MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Metallosphaera sedula DSM 5348 chromosome

Total Repeats: 22434

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_009440	GAG	2	6	286353	286358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303114
3002	NC_009440	GAG	2	6	286389	286394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303114
3003	NC_009440	GAA	2	6	286458	286463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146303114
3004	NC_009440	AGG	2	6	286502	286507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303114
3005	NC_009440	TTA	2	6	286625	286630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146303115
3006	NC_009440	GAT	2	6	286645	286650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303115
3007	NC_009440	TGG	2	6	286713	286718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146303115
3008	NC_009440	ACC	3	9	286804	286812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146303115
3009	NC_009440	GCG	2	6	286844	286849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146303115
3010	NC_009440	GTA	2	6	286860	286865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303115
3011	NC_009440	CTC	2	6	286971	286976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303115
3012	NC_009440	TCC	2	6	287018	287023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303115
3013	NC_009440	AGG	2	6	287045	287050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303115
3014	NC_009440	GTA	2	6	287109	287114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303115
3015	NC_009440	TAG	2	6	287238	287243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303115
3016	NC_009440	TGG	2	6	287285	287290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146303115
3017	NC_009440	AGG	2	6	287509	287514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303115
3018	NC_009440	AGG	2	6	287614	287619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303115
3019	NC_009440	AGG	2	6	287644	287649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303115
3020	NC_009440	GGA	2	6	287793	287798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303115
3021	NC_009440	TGA	2	6	287906	287911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303115
3022	NC_009440	ATT	2	6	287932	287937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146303115
3023	NC_009440	TGA	2	6	287954	287959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303115
3024	NC_009440	AGG	2	6	288001	288006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303115
3025	NC_009440	GTT	2	6	288026	288031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146303115
3026	NC_009440	TCG	2	6	288254	288259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146303115
3027	NC_009440	CAC	2	6	288288	288293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146303115
3028	NC_009440	ACG	2	6	288352	288357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146303115
3029	NC_009440	AAC	2	6	288565	288570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146303115
3030	NC_009440	ACT	2	6	288589	288594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303115
3031	NC_009440	AGT	2	6	288855	288860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303116
3032	NC_009440	GAG	2	6	288967	288972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303116
3033	NC_009440	ACT	2	6	289183	289188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303116
3034	NC_009440	CAG	2	6	289191	289196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146303116
3035	NC_009440	GTG	2	6	289342	289347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146303116
3036	NC_009440	AAT	2	6	289395	289400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146303116
3037	NC_009440	GAA	2	6	289491	289496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146303116
3038	NC_009440	CTT	2	6	289601	289606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146303117
3039	NC_009440	GTT	2	6	289688	289693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146303117
3040	NC_009440	AGA	2	6	289954	289959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146303117
3041	NC_009440	CCT	2	6	289976	289981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303117
3042	NC_009440	CAA	2	6	290049	290054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146303117
3043	NC_009440	GTT	2	6	290147	290152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146303117
3044	NC_009440	ATA	2	6	290316	290321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146303117
3045	NC_009440	CAA	2	6	290330	290335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146303117
3046	NC_009440	GAG	2	6	290609	290614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303118
3047	NC_009440	AAG	2	6	290753	290758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146303118
3048	NC_009440	AGG	3	9	290763	290771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303118
3049	NC_009440	ATG	2	6	290802	290807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303118
3050	NC_009440	CAG	2	6	290842	290847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146303118
3051	NC_009440	GAG	2	6	290920	290925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303118
3052	NC_009440	GAG	2	6	290987	290992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303118
3053	NC_009440	GGT	2	6	291038	291043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146303118
3054	NC_009440	GGA	2	6	291136	291141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303118
3055	NC_009440	CTA	2	6	291202	291207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303118
3056	NC_009440	CGG	2	6	291264	291269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146303118
3057	NC_009440	TGA	2	6	291420	291425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303118
3058	NC_009440	GTT	2	6	291475	291480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146303118
3059	NC_009440	GTG	2	6	291816	291821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146303119
3060	NC_009440	TAT	2	6	291946	291951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146303120
3061	NC_009440	TAT	2	6	292099	292104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146303120
3062	NC_009440	CCT	2	6	292112	292117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303120
3063	NC_009440	GAC	2	6	292184	292189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146303120
3064	NC_009440	AAC	2	6	292199	292204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146303120
3065	NC_009440	AGG	2	6	292310	292315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303120
3066	NC_009440	AAG	2	6	292391	292396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146303120
3067	NC_009440	TCA	2	6	292437	292442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303120
3068	NC_009440	GGA	2	6	292465	292470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303120
3069	NC_009440	GGA	2	6	292627	292632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303120
3070	NC_009440	TGG	2	6	292651	292656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146303120
3071	NC_009440	TGA	2	6	292831	292836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303120
3072	NC_009440	GAA	2	6	293065	293070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146303120
3073	NC_009440	TGA	2	6	293073	293078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303120
3074	NC_009440	CGA	2	6	293086	293091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146303120
3075	NC_009440	AGT	2	6	293102	293107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303120
3076	NC_009440	TCC	2	6	293254	293259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303121
3077	NC_009440	TCA	2	6	293276	293281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303121
3078	NC_009440	CTT	2	6	293361	293366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146303121
3079	NC_009440	CAA	2	6	293406	293411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146303121
3080	NC_009440	GAG	2	6	293608	293613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303121
3081	NC_009440	TTG	2	6	293645	293650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146303121
3082	NC_009440	CCT	2	6	293919	293924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303122
3083	NC_009440	AGG	2	6	293967	293972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303122
3084	NC_009440	GAG	2	6	293983	293988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303122
