MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mannheimia haemolytica M42548

Total Repeats: 33036

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_021082	ATA	2	6	210023	210028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884920
2502	NC_021082	TAA	2	6	210306	210311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884920
2503	NC_021082	AAT	2	6	210349	210354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884921
2504	NC_021082	GGT	2	6	210377	210382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482884921
2505	NC_021082	CAC	2	6	210460	210465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884921
2506	NC_021082	CCG	2	6	210499	210504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482884921
2507	NC_021082	TGT	2	6	210516	210521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884921
2508	NC_021082	TGC	2	6	210570	210575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884921
2509	NC_021082	TTG	2	6	210605	210610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884921
2510	NC_021082	CAC	4	12	210620	210631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884921
2511	NC_021082	CCA	2	6	210787	210792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884921
2512	NC_021082	AAT	2	6	211017	211022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884921
2513	NC_021082	ATG	2	6	211177	211182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884921
2514	NC_021082	ATA	2	6	211369	211374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884921
2515	NC_021082	AAT	2	6	211382	211387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884921
2516	NC_021082	TCT	2	6	211449	211454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884921
2517	NC_021082	ATC	2	6	211563	211568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884921
2518	NC_021082	GAA	2	6	211628	211633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2519	NC_021082	TTC	2	6	211891	211896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884922
2520	NC_021082	TGC	2	6	211919	211924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884922
2521	NC_021082	GGT	2	6	211931	211936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482884922
2522	NC_021082	GGC	2	6	212022	212027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482884922
2523	NC_021082	CAG	2	6	212117	212122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482884922
2524	NC_021082	GGT	2	6	212396	212401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482884922
2525	NC_021082	CGC	2	6	212403	212408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482884922
2526	NC_021082	AGC	2	6	212500	212505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482884922
2527	NC_021082	TGA	2	6	212534	212539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884922
2528	NC_021082	ATG	2	6	212664	212669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884922
2529	NC_021082	TCA	2	6	212816	212821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884922
2530	NC_021082	CAA	2	6	212871	212876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884922
2531	NC_021082	AAC	2	6	213119	213124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884922
2532	NC_021082	TTG	2	6	213151	213156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884922
2533	NC_021082	CCA	2	6	213236	213241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884922
2534	NC_021082	AGA	2	6	213287	213292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884922
2535	NC_021082	GTT	2	6	213374	213379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884922
2536	NC_021082	CAA	3	9	213405	213413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884922
2537	NC_021082	CAA	2	6	213426	213431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884922
2538	NC_021082	AGA	2	6	213437	213442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884922
2539	NC_021082	GCA	2	6	213791	213796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482884923
2540	NC_021082	ATC	2	6	213807	213812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884923
2541	NC_021082	CTG	2	6	214107	214112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884924
2542	NC_021082	AAG	2	6	214433	214438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2543	NC_021082	CTG	2	6	214522	214527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2544	NC_021082	TAG	2	6	214559	214564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2545	NC_021082	CCT	2	6	214580	214585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2546	NC_021082	CTA	2	6	214591	214596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2547	NC_021082	GAT	2	6	214599	214604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2548	NC_021082	TGG	2	6	215016	215021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482884925
2549	NC_021082	TTA	2	6	215035	215040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884925
2550	NC_021082	CTC	2	6	215313	215318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482884925
2551	NC_021082	AAC	2	6	215349	215354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884925
2552	NC_021082	AGG	2	6	215388	215393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482884925
2553	NC_021082	TGG	2	6	215628	215633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482884925
2554	NC_021082	ATT	2	6	215646	215651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884925
2555	NC_021082	ATA	2	6	215664	215669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884925
2556	NC_021082	ATT	2	6	215695	215700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2557	NC_021082	TCG	2	6	215787	215792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884926
2558	NC_021082	GTT	2	6	215926	215931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884926
2559	NC_021082	CTG	2	6	215984	215989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884926
2560	NC_021082	AAT	2	6	216011	216016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884926
2561	NC_021082	ATT	2	6	216020	216025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2562	NC_021082	AGA	2	6	216061	216066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884927
2563	NC_021082	GCC	2	6	216116	216121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482884927
2564	NC_021082	ACC	2	6	216257	216262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884927
2565	NC_021082	GCC	2	6	216264	216269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482884927
2566	NC_021082	AGT	2	6	216349	216354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884927
2567	NC_021082	GTG	2	6	216419	216424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482884927
2568	NC_021082	CAA	2	6	216554	216559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884927
2569	NC_021082	TGC	2	6	216793	216798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884927
2570	NC_021082	ACC	2	6	216944	216949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884927
2571	NC_021082	CTC	2	6	217235	217240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482884927
2572	NC_021082	GAA	2	6	217617	217622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2573	NC_021082	TAC	2	6	217640	217645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884928
2574	NC_021082	GCA	3	9	217664	217672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482884928
2575	NC_021082	CAC	2	6	217680	217685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884928
2576	NC_021082	ACC	2	6	218056	218061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884928
2577	NC_021082	AAC	2	6	218128	218133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884928
2578	NC_021082	TTA	2	6	218171	218176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884928
2579	NC_021082	TTG	2	6	218289	218294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884928
2580	NC_021082	GTT	2	6	218414	218419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884928
