MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Metallosphaera sedula DSM 5348 chromosome

Total Repeats: 22434

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009440	AAT	2	6	46077	46082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146302835
502	NC_009440	CGG	2	6	46291	46296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146302836
503	NC_009440	ATC	2	6	46337	46342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146302836
504	NC_009440	CTT	2	6	46360	46365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146302836
505	NC_009440	CAC	2	6	46408	46413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146302836
506	NC_009440	TCT	2	6	46594	46599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146302836
507	NC_009440	CAT	2	6	46685	46690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146302836
508	NC_009440	GGA	2	6	46772	46777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302836
509	NC_009440	GTA	2	6	46784	46789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146302836
510	NC_009440	CTT	2	6	46840	46845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146302837
511	NC_009440	GTC	2	6	46865	46870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146302837
512	NC_009440	CCT	2	6	46950	46955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146302837
513	NC_009440	CTT	2	6	47046	47051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146302837
514	NC_009440	TCC	2	6	47057	47062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146302837
515	NC_009440	AAC	2	6	47148	47153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146302838
516	NC_009440	CTC	2	6	47230	47235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146302838
517	NC_009440	ATC	2	6	47329	47334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146302838
518	NC_009440	TTC	2	6	47387	47392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146302838
519	NC_009440	CAC	2	6	47423	47428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146302838
520	NC_009440	GTG	2	6	47557	47562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146302838
521	NC_009440	AGT	2	6	47599	47604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146302838
522	NC_009440	AGG	2	6	47748	47753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302838
523	NC_009440	TCC	3	9	47954	47962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146302838
524	NC_009440	TGT	2	6	48080	48085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146302838
525	NC_009440	TTC	2	6	48088	48093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146302838
526	NC_009440	CTT	2	6	48120	48125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146302838
527	NC_009440	AAC	2	6	48160	48165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146302838
528	NC_009440	GGA	2	6	48276	48281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302838
529	NC_009440	TAT	2	6	48330	48335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146302838
530	NC_009440	AGG	2	6	48403	48408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302838
531	NC_009440	GTA	2	6	48454	48459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146302838
532	NC_009440	GAT	2	6	48493	48498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146302838
533	NC_009440	AGG	2	6	48619	48624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302838
534	NC_009440	ATA	2	6	48644	48649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146302838
535	NC_009440	ATA	2	6	48656	48661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146302838
536	NC_009440	ATC	2	6	48718	48723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146302838
537	NC_009440	ATC	2	6	49146	49151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146302839
538	NC_009440	TCC	2	6	49157	49162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146302839
539	NC_009440	TCT	2	6	49166	49171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146302839
540	NC_009440	ACA	2	6	49176	49181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146302839
541	NC_009440	AAG	2	6	49221	49226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146302839
542	NC_009440	CTA	2	6	49227	49232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146302839
543	NC_009440	AGA	2	6	49282	49287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146302839
544	NC_009440	GAG	2	6	49410	49415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302839
545	NC_009440	AGG	2	6	49483	49488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302839
546	NC_009440	TTG	2	6	49735	49740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146302839
547	NC_009440	GAG	2	6	49841	49846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302839
548	NC_009440	ACG	2	6	49903	49908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146302839
549	NC_009440	AGG	2	6	49966	49971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302839
550	NC_009440	AAC	2	6	50113	50118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146302839
551	NC_009440	AGG	2	6	50169	50174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302839
552	NC_009440	AGG	2	6	50318	50323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302839
553	NC_009440	GTG	2	6	50337	50342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146302839
554	NC_009440	AGG	2	6	50350	50355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302839
555	NC_009440	AAG	2	6	50385	50390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146302839
556	NC_009440	AGG	2	6	50434	50439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302839
557	NC_009440	GAA	2	6	50482	50487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146302839
558	NC_009440	AGG	2	6	50553	50558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302839
559	NC_009440	TGG	2	6	50569	50574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146302839
560	NC_009440	AAC	2	6	50628	50633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146302839
561	NC_009440	GGA	2	6	50750	50755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302839
562	NC_009440	AGC	2	6	50809	50814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146302839
