MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 genome

Total Repeats: 44879

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_021081	GCG	3	9	415581	415589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482882043
6002	NC_021081	AGG	2	6	415660	415665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482882043
6003	NC_021081	AGG	2	6	415699	415704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482882043
6004	NC_021081	GGC	2	6	415736	415741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482882043
6005	NC_021081	GGT	2	6	415754	415759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482882043
6006	NC_021081	CTT	2	6	415763	415768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482882043
6007	NC_021081	CTG	2	6	415819	415824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482882043
6008	NC_021081	AGC	2	6	415826	415831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482882043
6009	NC_021081	CTG	2	6	415839	415844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482882043
6010	NC_021081	CAC	2	6	415902	415907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482882043
6011	NC_021081	TGG	2	6	415960	415965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482882043
6012	NC_021081	GCT	2	6	415967	415972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482882043
6013	NC_021081	AGG	2	6	415990	415995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482882043
6014	NC_021081	GCT	2	6	416022	416027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482882043
6015	NC_021081	CAC	2	6	416076	416081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482882043
6016	NC_021081	TGC	2	6	416206	416211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482882043
6017	NC_021081	GGA	2	6	416222	416227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482882043
6018	NC_021081	GTG	2	6	416232	416237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482882043
6019	NC_021081	TTG	2	6	416283	416288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482882043
6020	NC_021081	CGA	2	6	416505	416510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482882044
6021	NC_021081	TAG	2	6	416585	416590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482882044
6022	NC_021081	CAG	2	6	416626	416631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482882044
6023	NC_021081	CAG	2	6	416671	416676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482882044
6024	NC_021081	CTC	2	6	416701	416706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482882044
6025	NC_021081	GTA	2	6	416863	416868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482882044
6026	NC_021081	CTC	2	6	416936	416941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482882044
6027	NC_021081	GCT	2	6	416976	416981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482882044
6028	NC_021081	TGG	2	6	417054	417059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482882044
6029	NC_021081	CAC	2	6	417120	417125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482882044
6030	NC_021081	CTG	2	6	417262	417267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482882044
6031	NC_021081	CAC	2	6	417268	417273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482882044
6032	NC_021081	CGC	2	6	417274	417279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482882044
6033	NC_021081	CTC	2	6	417280	417285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482882044
6034	NC_021081	GGC	2	6	417381	417386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482882044
6035	NC_021081	GTG	3	9	417461	417469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482882044
6036	NC_021081	CAC	2	6	417583	417588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482882044
6037	NC_021081	CAG	2	6	417960	417965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482882045
6038	NC_021081	GTC	2	6	417968	417973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482882045
6039	NC_021081	CGA	2	6	417983	417988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482882045
6040	NC_021081	CCA	3	9	418031	418039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482882045
6041	NC_021081	GAA	2	6	418104	418109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482882045
6042	NC_021081	TCC	2	6	418171	418176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482882045
6043	NC_021081	AGT	2	6	418202	418207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482882045
6044	NC_021081	CTC	2	6	418245	418250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482882045
6045	NC_021081	CAA	2	6	418266	418271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482882045
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6047	NC_021081	CAG	2	6	418388	418393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482882045
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6050	NC_021081	GCT	2	6	418666	418671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482882046
6051	NC_021081	CTG	2	6	418772	418777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482882046
6052	NC_021081	GGA	2	6	418789	418794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482882046
6053	NC_021081	GAC	2	6	418814	418819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482882046
6054	NC_021081	CTG	2	6	419024	419029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482882047
6055	NC_021081	GAT	2	6	419110	419115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482882047
6056	NC_021081	GGA	2	6	419302	419307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482882047
6057	NC_021081	TGG	2	6	419368	419373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482882048
6058	NC_021081	AGG	2	6	419557	419562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482882048
6059	NC_021081	CGG	3	9	419563	419571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482882048
6060	NC_021081	GCG	3	9	419596	419604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482882048
6061	NC_021081	GAG	2	6	419678	419683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482882048
6062	NC_021081	GGC	2	6	419693	419698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482882048
6063	NC_021081	CAG	2	6	419700	419705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482882048
6064	NC_021081	CGA	2	6	419711	419716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482882048
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6066	NC_021081	CTG	2	6	420015	420020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482882048
6067	NC_021081	GCC	2	6	420067	420072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482882048
6068	NC_021081	CGG	2	6	420101	420106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482882048
6069	NC_021081	AGG	2	6	420130	420135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482882048
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6071	NC_021081	GCA	2	6	420221	420226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482882048
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6074	NC_021081	TGT	2	6	420445	420450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482882049
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6090	NC_021081	GGC	2	6	421417	421422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482882049
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6105	NC_021081	TGG	2	6	422623	422628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482882050
6106	NC_021081	GGT	2	6	422636	422641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482882050
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6476	NC_021081	CTG	2	6	442841	442846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482882077
6477	NC_021081	CGC	2	6	442958	442963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482882077
6478	NC_021081	GAG	2	6	443016	443021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482882077
6479	NC_021081	CGA	2	6	443027	443032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482882077
6480	NC_021081	ACG	2	6	443149	443154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482882077
6481	NC_021081	CTA	2	6	443204	443209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482882077
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6491	NC_021081	CTT	2	6	443741	443746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482882077
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