MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 chromosome

Total Repeats: 3743

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019738	GGCAA	2	10	1078025	1078034	40 %	0 %	40 %	20 %	428309259
502	NC_019738	CGTAC	2	10	1079489	1079498	20 %	20 %	20 %	40 %	428309261
503	NC_019738	ACACC	2	10	1081731	1081740	40 %	0 %	0 %	60 %	428309262
504	NC_019738	ATTCA	2	10	1085696	1085705	40 %	40 %	0 %	20 %	428309262
505	NC_019738	GCATC	2	10	1088510	1088519	20 %	20 %	20 %	40 %	428309265
506	NC_019738	TCACA	2	10	1089599	1089608	40 %	20 %	0 %	40 %	428309266
507	NC_019738	GTGAG	2	10	1089814	1089823	20 %	20 %	60 %	0 %	428309266
508	NC_019738	GTGAG	2	10	1090627	1090636	20 %	20 %	60 %	0 %	428309266
509	NC_019738	CCCGT	2	10	1092370	1092379	0 %	20 %	20 %	60 %	428309268
510	NC_019738	ACCTC	2	10	1094108	1094117	20 %	20 %	0 %	60 %	428309270
511	NC_019738	GTCGG	2	10	1094566	1094575	0 %	20 %	60 %	20 %	428309270
512	NC_019738	AGGCA	2	10	1099607	1099616	40 %	0 %	40 %	20 %	428309277
513	NC_019738	GGCGA	2	10	1100339	1100348	20 %	0 %	60 %	20 %	428309277
514	NC_019738	TTTCT	2	10	1101102	1101111	0 %	80 %	0 %	20 %	428309278
515	NC_019738	GTGCG	2	10	1101266	1101275	0 %	20 %	60 %	20 %	428309278
516	NC_019738	TAAAA	2	10	1102756	1102765	80 %	20 %	0 %	0 %	428309279
517	NC_019738	GCGCC	2	10	1104322	1104331	0 %	0 %	40 %	60 %	428309280
518	NC_019738	TTCGC	2	10	1105155	1105164	0 %	40 %	20 %	40 %	428309281
519	NC_019738	GATCA	2	10	1107500	1107509	40 %	20 %	20 %	20 %	428309282
520	NC_019738	GGTCA	2	10	1110167	1110176	20 %	20 %	40 %	20 %	428309284
521	NC_019738	GGAGG	2	10	1110362	1110371	20 %	0 %	80 %	0 %	428309284
522	NC_019738	GGGAA	2	10	1112660	1112669	40 %	0 %	60 %	0 %	428309286
523	NC_019738	CAAAC	2	10	1113001	1113010	60 %	0 %	0 %	40 %	428309287
524	NC_019738	GGGAT	2	10	1114012	1114021	20 %	20 %	60 %	0 %	428309287
525	NC_019738	GTCGC	2	10	1114367	1114376	0 %	20 %	40 %	40 %	428309288
526	NC_019738	TAACA	2	10	1114532	1114541	60 %	20 %	0 %	20 %	428309288
527	NC_019738	ATTAA	2	10	1115334	1115343	60 %	40 %	0 %	0 %	428309290
528	NC_019738	CCATA	2	10	1118298	1118307	40 %	20 %	0 %	40 %	428309293
529	NC_019738	TTCGT	2	10	1126722	1126731	0 %	60 %	20 %	20 %	428309300
530	NC_019738	AACGG	2	10	1128155	1128164	40 %	0 %	40 %	20 %	428309300
531	NC_019738	GCAAA	2	10	1128565	1128574	60 %	0 %	20 %	20 %	428309301
532	NC_019738	CCCAA	2	10	1130406	1130415	40 %	0 %	0 %	60 %	428309303
533	NC_019738	GGGAT	2	10	1135945	1135954	20 %	20 %	60 %	0 %	428309307
534	NC_019738	CTTGA	2	10	1136457	1136466	20 %	40 %	20 %	20 %	428309307
535	NC_019738	AAATC	2	10	1137394	1137403	60 %	20 %	0 %	20 %	428309308
536	NC_019738	AACTG	2	10	1140330	1140339	40 %	20 %	20 %	20 %	428309310
537	NC_019738	GCTTA	2	10	1144327	1144336	20 %	40 %	20 %	20 %	428309316
538	NC_019738	AATCA	2	10	1146510	1146519	60 %	20 %	0 %	20 %	428309317
539	NC_019738	CGCTT	2	10	1148703	1148712	0 %	40 %	20 %	40 %	428309318
540	NC_019738	GTTGC	2	10	1149465	1149474	0 %	40 %	40 %	20 %	428309318
