MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mannheimia haemolytica M42548

Total Repeats: 33036

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021082	CGG	2	6	416377	416382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482885118
5002	NC_021082	CTT	2	6	416428	416433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482885119
5003	NC_021082	TGC	2	6	416477	416482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482885119
5004	NC_021082	TTC	2	6	416494	416499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482885119
5005	NC_021082	TCA	2	6	416554	416559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482885119
5006	NC_021082	TGC	2	6	416588	416593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482885119
5007	NC_021082	AAC	2	6	416615	416620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482885119
5008	NC_021082	GTA	2	6	416652	416657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482885119
5009	NC_021082	ATA	2	6	416692	416697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482885119
5010	NC_021082	CCA	2	6	416771	416776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482885119
5011	NC_021082	TTG	2	6	416812	416817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482885119
5012	NC_021082	TCC	2	6	416829	416834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482885120
5013	NC_021082	TGC	2	6	416974	416979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482885120
5014	NC_021082	GCA	2	6	417051	417056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482885120
5015	NC_021082	TAT	2	6	417193	417198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482885120
5016	NC_021082	AAT	2	6	417200	417205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482885120
5017	NC_021082	ACT	2	6	417252	417257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482885120
5018	NC_021082	CAT	2	6	417359	417364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482885120
5019	NC_021082	TAC	2	6	417568	417573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_021082	TTG	2	6	417584	417589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482885121
5021	NC_021082	CTG	2	6	417601	417606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482885121
5022	NC_021082	TCG	2	6	417697	417702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482885121
5023	NC_021082	GTA	2	6	417719	417724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482885121
5024	NC_021082	AGT	2	6	417742	417747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482885121
5025	NC_021082	CAT	2	6	417751	417756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482885121
5026	NC_021082	CTT	2	6	417994	417999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482885121
5027	NC_021082	CCA	2	6	418078	418083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482885121
5028	NC_021082	TGA	2	6	418229	418234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482885121
5029	NC_021082	ACC	2	6	418298	418303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482885121
5030	NC_021082	ACC	2	6	418317	418322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482885121
5031	NC_021082	TTA	2	6	418611	418616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482885121
5032	NC_021082	ACC	2	6	418625	418630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482885121
5033	NC_021082	CAC	2	6	418633	418638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482885121
5034	NC_021082	TCA	2	6	418651	418656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482885121
5035	NC_021082	CCG	2	6	418764	418769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482885121
5036	NC_021082	GCC	2	6	418796	418801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482885121
5037	NC_021082	CAT	2	6	418853	418858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482885121
5038	NC_021082	TCA	2	6	418920	418925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482885121
5039	NC_021082	CCG	2	6	418996	419001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482885121
5040	NC_021082	TCC	2	6	419027	419032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482885121
5041	NC_021082	ACG	2	6	419063	419068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482885121
5042	NC_021082	CAC	3	9	419161	419169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482885121
5043	NC_021082	CCG	2	6	419218	419223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482885121
5044	NC_021082	ACC	2	6	419228	419233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482885121
5045	NC_021082	CTG	2	6	419236	419241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482885121
5046	NC_021082	GCC	2	6	419310	419315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482885121
5047	NC_021082	AGC	2	6	419321	419326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482885121
5048	NC_021082	CCA	3	9	419334	419342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482885121
5049	NC_021082	TAA	2	6	419519	419524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_021082	ATA	2	6	419735	419740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482885122
5051	NC_021082	TGA	2	6	419945	419950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482885122
5052	NC_021082	ACT	2	6	419976	419981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482885122
5053	NC_021082	TGC	2	6	419982	419987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482885122
5054	NC_021082	GAT	2	6	420121	420126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482885122
5055	NC_021082	CAA	2	6	420133	420138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482885122
5056	NC_021082	CCA	2	6	420218	420223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482885122
5057	NC_021082	TGA	4	12	420267	420278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482885122
5058	NC_021082	TAC	2	6	420436	420441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482885122
5059	NC_021082	TGA	2	6	420486	420491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482885122
5060	NC_021082	CTG	3	9	420943	420951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482885123
5061	NC_021082	CAA	2	6	420958	420963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482885123
