MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 genome

Total Repeats: 44879

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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502	NC_021081	CGA	2	6	38628	38633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881680
503	NC_021081	TGG	2	6	38714	38719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881680
504	NC_021081	GTG	2	6	38734	38739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881680
505	NC_021081	GCC	2	6	38744	38749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881680
506	NC_021081	CGA	2	6	38820	38825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881680
507	NC_021081	CCG	2	6	38898	38903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881680
508	NC_021081	GTG	2	6	38947	38952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881680
509	NC_021081	CGG	2	6	39034	39039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881680
510	NC_021081	CAG	2	6	39319	39324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881681
511	NC_021081	TCC	2	6	39380	39385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881681
512	NC_021081	CGC	2	6	39530	39535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881681
513	NC_021081	CCA	2	6	39630	39635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881681
514	NC_021081	GAC	2	6	39663	39668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881681
515	NC_021081	ACC	2	6	39731	39736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881681
516	NC_021081	CAC	2	6	39742	39747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881681
517	NC_021081	CAC	2	6	39880	39885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881681
518	NC_021081	GCC	2	6	39923	39928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881681
519	NC_021081	GTA	2	6	40003	40008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881681
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521	NC_021081	GGC	2	6	40033	40038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881681
522	NC_021081	TGC	2	6	40104	40109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881682
523	NC_021081	CCT	2	6	40248	40253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881682
524	NC_021081	AGC	2	6	40256	40261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881682
525	NC_021081	GCC	2	6	40300	40305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881682
526	NC_021081	CCT	2	6	40413	40418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881682
527	NC_021081	CAG	3	9	40774	40782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881682
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529	NC_021081	TCT	2	6	40832	40837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881682
530	NC_021081	GCA	2	6	40895	40900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881682
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533	NC_021081	TGC	2	6	40955	40960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881682
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535	NC_021081	ACC	2	6	41040	41045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881683
536	NC_021081	GGT	3	9	41075	41083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881683
537	NC_021081	TGC	2	6	41094	41099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881683
538	NC_021081	CCG	2	6	41201	41206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881683
539	NC_021081	CTC	2	6	41213	41218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881683
540	NC_021081	GCG	3	9	41222	41230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881683
541	NC_021081	CAC	2	6	41249	41254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881683
542	NC_021081	TCC	2	6	41385	41390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881683
543	NC_021081	CAA	2	6	41426	41431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482881683
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545	NC_021081	CCT	4	12	41506	41517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881683
546	NC_021081	TCG	2	6	41574	41579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881683
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553	NC_021081	AGC	2	6	42341	42346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881684
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557	NC_021081	CTG	2	6	42483	42488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881684
558	NC_021081	TCC	2	6	42577	42582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881684
559	NC_021081	AGC	2	6	42583	42588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881684
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561	NC_021081	CCG	2	6	42688	42693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881684
562	NC_021081	CCG	2	6	42842	42847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881684
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564	NC_021081	GCC	2	6	42915	42920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881684
565	NC_021081	GTG	2	6	43009	43014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881684
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574	NC_021081	GCT	2	6	44097	44102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881687
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581	NC_021081	CTG	2	6	44874	44879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881688
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589	NC_021081	CAT	2	6	45155	45160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881688
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594	NC_021081	ACA	2	6	45595	45600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482881689
595	NC_021081	GGC	2	6	45713	45718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881689
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598	NC_021081	CGA	2	6	45857	45862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881689
599	NC_021081	GAG	2	6	45912	45917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881689
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601	NC_021081	GCC	2	6	45979	45984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881689
602	NC_021081	GCC	2	6	45990	45995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881689
603	NC_021081	TGC	2	6	45997	46002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881689
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605	NC_021081	CGA	2	6	46064	46069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881689
606	NC_021081	GAT	2	6	46109	46114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881689
607	NC_021081	CAG	2	6	46302	46307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881689
608	NC_021081	CGC	2	6	46328	46333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881689
609	NC_021081	CGG	2	6	46613	46618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881689
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611	NC_021081	CCG	2	6	46702	46707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881689
612	NC_021081	TGG	2	6	46771	46776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881689
613	NC_021081	CAG	2	6	46815	46820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881689
614	NC_021081	GGT	2	6	46880	46885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881689
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616	NC_021081	ACC	2	6	46977	46982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881689
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618	NC_021081	TGC	2	6	47086	47091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881689
619	NC_021081	GCT	2	6	47099	47104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881689
620	NC_021081	CGA	4	12	47111	47122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881689
621	NC_021081	TCA	2	6	47155	47160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881689
622	NC_021081	GGC	2	6	47379	47384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881690
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999	NC_021081	TGA	2	6	69913	69918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881709
1000	NC_021081	TCA	2	6	69953	69958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881709

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