MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 chromosome

Total Repeats: 3743

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_019738	TTGGA	2	10	2080571	2080580	20 %	40 %	40 %	0 %	428310074
1002	NC_019738	CAAGC	2	10	2081165	2081174	40 %	0 %	20 %	40 %	428310074
1003	NC_019738	GGAAG	2	10	2082216	2082225	40 %	0 %	60 %	0 %	428310074
1004	NC_019738	GGCAG	2	10	2082667	2082676	20 %	0 %	60 %	20 %	428310074
1005	NC_019738	ACGGT	2	10	2083170	2083179	20 %	20 %	40 %	20 %	428310074
1006	NC_019738	GGGAT	2	10	2083290	2083299	20 %	20 %	60 %	0 %	428310074
1007	NC_019738	CTCAA	2	10	2083972	2083981	40 %	20 %	0 %	40 %	428310075
1008	NC_019738	AACGA	2	10	2084530	2084539	60 %	0 %	20 %	20 %	428310076
1009	NC_019738	TTCGG	2	10	2086472	2086481	0 %	40 %	40 %	20 %	428310078
1010	NC_019738	TTCAG	2	10	2089704	2089713	20 %	40 %	20 %	20 %	428310080
1011	NC_019738	CGCGG	2	10	2091157	2091166	0 %	0 %	60 %	40 %	428310081
1012	NC_019738	ATATT	2	10	2091310	2091319	40 %	60 %	0 %	0 %	428310081
1013	NC_019738	CCCTT	2	10	2091565	2091574	0 %	40 %	0 %	60 %	428310082
1014	NC_019738	TCGGC	2	10	2091865	2091874	0 %	20 %	40 %	40 %	428310082
1015	NC_019738	TTTCG	2	10	2094400	2094409	0 %	60 %	20 %	20 %	428310083
1016	NC_019738	CCTTT	2	10	2094766	2094775	0 %	60 %	0 %	40 %	428310083
1017	NC_019738	TTTCG	2	10	2095466	2095475	0 %	60 %	20 %	20 %	428310084
1018	NC_019738	GTTTG	2	10	2095621	2095630	0 %	60 %	40 %	0 %	428310084
1019	NC_019738	AGGCG	2	10	2098820	2098829	20 %	0 %	60 %	20 %	428310087
1020	NC_019738	CAACC	2	10	2099035	2099044	40 %	0 %	0 %	60 %	428310087
1021	NC_019738	TCAAT	2	10	2099434	2099443	40 %	40 %	0 %	20 %	428310087
1022	NC_019738	ACAGC	2	10	2101113	2101122	40 %	0 %	20 %	40 %	428310089
1023	NC_019738	GAGCT	2	10	2105954	2105963	20 %	20 %	40 %	20 %	428310091
1024	NC_019738	ACCAA	2	10	2106809	2106818	60 %	0 %	0 %	40 %	428310092
1025	NC_019738	ACTTG	2	10	2108839	2108848	20 %	40 %	20 %	20 %	428310095
1026	NC_019738	AAAGA	2	10	2109219	2109228	80 %	0 %	20 %	0 %	428310095
1027	NC_019738	TGTTT	2	10	2113128	2113137	0 %	80 %	20 %	0 %	428310099
1028	NC_019738	GTTTA	2	10	2113599	2113608	20 %	60 %	20 %	0 %	428310099
1029	NC_019738	TTTGG	2	10	2115129	2115138	0 %	60 %	40 %	0 %	428310100
1030	NC_019738	CCATT	2	10	2116127	2116136	20 %	40 %	0 %	40 %	428310101
1031	NC_019738	TGGGG	2	10	2116323	2116332	0 %	20 %	80 %	0 %	428310101
1032	NC_019738	CCAAA	2	10	2120991	2121000	60 %	0 %	0 %	40 %	428310107
1033	NC_019738	TCAGC	2	10	2121723	2121732	20 %	20 %	20 %	40 %	428310107
