MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Metallosphaera sedula DSM 5348 chromosome

Total Repeats: 22434

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_009440	GAG	2	6	237669	237674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303062
2502	NC_009440	AGG	2	6	237858	237863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303063
2503	NC_009440	CGT	2	6	237898	237903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146303063
2504	NC_009440	GTC	2	6	237918	237923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146303063
2505	NC_009440	GGA	2	6	237969	237974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303063
2506	NC_009440	ACA	2	6	238003	238008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146303063
2507	NC_009440	CTC	2	6	238011	238016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303063
2508	NC_009440	TCC	2	6	238216	238221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303063
2509	NC_009440	CAC	2	6	238295	238300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146303063
2510	NC_009440	ACC	2	6	238512	238517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146303063
2511	NC_009440	AGC	2	6	238568	238573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146303063
2512	NC_009440	TAG	2	6	238726	238731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303063
2513	NC_009440	GAA	2	6	238808	238813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146303063
2514	NC_009440	GAG	2	6	238833	238838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303063
2515	NC_009440	CCA	2	6	238867	238872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146303063
2516	NC_009440	GTG	2	6	238878	238883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146303063
2517	NC_009440	ACC	2	6	238887	238892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146303063
2518	NC_009440	AGG	2	6	238909	238914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303063
2519	NC_009440	CAC	2	6	238932	238937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146303063
2520	NC_009440	CGA	2	6	238952	238957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146303063
2521	NC_009440	GGA	2	6	238964	238969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303063
2522	NC_009440	CCT	2	6	239103	239108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303064
2523	NC_009440	ATA	2	6	239188	239193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146303064
2524	NC_009440	AGG	2	6	239221	239226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303064
2525	NC_009440	CTG	2	6	239311	239316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146303064
2526	NC_009440	AGG	2	6	239390	239395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303064
2527	NC_009440	GCT	2	6	239431	239436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146303064
2528	NC_009440	ATA	2	6	239461	239466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146303064
2529	NC_009440	AGG	2	6	239576	239581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303064
2530	NC_009440	CTT	2	6	239617	239622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146303064
2531	NC_009440	TAA	2	6	239654	239659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146303064
2532	NC_009440	TGC	2	6	239724	239729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146303064
2533	NC_009440	GGA	2	6	239739	239744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303064
2534	NC_009440	GAT	2	6	239796	239801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303064
2535	NC_009440	TAT	2	6	239901	239906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146303065
2536	NC_009440	GAT	2	6	240151	240156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303065
2537	NC_009440	AAG	2	6	240175	240180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146303065
2538	NC_009440	CCT	2	6	240378	240383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303066
2539	NC_009440	GGA	2	6	240422	240427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303066
2540	NC_009440	AGT	2	6	240469	240474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303066
2541	NC_009440	GCA	2	6	240559	240564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146303066
2542	NC_009440	ATG	2	6	240614	240619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303066
2543	NC_009440	TCC	2	6	240641	240646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303066
2544	NC_009440	TGG	2	6	240699	240704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146303066
2545	NC_009440	AGG	2	6	240744	240749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303066
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2547	NC_009440	GTA	2	6	240947	240952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303066
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2549	NC_009440	TGG	2	6	240985	240990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146303066
2550	NC_009440	AGG	2	6	240999	241004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303066
2551	NC_009440	AAG	2	6	241145	241150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146303066
2552	NC_009440	GAA	2	6	241525	241530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146303067
2553	NC_009440	ATG	2	6	241554	241559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303067
2554	NC_009440	AGA	2	6	241565	241570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146303067
2555	NC_009440	TTC	2	6	241644	241649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146303067
2556	NC_009440	TCA	2	6	241653	241658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303067
2557	NC_009440	TGT	2	6	241671	241676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146303067
2558	NC_009440	TCC	2	6	241787	241792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303067
2559	NC_009440	TGG	2	6	241797	241802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146303067
2560	NC_009440	CAG	2	6	241817	241822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146303067
2561	NC_009440	ATA	2	6	241832	241837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146303067
