MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 chromosome

Total Repeats: 3743

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_019738	TTTGG	2	10	3012338	3012347	0 %	60 %	40 %	0 %	428310840
1502	NC_019738	ATCCC	2	10	3014599	3014608	20 %	20 %	0 %	60 %	428310842
1503	NC_019738	AATAC	2	10	3024146	3024155	60 %	20 %	0 %	20 %	428310849
1504	NC_019738	ATTGT	2	10	3028927	3028936	20 %	60 %	20 %	0 %	428310851
1505	NC_019738	GTAAT	2	10	3030863	3030872	40 %	40 %	20 %	0 %	428310852
1506	NC_019738	GCTCG	2	10	3030921	3030930	0 %	20 %	40 %	40 %	428310852
1507	NC_019738	TGCCT	2	10	3032222	3032231	0 %	40 %	20 %	40 %	428310853
1508	NC_019738	AAGAA	2	10	3033047	3033056	80 %	0 %	20 %	0 %	428310854
1509	NC_019738	GCAAA	2	10	3033555	3033564	60 %	0 %	20 %	20 %	428310854
1510	NC_019738	AGCCA	2	10	3034618	3034627	40 %	0 %	20 %	40 %	428310855
1511	NC_019738	AGCCA	2	10	3037695	3037704	40 %	0 %	20 %	40 %	428310857
1512	NC_019738	CGCGC	2	10	3040448	3040457	0 %	0 %	40 %	60 %	428310860
1513	NC_019738	GCTTA	2	10	3040460	3040469	20 %	40 %	20 %	20 %	428310860
1514	NC_019738	TTACG	2	10	3040787	3040796	20 %	40 %	20 %	20 %	428310860
1515	NC_019738	GCACA	2	10	3046001	3046010	40 %	0 %	20 %	40 %	428310863
1516	NC_019738	TGCTC	2	10	3046710	3046719	0 %	40 %	20 %	40 %	428310863
1517	NC_019738	TGGGG	2	10	3046807	3046816	0 %	20 %	80 %	0 %	428310863
1518	NC_019738	GATGC	2	10	3054314	3054323	20 %	20 %	40 %	20 %	428310871
1519	NC_019738	GTGAA	2	10	3055279	3055288	40 %	20 %	40 %	0 %	428310872
1520	NC_019738	CCTTA	2	10	3056828	3056837	20 %	40 %	0 %	40 %	428310873
1521	NC_019738	TCAAC	2	10	3057790	3057799	40 %	20 %	0 %	40 %	428310874
1522	NC_019738	CAAGT	2	10	3060889	3060898	40 %	20 %	20 %	20 %	428310877
1523	NC_019738	GAAAT	2	10	3062645	3062654	60 %	20 %	20 %	0 %	428310881
1524	NC_019738	AGATG	2	10	3063246	3063255	40 %	20 %	40 %	0 %	428310881
1525	NC_019738	TAAAG	2	10	3071006	3071015	60 %	20 %	20 %	0 %	428310888
1526	NC_019738	AAGGT	2	10	3071084	3071093	40 %	20 %	40 %	0 %	428310888
1527	NC_019738	ATACT	2	10	3072875	3072884	40 %	40 %	0 %	20 %	428310889
1528	NC_019738	AACTC	2	10	3073655	3073664	40 %	20 %	0 %	40 %	428310889
1529	NC_019738	ATAAC	2	10	3075142	3075151	60 %	20 %	0 %	20 %	428310891
1530	NC_019738	GGAGA	2	10	3078070	3078079	40 %	0 %	60 %	0 %	428310891
1531	NC_019738	TGGCT	2	10	3078194	3078203	0 %	40 %	40 %	20 %	428310891
1532	NC_019738	CTTGT	2	10	3078718	3078727	0 %	60 %	20 %	20 %	428310891
1533	NC_019738	CAAGA	2	10	3079048	3079057	60 %	0 %	20 %	20 %	428310891
1534	NC_019738	TGACC	2	10	3079662	3079671	20 %	20 %	20 %	40 %	428310891
1535	NC_019738	AGGTA	2	10	3083672	3083681	40 %	20 %	40 %	0 %	428310894
1536	NC_019738	TCTAT	2	10	3087719	3087728	20 %	60 %	0 %	20 %	428310898
1537	NC_019738	AATAA	2	10	3089127	3089136	80 %	20 %	0 %	0 %	428310898
1538	NC_019738	AATAA	2	10	3091536	3091545	80 %	20 %	0 %	0 %	428310899
1539	NC_019738	GCACC	2	10	3091799	3091808	20 %	0 %	20 %	60 %	428310899
1540	NC_019738	TCACT	2	10	3092534	3092543	20 %	40 %	0 %	40 %	428310899
1541	NC_019738	TTAAC	2	10	3093494	3093503	40 %	40 %	0 %	20 %	428310899
1542	NC_019738	ATCAA	2	10	3093595	3093604	60 %	20 %	0 %	20 %	428310899