5062	NC_021082	TTA	2	6	420974	420979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482885123
5063	NC_021082	TCT	2	6	421021	421026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482885123
5064	NC_021082	AGC	2	6	421154	421159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482885123
5065	NC_021082	ATT	2	6	421173	421178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482885123
5066	NC_021082	CTG	2	6	421183	421188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482885123
5067	NC_021082	GCC	2	6	421258	421263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482885123
5068	NC_021082	ACC	2	6	421379	421384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482885123
5069	NC_021082	TGC	2	6	421517	421522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482885123
5070	NC_021082	CCG	2	6	421583	421588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482885123
5071	NC_021082	GCA	2	6	421710	421715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482885124
5072	NC_021082	AGT	2	6	421722	421727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482885124
5073	NC_021082	CGG	2	6	421792	421797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482885124
5074	NC_021082	GCC	2	6	421805	421810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482885124
5075	NC_021082	CTT	2	6	421870	421875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482885124
5076	NC_021082	ACC	2	6	421884	421889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482885124
5077	NC_021082	TGA	2	6	421904	421909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482885124
5078	NC_021082	ATA	2	6	421911	421916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482885124
5079	NC_021082	CAA	3	9	421967	421975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482885124
5080	NC_021082	CCG	2	6	422046	422051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482885124
5081	NC_021082	TAA	2	6	422222	422227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482885124
5082	NC_021082	GTT	2	6	422242	422247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482885124
5083	NC_021082	AAT	2	6	422264	422269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482885124
5084	NC_021082	CAT	2	6	422319	422324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482885125
5085	NC_021082	AAT	2	6	422331	422336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482885125
5086	NC_021082	CAA	2	6	422344	422349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482885125
5087	NC_021082	AAG	2	6	422591	422596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482885125
5088	NC_021082	AAT	2	6	422665	422670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482885126
5089	NC_021082	CAA	2	6	422785	422790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482885126
5090	NC_021082	CAG	2	6	422806	422811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482885126
5091	NC_021082	TGT	2	6	422843	422848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482885126
5092	NC_021082	ATT	2	6	422960	422965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_021082	TTG	2	6	423127	423132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482885127
5094	NC_021082	ATC	2	6	423144	423149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482885127
5095	NC_021082	CGC	2	6	423350	423355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482885127
5096	NC_021082	CAA	2	6	423423	423428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482885127
5097	NC_021082	GAT	2	6	423461	423466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482885127
5098	NC_021082	ATT	2	6	423633	423638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482885127
5099	NC_021082	TAT	2	6	423930	423935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482885127
5100	NC_021082	GCT	2	6	423944	423949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482885127
5101	NC_021082	TGG	2	6	424029	424034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482885127
5102	NC_021082	CAA	2	6	424185	424190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482885127
5103	NC_021082	AAC	2	6	424228	424233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482885127
5104	NC_021082	GAA	2	6	424368	424373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482885127
5105	NC_021082	ATT	2	6	424409	424414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482885127
5106	NC_021082	ACT	2	6	424433	424438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482885127
5107	NC_021082	CAA	2	6	424562	424567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482885127
5108	NC_021082	AAC	2	6	424612	424617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482885127
5109	NC_021082	ATC	2	6	424629	424634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482885127
5110	NC_021082	CTT	2	6	424664	424669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482885127
5111	NC_021082	GTG	2	6	424782	424787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482885127
5112	NC_021082	TGG	2	6	424849	424854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482885127
5113	NC_021082	GAC	2	6	424860	424865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482885127
5114	NC_021082	ATG	2	6	424936	424941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482885127
5115	NC_021082	AGA	2	6	424958	424963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482885127
5116	NC_021082	TGC	2	6	424978	424983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482885127
5117	NC_021082	CAA	2	6	425099	425104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5118	NC_021082	TGT	2	6	425363	425368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482885128
5119	NC_021082	CGG	3	9	425557	425565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482885128
5120	NC_021082	CCG	2	6	425652	425657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482885129
5121	NC_021082	ATC	2	6	425664	425669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482885129
5122	NC_021082	GCG	2	6	425766	425771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482885129
5123	NC_021082	GGC	2	6	425948	425953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482885129
5124	NC_021082	AAT	2	6	425954	425959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482885129
