MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 chromosome

Total Repeats: 3743

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_019738	CTAAA	2	10	5025006	5025015	60 %	20 %	0 %	20 %	428312417
2502	NC_019738	CTTGG	2	10	5026640	5026649	0 %	40 %	40 %	20 %	428312418
2503	NC_019738	TCCAG	2	10	5027616	5027625	20 %	20 %	20 %	40 %	428312418
2504	NC_019738	GGGGA	2	10	5030661	5030670	20 %	0 %	80 %	0 %	428312420
2505	NC_019738	TTGGG	2	10	5032085	5032094	0 %	40 %	60 %	0 %	428312420
2506	NC_019738	ATTGC	2	10	5037258	5037267	20 %	40 %	20 %	20 %	428312422
2507	NC_019738	TCAAC	2	10	5037693	5037702	40 %	20 %	0 %	40 %	428312423
2508	NC_019738	GAGTA	2	10	5040438	5040447	40 %	20 %	40 %	0 %	428312425
2509	NC_019738	CAAAT	2	10	5043261	5043270	60 %	20 %	0 %	20 %	428312427
2510	NC_019738	ATCGG	2	10	5045729	5045738	20 %	20 %	40 %	20 %	428312429
2511	NC_019738	TGAGC	2	10	5046592	5046601	20 %	20 %	40 %	20 %	428312431
2512	NC_019738	TACCT	2	10	5050968	5050977	20 %	40 %	0 %	40 %	428312434
2513	NC_019738	TTGCT	2	10	5053946	5053955	0 %	60 %	20 %	20 %	428312436
2514	NC_019738	CACTC	2	10	5054784	5054793	20 %	20 %	0 %	60 %	428312437
2515	NC_019738	GTTTG	2	10	5057384	5057393	0 %	60 %	40 %	0 %	428312439
2516	NC_019738	GTCAG	2	10	5058560	5058569	20 %	20 %	40 %	20 %	428312441
2517	NC_019738	TCACC	2	10	5060320	5060329	20 %	20 %	0 %	60 %	428312442
2518	NC_019738	CAGCG	2	10	5061056	5061065	20 %	0 %	40 %	40 %	428312443
2519	NC_019738	AAATT	2	10	5067377	5067386	60 %	40 %	0 %	0 %	428312449
2520	NC_019738	AGAGG	2	10	5069494	5069503	40 %	0 %	60 %	0 %	428312450
2521	NC_019738	GAAGC	2	10	5070402	5070411	40 %	0 %	40 %	20 %	428312450
2522	NC_019738	GGAAA	2	10	5070455	5070464	60 %	0 %	40 %	0 %	428312450
2523	NC_019738	CTTTA	2	10	5071149	5071158	20 %	60 %	0 %	20 %	428312451
2524	NC_019738	AAACT	2	10	5076692	5076701	60 %	20 %	0 %	20 %	428312453
2525	NC_019738	TTTTC	2	10	5078659	5078668	0 %	80 %	0 %	20 %	428312454
2526	NC_019738	CAGCT	2	10	5080434	5080443	20 %	20 %	20 %	40 %	428312455
2527	NC_019738	AAGAA	2	10	5081043	5081052	80 %	0 %	20 %	0 %	428312456
2528	NC_019738	AACCC	2	10	5081759	5081768	40 %	0 %	0 %	60 %	428312456
2529	NC_019738	TGACG	2	10	5085212	5085221	20 %	20 %	40 %	20 %	428312460
2530	NC_019738	GTAGA	2	10	5089515	5089524	40 %	20 %	40 %	0 %	428312463
2531	NC_019738	TCAAC	2	10	5090307	5090316	40 %	20 %	0 %	40 %	428312463
2532	NC_019738	AGTGG	2	10	5091977	5091986	20 %	20 %	60 %	0 %	428312463
2533	NC_019738	AATCA	2	10	5092106	5092115	60 %	20 %	0 %	20 %	428312463
2534	NC_019738	CTCAA	2	10	5094417	5094426	40 %	20 %	0 %	40 %	428312463
2535	NC_019738	TAGGG	2	10	5113779	5113788	20 %	20 %	60 %	0 %	428312479
