MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Metallosphaera sedula DSM 5348 chromosome

Total Repeats: 22434

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_009440	TAA	2	6	189701	189706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146303013
2002	NC_009440	GTG	2	6	189825	189830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146303013
2003	NC_009440	CCT	2	6	189985	189990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303013
2004	NC_009440	GAT	2	6	190055	190060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303013
2005	NC_009440	TTC	2	6	190080	190085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146303013
2006	NC_009440	CGT	2	6	190163	190168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146303013
2007	NC_009440	TTC	2	6	190317	190322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146303014
2008	NC_009440	ACC	2	6	190432	190437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146303014
2009	NC_009440	GTA	2	6	190754	190759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303015
2010	NC_009440	CAT	2	6	190791	190796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303015
2011	NC_009440	AGA	2	6	190959	190964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146303016
2012	NC_009440	TAC	2	6	190987	190992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303016
2013	NC_009440	TCA	2	6	191016	191021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303016
2014	NC_009440	CTT	2	6	191038	191043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146303016
2015	NC_009440	AGG	2	6	191046	191051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303016
2016	NC_009440	ATG	2	6	191141	191146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303016
2017	NC_009440	AAT	2	6	191172	191177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146303016
2018	NC_009440	TGG	2	6	191279	191284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146303016
2019	NC_009440	AAG	2	6	191407	191412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146303016
2020	NC_009440	AGG	2	6	191474	191479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303016
2021	NC_009440	CTG	2	6	191768	191773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146303016
2022	NC_009440	ACA	2	6	191807	191812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146303016
2023	NC_009440	AAG	2	6	191833	191838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146303016
2024	NC_009440	TTC	2	6	192080	192085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146303017
2025	NC_009440	AAG	2	6	192143	192148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146303017
2026	NC_009440	CAC	2	6	192284	192289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146303017
2027	NC_009440	TTC	2	6	192300	192305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146303017
2028	NC_009440	TTC	2	6	192390	192395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146303017
2029	NC_009440	TCC	2	6	192417	192422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303017
2030	NC_009440	CTC	2	6	192477	192482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303017
2031	NC_009440	TCT	3	9	192634	192642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146303017
2032	NC_009440	GTT	2	6	192701	192706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146303017
2033	NC_009440	CAA	2	6	192781	192786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146303017
2034	NC_009440	GCA	2	6	192789	192794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146303017
2035	NC_009440	TCT	2	6	192931	192936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146303017
2036	NC_009440	GAG	2	6	193043	193048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303017
2037	NC_009440	CTA	2	6	193108	193113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303017
2038	NC_009440	TAG	2	6	193167	193172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303017
2039	NC_009440	CGT	2	6	193192	193197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146303017
2040	NC_009440	TTC	2	6	193325	193330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146303017
2041	NC_009440	TCT	2	6	193412	193417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146303017
2042	NC_009440	ATG	2	6	193428	193433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303017
2043	NC_009440	TGT	2	6	193678	193683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146303017
2044	NC_009440	AAG	2	6	193691	193696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146303017
2045	NC_009440	CGT	2	6	193702	193707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146303017
2046	NC_009440	CCT	2	6	193884	193889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303018
2047	NC_009440	GAA	2	6	193921	193926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146303018
2048	NC_009440	ATA	2	6	193929	193934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146303018
2049	NC_009440	TGT	2	6	194214	194219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146303018
2050	NC_009440	TCC	2	6	194322	194327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303018
2051	NC_009440	TCT	2	6	194498	194503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146303018
2052	NC_009440	TGA	2	6	194538	194543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303018
2053	NC_009440	AGA	2	6	194789	194794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146303019
2054	NC_009440	CAA	3	9	194802	194810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146303019
2055	NC_009440	GAG	2	6	194871	194876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303019
2056	NC_009440	ATG	2	6	194921	194926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303019
2057	NC_009440	CAT	2	6	194970	194975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303019
2058	NC_009440	GAA	2	6	195190	195195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146303019
2059	NC_009440	TGG	2	6	195210	195215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146303019
2060	NC_009440	GAT	2	6	195242	195247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303019
2061	NC_009440	GTT	2	6	195307	195312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146303019
2062	NC_009440	TCA	2	6	195402	195407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303019
2063	NC_009440	AGA	2	6	195508	195513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146303019
2064	NC_009440	GGT	2	6	195583	195588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146303019
2065	NC_009440	TAG	2	6	195607	195612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303019
2066	NC_009440	ATC	2	6	195619	195624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303019
2067	NC_009440	GGT	2	6	195678	195683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146303020
2068	NC_009440	TCT	2	6	196315	196320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146303021
