MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mannheimia haemolytica M42548

Total Repeats: 33036

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021082	AAC	2	6	250405	250410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884959
3002	NC_021082	TCA	2	6	250543	250548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884959
3003	NC_021082	CGA	2	6	250574	250579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482884959
3004	NC_021082	CAT	2	6	250581	250586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884959
3005	NC_021082	ATG	2	6	250636	250641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884959
3006	NC_021082	ACA	2	6	250701	250706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884959
3007	NC_021082	CTA	2	6	251132	251137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884959
3008	NC_021082	TAG	2	6	251144	251149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884959
3009	NC_021082	ACA	2	6	251292	251297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3010	NC_021082	GTT	2	6	251300	251305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_021082	ACA	2	6	251331	251336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3012	NC_021082	TAA	2	6	251349	251354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_021082	TCA	2	6	251467	251472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_021082	TGC	2	6	251543	251548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_021082	GTG	2	6	251564	251569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_021082	TAA	2	6	251672	251677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_021082	TAT	3	9	251856	251864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_021082	GAA	2	6	251921	251926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884961
3019	NC_021082	AAC	2	6	252010	252015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884961
3020	NC_021082	CGG	2	6	252363	252368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482884962
3021	NC_021082	ATC	2	6	252398	252403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884962
3022	NC_021082	CAC	2	6	252433	252438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884962
3023	NC_021082	AGA	2	6	252523	252528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884962
3024	NC_021082	GAC	2	6	252546	252551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482884962
3025	NC_021082	GAT	2	6	252568	252573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884962
3026	NC_021082	TCT	2	6	252608	252613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884962
3027	NC_021082	GTT	2	6	252724	252729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884962
3028	NC_021082	AAC	2	6	252933	252938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884962
3029	NC_021082	CGG	2	6	252939	252944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482884962
3030	NC_021082	CGG	2	6	253121	253126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482884962
3031	NC_021082	ACG	2	6	253270	253275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482884962
3032	NC_021082	ACG	2	6	253333	253338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482884962
3033	NC_021082	CGG	2	6	253349	253354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482884962
3034	NC_021082	TAC	2	6	253445	253450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3035	NC_021082	ATT	2	6	253544	253549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_021082	TGG	2	6	253668	253673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_021082	CAA	2	6	253757	253762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_021082	GGT	2	6	253983	253988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_021082	TAA	2	6	254039	254044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884963
3040	NC_021082	AGC	2	6	254132	254137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482884963
3041	NC_021082	TGA	2	6	254312	254317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884963
3042	NC_021082	TTA	2	6	254647	254652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884964
3043	NC_021082	TGG	3	9	254706	254714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482884964
3044	NC_021082	ATC	2	6	254719	254724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884964
3045	NC_021082	CCG	2	6	254764	254769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482884964
3046	NC_021082	CAT	2	6	254798	254803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884964
3047	NC_021082	ATT	3	9	254812	254820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884964
3048	NC_021082	CAT	2	6	254845	254850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884964
3049	NC_021082	TGG	2	6	254927	254932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482884964
3050	NC_021082	GCC	2	6	254936	254941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482884964
3051	NC_021082	ACG	2	6	255052	255057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482884964
3052	NC_021082	ATC	2	6	255073	255078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884964
3053	NC_021082	ATT	2	6	255257	255262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884964
3054	NC_021082	GCC	2	6	255340	255345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482884964
3055	NC_021082	GTA	2	6	255635	255640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884965
3056	NC_021082	CGG	2	6	255742	255747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482884965
3057	NC_021082	CAG	2	6	255813	255818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482884965
3058	NC_021082	GTG	2	6	255989	255994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482884965
3059	NC_021082	ACC	2	6	256127	256132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884965
3060	NC_021082	ACT	2	6	256156	256161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884965
3061	NC_021082	GAT	2	6	256171	256176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884965
3062	NC_021082	CGG	2	6	256180	256185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482884965
3063	NC_021082	TTC	2	6	256480	256485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884966
3064	NC_021082	TAC	2	6	256561	256566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884966
3065	NC_021082	TGG	2	6	256649	256654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482884966
3066	NC_021082	CAA	2	6	256662	256667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884966
3067	NC_021082	TGG	2	6	256734	256739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482884966
3068	NC_021082	GCC	2	6	256855	256860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482884966
3069	NC_021082	GCC	2	6	256864	256869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482884966
3070	NC_021082	CAA	2	6	257060	257065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884967
3071	NC_021082	ATT	2	6	257226	257231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884967
3072	NC_021082	GCA	2	6	257251	257256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482884967
3073	NC_021082	GAA	2	6	257263	257268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884967
3074	NC_021082	ACA	2	6	257514	257519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884968