1034	NC_019738	ACCCG	2	10	2124705	2124714	20 %	0 %	20 %	60 %	428310108
1035	NC_019738	TTCAC	2	10	2127973	2127982	20 %	40 %	0 %	40 %	428310112
1036	NC_019738	GGTGA	2	10	2128377	2128386	20 %	20 %	60 %	0 %	428310113
1037	NC_019738	GTGGG	2	10	2128487	2128496	0 %	20 %	80 %	0 %	428310113
1038	NC_019738	CCCAA	2	10	2128525	2128534	40 %	0 %	0 %	60 %	428310113
1039	NC_019738	TGTCC	2	10	2131005	2131014	0 %	40 %	20 %	40 %	428310115
1040	NC_019738	AAAGA	2	10	2133812	2133821	80 %	0 %	20 %	0 %	428310115
1041	NC_019738	TGCTC	2	10	2134338	2134347	0 %	40 %	20 %	40 %	428310116
1042	NC_019738	ATTTA	2	10	2134953	2134962	40 %	60 %	0 %	0 %	428310117
1043	NC_019738	ACCCA	2	10	2136834	2136843	40 %	0 %	0 %	60 %	428310119
1044	NC_019738	CAGTC	2	10	2138930	2138939	20 %	20 %	20 %	40 %	428310120
1045	NC_019738	GAGCT	2	10	2140067	2140076	20 %	20 %	40 %	20 %	428310122
1046	NC_019738	GTAAC	2	10	2140228	2140237	40 %	20 %	20 %	20 %	428310122
1047	NC_019738	TCCAC	2	10	2140842	2140851	20 %	20 %	0 %	60 %	428310122
1048	NC_019738	GGGCA	2	10	2141698	2141707	20 %	0 %	60 %	20 %	428310123
1049	NC_019738	ACTTG	2	10	2147139	2147148	20 %	40 %	20 %	20 %	428310128
1050	NC_019738	CACGA	2	10	2150107	2150116	40 %	0 %	20 %	40 %	428310131
1051	NC_019738	AAGTG	2	10	2150148	2150157	40 %	20 %	40 %	0 %	428310131
1052	NC_019738	TTAAG	2	10	2156196	2156205	40 %	40 %	20 %	0 %	428310135
1053	NC_019738	GTGGC	2	10	2156587	2156596	0 %	20 %	60 %	20 %	428310135
1054	NC_019738	GGTCT	2	10	2160477	2160486	0 %	40 %	40 %	20 %	428310139
1055	NC_019738	ACCCT	2	10	2161287	2161296	20 %	20 %	0 %	60 %	428310140
1056	NC_019738	AGCCT	2	10	2163379	2163388	20 %	20 %	20 %	40 %	428310141
1057	NC_019738	GGATC	2	10	2164706	2164715	20 %	20 %	40 %	20 %	428310142
1058	NC_019738	ACCCT	2	10	2167173	2167182	20 %	20 %	0 %	60 %	428310144
1059	NC_019738	GGTTA	2	10	2167239	2167248	20 %	40 %	40 %	0 %	428310144
1060	NC_019738	AGAAA	2	10	2167612	2167621	80 %	0 %	20 %	0 %	428310144
1061	NC_019738	TTGCT	2	10	2169018	2169027	0 %	60 %	20 %	20 %	428310146
1062	NC_019738	AGACC	2	10	2170723	2170732	40 %	0 %	20 %	40 %	428310147
1063	NC_019738	ATATT	2	10	2172251	2172260	40 %	60 %	0 %	0 %	428310148
1064	NC_019738	CCCTC	2	10	2178059	2178068	0 %	20 %	0 %	80 %	428310153
1065	NC_019738	GCGAT	2	10	2179433	2179442	20 %	20 %	40 %	20 %	428310153
1066	NC_019738	AACCC	2	10	2182118	2182127	40 %	0 %	0 %	60 %	428310154
1067	NC_019738	GTACA	2	10	2182185	2182194	40 %	20 %	20 %	20 %	428310154
1068	NC_019738	CAAAA	2	10	2182216	2182225	80 %	0 %	0 %	20 %	428310154
