MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Metallosphaera sedula DSM 5348 chromosome

Total Repeats: 22434

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009440	CGA	2	6	345	350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146302786
2	NC_009440	TCC	2	6	401	406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146302786
3	NC_009440	AAG	2	6	451	456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146302786
4	NC_009440	CGG	2	6	695	700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146302786
5	NC_009440	AGG	2	6	709	714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302786
6	NC_009440	AAG	2	6	784	789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146302786
7	NC_009440	TGA	2	6	795	800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146302786
8	NC_009440	ACG	2	6	830	835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146302786
9	NC_009440	GAG	3	9	925	933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302786
10	NC_009440	AAC	2	6	959	964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146302786
11	NC_009440	GGA	2	6	966	971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302786
12	NC_009440	AAG	2	6	979	984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146302786
13	NC_009440	CAT	2	6	1026	1031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146302786
14	NC_009440	AGG	2	6	1075	1080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302786
15	NC_009440	GAA	2	6	1147	1152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146302786
16	NC_009440	CAT	2	6	1242	1247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146302786
17	NC_009440	AGG	2	6	1345	1350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302786
18	NC_009440	ATA	2	6	1360	1365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146302786
19	NC_009440	ATG	2	6	1378	1383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146302786
20	NC_009440	GTG	2	6	1402	1407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146302786
21	NC_009440	GTT	2	6	1438	1443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146302786
22	NC_009440	CCT	2	6	1476	1481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146302786
23	NC_009440	GAT	2	6	1517	1522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146302786
24	NC_009440	TCT	2	6	1653	1658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146302787
25	NC_009440	ATT	2	6	1721	1726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146302787
26	NC_009440	GAT	2	6	1808	1813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146302787
27	NC_009440	GAG	2	6	1912	1917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302787
28	NC_009440	TCC	2	6	2090	2095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146302788
29	NC_009440	CTC	2	6	2110	2115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146302788
30	NC_009440	GAG	2	6	2138	2143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302788
31	NC_009440	TCG	2	6	2180	2185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146302788
32	NC_009440	CCT	2	6	2221	2226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146302788
33	NC_009440	CAT	2	6	2425	2430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146302788
34	NC_009440	CTT	2	6	2498	2503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146302788
35	NC_009440	TTC	2	6	2552	2557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146302788
36	NC_009440	CTC	2	6	2680	2685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146302788
37	NC_009440	CAG	2	6	2754	2759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146302788
38	NC_009440	CCG	2	6	2894	2899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146302788
39	NC_009440	CTA	2	6	2987	2992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146302789
40	NC_009440	TTC	2	6	3085	3090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146302789
41	NC_009440	ACG	2	6	3206	3211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146302789
42	NC_009440	GTT	2	6	3243	3248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146302789
43	NC_009440	ATC	2	6	3322	3327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146302789
44	NC_009440	ATT	2	6	3394	3399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146302789
45	NC_009440	CAT	2	6	3493	3498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146302790
46	NC_009440	CTT	2	6	3502	3507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146302790
47	NC_009440	ACT	2	6	3519	3524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146302790
48	NC_009440	GAA	2	6	3722	3727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146302790
49	NC_009440	CAA	2	6	3836	3841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146302790
50	NC_009440	TCC	2	6	3945	3950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146302790
51	NC_009440	AGG	2	6	3963	3968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302790
52	NC_009440	AGT	2	6	3994	3999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146302790
53	NC_009440	CAC	2	6	4052	4057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146302790
54	NC_009440	TTA	2	6	4183	4188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146302790
55	NC_009440	CAC	2	6	4292	4297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146302791
56	NC_009440	AAG	2	6	4327	4332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146302791
57	NC_009440	TCG	2	6	4348	4353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146302791
58	NC_009440	CTT	2	6	4425	4430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146302791
59	NC_009440	GTC	2	6	4509	4514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146302791
60	NC_009440	TCC	2	6	4531	4536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146302791
61	NC_009440	AGT	2	6	4705	4710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146302791
62	NC_009440	TCC	2	6	5162	5167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146302792
63	NC_009440	AGG	2	6	5185	5190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302792
64	NC_009440	TCC	2	6	5214	5219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146302792
65	NC_009440	GGA	2	6	5223	5228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302792
66	NC_009440	ACC	2	6	5232	5237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146302792
67	NC_009440	TGA	2	6	5251	5256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146302792
68	NC_009440	GAA	2	6	5285	5290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146302792
69	NC_009440	TGT	2	6	5345	5350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146302792
70	NC_009440	TGT	2	6	5353	5358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146302792
71	NC_009440	GGA	2	6	5480	5485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302792
72	NC_009440	GTA	2	6	5575	5580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146302792
73	NC_009440	CTG	2	6	5772	5777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146302792
74	NC_009440	TAC	2	6	5893	5898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146302793