5125	NC_021082	ATA	2	6	426120	426125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482885129
5126	NC_021082	GCA	2	6	426274	426279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482885129
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5128	NC_021082	GCC	2	6	426548	426553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482885129
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5132	NC_021082	AAC	2	6	426866	426871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482885129
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5138	NC_021082	AAC	2	6	427375	427380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5139	NC_021082	CGC	2	6	427477	427482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482885130
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5154	NC_021082	ACA	2	6	428286	428291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5155	NC_021082	TAA	2	6	428347	428352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482885132
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5188	NC_021082	ACC	3	9	430664	430672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482885134
5189	NC_021082	AAT	2	6	430704	430709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482885134
5190	NC_021082	CTG	2	6	430725	430730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482885134
5191	NC_021082	CAT	2	6	430746	430751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482885134
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5193	NC_021082	TCT	2	6	430916	430921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482885134
5194	NC_021082	TAA	2	6	431035	431040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5195	NC_021082	ATT	2	6	431089	431094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482885135
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5198	NC_021082	CTA	2	6	431410	431415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482885135
5199	NC_021082	AGC	2	6	431430	431435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482885135
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5205	NC_021082	ACA	2	6	432093	432098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5206	NC_021082	GGT	2	6	432144	432149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482885136
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5223	NC_021082	CAA	2	6	433144	433149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482885136
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5225	NC_021082	ACT	2	6	433392	433397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482885136
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5227	NC_021082	TCA	2	6	433975	433980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482885137
5228	NC_021082	AGA	2	6	434046	434051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482885137
5229	NC_021082	ATA	2	6	434171	434176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5230	NC_021082	CAA	2	6	434219	434224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482885138
5231	NC_021082	GAA	2	6	434384	434389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482885138
5232	NC_021082	ACC	2	6	434390	434395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482885138
5233	NC_021082	AAT	2	6	434431	434436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482885138
5234	NC_021082	TGG	2	6	434442	434447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482885138
5235	NC_021082	AGC	2	6	434452	434457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482885138
5236	NC_021082	TAA	2	6	434494	434499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482885138
5237	NC_021082	AGC	2	6	434530	434535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482885138
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5239	NC_021082	TGA	2	6	434622	434627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482885138
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5360	NC_021082	TTA	2	6	445096	445101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482885148
5361	NC_021082	CTT	2	6	445211	445216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482885148
5362	NC_021082	ATA	2	6	445261	445266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482885148
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5364	NC_021082	CAA	2	6	445602	445607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482885148
5365	NC_021082	CAC	2	6	445653	445658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482885148
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5378	NC_021082	ATT	2	6	447236	447241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482885151
5379	NC_021082	TGA	2	6	447269	447274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482885151
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5383	NC_021082	ATT	2	6	447708	447713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482885151
5384	NC_021082	TAA	2	6	447775	447780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5385	NC_021082	ATC	2	6	447895	447900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482885152
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5391	NC_021082	TTC	2	6	448396	448401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482885152
5392	NC_021082	CTG	2	6	448512	448517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482885152
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5422	NC_021082	TGA	2	6	450918	450923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482885154
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5479	NC_021082	TTG	2	6	454984	454989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482885159
5480	NC_021082	GCT	2	6	455182	455187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482885159
5481	NC_021082	TGA	2	6	455244	455249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482885159
5482	NC_021082	GGT	2	6	455406	455411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482885159
5483	NC_021082	CCG	2	6	455423	455428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482885159
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5488	NC_021082	ACA	2	6	455666	455671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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