MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methylomicrobium alcaliphilum chromosome

Total Repeats: 47741

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_016112	GCC	2	6	300385	300390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403653
3002	NC_016112	CAG	2	6	300521	300526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403653
3003	NC_016112	GCC	2	6	300654	300659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403653
3004	NC_016112	CAT	2	6	300673	300678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403653
3005	NC_016112	CGG	2	6	300691	300696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403653
3006	NC_016112	TCA	2	6	301438	301443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403654
3007	NC_016112	CGA	2	6	301483	301488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403654
3008	NC_016112	CCG	2	6	301632	301637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403654
3009	NC_016112	GCC	2	6	301704	301709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403654
3010	NC_016112	ATG	3	9	301790	301798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403654
3011	NC_016112	AGT	2	6	301926	301931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403654
3012	NC_016112	GCG	2	6	302086	302091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403654
3013	NC_016112	GTC	2	6	302093	302098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403654
3014	NC_016112	TGA	2	6	302228	302233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403655
3015	NC_016112	CGC	2	6	302304	302309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403655
3016	NC_016112	CGT	2	6	302328	302333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403655
3017	NC_016112	GAA	2	6	302404	302409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403655
3018	NC_016112	TGC	2	6	302445	302450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403655
3019	NC_016112	TTG	2	6	302534	302539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403655
3020	NC_016112	ATC	2	6	302649	302654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403656
3021	NC_016112	CGT	2	6	302726	302731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403656
3022	NC_016112	ATC	2	6	302931	302936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403656
3023	NC_016112	CGT	2	6	302990	302995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403656
3024	NC_016112	TTA	2	6	303159	303164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403656
3025	NC_016112	CCA	2	6	303202	303207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357403656
3026	NC_016112	CGT	2	6	303211	303216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403656
3027	NC_016112	GGC	2	6	303242	303247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403656
3028	NC_016112	TCG	2	6	303282	303287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403656
3029	NC_016112	ATG	2	6	303483	303488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403656
3030	NC_016112	GTT	2	6	303562	303567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403656
3031	NC_016112	CGA	2	6	303805	303810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403656
3032	NC_016112	TCG	2	6	303915	303920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403656
3033	NC_016112	CGG	2	6	303973	303978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403656
3034	NC_016112	ATT	2	6	304071	304076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403657
3035	NC_016112	TTC	2	6	304120	304125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403657
3036	NC_016112	GAT	2	6	304194	304199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403657
3037	NC_016112	CGT	2	6	304488	304493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403657
3038	NC_016112	GTC	2	6	305207	305212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403658
3039	NC_016112	TTC	2	6	305243	305248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403658
3040	NC_016112	GCT	2	6	305393	305398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403658
3041	NC_016112	TTA	2	6	305437	305442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403658
3042	NC_016112	AGT	2	6	305470	305475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403658
3043	NC_016112	CAT	2	6	305791	305796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403658
3044	NC_016112	GCC	2	6	305900	305905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403658
3045	NC_016112	TGA	2	6	305968	305973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403658
3046	NC_016112	TCT	3	9	306005	306013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403658
3047	NC_016112	TTG	2	6	306401	306406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403659
3048	NC_016112	CGG	2	6	306495	306500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403659
3049	NC_016112	ATG	2	6	306668	306673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403659
3050	NC_016112	GAT	2	6	306676	306681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403659
3051	NC_016112	CTT	2	6	306699	306704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403659
3052	NC_016112	TGA	2	6	306717	306722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403659
3053	NC_016112	GGA	2	6	306768	306773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357403659
3054	NC_016112	TGT	2	6	306855	306860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403659
3055	NC_016112	GTT	2	6	306884	306889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403659
3056	NC_016112	CAA	2	6	306923	306928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403659
3057	NC_016112	GAT	2	6	306947	306952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403659
3058	NC_016112	CGA	2	6	306964	306969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403659
3059	NC_016112	GCG	2	6	307127	307132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403659
3060	NC_016112	GAA	2	6	307142	307147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403659
3061	NC_016112	TGT	2	6	307206	307211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403659
3062	NC_016112	CAT	2	6	307495	307500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403659
3063	NC_016112	GGT	2	6	307624	307629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357403659
3064	NC_016112	CGC	2	6	307794	307799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403659
3065	NC_016112	GGT	2	6	307806	307811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357403659
3066	NC_016112	TGC	2	6	307827	307832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403659
3067	NC_016112	GGC	2	6	307837	307842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403659
3068	NC_016112	CCG	2	6	307865	307870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403659
3069	NC_016112	TCA	2	6	308493	308498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403660
3070	NC_016112	ATG	2	6	308768	308773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403660
3071	NC_016112	GGC	2	6	308828	308833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403660
3072	NC_016112	TAC	2	6	308841	308846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403660
3073	NC_016112	ATT	2	6	308854	308859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403660
3074	NC_016112	CGT	2	6	308937	308942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403660
3075	NC_016112	CGG	2	6	310030	310035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403661
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3077	NC_016112	GCG	2	6	310474	310479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403662
3078	NC_016112	CGT	3	9	310535	310543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403662
3079	NC_016112	CGG	2	6	310574	310579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403662
3080	NC_016112	TTC	2	6	310606	310611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403662
3081	NC_016112	GCT	2	6	310619	310624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403662
3082	NC_016112	TGA	2	6	310694	310699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403662
3083	NC_016112	GCC	2	6	310941	310946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403662
3084	NC_016112	CGC	2	6	310967	310972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403662
3085	NC_016112	TGC	2	6	311139	311144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403662
3086	NC_016112	CAC	2	6	311194	311199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357403662
3087	NC_016112	GCT	2	6	311262	311267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403662
3088	NC_016112	CCT	2	6	311275	311280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357403663
3089	NC_016112	GCG	3	9	311301	311309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403663
3090	NC_016112	CAG	2	6	311327	311332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403663
3091	NC_016112	GCG	2	6	311362	311367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403663
3092	NC_016112	ACC	2	6	311424	311429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357403663
3093	NC_016112	GGA	2	6	311564	311569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357403663
3094	NC_016112	TCA	2	6	311619	311624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403663
3095	NC_016112	GCG	3	9	311648	311656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403663
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3099	NC_016112	GTC	2	6	311961	311966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403663
3100	NC_016112	TGG	2	6	312061	312066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357403663
3101	NC_016112	GCC	2	6	312263	312268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403663
3102	NC_016112	CGC	2	6	312349	312354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403663
3103	NC_016112	GGC	2	6	312414	312419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403663
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3105	NC_016112	CGA	2	6	312559	312564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403663
3106	NC_016112	CGA	2	6	312571	312576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403663
3107	NC_016112	GGC	2	6	312678	312683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403663
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3109	NC_016112	TCG	2	6	312735	312740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403663
3110	NC_016112	ATC	2	6	312791	312796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403663
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3112	NC_016112	GCA	2	6	312903	312908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403663
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3115	NC_016112	CCG	2	6	312948	312953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403663
3116	NC_016112	GGA	2	6	313177	313182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357403664
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3118	NC_016112	CAT	2	6	313694	313699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403665
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3232	NC_016112	GTC	2	6	323195	323200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403677
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3237	NC_016112	GCG	2	6	324270	324275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403678
3238	NC_016112	GAT	2	6	324285	324290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403678
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3241	NC_016112	CGC	2	6	324513	324518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403678
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3251	NC_016112	GCT	2	6	325491	325496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403678
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3256	NC_016112	ATC	2	6	325679	325684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403678
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3358	NC_016112	CGT	2	6	335443	335448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403685
3359	NC_016112	CGC	2	6	335452	335457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403685
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