75	NC_009440	TTG	2	6	5937	5942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146302793
76	NC_009440	GAT	2	6	5944	5949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146302793
77	NC_009440	CCT	2	6	5992	5997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146302793
78	NC_009440	AAT	2	6	6055	6060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146302793
79	NC_009440	GAG	2	6	6095	6100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302793
80	NC_009440	AGG	3	9	6167	6175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302793
81	NC_009440	ATA	2	6	6191	6196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146302793
82	NC_009440	TAA	2	6	6236	6241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146302793
83	NC_009440	GAA	2	6	6325	6330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146302794
84	NC_009440	TAA	2	6	6379	6384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146302794
85	NC_009440	GCT	2	6	6452	6457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146302794
86	NC_009440	AGG	3	9	6604	6612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302794
87	NC_009440	AGG	2	6	6813	6818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302794
88	NC_009440	TTC	2	6	6819	6824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146302794
89	NC_009440	CAT	2	6	6829	6834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146302794
90	NC_009440	ATA	2	6	6893	6898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146302794
91	NC_009440	AGA	2	6	7167	7172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146302794
92	NC_009440	TAT	2	6	7349	7354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146302795
93	NC_009440	CTT	2	6	7533	7538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146302795
94	NC_009440	AGG	2	6	7546	7551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302795
95	NC_009440	TTC	2	6	7744	7749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146302795
96	NC_009440	AGA	2	6	7760	7765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146302795
97	NC_009440	GAA	2	6	7803	7808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146302795
98	NC_009440	TGA	2	6	7848	7853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146302796
99	NC_009440	GAT	2	6	7868	7873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146302796
100	NC_009440	ACT	2	6	7934	7939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146302796
101	NC_009440	AGA	2	6	7989	7994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146302796
102	NC_009440	TAA	2	6	8023	8028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146302796
103	NC_009440	TGC	2	6	8110	8115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146302796
104	NC_009440	CCA	2	6	8136	8141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146302796
105	NC_009440	CAA	2	6	8181	8186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146302796
106	NC_009440	GAA	2	6	8239	8244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146302796
107	NC_009440	GGA	2	6	8248	8253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302796
108	NC_009440	GAT	2	6	8294	8299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146302796
109	NC_009440	CTT	2	6	8556	8561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146302796
110	NC_009440	GAC	2	6	8594	8599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146302796
111	NC_009440	GAT	2	6	8612	8617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146302796
112	NC_009440	ATG	3	9	8636	8644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146302796
113	NC_009440	GTA	2	6	8666	8671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146302796
114	NC_009440	GCT	2	6	8684	8689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146302796
115	NC_009440	GAA	2	6	8731	8736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146302796
116	NC_009440	GGC	2	6	9508	9513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146302797
117	NC_009440	GCG	2	6	9542	9547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146302797
118	NC_009440	GCG	2	6	9563	9568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146302797
119	NC_009440	TAG	2	6	9891	9896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146302797
120	NC_009440	GCA	2	6	10037	10042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146302798
121	NC_009440	TTC	2	6	10134	10139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146302798
122	NC_009440	TGA	2	6	10154	10159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146302798
123	NC_009440	TCA	2	6	10369	10374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146302798
124	NC_009440	CCT	2	6	10499	10504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146302798
125	NC_009440	CTT	2	6	10535	10540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146302798
126	NC_009440	TGA	2	6	10589	10594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146302798
127	NC_009440	CTA	2	6	10799	10804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146302798
128	NC_009440	AAT	2	6	10931	10936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146302799
129	NC_009440	GCT	2	6	10966	10971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146302799
130	NC_009440	GCA	2	6	11029	11034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146302799
131	NC_009440	TGT	2	6	11147	11152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146302799
132	NC_009440	CAT	2	6	11480	11485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146302799
133	NC_009440	TCC	2	6	11508	11513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146302799
134	NC_009440	GTC	2	6	11541	11546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146302799
135	NC_009440	CTT	2	6	11781	11786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146302799
136	NC_009440	CTC	2	6	11958	11963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146302799
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139	NC_009440	CTC	2	6	12052	12057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146302799
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153	NC_009440	TAT	2	6	13186	13191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146302800
154	NC_009440	CTT	2	6	13510	13515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146302801
155	NC_009440	TTC	3	9	13545	13553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146302801
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159	NC_009440	TAT	2	6	14011	14016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146302801
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162	NC_009440	GTA	2	6	14191	14196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146302801
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253	NC_009440	TCA	2	6	23956	23961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146302811
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255	NC_009440	GGC	2	6	24095	24100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146302811
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