2581	NC_021082	TTC	2	6	218588	218593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884928
2582	NC_021082	AGA	2	6	218613	218618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884928
2583	NC_021082	CAT	2	6	218625	218630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884928
2584	NC_021082	ACA	2	6	218849	218854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884928
2585	NC_021082	ACC	2	6	219004	219009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884928
2586	NC_021082	GTT	2	6	219019	219024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884928
2587	NC_021082	TTA	2	6	219044	219049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884928
2588	NC_021082	CTT	2	6	219051	219056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884928
2589	NC_021082	TAA	3	9	219060	219068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884928
2590	NC_021082	TGT	2	6	219081	219086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884928
2591	NC_021082	CTT	2	6	219165	219170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884928
2592	NC_021082	CAT	2	6	219309	219314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884928
2593	NC_021082	GTA	2	6	219323	219328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884928
2594	NC_021082	TTG	2	6	219398	219403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884928
2595	NC_021082	ACA	2	6	219407	219412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884928
2596	NC_021082	TCA	2	6	219503	219508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884928
2597	NC_021082	CGT	2	6	219606	219611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884928
2598	NC_021082	TGT	2	6	219835	219840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884928
2599	NC_021082	GAT	2	6	219841	219846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884928
2600	NC_021082	ATA	2	6	219938	219943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884928
2601	NC_021082	ACA	2	6	219959	219964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884928
2602	NC_021082	CTT	2	6	219993	219998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884928
2603	NC_021082	GCC	2	6	220114	220119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482884928
2604	NC_021082	ATT	3	9	220192	220200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884928
2605	NC_021082	TAC	2	6	220201	220206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884928
2606	NC_021082	TGT	2	6	220207	220212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884928
2607	NC_021082	CTT	2	6	220224	220229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884928
2608	NC_021082	CCA	2	6	220364	220369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884928
2609	NC_021082	CAT	2	6	220413	220418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884928
2610	NC_021082	CAT	2	6	220437	220442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884928
2611	NC_021082	CAA	2	6	220548	220553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884928
2612	NC_021082	AAC	2	6	220642	220647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884928
2613	NC_021082	ATT	2	6	220813	220818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884928
2614	NC_021082	CCA	2	6	220844	220849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884928
2615	NC_021082	CAA	2	6	220857	220862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884928
2616	NC_021082	TTG	2	6	220928	220933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884928
2617	NC_021082	TGT	2	6	220960	220965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884928
2618	NC_021082	CTG	2	6	221037	221042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884928
2619	NC_021082	ACC	2	6	221110	221115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884928
2620	NC_021082	CAT	2	6	221160	221165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884928
2621	NC_021082	CAA	2	6	221289	221294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884928
2622	NC_021082	TGT	2	6	221344	221349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884928
2623	NC_021082	CAT	2	6	221400	221405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884928
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2742	NC_021082	CAC	2	6	230216	230221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884934
2743	NC_021082	GTG	2	6	230236	230241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482884934
2744	NC_021082	GAA	2	6	230292	230297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884934
2745	NC_021082	TGG	2	6	230311	230316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482884934
2746	NC_021082	AAC	2	6	230319	230324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884934
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2748	NC_021082	AAC	2	6	230418	230423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884934
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2750	NC_021082	TCA	2	6	230542	230547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884934
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2762	NC_021082	AAT	2	6	231258	231263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884934
2763	NC_021082	CTG	2	6	231265	231270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884934
2764	NC_021082	TGC	2	6	231392	231397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884934
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2772	NC_021082	TAA	2	6	232326	232331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2773	NC_021082	CAT	2	6	232388	232393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884937
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2800	NC_021082	GTT	2	6	234977	234982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2801	NC_021082	GTT	2	6	235223	235228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884939
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2981	NC_021082	TGA	2	6	249062	249067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2982	NC_021082	AAT	2	6	249098	249103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2983	NC_021082	AAT	2	6	249174	249179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2984	NC_021082	ATC	2	6	249182	249187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2985	NC_021082	ATC	2	6	249428	249433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884958
2986	NC_021082	TAT	2	6	249439	249444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884958
2987	NC_021082	TGG	2	6	249504	249509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482884958
2988	NC_021082	GTG	3	9	249638	249646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482884958
2989	NC_021082	ACC	2	6	249722	249727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884958
2990	NC_021082	TGT	2	6	249775	249780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884958
2991	NC_021082	GAT	2	6	249872	249877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884958
2992	NC_021082	GTG	2	6	249902	249907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482884958
2993	NC_021082	ATC	2	6	249959	249964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884958
2994	NC_021082	TGG	2	6	250035	250040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482884958
2995	NC_021082	GAT	2	6	250081	250086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884958
2996	NC_021082	GCC	2	6	250092	250097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482884958
2997	NC_021082	CGG	2	6	250120	250125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482884958
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2999	NC_021082	ATG	2	6	250212	250217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884958
3000	NC_021082	CAA	2	6	250371	250376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884959

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