MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mannheimia haemolytica M42548

Total Repeats: 33036

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021082	TGG	2	6	79441	79446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482884775
1002	NC_021082	CGG	2	6	79504	79509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482884775
1003	NC_021082	GTA	2	6	79578	79583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884775
1004	NC_021082	CAG	2	6	79762	79767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482884775
1005	NC_021082	AAG	2	6	79841	79846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884776
1006	NC_021082	TTA	2	6	79937	79942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884776
1007	NC_021082	ACA	2	6	80048	80053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884776
1008	NC_021082	GCG	2	6	80585	80590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482884776
1009	NC_021082	GTT	2	6	80697	80702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884777
1010	NC_021082	GTT	2	6	80706	80711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884777
1011	NC_021082	TTG	2	6	80902	80907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884777
1012	NC_021082	ATC	2	6	80924	80929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884777
1013	NC_021082	ATA	2	6	80959	80964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884777
1014	NC_021082	TGG	2	6	81272	81277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482884777
1015	NC_021082	TAA	2	6	81347	81352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884777
1016	NC_021082	ATT	2	6	81361	81366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884777
1017	NC_021082	GTT	2	6	81561	81566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884777
1018	NC_021082	TGG	3	9	81647	81655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482884777
1019	NC_021082	CTT	2	6	81890	81895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884777
1020	NC_021082	TAT	2	6	81955	81960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884778
1021	NC_021082	TGG	2	6	82000	82005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482884778
1022	NC_021082	GAT	2	6	82046	82051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884778
1023	NC_021082	GAA	2	6	82196	82201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884778
1024	NC_021082	AGC	2	6	82285	82290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482884778
1025	NC_021082	TGT	2	6	82294	82299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884778
1026	NC_021082	TTA	2	6	82431	82436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884778
1027	NC_021082	ACA	2	6	82475	82480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884778
1028	NC_021082	GCA	2	6	82499	82504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482884778
1029	NC_021082	ATG	2	6	82506	82511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884778
1030	NC_021082	TCA	2	6	82755	82760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884778
1031	NC_021082	TTA	2	6	82784	82789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884778
1032	NC_021082	GAA	2	6	82790	82795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884778
1033	NC_021082	ATG	2	6	82805	82810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884778
1034	NC_021082	AGA	2	6	82834	82839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884778
1035	NC_021082	ACA	2	6	83026	83031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884778
1036	NC_021082	ACA	2	6	83098	83103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884778
1037	NC_021082	AGC	2	6	83249	83254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482884779
1038	NC_021082	ATG	3	9	83425	83433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884779
1039	NC_021082	GCA	2	6	83466	83471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482884779
1040	NC_021082	TTG	2	6	83500	83505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884779
1041	NC_021082	TTA	2	6	83565	83570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884779
1042	NC_021082	GAA	2	6	83583	83588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884779
1043	NC_021082	GAA	2	6	83600	83605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884779
1044	NC_021082	GAA	2	6	83637	83642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884779
1045	NC_021082	CTG	2	6	83758	83763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884779
1046	NC_021082	GAT	2	6	83880	83885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884779
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1048	NC_021082	ATT	2	6	84035	84040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884779
1049	NC_021082	ACA	2	6	84122	84127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884779
1050	NC_021082	TAT	2	6	84312	84317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884780
1051	NC_021082	TAA	2	6	84336	84341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884780
1052	NC_021082	TTA	2	6	84392	84397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884780
1053	NC_021082	GAT	2	6	84474	84479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884780
1054	NC_021082	TGA	2	6	84573	84578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884780
1055	NC_021082	CAC	2	6	84719	84724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884780
1056	NC_021082	TGA	2	6	84791	84796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884780
1057	NC_021082	GAA	2	6	84946	84951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884780
1058	NC_021082	TCT	2	6	84976	84981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884780
1059	NC_021082	GAG	2	6	84985	84990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482884780
1060	NC_021082	TTA	2	6	85021	85026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884780
1061	NC_021082	TGA	3	9	85029	85037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884780
1062	NC_021082	TAC	2	6	85211	85216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884780
1063	NC_021082	ATA	2	6	85226	85231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884780
1064	NC_021082	GAA	2	6	85348	85353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884780
1065	NC_021082	AGA	2	6	85404	85409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884780
1066	NC_021082	GCA	2	6	85571	85576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482884780
1067	NC_021082	ACA	2	6	85584	85589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884780
1068	NC_021082	TGG	2	6	85617	85622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482884780
1069	NC_021082	TAT	2	6	85686	85691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884780
1070	NC_021082	TGA	2	6	85695	85700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884780
1071	NC_021082	CTG	2	6	85724	85729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884780
1072	NC_021082	TAT	2	6	85778	85783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884780
1073	NC_021082	CAG	2	6	85822	85827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482884780
1074	NC_021082	AAT	2	6	85852	85857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884780