2536	NC_019738	ATCCG	2	10	5115813	5115822	20 %	20 %	20 %	40 %	428312480
2537	NC_019738	GTGAA	2	10	5119454	5119463	40 %	20 %	40 %	0 %	428312484
2538	NC_019738	GTTTG	2	10	5120639	5120648	0 %	60 %	40 %	0 %	428312485
2539	NC_019738	TCGCG	2	10	5121238	5121247	0 %	20 %	40 %	40 %	428312486
2540	NC_019738	GAATT	2	10	5122543	5122552	40 %	40 %	20 %	0 %	428312486
2541	NC_019738	TTGGC	2	10	5123601	5123610	0 %	40 %	40 %	20 %	428312486
2542	NC_019738	AGTCC	2	10	5125944	5125953	20 %	20 %	20 %	40 %	428312486
2543	NC_019738	TGATT	2	10	5127982	5127991	20 %	60 %	20 %	0 %	428312488
2544	NC_019738	ATTTT	2	10	5129068	5129077	20 %	80 %	0 %	0 %	428312489
2545	NC_019738	ACACC	2	10	5132102	5132111	40 %	0 %	0 %	60 %	428312492
2546	NC_019738	CCAAA	2	10	5132208	5132217	60 %	0 %	0 %	40 %	428312492
2547	NC_019738	GGTCA	2	10	5134231	5134240	20 %	20 %	40 %	20 %	428312492
2548	NC_019738	CAACT	2	10	5135618	5135627	40 %	20 %	0 %	40 %	428312493
2549	NC_019738	CAGCT	2	10	5136641	5136650	20 %	20 %	20 %	40 %	428312493
2550	NC_019738	CGGGG	2	10	5138303	5138312	0 %	0 %	80 %	20 %	428312494
2551	NC_019738	GAGAA	2	10	5140061	5140070	60 %	0 %	40 %	0 %	428312496
2552	NC_019738	AATTT	2	10	5143502	5143511	40 %	60 %	0 %	0 %	428312499
2553	NC_019738	GCAGG	2	10	5145343	5145352	20 %	0 %	60 %	20 %	428312502
2554	NC_019738	TCAGT	2	10	5147608	5147617	20 %	40 %	20 %	20 %	428312503
2555	NC_019738	GAACA	2	10	5147965	5147974	60 %	0 %	20 %	20 %	428312504
2556	NC_019738	GAGCG	2	10	5148607	5148616	20 %	0 %	60 %	20 %	428312504
2557	NC_019738	GTCAA	2	10	5148800	5148809	40 %	20 %	20 %	20 %	428312505
2558	NC_019738	GAGAT	2	10	5154875	5154884	40 %	20 %	40 %	0 %	428312511
2559	NC_019738	GACTC	2	10	5155574	5155583	20 %	20 %	20 %	40 %	428312511
2560	NC_019738	ACTCA	2	10	5156358	5156367	40 %	20 %	0 %	40 %	428312513
2561	NC_019738	CTCGA	2	10	5159662	5159671	20 %	20 %	20 %	40 %	428312519
2562	NC_019738	AGATG	2	10	5159738	5159747	40 %	20 %	40 %	0 %	428312519
2563	NC_019738	AAATC	2	10	5163108	5163117	60 %	20 %	0 %	20 %	428312524
2564	NC_019738	TTGAT	2	10	5163925	5163934	20 %	60 %	20 %	0 %	428312526
2565	NC_019738	GCCTT	2	10	5168316	5168325	0 %	40 %	20 %	40 %	428312531
2566	NC_019738	AGTGG	2	10	5170269	5170278	20 %	20 %	60 %	0 %	428312532
2567	NC_019738	GGCGA	2	10	5171438	5171447	20 %	0 %	60 %	20 %	428312534
2568	NC_019738	GGTGG	2	10	5175500	5175509	0 %	20 %	80 %	0 %	428312538
2569	NC_019738	AGTAA	2	10	5176037	5176046	60 %	20 %	20 %	0 %	428312538
2570	NC_019738	TGGGA	2	10	5187448	5187457	20 %	20 %	60 %	0 %	428312544
2571	NC_019738	TTGTT	2	10	5191781	5191790	0 %	80 %	20 %	0 %	428312548
2572	NC_019738	CGTTC	2	10	5191839	5191848	0 %	40 %	20 %	40 %	428312548