3085	NC_009440	GTA	2	6	294214	294219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303122
3086	NC_009440	TCC	2	6	294244	294249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303122
3087	NC_009440	AGG	2	6	294251	294256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303122
3088	NC_009440	GAA	2	6	294339	294344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146303122
3089	NC_009440	GAA	2	6	294459	294464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146303122
3090	NC_009440	CAA	2	6	294531	294536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146303122
3091	NC_009440	TCC	2	6	294550	294555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303122
3092	NC_009440	ATG	2	6	294614	294619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303122
3093	NC_009440	TCA	2	6	294791	294796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303123
3094	NC_009440	ATG	2	6	294897	294902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303123
3095	NC_009440	CGT	2	6	294903	294908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146303123
3096	NC_009440	TTC	2	6	295034	295039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146303123
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3098	NC_009440	AGG	2	6	295112	295117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303123
3099	NC_009440	GAA	2	6	295154	295159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146303123
3100	NC_009440	CAT	2	6	295296	295301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303124
3101	NC_009440	TAA	2	6	295313	295318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146303124
3102	NC_009440	CTC	2	6	295362	295367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303124
3103	NC_009440	GTC	2	6	295528	295533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146303125
3104	NC_009440	ATG	2	6	295605	295610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303125
3105	NC_009440	AGG	2	6	295703	295708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303125
3106	NC_009440	GGA	2	6	295780	295785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303125
3107	NC_009440	TCC	2	6	295817	295822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303125
3108	NC_009440	CTC	2	6	295838	295843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303125
3109	NC_009440	CGA	2	6	295906	295911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146303125
3110	NC_009440	CAT	2	6	295921	295926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303125
3111	NC_009440	CAC	2	6	296004	296009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146303125
3112	NC_009440	TTG	2	6	296134	296139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146303126
3113	NC_009440	AGA	2	6	296217	296222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146303126
3114	NC_009440	CGT	2	6	296253	296258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146303126
3115	NC_009440	GGT	2	6	296260	296265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146303126
3116	NC_009440	ATG	2	6	296284	296289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303126
3117	NC_009440	CAT	2	6	296314	296319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303126
3118	NC_009440	CAC	2	6	296374	296379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146303126
3119	NC_009440	TGA	2	6	296432	296437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303126
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3239	NC_009440	ACC	2	6	308207	308212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146303140
3240	NC_009440	TTC	2	6	308213	308218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146303140
3241	NC_009440	AGG	2	6	308249	308254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303140
3242	NC_009440	TCC	2	6	308265	308270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303140
3243	NC_009440	AGG	2	6	308274	308279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303140
3244	NC_009440	GAT	2	6	308368	308373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303140
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3247	NC_009440	TAC	2	6	308484	308489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303140
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3270	NC_009440	ACT	2	6	310572	310577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303142
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3327	NC_009440	CAT	2	6	316280	316285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303147
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3340	NC_009440	TCA	2	6	317998	318003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303150
3341	NC_009440	CAT	2	6	318007	318012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303150
3342	NC_009440	TCA	2	6	318037	318042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303150
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3349	NC_009440	TCC	2	6	318822	318827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303151
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3351	NC_009440	TCA	2	6	318996	319001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303151
3352	NC_009440	AAT	2	6	319016	319021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146303151
3353	NC_009440	GGA	2	6	319191	319196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303152
3354	NC_009440	TGG	2	6	319211	319216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146303152
3355	NC_009440	ATG	2	6	319358	319363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303152
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3359	NC_009440	CGT	2	6	319761	319766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146303152
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3474	NC_009440	TCC	2	6	331400	331405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303168
3475	NC_009440	CCT	2	6	331419	331424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303168
3476	NC_009440	TGG	2	6	331456	331461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146303168
3477	NC_009440	TCA	2	6	331592	331597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303168
3478	NC_009440	CTC	2	6	331627	331632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303168
3479	NC_009440	GTG	2	6	331655	331660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146303168
3480	NC_009440	CAT	2	6	331687	331692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303168
3481	NC_009440	CTT	2	6	331723	331728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146303168
3482	NC_009440	TCA	2	6	331845	331850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303168
3483	NC_009440	TGT	2	6	331878	331883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146303168
3484	NC_009440	GTC	2	6	331907	331912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146303168
3485	NC_009440	CCG	2	6	331926	331931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146303168
3486	NC_009440	GGT	2	6	331938	331943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146303168
3487	NC_009440	ACC	2	6	332010	332015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146303168
3488	NC_009440	TCC	2	6	332087	332092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303168
3489	NC_009440	TCC	2	6	332388	332393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303169
3490	NC_009440	CCT	2	6	332445	332450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303169
3491	NC_009440	TCA	2	6	332525	332530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303169
3492	NC_009440	TGA	2	6	332577	332582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303169
3493	NC_009440	TAT	2	6	332662	332667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146303169
3494	NC_009440	TCC	2	6	332746	332751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303169
3495	NC_009440	CTG	2	6	332754	332759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146303169
3496	NC_009440	ATT	2	6	333017	333022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146303169
3497	NC_009440	CCT	2	6	333109	333114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303170
3498	NC_009440	TTC	2	6	333170	333175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146303170
3499	NC_009440	CTT	2	6	333206	333211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146303170
3500	NC_009440	GGA	2	6	333239	333244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303170

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