MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mannheimia haemolytica M42548

Total Repeats: 33036

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33001	NC_021082	ATT	2	6	2728019	2728024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482887495
33002	NC_021082	TTG	2	6	2728065	2728070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482887495
33003	NC_021082	CCA	2	6	2728260	2728265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482887495
33004	NC_021082	ACA	2	6	2728363	2728368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482887495
33005	NC_021082	TGA	2	6	2728531	2728536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482887495
33006	NC_021082	GCA	2	6	2728832	2728837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482887495
33007	NC_021082	ACC	2	6	2728919	2728924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482887495
33008	NC_021082	ATT	2	6	2728943	2728948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482887495
33009	NC_021082	ACC	2	6	2728955	2728960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482887495
33010	NC_021082	TTA	2	6	2729192	2729197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482887495
33011	NC_021082	GTG	2	6	2729234	2729239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482887495
33012	NC_021082	TGA	2	6	2729290	2729295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482887495
33013	NC_021082	AAT	2	6	2729325	2729330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482887495
33014	NC_021082	TTA	2	6	2729353	2729358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482887496
33015	NC_021082	GTC	2	6	2729468	2729473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482887496
33016	NC_021082	CAG	2	6	2729633	2729638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482887496
33017	NC_021082	AAG	2	6	2729639	2729644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482887496
33018	NC_021082	AAG	2	6	2729759	2729764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482887496
33019	NC_021082	TAC	2	6	2730055	2730060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482887497
33020	NC_021082	TAT	2	6	2730086	2730091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482887497
33021	NC_021082	GTG	2	6	2730216	2730221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482887497
33022	NC_021082	CAG	2	6	2730236	2730241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482887497
33023	NC_021082	CAC	2	6	2730443	2730448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482887497
33024	NC_021082	TTA	2	6	2730462	2730467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482887497
33025	NC_021082	GCT	2	6	2730558	2730563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482887497
33026	NC_021082	TAA	2	6	2730769	2730774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482887497
33027	NC_021082	GTA	2	6	2730816	2730821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482887497
33028	NC_021082	GTG	2	6	2731120	2731125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482887497
33029	NC_021082	TAT	2	6	2731150	2731155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482887497
33030	NC_021082	GAA	2	6	2731323	2731328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482887497
33031	NC_021082	GAT	2	6	2731331	2731336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482887497
33032	NC_021082	GCC	2	6	2731356	2731361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482887497
33033	NC_021082	CGG	2	6	2731445	2731450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482887497
33034	NC_021082	TTA	2	6	2731503	2731508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482887497
33035	NC_021082	GAA	2	6	2731686	2731691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482887497
33036	NC_021082	CAA	2	6	2731835	2731840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.