2069	NC_009440	TCA	2	6	196327	196332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303021
2070	NC_009440	CTA	2	6	196342	196347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303021
2071	NC_009440	TTC	2	6	196462	196467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146303021
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2087	NC_009440	TGA	2	6	198317	198322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303023
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2091	NC_009440	CCT	2	6	199223	199228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303023
2092	NC_009440	GCT	2	6	199374	199379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146303023
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2104	NC_009440	GAC	2	6	200686	200691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146303025
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2106	NC_009440	TCC	2	6	201029	201034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303025
2107	NC_009440	GTA	2	6	201063	201068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303025
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2109	NC_009440	GTA	2	6	201448	201453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303026
2110	NC_009440	TTC	2	6	201479	201484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146303026
2111	NC_009440	TCC	2	6	201515	201520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303026
2112	NC_009440	TCG	2	6	201752	201757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146303026
2113	NC_009440	CTC	2	6	201778	201783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303026
2114	NC_009440	TCC	2	6	202202	202207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303026
2115	NC_009440	GAA	2	6	202571	202576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146303027
2116	NC_009440	AGT	2	6	202609	202614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303027
2117	NC_009440	TCA	2	6	202678	202683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303027
2118	NC_009440	GTT	2	6	202685	202690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146303027
2119	NC_009440	TCC	2	6	202769	202774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303027
2120	NC_009440	GAA	2	6	202838	202843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146303027
2121	NC_009440	AAC	2	6	202859	202864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146303027
2122	NC_009440	AGA	2	6	202866	202871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146303027
2123	NC_009440	TCC	2	6	202901	202906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303027
2124	NC_009440	TCC	2	6	202916	202921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303027
2125	NC_009440	TTG	2	6	203184	203189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146303027
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2132	NC_009440	TCA	2	6	204032	204037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303028
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2147	NC_009440	AGA	2	6	205723	205728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146303031
2148	NC_009440	GTA	2	6	205786	205791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303031
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2239	NC_009440	TAA	2	6	214023	214028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146303039
2240	NC_009440	CTA	2	6	214629	214634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303039
2241	NC_009440	CTC	2	6	214763	214768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303039
2242	NC_009440	CAT	2	6	214777	214782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303039
2243	NC_009440	ACA	2	6	214797	214802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146303039
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2249	NC_009440	GAT	2	6	215526	215531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303040
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2349	NC_009440	CCT	2	6	224768	224773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303052
2350	NC_009440	TCG	2	6	224917	224922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146303052
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2352	NC_009440	CTC	2	6	225087	225092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303052
2353	NC_009440	AGG	3	9	225161	225169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303052
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2355	NC_009440	CCA	2	6	225223	225228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146303052
2356	NC_009440	GAC	2	6	225343	225348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146303052
2357	NC_009440	GAG	2	6	225444	225449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303052
2358	NC_009440	CAT	2	6	225498	225503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303052
2359	NC_009440	GGT	2	6	225627	225632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146303052
2360	NC_009440	TCC	2	6	225690	225695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303052
2361	NC_009440	TCC	2	6	225856	225861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303052
2362	NC_009440	AAT	2	6	225909	225914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146303052
2363	NC_009440	CTC	2	6	226009	226014	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303052
2364	NC_009440	CTC	2	6	226080	226085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303052
2365	NC_009440	ATC	2	6	226116	226121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303052
2366	NC_009440	TCC	2	6	226208	226213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303052
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2370	NC_009440	GTA	2	6	226526	226531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303053
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2387	NC_009440	TCC	2	6	228406	228411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303055
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2474	NC_009440	CAC	2	6	235309	235314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146303061
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2476	NC_009440	GAC	2	6	235504	235509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146303062
2477	NC_009440	AGG	2	6	235586	235591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303062
2478	NC_009440	TCA	2	6	235598	235603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303062
2479	NC_009440	TCT	2	6	235640	235645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146303062
2480	NC_009440	TTG	2	6	235715	235720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146303062
2481	NC_009440	GGA	2	6	235743	235748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303062
2482	NC_009440	CCA	2	6	235833	235838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146303062
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