1075	NC_021082	TGG	2	6	86045	86050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_021082	AAT	2	6	86134	86139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_021082	AAT	2	6	86432	86437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884781
1078	NC_021082	AGC	3	9	86476	86484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482884781
1079	NC_021082	TCG	2	6	86489	86494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884781
1080	NC_021082	GCT	2	6	86524	86529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884781
1081	NC_021082	TTC	2	6	86581	86586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884781
1082	NC_021082	TCA	2	6	86849	86854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884781
1083	NC_021082	GTG	2	6	86982	86987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482884781
1084	NC_021082	TTG	2	6	86990	86995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884781
1085	NC_021082	GTC	2	6	87040	87045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884781
1086	NC_021082	CAC	3	9	87046	87054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884781
1087	NC_021082	AAT	2	6	87091	87096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884781
1088	NC_021082	TAC	2	6	87154	87159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884781
1089	NC_021082	CTT	2	6	87264	87269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884781
1090	NC_021082	GCG	2	6	87437	87442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482884781
1091	NC_021082	CAT	2	6	87501	87506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884781
1092	NC_021082	TGA	2	6	87655	87660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884782
1093	NC_021082	TAC	2	6	87685	87690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884782
1094	NC_021082	AGG	2	6	87851	87856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_021082	CAC	2	6	87885	87890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1096	NC_021082	GTT	2	6	87908	87913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_021082	AGG	2	6	87975	87980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_021082	CAC	2	6	88009	88014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1099	NC_021082	AGG	2	6	88103	88108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_021082	CAC	2	6	88137	88142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1101	NC_021082	AGG	2	6	88227	88232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_021082	CCA	2	6	88260	88265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1103	NC_021082	TAA	2	6	88304	88309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_021082	AAG	2	6	88481	88486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884783
1105	NC_021082	TAC	2	6	88568	88573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884783
1106	NC_021082	ATA	2	6	88575	88580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884783
1107	NC_021082	ATA	2	6	88647	88652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884783
1108	NC_021082	CAC	2	6	88709	88714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884783
1109	NC_021082	GTT	2	6	88718	88723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884783
1110	NC_021082	CGA	2	6	88732	88737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482884783
1111	NC_021082	CAA	2	6	88743	88748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884783
1112	NC_021082	GCT	2	6	88771	88776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884783
1113	NC_021082	CAT	2	6	88923	88928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884783
1114	NC_021082	GCC	2	6	88993	88998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482884783
1115	NC_021082	TCT	2	6	89131	89136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884783
1116	NC_021082	CAG	2	6	89181	89186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482884783
1117	NC_021082	TCA	2	6	89242	89247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884783
1118	NC_021082	GCA	2	6	89290	89295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482884783
1119	NC_021082	CTT	2	6	89360	89365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884783
1120	NC_021082	AAT	2	6	89454	89459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884783
1121	NC_021082	AAG	2	6	89525	89530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884783
1122	NC_021082	AAT	2	6	89534	89539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884783
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1124	NC_021082	GCA	2	6	89596	89601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482884783
1125	NC_021082	CAT	2	6	89609	89614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884783
1126	NC_021082	CTA	2	6	89644	89649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884783
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1128	NC_021082	ATT	2	6	89925	89930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1130	NC_021082	ATT	2	6	89992	89997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_021082	CAC	2	6	90371	90376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1248	NC_021082	AGA	2	6	101091	101096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884796
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1251	NC_021082	TCT	2	6	101178	101183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884796
1252	NC_021082	CGC	2	6	101216	101221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482884796
1253	NC_021082	AGT	2	6	101249	101254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884796
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1260	NC_021082	CTA	2	6	101848	101853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884797
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1363	NC_021082	TTC	2	6	111383	111388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1487	NC_021082	CTG	2	6	123810	123815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884826
1488	NC_021082	ACA	2	6	123869	123874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884826
1489	NC_021082	TAA	2	6	123929	123934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884826
1490	NC_021082	TTC	2	6	124174	124179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884827
1491	NC_021082	TGA	2	6	124280	124285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884827
1492	NC_021082	TCA	2	6	124300	124305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884827
1493	NC_021082	TGT	2	6	124351	124356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884827
1494	NC_021082	GCT	2	6	124386	124391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884827
1495	NC_021082	TCA	2	6	124432	124437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884827
1496	NC_021082	CTT	2	6	124496	124501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884827
1497	NC_021082	ATC	2	6	124518	124523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884827
1498	NC_021082	TCT	2	6	124540	124545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884827
1499	NC_021082	AAT	2	6	124591	124596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884827
1500	NC_021082	TGG	2	6	124610	124615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482884827

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