541	NC_019738	TAACC	2	10	1153173	1153182	40 %	20 %	0 %	40 %	428309322
542	NC_019738	TATTT	3	15	1154845	1154859	20 %	80 %	0 %	0 %	428309324
543	NC_019738	ATTTT	2	10	1155123	1155132	20 %	80 %	0 %	0 %	428309324
544	NC_019738	AAGGA	2	10	1155574	1155583	60 %	0 %	40 %	0 %	428309324
545	NC_019738	CCCTT	2	10	1161069	1161078	0 %	40 %	0 %	60 %	428309332
546	NC_019738	ATCAC	2	10	1164365	1164374	40 %	20 %	0 %	40 %	428309336
547	NC_019738	GAATT	2	10	1168527	1168536	40 %	40 %	20 %	0 %	428309341
548	NC_019738	TTCGT	2	10	1168578	1168587	0 %	60 %	20 %	20 %	428309341
549	NC_019738	ATCGC	2	10	1170237	1170246	20 %	20 %	20 %	40 %	428309343
550	NC_019738	TCCGT	2	10	1170770	1170779	0 %	40 %	20 %	40 %	428309344
551	NC_019738	GAACT	2	10	1174176	1174185	40 %	20 %	20 %	20 %	428309347
552	NC_019738	TGGCA	2	10	1174978	1174987	20 %	20 %	40 %	20 %	428309348
553	NC_019738	AACGA	2	10	1175511	1175520	60 %	0 %	20 %	20 %	428309348
554	NC_019738	CATGG	2	10	1179505	1179514	20 %	20 %	40 %	20 %	428309351
555	NC_019738	GATTT	2	10	1183315	1183324	20 %	60 %	20 %	0 %	428309353
556	NC_019738	TGGGT	2	10	1186742	1186751	0 %	40 %	60 %	0 %	428309353
557	NC_019738	AAAGT	2	10	1188437	1188446	60 %	20 %	20 %	0 %	428309355
558	NC_019738	ATCAA	2	10	1189558	1189567	60 %	20 %	0 %	20 %	428309356
559	NC_019738	TACCC	2	10	1190222	1190231	20 %	20 %	0 %	60 %	428309356
560	NC_019738	GATTT	2	10	1190487	1190496	20 %	60 %	20 %	0 %	428309356
561	NC_019738	CGTCT	2	10	1191190	1191199	0 %	40 %	20 %	40 %	428309356
562	NC_019738	AAAAT	2	10	1191430	1191439	80 %	20 %	0 %	0 %	428309356
563	NC_019738	CCATC	2	10	1191714	1191723	20 %	20 %	0 %	60 %	428309357
564	NC_019738	GAATC	2	10	1191815	1191824	40 %	20 %	20 %	20 %	428309357
565	NC_019738	TTAAC	2	10	1191959	1191968	40 %	40 %	0 %	20 %	428309357
566	NC_019738	GCGTG	2	10	1194877	1194886	0 %	20 %	60 %	20 %	428309359
567	NC_019738	GCTGA	2	10	1195777	1195786	20 %	20 %	40 %	20 %	428309360
568	NC_019738	ATGCC	2	10	1196413	1196422	20 %	20 %	20 %	40 %	428309361
569	NC_019738	TTCCT	2	10	1198983	1198992	0 %	60 %	0 %	40 %	428309363
570	NC_019738	CCATC	2	10	1202012	1202021	20 %	20 %	0 %	60 %	428309366
571	NC_019738	CCCAG	2	10	1205501	1205510	20 %	0 %	20 %	60 %	428309368
572	NC_019738	TTTAC	2	10	1208964	1208973	20 %	60 %	0 %	20 %	428309371
573	NC_019738	ATCGG	2	10	1210039	1210048	20 %	20 %	40 %	20 %	428309371
574	NC_019738	CCTCG	2	10	1210252	1210261	0 %	20 %	20 %	60 %	428309371
575	NC_019738	TTTAT	2	10	1210655	1210664	20 %	80 %	0 %	0 %	428309372
576	NC_019738	CCATC	2	10	1211383	1211392	20 %	20 %	0 %	60 %	428309373
577	NC_019738	AAATT	2	10	1211459	1211468	60 %	40 %	0 %	0 %	428309373
578	NC_019738	GTTTT	2	10	1211629	1211638	0 %	80 %	20 %	0 %	428309373
579	NC_019738	AGGCA	2	10	1211671	1211680	40 %	0 %	40 %	20 %	428309373
580	NC_019738	GCCGT	2	10	1212575	1212584	0 %	20 %	40 %	40 %	428309373
581	NC_019738	GAGGT	2	10	1213010	1213019	20 %	20 %	60 %	0 %	428309373
582	NC_019738	TGAGC	2	10	1215738	1215747	20 %	20 %	40 %	20 %	428309373