563	NC_009440	TAT	2	6	51166	51171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146302839
564	NC_009440	CTA	2	6	51418	51423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146302839
565	NC_009440	GGA	3	9	51485	51493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302839
566	NC_009440	TCA	2	6	51502	51507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146302839
567	NC_009440	ATA	2	6	51650	51655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146302840
568	NC_009440	AAT	2	6	51659	51664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146302840
569	NC_009440	AGG	2	6	51710	51715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302840
570	NC_009440	AAG	2	6	51780	51785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146302840
571	NC_009440	TAG	2	6	51813	51818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146302840
572	NC_009440	TAT	2	6	52006	52011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146302841
573	NC_009440	AGG	2	6	52246	52251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302842
574	NC_009440	TCC	2	6	52450	52455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146302842
575	NC_009440	GAG	2	6	52484	52489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302842
576	NC_009440	ACA	2	6	52532	52537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146302842
577	NC_009440	GAG	2	6	52575	52580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302842
578	NC_009440	GAG	2	6	52589	52594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302842
579	NC_009440	GAA	2	6	52874	52879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146302842
580	NC_009440	ATG	2	6	52880	52885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146302842
581	NC_009440	TCT	2	6	52944	52949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146302843
582	NC_009440	AAG	2	6	52952	52957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146302843
583	NC_009440	GAG	2	6	53006	53011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302843
584	NC_009440	CAT	2	6	53065	53070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146302843
585	NC_009440	TCC	2	6	53230	53235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146302843
586	NC_009440	CTC	2	6	54421	54426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146302844
587	NC_009440	ACC	2	6	54467	54472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146302844
588	NC_009440	CAC	2	6	54790	54795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146302844
589	NC_009440	CAA	2	6	54820	54825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146302844
590	NC_009440	TCA	2	6	54831	54836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146302844
591	NC_009440	CTC	3	9	55078	55086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146302844
592	NC_009440	TAT	2	6	55144	55149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146302844
593	NC_009440	TCA	2	6	55220	55225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146302844
594	NC_009440	TTA	2	6	55239	55244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146302844
595	NC_009440	TCC	2	6	55373	55378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146302844
596	NC_009440	GTT	2	6	55441	55446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146302844
597	NC_009440	GAA	2	6	55498	55503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146302844
598	NC_009440	GAG	2	6	55648	55653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302844
599	NC_009440	CTT	2	6	55689	55694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146302844
600	NC_009440	CCT	2	6	55695	55700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146302844
601	NC_009440	AGA	2	6	55761	55766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146302844
602	NC_009440	CAA	2	6	57222	57227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146302845
603	NC_009440	GAG	2	6	57241	57246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302845
604	NC_009440	CGA	2	6	57342	57347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146302845
605	NC_009440	TCC	2	6	57636	57641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146302845
606	NC_009440	GTC	2	6	57651	57656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146302845
607	NC_009440	GGA	2	6	57699	57704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302845
608	NC_009440	CTA	2	6	57788	57793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146302845
609	NC_009440	TCT	2	6	57810	57815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146302845
610	NC_009440	CCA	2	6	57950	57955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146302845
611	NC_009440	TCC	2	6	57970	57975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146302845
612	NC_009440	TCC	2	6	58078	58083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146302845
613	NC_009440	ACG	3	9	58124	58132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146302845
614	NC_009440	GGT	2	6	58197	58202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146302845
615	NC_009440	CGT	2	6	58236	58241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146302845
616	NC_009440	CGA	2	6	58242	58247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146302845
617	NC_009440	GTT	2	6	58280	58285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146302845
618	NC_009440	CAG	2	6	58351	58356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146302845
619	NC_009440	CCA	2	6	58403	58408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146302845
620	NC_009440	CGA	2	6	58413	58418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146302845
621	NC_009440	GAG	2	6	58507	58512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302845
622	NC_009440	AGG	2	6	58541	58546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302845
623	NC_009440	AAG	2	6	58995	59000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146302846
624	NC_009440	CTT	2	6	59026	59031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146302846
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626	NC_009440	AGG	2	6	59324	59329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302847
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