2562	NC_009440	GAT	2	6	241907	241912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303067
2563	NC_009440	CGG	2	6	242014	242019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146303067
2564	NC_009440	CAT	2	6	242359	242364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303068
2565	NC_009440	TCT	2	6	242749	242754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146303069
2566	NC_009440	TCA	2	6	242765	242770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303069
2567	NC_009440	TCC	2	6	242779	242784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303069
2568	NC_009440	GTT	2	6	243287	243292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146303070
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2570	NC_009440	CGT	2	6	243413	243418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146303071
2571	NC_009440	AGA	2	6	243487	243492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146303071
2572	NC_009440	TGC	2	6	243638	243643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146303071
2573	NC_009440	CCA	2	6	243751	243756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146303071
2574	NC_009440	ACA	2	6	243890	243895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146303072
2575	NC_009440	AGA	2	6	243998	244003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146303072
2576	NC_009440	GAA	2	6	244006	244011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146303072
2577	NC_009440	AGG	2	6	244181	244186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303073
2578	NC_009440	TTA	2	6	244204	244209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146303073
2579	NC_009440	TGC	2	6	244512	244517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146303073
2580	NC_009440	CGA	2	6	244637	244642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146303073
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2582	NC_009440	TCC	2	6	244979	244984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303073
2583	NC_009440	TCG	2	6	245062	245067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146303073
2584	NC_009440	TGA	2	6	245240	245245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303073
2585	NC_009440	TCT	2	6	245510	245515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146303074
2586	NC_009440	ATA	2	6	245656	245661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146303074
2587	NC_009440	GTG	2	6	245674	245679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146303074
2588	NC_009440	ATT	2	6	245764	245769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146303074
2589	NC_009440	TTC	2	6	245797	245802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146303074
2590	NC_009440	GTG	2	6	245821	245826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146303074
2591	NC_009440	GGT	2	6	245955	245960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146303074
2592	NC_009440	GTA	2	6	246112	246117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303075
2593	NC_009440	CTT	2	6	246195	246200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146303075
2594	NC_009440	TGA	2	6	246308	246313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303075
2595	NC_009440	CTC	2	6	246355	246360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303075
2596	NC_009440	GGA	2	6	246361	246366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303075
2597	NC_009440	GGT	2	6	246377	246382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146303075
2598	NC_009440	ATT	2	6	246598	246603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146303075
2599	NC_009440	TAT	2	6	246727	246732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146303075
2600	NC_009440	TAC	2	6	246760	246765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303075
2601	NC_009440	TCA	2	6	246861	246866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303075
2602	NC_009440	CGT	2	6	247116	247121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146303075
2603	NC_009440	CAA	2	6	247229	247234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146303075
2604	NC_009440	TAA	2	6	247238	247243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146303075
2605	NC_009440	TGA	2	6	247292	247297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303075
2606	NC_009440	AAG	2	6	247323	247328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146303075
2607	NC_009440	TGG	2	6	247430	247435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146303075
2608	NC_009440	ATC	2	6	247488	247493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303075
2609	NC_009440	TAA	2	6	247569	247574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146303075
2610	NC_009440	AAG	2	6	247602	247607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146303075
2611	NC_009440	GCT	2	6	247756	247761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146303076
2612	NC_009440	CAT	2	6	247899	247904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303076
2613	NC_009440	ATC	2	6	247906	247911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303076
2614	NC_009440	CTT	2	6	248086	248091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146303076
2615	NC_009440	CTT	2	6	248203	248208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146303076
2616	NC_009440	CAT	3	9	248217	248225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303076
2617	NC_009440	AGG	2	6	248333	248338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303076
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2619	NC_009440	TGA	2	6	248399	248404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303076
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2739	NC_009440	GAA	2	6	259748	259753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146303085
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2743	NC_009440	CGT	2	6	260744	260749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146303087
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2980	NC_009440	TCG	2	6	284305	284310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146303114
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