1543	NC_019738	ATCTT	2	10	3093679	3093688	20 %	60 %	0 %	20 %	428310899
1544	NC_019738	TTGAT	2	10	3094671	3094680	20 %	60 %	20 %	0 %	428310900
1545	NC_019738	AGATG	2	10	3095089	3095098	40 %	20 %	40 %	0 %	428310900
1546	NC_019738	ATCGA	2	10	3096193	3096202	40 %	20 %	20 %	20 %	428310901
1547	NC_019738	AGTCC	2	10	3096405	3096414	20 %	20 %	20 %	40 %	428310901
1548	NC_019738	AGTAC	2	10	3098018	3098027	40 %	20 %	20 %	20 %	428310903
1549	NC_019738	TCTAG	2	10	3099317	3099326	20 %	40 %	20 %	20 %	428310903
1550	NC_019738	ATGGC	2	10	3099689	3099698	20 %	20 %	40 %	20 %	428310903
1551	NC_019738	CTGGA	2	10	3103064	3103073	20 %	20 %	40 %	20 %	428310907
1552	NC_019738	GGATT	2	10	3103537	3103546	20 %	40 %	40 %	0 %	428310907
1553	NC_019738	GTTTA	2	10	3103755	3103764	20 %	60 %	20 %	0 %	428310908
1554	NC_019738	TTTGG	2	10	3105731	3105740	0 %	60 %	40 %	0 %	428310910
1555	NC_019738	GTGAT	2	10	3106005	3106014	20 %	40 %	40 %	0 %	428310911
1556	NC_019738	CAAGC	2	10	3107758	3107767	40 %	0 %	20 %	40 %	428310913
1557	NC_019738	AATCC	2	10	3108427	3108436	40 %	20 %	0 %	40 %	428310913
1558	NC_019738	GATGG	2	10	3109365	3109374	20 %	20 %	60 %	0 %	428310914
1559	NC_019738	TTTGG	2	10	3109378	3109387	0 %	60 %	40 %	0 %	428310914
1560	NC_019738	TTCTT	2	10	3113867	3113876	0 %	80 %	0 %	20 %	428310919
1561	NC_019738	GTTTT	2	10	3113992	3114001	0 %	80 %	20 %	0 %	428310919
1562	NC_019738	TTGCC	2	10	3115395	3115404	0 %	40 %	20 %	40 %	428310921
1563	NC_019738	AACCA	2	10	3116939	3116948	60 %	0 %	0 %	40 %	428310922
1564	NC_019738	GAGTT	2	10	3118477	3118486	20 %	40 %	40 %	0 %	428310922
1565	NC_019738	TTGGT	2	10	3119086	3119095	0 %	60 %	40 %	0 %	428310923
1566	NC_019738	ACGAA	2	10	3119489	3119498	60 %	0 %	20 %	20 %	428310923
1567	NC_019738	AGTCC	2	10	3120652	3120661	20 %	20 %	20 %	40 %	428310924
1568	NC_019738	GTGAT	2	10	3125272	3125281	20 %	40 %	40 %	0 %	428310927
1569	NC_019738	GTTTT	2	10	3129498	3129507	0 %	80 %	20 %	0 %	428310929
1570	NC_019738	CAAAA	2	10	3138096	3138105	80 %	0 %	0 %	20 %	428310938
1571	NC_019738	GATTG	2	10	3138392	3138401	20 %	40 %	40 %	0 %	428310939
1572	NC_019738	GTTGG	2	10	3141780	3141789	0 %	40 %	60 %	0 %	428310944
1573	NC_019738	TGTAA	2	10	3142173	3142182	40 %	40 %	20 %	0 %	428310945
1574	NC_019738	CTTGT	2	10	3144663	3144672	0 %	60 %	20 %	20 %	428310947
1575	NC_019738	TCCAA	2	10	3146277	3146286	40 %	20 %	0 %	40 %	428310947
1576	NC_019738	GATTT	2	10	3146589	3146598	20 %	60 %	20 %	0 %	428310947
1577	NC_019738	ACCGA	2	10	3149108	3149117	40 %	0 %	20 %	40 %	428310949
1578	NC_019738	ACTGA	2	10	3150518	3150527	40 %	20 %	20 %	20 %	428310949
1579	NC_019738	CACGG	2	10	3151775	3151784	20 %	0 %	40 %	40 %	428310950
1580	NC_019738	GAACA	2	10	3153368	3153377	60 %	0 %	20 %	20 %	428310951
1581	NC_019738	TAGCT	2	10	3153432	3153441	20 %	40 %	20 %	20 %	428310951
1582	NC_019738	CAGGT	2	10	3153518	3153527	20 %	20 %	40 %	20 %	428310951
1583	NC_019738	CGATT	2	10	3155076	3155085	20 %	40 %	20 %	20 %	428310954
1584	NC_019738	CGTGC	2	10	3155347	3155356	0 %	20 %	40 %	40 %	428310954
1585	NC_019738	ATTTC	2	10	3156293	3156302	20 %	60 %	0 %	20 %	428310954
1586	NC_019738	GGTTG	2	10	3156338	3156347	0 %	40 %	60 %	0 %	428310954