583	NC_019738	GTACC	2	10	1216158	1216167	20 %	20 %	20 %	40 %	428309373
584	NC_019738	TTGGC	2	10	1216769	1216778	0 %	40 %	40 %	20 %	428309373
585	NC_019738	TAAAC	2	10	1217981	1217990	60 %	20 %	0 %	20 %	428309373
586	NC_019738	AAAAT	2	10	1218778	1218787	80 %	20 %	0 %	0 %	428309374
587	NC_019738	CCTTG	2	10	1219901	1219910	0 %	40 %	20 %	40 %	428309375
588	NC_019738	GAGAG	2	10	1222039	1222048	40 %	0 %	60 %	0 %	428309376
589	NC_019738	GGCTT	2	10	1222786	1222795	0 %	40 %	40 %	20 %	428309377
590	NC_019738	TTTAT	2	10	1222855	1222864	20 %	80 %	0 %	0 %	428309377
591	NC_019738	GCTTG	2	10	1224526	1224535	0 %	40 %	40 %	20 %	428309380
592	NC_019738	GTGTT	2	10	1224966	1224975	0 %	60 %	40 %	0 %	428309381
593	NC_019738	ATGGG	2	10	1225272	1225281	20 %	20 %	60 %	0 %	428309381
594	NC_019738	TCCTC	2	10	1226114	1226123	0 %	40 %	0 %	60 %	428309383
595	NC_019738	TATTT	2	10	1232325	1232334	20 %	80 %	0 %	0 %	428309393
596	NC_019738	ATTAA	2	10	1232884	1232893	60 %	40 %	0 %	0 %	428309394
597	NC_019738	CATCC	2	10	1233589	1233598	20 %	20 %	0 %	60 %	428309395
598	NC_019738	TGCAC	2	10	1233754	1233763	20 %	20 %	20 %	40 %	428309396
599	NC_019738	ATGAA	2	10	1238152	1238161	60 %	20 %	20 %	0 %	428309399
600	NC_019738	ACCCT	2	10	1239412	1239421	20 %	20 %	0 %	60 %	428309401
601	NC_019738	GGGAT	2	10	1239740	1239749	20 %	20 %	60 %	0 %	428309401
602	NC_019738	CGGGT	2	10	1242628	1242637	0 %	20 %	60 %	20 %	428309404
603	NC_019738	ATGTG	2	10	1247194	1247203	20 %	40 %	40 %	0 %	428309406
604	NC_019738	ACCTT	2	10	1249998	1250007	20 %	40 %	0 %	40 %	428309407
605	NC_019738	GGCTT	2	10	1254013	1254022	0 %	40 %	40 %	20 %	428309411
606	NC_019738	TTTTA	2	10	1254333	1254342	20 %	80 %	0 %	0 %	428309411
607	NC_019738	CATCC	2	10	1258086	1258095	20 %	20 %	0 %	60 %	428309414
608	NC_019738	TTCAA	2	10	1258381	1258390	40 %	40 %	0 %	20 %	428309414
609	NC_019738	GAAGC	2	10	1260103	1260112	40 %	0 %	40 %	20 %	428309414
610	NC_019738	TGGGG	2	10	1260413	1260422	0 %	20 %	80 %	0 %	428309415
611	NC_019738	CAGCC	2	10	1264328	1264337	20 %	0 %	20 %	60 %	428309417
612	NC_019738	TTAGT	2	10	1264804	1264813	20 %	60 %	20 %	0 %	428309417
613	NC_019738	AATCA	2	10	1271321	1271330	60 %	20 %	0 %	20 %	428309423
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615	NC_019738	TCAAT	2	10	1278632	1278641	40 %	40 %	0 %	20 %	428309432
616	NC_019738	AGAGG	2	10	1284810	1284819	40 %	0 %	60 %	0 %	428309436
617	NC_019738	CAGGA	2	10	1285158	1285167	40 %	0 %	40 %	20 %	428309436
618	NC_019738	TTAAT	2	10	1298867	1298876	40 %	60 %	0 %	0 %	428309452
619	NC_019738	ATTTA	2	10	1298886	1298895	40 %	60 %	0 %	0 %	428309452
620	NC_019738	AACCG	2	10	1299438	1299447	40 %	0 %	20 %	40 %	428309452
621	NC_019738	AACTG	2	10	1303048	1303057	40 %	20 %	20 %	20 %	428309455
622	NC_019738	ATTGC	2	10	1303889	1303898	20 %	40 %	20 %	20 %	428309455
623	NC_019738	CCAAA	2	10	1313284	1313293	60 %	0 %	0 %	40 %	428309460
624	NC_019738	AGCAA	2	10	1315850	1315859	60 %	0 %	20 %	20 %	428309463
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