021081	CCT	2	6	3496	3501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881640
50	NC_021081	CAG	2	6	3533	3538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881641
51	NC_021081	CCA	2	6	3592	3597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881641
52	NC_021081	TTG	3	9	3615	3623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881641
53	NC_021081	CGC	2	6	3646	3651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881641
54	NC_021081	CAG	3	9	3659	3667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881641
55	NC_021081	GTG	3	9	3696	3704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881641
56	NC_021081	GTA	2	6	3728	3733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881641
57	NC_021081	CAC	2	6	3860	3865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881641
58	NC_021081	CGC	2	6	3920	3925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881641
59	NC_021081	GCA	2	6	4130	4135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881642
60	NC_021081	CGT	2	6	4190	4195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881642
61	NC_021081	CGT	2	6	4259	4264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881642
62	NC_021081	GAA	2	6	4434	4439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482881642
63	NC_021081	CCA	2	6	4454	4459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881642
64	NC_021081	CAA	2	6	4461	4466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482881642
65	NC_021081	GAA	2	6	4539	4544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482881642
66	NC_021081	CTG	2	6	4549	4554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881642
67	NC_021081	CGC	2	6	4558	4563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881642
68	NC_021081	CTT	2	6	4583	4588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881642
69	NC_021081	CCA	2	6	4667	4672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881642
70	NC_021081	GGC	2	6	4873	4878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881643
71	NC_021081	TGC	2	6	5397	5402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881644
72	NC_021081	GGC	2	6	5423	5428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881644
73	NC_021081	GGC	2	6	5500	5505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881644
74	NC_021081	GTT	2	6	5552	5557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881644
75	NC_021081	CAC	2	6	5578	5583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881644
76	NC_021081	CCT	2	6	5586	5591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881645
77	NC_021081	CCA	2	6	5676	5681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881645
78	NC_021081	CCG	2	6	5685	5690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881645
79	NC_021081	GTC	2	6	5701	5706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881645
80	NC_021081	GTG	2	6	5848	5853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881645
81	NC_021081	CCA	2	6	5961	5966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881645
82	NC_021081	TCA	2	6	6108	6113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881645
83	NC_021081	CAG	2	6	6124	6129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881646
84	NC_021081	CAG	2	6	6212	6217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881646
85	NC_021081	GGC	2	6	6287	6292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881646
86	NC_021081	CTT	2	6	6385	6390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881646
87	NC_021081	TCT	2	6	6519	6524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881646
88	NC_021081	GAT	2	6	6549	6554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881646
89	NC_021081	CCG	2	6	6580	6585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881646
90	NC_021081	CCG	2	6	6595	6600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881646
91	NC_021081	GTT	2	6	6616	6621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881646
92	NC_021081	CCT	2	6	6631	6636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881647
93	NC_021081	CCG	2	6	6782	6787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881647
94	NC_021081	CCT	2	6	6963	6968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881648
95	NC_021081	GGC	2	6	7011	7016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881648
96	NC_021081	TGG	2	6	7088	7093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881648
97	NC_021081	GCT	2	6	7132	7137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881648
98	NC_021081	CCA	2	6	7616	7621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881649
99	NC_021081	GGC	2	6	7737	7742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881649
100	NC_021081	AGC	2	6	7768	7773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881649
101	NC_021081	GGC	2	6	7835	7840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881649
102	NC_021081	GTC	2	6	7900	7905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881650
103	NC_021081	CGG	2	6	7914	7919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881650
104	NC_021081	CAC	2	6	7950	7955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881650
105	NC_021081	GGC	2	6	7975	7980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881650
106	NC_021081	GTG	2	6	8117	8122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881650
107	NC_021081	TTC	2	6	8152	8157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881650
108	NC_021081	CAG	2	6	8206	8211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881650
109	NC_021081	CTT	2	6	8385	8390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881651
110	NC_021081	TGC	2	6	8414	8419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881651
111	NC_021081	CTG	2	6	8455	8460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881651
112	NC_021081	CTG	2	6	8635	8640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881651
113	NC_021081	TCT	2	6	8681	8686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881651
114	NC_021081	CGG	2	6	8690	8695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881651
115	NC_021081	CAT	2	6	8742	8747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881651
116	NC_021081	GCC	2	6	8770	8775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881651
117	NC_021081	TGG	2	6	8777	8782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881651
118	NC_021081	GTT	2	6	8947	8952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881652
119	NC_021081	GCC	2	6	8988	8993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881652
120	NC_021081	CGG	2	6	8994	8999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881652
121	NC_021081	GCA	2	6	9012	9017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881652
122	NC_021081	CGG	2	6	9094	9099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881652
123	NC_021081	CAG	2	6	9298	9303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881652
124	NC_021081	GCC	2	6	9339	9344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881652
125	NC_021081	CAC	2	6	9490	9495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881652
126	NC_021081	CAG	2	6	9523	9528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881652
127	NC_021081	TCC	2	6	9626	9631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881652
128	NC_021081	GTC	2	6	9682	9687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881652
129	NC_021081	CCA	2	6	9780	9785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881652
130	NC_021081	CCA	2	6	9792	9797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881652
131	NC_021081	CTC	2	6	9988	9993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881652
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259	NC_021081	TGG	2	6	17770	17775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881662
260	NC_021081	CGG	2	6	17812	17817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881662
261	NC_021081	CAG	2	6	17825	17830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881662
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