1587	NC_019738	CAAAT	2	10	3157758	3157767	60 %	20 %	0 %	20 %	428310956
1588	NC_019738	GGCAA	2	10	3164110	3164119	40 %	0 %	40 %	20 %	428310960
1589	NC_019738	AAACC	2	10	3164231	3164240	60 %	0 %	0 %	40 %	428310960
1590	NC_019738	CGGCG	2	10	3164290	3164299	0 %	0 %	60 %	40 %	428310960
1591	NC_019738	AATGA	2	10	3164443	3164452	60 %	20 %	20 %	0 %	428310960
1592	NC_019738	ATCCA	2	10	3166642	3166651	40 %	20 %	0 %	40 %	428310963
1593	NC_019738	TTGGT	2	10	3171440	3171449	0 %	60 %	40 %	0 %	428310968
1594	NC_019738	TTCTT	2	10	3171951	3171960	0 %	80 %	0 %	20 %	428310968
1595	NC_019738	TTTGG	2	10	3172552	3172561	0 %	60 %	40 %	0 %	428310969
1596	NC_019738	TATGA	2	10	3173469	3173478	40 %	40 %	20 %	0 %	428310970
1597	NC_019738	CGGAG	2	10	3176835	3176844	20 %	0 %	60 %	20 %	428310972
1598	NC_019738	TGAAA	2	10	3176898	3176907	60 %	20 %	20 %	0 %	428310972
1599	NC_019738	CAACT	2	10	3179053	3179062	40 %	20 %	0 %	40 %	428310975
1600	NC_019738	AACCA	2	10	3180213	3180222	60 %	0 %	0 %	40 %	428310975
1601	NC_019738	TGGCA	2	10	3181620	3181629	20 %	20 %	40 %	20 %	428310977
1602	NC_019738	TGGGA	2	10	3182038	3182047	20 %	20 %	60 %	0 %	428310977
1603	NC_019738	AACTC	2	10	3182318	3182327	40 %	20 %	0 %	40 %	428310977
1604	NC_019738	TGGTA	2	10	3184735	3184744	20 %	40 %	40 %	0 %	428310982
1605	NC_019738	TACCA	2	10	3184913	3184922	40 %	20 %	0 %	40 %	428310982
1606	NC_019738	GGTAA	2	10	3186259	3186268	40 %	20 %	40 %	0 %	428310984
1607	NC_019738	GGGAT	2	10	3186272	3186281	20 %	20 %	60 %	0 %	428310984
1608	NC_019738	AGAAC	2	10	3191571	3191580	60 %	0 %	20 %	20 %	428310987
1609	NC_019738	CGGGT	2	10	3195427	3195436	0 %	20 %	60 %	20 %	428310990
1610	NC_019738	CCACT	2	10	3195583	3195592	20 %	20 %	0 %	60 %	428310990
1611	NC_019738	TCGCC	2	10	3196806	3196815	0 %	20 %	20 %	60 %	428310992
1612	NC_019738	TGAGG	2	10	3200099	3200108	20 %	20 %	60 %	0 %	428310996
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1614	NC_019738	TGCCC	2	10	3203717	3203726	0 %	20 %	20 %	60 %	428310998
1615	NC_019738	CCAAC	2	10	3204710	3204719	40 %	0 %	0 %	60 %	428310998
1616	NC_019738	CCAAT	2	10	3204780	3204789	40 %	20 %	0 %	40 %	428310998
1617	NC_019738	AAGCG	2	10	3204998	3205007	40 %	0 %	40 %	20 %	428310998
1618	NC_019738	TTTTA	2	10	3208355	3208364	20 %	80 %	0 %	0 %	428310998
1619	NC_019738	TGAAC	2	10	3209239	3209248	40 %	20 %	20 %	20 %	428310999
1620	NC_019738	TTTTG	2	10	3212128	3212137	0 %	80 %	20 %	0 %	428310999
1621	NC_019738	TTCCA	2	10	3212746	3212755	20 %	40 %	0 %	40 %	428311001
1622	NC_019738	CTCTG	2	10	3216726	3216735	0 %	40 %	20 %	40 %	428311005
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1994	NC_019738	TTACT	2	10	3954078	3954087	20 %	60 %	0 %	20 %	428311589
1995	NC_019738	AGATA	2	10	3957083	3957092	60 %	20 %	20 %	0 %	428311590
1996	NC_019738	AGCCA	2	10	3957574	3957583	40 %	0 %	20 %	40 %	428311590
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1998	NC_019738	ATCCC	2	10	3964168	3964177	20 %	20 %	0 %	60 %	428311596
1999	NC_019738	TGCTG	2	10	3965697	3965706	0 %	40 %	40 %	20 %	428311597
2000	NC_019738	ACGCA	2	10	3966985	3966994	40 %	0 %	20 %	40 %	428311598

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