MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 genome

Total Repeats: 44879

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021081	CTA	2	6	203041	203046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881853
3002	NC_021081	CTG	3	9	203161	203169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881853
3003	NC_021081	GTG	2	6	203257	203262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881853
3004	NC_021081	GCG	2	6	203336	203341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881853
3005	NC_021081	ATG	2	6	203364	203369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881853
3006	NC_021081	TGG	2	6	203407	203412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881854
3007	NC_021081	TGG	2	6	203416	203421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881854
3008	NC_021081	GAT	2	6	203480	203485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881854
3009	NC_021081	CGA	3	9	203711	203719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881854
3010	NC_021081	AAC	2	6	203776	203781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482881854
3011	NC_021081	CTG	2	6	203793	203798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881854
3012	NC_021081	GCC	2	6	203876	203881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881854
3013	NC_021081	GCC	2	6	203926	203931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881854
3014	NC_021081	GGT	2	6	203993	203998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881854
3015	NC_021081	CTT	2	6	204088	204093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881854
3016	NC_021081	ACA	2	6	204125	204130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482881854
3017	NC_021081	CAC	2	6	204213	204218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881854
3018	NC_021081	GCC	2	6	204313	204318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881854
3019	NC_021081	ACT	2	6	204564	204569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881855
3020	NC_021081	GCC	2	6	204700	204705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881855
3021	NC_021081	GGC	2	6	204727	204732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881855
3022	NC_021081	CTG	2	6	204745	204750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881855
3023	NC_021081	ACC	2	6	204821	204826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881855
3024	NC_021081	CGG	2	6	204947	204952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881855
3025	NC_021081	AGG	2	6	205157	205162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881855
3026	NC_021081	CTA	2	6	205257	205262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881855
3027	NC_021081	CTG	2	6	205348	205353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881855
3028	NC_021081	GAT	3	9	205440	205448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881855
3029	NC_021081	ATC	2	6	205475	205480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881855
3030	NC_021081	ATG	3	9	205537	205545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881855
3031	NC_021081	GCC	2	6	205559	205564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881855
3032	NC_021081	TCG	2	6	205583	205588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881855
3033	NC_021081	CGC	2	6	205672	205677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881855
3034	NC_021081	ATG	2	6	205696	205701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881855
3035	NC_021081	TCA	2	6	205715	205720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881855
3036	NC_021081	TAA	2	6	205794	205799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482881855
3037	NC_021081	GTG	2	6	205918	205923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881855
3038	NC_021081	CAC	2	6	205956	205961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881855
3039	NC_021081	TCG	2	6	205979	205984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881855
3040	NC_021081	ATG	2	6	206002	206007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881855
3041	NC_021081	ATG	2	6	206216	206221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881856
3042	NC_021081	ACC	2	6	206226	206231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881856
3043	NC_021081	GCC	2	6	206297	206302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881856
3044	NC_021081	GAT	2	6	206398	206403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881856
3045	NC_021081	ATG	2	6	206423	206428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881856
3046	NC_021081	ATG	2	6	206438	206443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881856
3047	NC_021081	ATG	2	6	206447	206452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881856
3048	NC_021081	CAC	2	6	206504	206509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881856
3049	NC_021081	GGC	2	6	206548	206553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881856
3050	NC_021081	TCA	2	6	206586	206591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881856
3051	NC_021081	GAA	2	6	206679	206684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482881857
3052	NC_021081	GTA	2	6	206742	206747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881857
3053	NC_021081	CCG	2	6	206767	206772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881857
3054	NC_021081	AGC	2	6	206785	206790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881857
3055	NC_021081	CAG	2	6	206874	206879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881857
3056	NC_021081	TCT	2	6	206881	206886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881857
3057	NC_021081	CGT	2	6	206921	206926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881857
3058	NC_021081	CGG	2	6	206957	206962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881857
3059	NC_021081	GCC	2	6	206979	206984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881857
3060	NC_021081	CCG	2	6	207201	207206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881858
3061	NC_021081	CCA	2	6	207247	207252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881858
3062	NC_021081	AGG	2	6	207321	207326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881858
3063	NC_021081	CAC	2	6	207344	207349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881858
3064	NC_021081	CAG	2	6	207350	207355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881858
3065	NC_021081	TCG	2	6	207600	207605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881858
3066	NC_021081	GTA	2	6	207608	207613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881858
3067	NC_021081	AGC	2	6	207642	207647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881858
3068	NC_021081	CTC	2	6	207758	207763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881858
3069	NC_021081	TGC	2	6	207769	207774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881858
3070	NC_021081	GTT	2	6	207794	207799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881858
3071	NC_021081	GTA	2	6	207863	207868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881858
3072	NC_021081	TGG	2	6	207879	207884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881858
3073	NC_021081	ATC	2	6	207906	207911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881858
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3076	NC_021081	CAG	2	6	208076	208081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881858
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3079	NC_021081	GTA	2	6	208211	208216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881858
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3083	NC_021081	GCT	2	6	208340	208345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881858
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3086	NC_021081	CGT	2	6	208498	208503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881858
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3089	NC_021081	TGG	2	6	209015	209020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881859
3090	NC_021081	GTC	2	6	209071	209076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881859
3091	NC_021081	TGG	2	6	209078	209083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881859
3092	NC_021081	TCG	2	6	209126	209131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881859
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3118	NC_021081	GGT	3	9	211214	211222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881860
3119	NC_021081	ACC	2	6	211272	211277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881860
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3122	NC_021081	ACC	2	6	211452	211457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881860
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3356	NC_021081	CGG	2	6	226353	226358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881875
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3473	NC_021081	CTC	2	6	235560	235565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881882
3474	NC_021081	CCG	2	6	235613	235618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881882
3475	NC_021081	GCC	2	6	235641	235646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881882
3476	NC_021081	GGC	2	6	235701	235706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881882
3477	NC_021081	GCT	2	6	235752	235757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881882
3478	NC_021081	CTG	2	6	235900	235905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881882
3479	NC_021081	CGA	2	6	235932	235937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881882
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3482	NC_021081	CAG	2	6	236038	236043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881882
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3486	NC_021081	ACC	2	6	236102	236107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881882
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3491	NC_021081	GCT	2	6	236382	236387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881882
3492	NC_021081	CAT	2	6	236490	236495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881882
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3497	NC_021081	GCC	2	6	236664	236669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881882
3498	NC_021081	GCC	2	6	236731	236736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881882
3499	NC_021081	GTT	2	6	236922	236927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881883
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