MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 chromosome

Total Repeats: 3743

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_019738	TGCCG	2	10	3967765	3967774	0 %	20 %	40 %	40 %	428311598
2002	NC_019738	GACAG	2	10	3967872	3967881	40 %	0 %	40 %	20 %	428311598
2003	NC_019738	AGTTG	2	10	3969134	3969143	20 %	40 %	40 %	0 %	428311599
2004	NC_019738	TTTGA	2	10	3972046	3972055	20 %	60 %	20 %	0 %	428311602
2005	NC_019738	GACCT	2	10	3973067	3973076	20 %	20 %	20 %	40 %	428311602
2006	NC_019738	GCGGT	2	10	3979296	3979305	0 %	20 %	60 %	20 %	428311606
2007	NC_019738	CCTTG	2	10	3979735	3979744	0 %	40 %	20 %	40 %	428311607
2008	NC_019738	TTTTG	3	15	3981400	3981414	0 %	80 %	20 %	0 %	428311609
2009	NC_019738	GTCCA	2	10	3991244	3991253	20 %	20 %	20 %	40 %	428311615
2010	NC_019738	AATGA	2	10	3994122	3994131	60 %	20 %	20 %	0 %	428311617
2011	NC_019738	TCCAC	2	10	3995252	3995261	20 %	20 %	0 %	60 %	428311619
2012	NC_019738	AGTGA	2	10	3998180	3998189	40 %	20 %	40 %	0 %	428311622
2013	NC_019738	AACAT	2	10	3999903	3999912	60 %	20 %	0 %	20 %	428311623
2014	NC_019738	CAAAG	2	10	4002389	4002398	60 %	0 %	20 %	20 %	428311626
2015	NC_019738	TAGCT	2	10	4003844	4003853	20 %	40 %	20 %	20 %	428311629
2016	NC_019738	CAGTT	2	10	4005773	4005782	20 %	40 %	20 %	20 %	428311630
2017	NC_019738	CTACG	2	10	4006249	4006258	20 %	20 %	20 %	40 %	428311630
2018	NC_019738	GCGAG	2	10	4006400	4006409	20 %	0 %	60 %	20 %	428311630
2019	NC_019738	AGCTT	2	10	4008052	4008061	20 %	40 %	20 %	20 %	428311631
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2021	NC_019738	TGAGA	2	10	4012232	4012241	40 %	20 %	40 %	0 %	428311636
2022	NC_019738	TTGAT	2	10	4012467	4012476	20 %	60 %	20 %	0 %	428311636
2023	NC_019738	AACCA	2	10	4012747	4012756	60 %	0 %	0 %	40 %	428311636
2024	NC_019738	CTTGA	2	10	4012931	4012940	20 %	40 %	20 %	20 %	428311636
2025	NC_019738	CTGAG	2	10	4016406	4016415	20 %	20 %	40 %	20 %	428311638
2026	NC_019738	GCAAA	2	10	4016757	4016766	60 %	0 %	20 %	20 %	428311638
2027	NC_019738	ATATA	2	10	4017769	4017778	60 %	40 %	0 %	0 %	428311639
2028	NC_019738	ACTGG	2	10	4020626	4020635	20 %	20 %	40 %	20 %	428311643
2029	NC_019738	GCTGG	2	10	4024477	4024486	0 %	20 %	60 %	20 %	428311646
2030	NC_019738	CCAGC	2	10	4025184	4025193	20 %	0 %	20 %	60 %	428311646
2031	NC_019738	TCTCC	2	10	4025285	4025294	0 %	40 %	0 %	60 %	428311646
2032	NC_019738	AATTG	2	10	4030525	4030534	40 %	40 %	20 %	0 %	428311650
2033	NC_019738	TGCGC	2	10	4034653	4034662	0 %	20 %	40 %	40 %	428311655
2034	NC_019738	CCTAC	2	10	4035883	4035892	20 %	20 %	0 %	60 %	428311656
2035	NC_019738	CGACA	2	10	4036955	4036964	40 %	0 %	20 %	40 %	428311656
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2037	NC_019738	ATTTT	2	10	4037999	4038008	20 %	80 %	0 %	0 %	428311657
2038	NC_019738	GGTAA	2	10	4038285	4038294	40 %	20 %	40 %	0 %	428311657
2039	NC_019738	GATAG	2	10	4039774	4039783	40 %	20 %	40 %	0 %	428311658
2040	NC_019738	GTAAG	2	10	4050201	4050210	40 %	20 %	40 %	0 %	428311666
2041	NC_019738	TCACT	2	10	4050912	4050921	20 %	40 %	0 %	40 %	428311666
2042	NC_019738	AACTG	2	10	4051588	4051597	40 %	20 %	20 %	20 %	428311666
2043	NC_019738	TGAGA	2	10	4051966	4051975	40 %	20 %	40 %	0 %	428311667
2044	NC_019738	ACCAC	2	10	4054956	4054965	40 %	0 %	0 %	60 %	428311669
2045	NC_019738	CGTGA	2	10	4059956	4059965	20 %	20 %	40 %	20 %	428311673
2046	NC_019738	AATCA	2	10	4060769	4060778	60 %	20 %	0 %	20 %	428311673
2047	NC_019738	ATTTG	2	10	4066734	4066743	20 %	60 %	20 %	0 %	428311677
2048	NC_019738	AAACT	2	10	4066745	4066754	60 %	20 %	0 %	20 %	428311677
2049	NC_019738	TCGTG	2	10	4069315	4069324	0 %	40 %	40 %	20 %	428311680
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2054	NC_019738	GGGAC	2	10	4078871	4078880	20 %	0 %	60 %	20 %	428311687
2055	NC_019738	AAGCA	2	10	4079270	4079279	60 %	0 %	20 %	20 %	428311687
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2495	NC_019738	CACTT	2	10	5007674	5007683	20 %	40 %	0 %	40 %	428312405
2496	NC_019738	TTGGA	2	10	5012537	5012546	20 %	40 %	40 %	0 %	428312409
2497	NC_019738	GACTG	2	10	5016664	5016673	20 %	20 %	40 %	20 %	428312412
2498	NC_019738	ATCGC	2	10	5017660	5017669	20 %	20 %	20 %	40 %	428312412
2499	NC_019738	TCAGT	2	10	5018344	5018353	20 %	40 %	20 %	20 %	428312412
2500	NC_019738	GATTT	2	10	5022652	5022661	20 %	60 %	20 %	0 %	428312414

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