3075	NC_021082	ATT	2	6	257523	257528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884968
3076	NC_021082	TGA	2	6	257606	257611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884968
3077	NC_021082	ATC	2	6	257682	257687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884969
3078	NC_021082	ACT	2	6	257830	257835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884970
3079	NC_021082	GAT	2	6	257868	257873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884970
3080	NC_021082	GGC	2	6	258167	258172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482884970
3081	NC_021082	ACA	2	6	258224	258229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884970
3082	NC_021082	GAA	2	6	258452	258457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884970
3083	NC_021082	AGT	2	6	258494	258499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884970
3084	NC_021082	CAC	2	6	258678	258683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884970
3085	NC_021082	ATT	2	6	258701	258706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884970
3086	NC_021082	ATT	2	6	258866	258871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884971
3087	NC_021082	GCT	2	6	259012	259017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884971
3088	NC_021082	TGG	2	6	259097	259102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482884971
3089	NC_021082	CTT	2	6	259535	259540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884971
3090	NC_021082	TGT	2	6	259554	259559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884971
3091	NC_021082	GAA	2	6	259789	259794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884972
3092	NC_021082	TAA	2	6	259813	259818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884972
3093	NC_021082	CCG	2	6	259901	259906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482884972
3094	NC_021082	TGA	2	6	260011	260016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884972
3095	NC_021082	AAT	2	6	260084	260089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884972
3096	NC_021082	ACA	2	6	260150	260155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884972
3097	NC_021082	CAA	2	6	260299	260304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3098	NC_021082	AGC	2	6	260444	260449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3099	NC_021082	CCA	2	6	260492	260497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3100	NC_021082	AGC	2	6	260542	260547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3101	NC_021082	CCA	2	6	260590	260595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3102	NC_021082	CTC	2	6	260608	260613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3103	NC_021082	AGC	2	6	260639	260644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3104	NC_021082	CCA	2	6	260687	260692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3105	NC_021082	TAG	2	6	260741	260746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_021082	TCA	2	6	260779	260784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3107	NC_021082	AGA	2	6	260958	260963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884973
3108	NC_021082	AAG	2	6	261110	261115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884973
3109	NC_021082	AAC	2	6	261167	261172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884973
3110	NC_021082	ATT	2	6	261185	261190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884973
3111	NC_021082	TTA	2	6	261485	261490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884973
3112	NC_021082	CAA	2	6	261501	261506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884973
3113	NC_021082	CCG	2	6	261570	261575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482884973
3114	NC_021082	AGA	2	6	261585	261590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884973
3115	NC_021082	ATA	2	6	261686	261691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884973
3116	NC_021082	ATA	2	6	261758	261763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884973
3117	NC_021082	GTA	2	6	261932	261937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884974
3118	NC_021082	CGG	2	6	261952	261957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482884974
3119	NC_021082	GAA	2	6	262004	262009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884974
3120	NC_021082	GCT	2	6	262030	262035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884974
3121	NC_021082	GCT	2	6	262046	262051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884974
3122	NC_021082	CTT	2	6	262315	262320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884974
3123	NC_021082	ATC	2	6	262376	262381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884974
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3125	NC_021082	CAA	2	6	262421	262426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884974
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3128	NC_021082	TCA	2	6	262512	262517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884975
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3130	NC_021082	CAA	2	6	262753	262758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884975
3131	NC_021082	GAG	2	6	262784	262789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482884975
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3134	NC_021082	CAA	2	6	263287	263292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884975
3135	NC_021082	CAA	2	6	263332	263337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884975
3136	NC_021082	AAT	2	6	263534	263539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3137	NC_021082	AAC	2	6	263566	263571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884976
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3140	NC_021082	TGA	2	6	263758	263763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884976
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3145	NC_021082	GTG	2	6	263959	263964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482884977
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3161	NC_021082	CAA	2	6	265464	265469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3162	NC_021082	ACT	2	6	265565	265570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884980
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3181	NC_021082	GTC	2	6	267324	267329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3186	NC_021082	CAA	2	6	267579	267584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3187	NC_021082	AGC	2	6	267744	267749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3233	NC_021082	CTG	2	6	272439	272444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3243	NC_021082	ATA	2	6	273101	273106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884983
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3245	NC_021082	CTG	2	6	273212	273217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884983
3246	NC_021082	TGG	2	6	273236	273241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482884983
3247	NC_021082	GTC	2	6	273377	273382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884983
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3369	NC_021082	TAC	2	6	283264	283269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884993
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