1069	NC_019738	TTACC	2	10	2184886	2184895	20 %	40 %	0 %	40 %	428310156
1070	NC_019738	TTTCA	2	10	2188000	2188009	20 %	60 %	0 %	20 %	428310159
1071	NC_019738	AATTA	2	10	2188156	2188165	60 %	40 %	0 %	0 %	428310159
1072	NC_019738	CTTTA	2	10	2190167	2190176	20 %	60 %	0 %	20 %	428310161
1073	NC_019738	TGCAA	2	10	2191985	2191994	40 %	20 %	20 %	20 %	428310163
1074	NC_019738	CGTGA	2	10	2194567	2194576	20 %	20 %	40 %	20 %	428310165
1075	NC_019738	CACTG	2	10	2196921	2196930	20 %	20 %	20 %	40 %	428310166
1076	NC_019738	ATTAT	2	10	2200472	2200481	40 %	60 %	0 %	0 %	428310168
1077	NC_019738	CAAGC	2	10	2200617	2200626	40 %	0 %	20 %	40 %	428310168
1078	NC_019738	AATCT	2	10	2203114	2203123	40 %	40 %	0 %	20 %	428310172
1079	NC_019738	GCCGA	2	10	2204115	2204124	20 %	0 %	40 %	40 %	428310173
1080	NC_019738	GATGC	2	10	2204533	2204542	20 %	20 %	40 %	20 %	428310173
1081	NC_019738	GTTAC	2	10	2208369	2208378	20 %	40 %	20 %	20 %	428310177
1082	NC_019738	TATTC	2	10	2209896	2209905	20 %	60 %	0 %	20 %	428310177
1083	NC_019738	GGGGC	2	10	2210230	2210239	0 %	0 %	80 %	20 %	428310178
1084	NC_019738	GGTAT	2	10	2210241	2210250	20 %	40 %	40 %	0 %	428310178
1085	NC_019738	GGTTT	2	10	2211247	2211256	0 %	60 %	40 %	0 %	428310178
1086	NC_019738	CCAAC	2	10	2211535	2211544	40 %	0 %	0 %	60 %	428310178
1087	NC_019738	GGTTG	2	10	2213754	2213763	0 %	40 %	60 %	0 %	428310179
1088	NC_019738	TCTGC	2	10	2215174	2215183	0 %	40 %	20 %	40 %	428310180
1089	NC_019738	ATTTC	2	10	2218009	2218018	20 %	60 %	0 %	20 %	428310181
1090	NC_019738	GAATT	2	10	2219221	2219230	40 %	40 %	20 %	0 %	428310181
1091	NC_019738	GCTAA	2	10	2219262	2219271	40 %	20 %	20 %	20 %	428310181
1092	NC_019738	TAACC	2	10	2219381	2219390	40 %	20 %	0 %	40 %	428310181
1093	NC_019738	TCATG	2	10	2219999	2220008	20 %	40 %	20 %	20 %	428310181
1094	NC_019738	TATTT	2	10	2220481	2220490	20 %	80 %	0 %	0 %	428310181
1095	NC_019738	TTTTG	2	10	2225803	2225812	0 %	80 %	20 %	0 %	428310185
1096	NC_019738	CGCAG	2	10	2226154	2226163	20 %	0 %	40 %	40 %	428310185
1097	NC_019738	TGAGC	2	10	2226670	2226679	20 %	20 %	40 %	20 %	428310185
1098	NC_019738	CCAAC	2	10	2228665	2228674	40 %	0 %	0 %	60 %	428310185
1099	NC_019738	CACTT	2	10	2229880	2229889	20 %	40 %	0 %	40 %	428310186
1100	NC_019738	CCGTT	2	10	2234817	2234826	0 %	40 %	20 %	40 %	428310186
1101	NC_019738	TCAGG	2	10	2236750	2236759	20 %	20 %	40 %	20 %	428310189
1102	NC_019738	GGCTA	2	10	2236847	2236856	20 %	20 %	40 %	20 %	428310189