2573	NC_019738	ATTTA	2	10	5193190	5193199	40 %	60 %	0 %	0 %	428312550
2574	NC_019738	GCTGT	2	10	5193603	5193612	0 %	40 %	40 %	20 %	428312551
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2578	NC_019738	TCACC	2	10	5196896	5196905	20 %	20 %	0 %	60 %	428312554
2579	NC_019738	ATCGG	2	10	5196978	5196987	20 %	20 %	40 %	20 %	428312554
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2583	NC_019738	CTACC	2	10	5202723	5202732	20 %	20 %	0 %	60 %	428312561
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2585	NC_019738	CCAGA	2	10	5207153	5207162	40 %	0 %	20 %	40 %	428312565
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2587	NC_019738	ATTGA	2	10	5209170	5209179	40 %	40 %	20 %	0 %	428312567
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2591	NC_019738	CACTC	2	10	5211101	5211110	20 %	20 %	0 %	60 %	428312570
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2593	NC_019738	CACCG	2	10	5211504	5211513	20 %	0 %	20 %	60 %	428312570
2594	NC_019738	CACTC	2	10	5211902	5211911	20 %	20 %	0 %	60 %	428312570
2595	NC_019738	CTTCT	2	10	5213884	5213893	0 %	60 %	0 %	40 %	428312572
2596	NC_019738	TCCAG	2	10	5214707	5214716	20 %	20 %	20 %	40 %	428312572
2597	NC_019738	CCCCG	2	10	5216096	5216105	0 %	0 %	20 %	80 %	428312573
2598	NC_019738	ACTGC	2	10	5221075	5221084	20 %	20 %	20 %	40 %	428312576
2599	NC_019738	TCCAA	2	10	5221482	5221491	40 %	20 %	0 %	40 %	428312576
2600	NC_019738	CATTC	2	10	5226068	5226077	20 %	40 %	0 %	40 %	428312580
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2603	NC_019738	ACGTT	2	10	5230287	5230296	20 %	40 %	20 %	20 %	428312583
2604	NC_019738	TACCG	2	10	5230362	5230371	20 %	20 %	20 %	40 %	428312583
2605	NC_019738	TCAAG	2	10	5235106	5235115	40 %	20 %	20 %	20 %	428312586
2606	NC_019738	CGGTT	2	10	5236722	5236731	0 %	40 %	40 %	20 %	428312588
2607	NC_019738	GCATT	2	10	5237999	5238008	20 %	40 %	20 %	20 %	428312588
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2609	NC_019738	ATTTA	2	10	5242227	5242236	40 %	60 %	0 %	0 %	428312588
2610	NC_019738	CTAGG	2	10	5242529	5242538	20 %	20 %	40 %	20 %	428312588
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2613	NC_019738	GGCAT	2	10	5244841	5244850	20 %	20 %	40 %	20 %	428312590
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2619	NC_019738	TGATG	2	10	5256901	5256910	20 %	40 %	40 %	0 %	428312603
2620	NC_019738	TGATT	2	10	5257391	5257400	20 %	60 %	20 %	0 %	428312604
2621	NC_019738	TGTGA	2	10	5257404	5257413	20 %	40 %	40 %	0 %	428312604
2622	NC_019738	CCCTT	2	10	5260445	5260454	0 %	40 %	0 %	60 %	428312606
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