MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 genome

Total Repeats: 44879

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_021081	CCA	2	6	278547	278552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881916
4002	NC_021081	TCT	2	6	278645	278650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881916
4003	NC_021081	GGC	2	6	278705	278710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881916
4004	NC_021081	CCG	2	6	278754	278759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881916
4005	NC_021081	CCA	2	6	278811	278816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881916
4006	NC_021081	GCG	2	6	278889	278894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881916
4007	NC_021081	AGC	2	6	278957	278962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881916
4008	NC_021081	CCA	2	6	279030	279035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881916
4009	NC_021081	CAG	2	6	279064	279069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881916
4010	NC_021081	TGG	3	9	279102	279110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881916
4011	NC_021081	ACC	2	6	279170	279175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881916
4012	NC_021081	AAG	2	6	279213	279218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482881916
4013	NC_021081	TGA	2	6	279226	279231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881916
4014	NC_021081	TGG	3	9	279264	279272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881916
4015	NC_021081	GCC	2	6	279294	279299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881916
4016	NC_021081	CGC	2	6	279379	279384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881916
4017	NC_021081	GTG	2	6	279398	279403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881916
4018	NC_021081	CAG	2	6	279421	279426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881916
4019	NC_021081	GGT	2	6	279538	279543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881916
4020	NC_021081	CCG	2	6	279573	279578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881916
4021	NC_021081	CGC	2	6	279730	279735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881916
4022	NC_021081	CGG	2	6	279745	279750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881916
4023	NC_021081	CAG	2	6	279821	279826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881916
4024	NC_021081	CGG	2	6	279946	279951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881916
4025	NC_021081	AGC	2	6	279980	279985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881916
4026	NC_021081	GCC	2	6	280002	280007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881916
4027	NC_021081	AAG	2	6	280340	280345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482881916
4028	NC_021081	ACT	2	6	280682	280687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881917
4029	NC_021081	AGG	2	6	280697	280702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881917
4030	NC_021081	GCC	2	6	280703	280708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881917
4031	NC_021081	ACC	2	6	280831	280836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881917
4032	NC_021081	GCG	2	6	280864	280869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881917
4033	NC_021081	CCG	2	6	280928	280933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881917
4034	NC_021081	CAT	2	6	280971	280976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881917
4035	NC_021081	GTG	2	6	280978	280983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881917
4036	NC_021081	CAT	2	6	281016	281021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881917
4037	NC_021081	ACC	2	6	281155	281160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881917
4038	NC_021081	GGC	2	6	281161	281166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881917
4039	NC_021081	ACG	3	9	281189	281197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881917
4040	NC_021081	ACG	2	6	281243	281248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881917
4041	NC_021081	AGC	2	6	281378	281383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881917
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4043	NC_021081	CTA	2	6	281472	281477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881917
4044	NC_021081	TAC	2	6	281482	281487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881917
4045	NC_021081	CGG	2	6	281617	281622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881917
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4049	NC_021081	CTG	2	6	281889	281894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881918
4050	NC_021081	TGG	3	9	282052	282060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881918
4051	NC_021081	TGC	2	6	282109	282114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881918
4052	NC_021081	ACT	2	6	282199	282204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881918
4053	NC_021081	CGA	2	6	282263	282268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881918
4054	NC_021081	TGC	2	6	282316	282321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881918
4055	NC_021081	TGC	2	6	282397	282402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881918
4056	NC_021081	ACC	2	6	282403	282408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881918
4057	NC_021081	ATC	2	6	282420	282425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881918
4058	NC_021081	GGT	2	6	282452	282457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881918
4059	NC_021081	GGT	2	6	282482	282487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881918
4060	NC_021081	TGG	2	6	282502	282507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881918
4061	NC_021081	TGG	2	6	282556	282561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881918
4062	NC_021081	GCA	2	6	282667	282672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881918
4063	NC_021081	GCA	2	6	282700	282705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881918
4064	NC_021081	CGA	2	6	282743	282748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881918
4065	NC_021081	GGT	2	6	282755	282760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881918
4066	NC_021081	TGG	2	6	282814	282819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881918
4067	NC_021081	GGT	2	6	282842	282847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881918
4068	NC_021081	GGC	2	6	282883	282888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881918
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4074	NC_021081	CAG	2	6	283299	283304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881918
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4083	NC_021081	GTG	2	6	283831	283836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881919
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4089	NC_021081	CGC	2	6	284419	284424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881919
4090	NC_021081	CCA	2	6	284429	284434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881919
4091	NC_021081	TAC	2	6	284476	284481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881919
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4101	NC_021081	TAC	2	6	285325	285330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881919
4102	NC_021081	CTC	2	6	285333	285338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881919
4103	NC_021081	CCT	2	6	285400	285405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881919
4104	NC_021081	GAG	2	6	285416	285421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881919
4105	NC_021081	AAT	2	6	285454	285459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482881919
4106	NC_021081	CGG	2	6	285552	285557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881919
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4108	NC_021081	CAT	2	6	285705	285710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881919
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