1103	NC_019738	CAATC	2	10	2237015	2237024	40 %	20 %	0 %	40 %	428310189
1104	NC_019738	GTTCA	2	10	2239094	2239103	20 %	40 %	20 %	20 %	428310191
1105	NC_019738	GGATT	2	10	2240344	2240353	20 %	40 %	40 %	0 %	428310193
1106	NC_019738	GATGT	4	20	2244516	2244535	20 %	40 %	40 %	0 %	428310197
1107	NC_019738	CAGTT	2	10	2244902	2244911	20 %	40 %	20 %	20 %	428310198
1108	NC_019738	TCCAC	2	10	2246537	2246546	20 %	20 %	0 %	60 %	428310199
1109	NC_019738	CCCCA	2	10	2246757	2246766	20 %	0 %	0 %	80 %	428310199
1110	NC_019738	TGTTC	2	10	2253122	2253131	0 %	60 %	20 %	20 %	428310207
1111	NC_019738	GCATT	2	10	2253566	2253575	20 %	40 %	20 %	20 %	428310207
1112	NC_019738	GATCT	2	10	2253610	2253619	20 %	40 %	20 %	20 %	428310207
1113	NC_019738	TGAGT	2	10	2256893	2256902	20 %	40 %	40 %	0 %	428310211
1114	NC_019738	TGGGC	2	10	2257873	2257882	0 %	20 %	60 %	20 %	428310212
1115	NC_019738	CAAGA	2	10	2261144	2261153	60 %	0 %	20 %	20 %	428310213
1116	NC_019738	TAAGA	2	10	2262219	2262228	60 %	20 %	20 %	0 %	428310214
1117	NC_019738	ATGGC	2	10	2266549	2266558	20 %	20 %	40 %	20 %	428310217
1118	NC_019738	CTGTC	2	10	2267266	2267275	0 %	40 %	20 %	40 %	428310217
1119	NC_019738	CCCTT	2	10	2270116	2270125	0 %	40 %	0 %	60 %	428310219
1120	NC_019738	GCTCT	2	10	2271009	2271018	0 %	40 %	20 %	40 %	428310220
1121	NC_019738	TGCTC	2	10	2271050	2271059	0 %	40 %	20 %	40 %	428310220
1122	NC_019738	CAACT	2	10	2271151	2271160	40 %	20 %	0 %	40 %	428310220
1123	NC_019738	CTATT	2	10	2274180	2274189	20 %	60 %	0 %	20 %	428310222
1124	NC_019738	TTCAG	2	10	2276608	2276617	20 %	40 %	20 %	20 %	428310222
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1240	NC_019738	CTCTA	2	10	2485165	2485174	20 %	40 %	0 %	40 %	428310419
1241	NC_019738	TTCAA	2	10	2487209	2487218	40 %	40 %	0 %	20 %	428310421
1242	NC_019738	CATCA	2	10	2487304	2487313	40 %	20 %	0 %	40 %	428310421
1243	NC_019738	AGTAA	2	10	2487681	2487690	60 %	20 %	20 %	0 %	428310422
1244	NC_019738	GCGAT	2	10	2492015	2492024	20 %	20 %	40 %	20 %	428310426
1245	NC_019738	TTGGC	2	10	2494506	2494515	0 %	40 %	40 %	20 %	428310429
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1366	NC_019738	TACCC	2	10	2727680	2727689	20 %	20 %	0 %	60 %	428310605
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1494	NC_019738	AAGAG	2	10	3002231	3002240	60 %	0 %	40 %	0 %	428310833
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1499	NC_019738	TCAAC	2	10	3006602	3006611	40 %	20 %	0 %	40 %	428310837
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