MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mannheimia haemolytica M42548

Total Repeats: 33036

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021082	TCA	2	6	124736	124741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884827
1502	NC_021082	GCC	2	6	124849	124854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482884827
1503	NC_021082	TCA	2	6	124864	124869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884827
1504	NC_021082	TAA	3	9	124870	124878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884827
1505	NC_021082	CGG	2	6	124904	124909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482884827
1506	NC_021082	TCT	2	6	125017	125022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884827
1507	NC_021082	TCA	2	6	125032	125037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884827
1508	NC_021082	ATA	2	6	125350	125355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_021082	ACG	2	6	125363	125368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_021082	AGC	2	6	125382	125387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_021082	TAA	2	6	125389	125394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_021082	CGC	3	9	125476	125484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1513	NC_021082	GTA	2	6	125578	125583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_021082	CCA	2	6	125629	125634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1515	NC_021082	TAC	2	6	125994	125999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884828
1516	NC_021082	TTA	2	6	126003	126008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884828
1517	NC_021082	AGA	2	6	126124	126129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884828
1518	NC_021082	ATT	2	6	126139	126144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884828
1519	NC_021082	CAA	2	6	126176	126181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884828
1520	NC_021082	AAG	2	6	126260	126265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884828
1521	NC_021082	GAA	2	6	126333	126338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884828
1522	NC_021082	ATG	2	6	126449	126454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884828
1523	NC_021082	CGG	2	6	126714	126719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482884828
1524	NC_021082	GAA	2	6	126832	126837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884828
1525	NC_021082	GCC	2	6	127016	127021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482884828
1526	NC_021082	TGA	2	6	127216	127221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884829
1527	NC_021082	TAT	2	6	127269	127274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884829
1528	NC_021082	AAG	2	6	127398	127403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_021082	ATG	2	6	127410	127415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884830
1530	NC_021082	ATT	3	9	127437	127445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884830
1531	NC_021082	TTA	2	6	127616	127621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884830
1532	NC_021082	CGG	2	6	127658	127663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482884831
1533	NC_021082	GCA	2	6	127768	127773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482884832
1534	NC_021082	GCA	2	6	127982	127987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482884832
1535	NC_021082	TAA	2	6	128262	128267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_021082	TTA	2	6	128276	128281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_021082	AAT	2	6	128297	128302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_021082	TTA	2	6	128782	128787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884833
1539	NC_021082	ACC	2	6	128852	128857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884833
1540	NC_021082	ATA	2	6	129045	129050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884833
1541	NC_021082	AGC	2	6	129061	129066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482884833
1542	NC_021082	TAA	2	6	129085	129090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884833
1543	NC_021082	AGC	2	6	129110	129115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482884833
1544	NC_021082	TGA	3	9	129124	129132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884833
1545	NC_021082	GCA	2	6	129149	129154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482884834
1546	NC_021082	AGC	2	6	129205	129210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482884834
1547	NC_021082	ATT	2	6	129249	129254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884834
1548	NC_021082	AAC	3	9	129352	129360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884835
1549	NC_021082	AAC	2	6	129412	129417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884835
1550	NC_021082	CAC	2	6	129570	129575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884836
1551	NC_021082	ATT	2	6	129678	129683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884836
1552	NC_021082	ATC	2	6	129688	129693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884836
1553	NC_021082	CGC	2	6	129709	129714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482884836
1554	NC_021082	ATG	2	6	129724	129729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884836
1555	NC_021082	CAA	2	6	129746	129751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884836
1556	NC_021082	TGA	2	6	130099	130104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884837
1557	NC_021082	TGA	2	6	130306	130311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884837
1558	NC_021082	CAA	2	6	130466	130471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884837
1559	NC_021082	TGA	2	6	130585	130590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_021082	CAA	2	6	130747	130752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_021082	AAT	2	6	130858	130863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_021082	CTT	2	6	131235	131240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884838
1563	NC_021082	CAA	2	6	131316	131321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884838
1564	NC_021082	ATG	2	6	131464	131469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884838
1565	NC_021082	TAG	2	6	131696	131701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_021082	CTG	3	9	131883	131891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884839
1567	NC_021082	CAC	2	6	131917	131922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884839
1568	NC_021082	ATC	2	6	131990	131995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884839
1569	NC_021082	CAT	2	6	132075	132080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884839
1570	NC_021082	CAG	2	6	132286	132291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482884839
1571	NC_021082	AAT	2	6	132361	132366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884839
1572	NC_021082	AAT	2	6	132394	132399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884839
1573	NC_021082	CTG	2	6	132586	132591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884839
1574	NC_021082	CAA	2	6	132634	132639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884840
1575	NC_021082	CAC	2	6	132646	132651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884840
1576	NC_021082	CTT	2	6	132741	132746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884840
1577	NC_021082	TAT	2	6	132750	132755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884840
1578	NC_021082	CGG	2	6	132833	132838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482884840
1579	NC_021082	ATA	2	6	133061	133066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884840
1580	NC_021082	TTG	2	6	133070	133075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884840
1581	NC_021082	GCC	2	6	133175	133180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482884840
1582	NC_021082	CAA	2	6	133258	133263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884840
1583	NC_021082	CAC	2	6	133369	133374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884840
1584	NC_021082	CAG	2	6	133378	133383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482884840
1585	NC_021082	TAG	2	6	133659	133664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_021082	TCT	2	6	133758	133763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884841
1587	NC_021082	CAT	2	6	133981	133986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884841
1588	NC_021082	TCT	2	6	133992	133997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884841
1589	NC_021082	TTG	2	6	134099	134104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884841
1590	NC_021082	CTT	2	6	134191	134196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884841
1591	NC_021082	TCT	2	6	134217	134222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884841
1592	NC_021082	TAA	2	6	134238	134243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_021082	ATT	2	6	134247	134252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884842
1594	NC_021082	TGC	2	6	134278	134283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884842
1595	NC_021082	GCC	2	6	134290	134295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482884842
1596	NC_021082	CTT	2	6	134301	134306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884842
1597	NC_021082	ACC	2	6	134356	134361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884842
1598	NC_021082	CTA	2	6	134382	134387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884842
1599	NC_021082	GCT	2	6	134432	134437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884842
1600	NC_021082	AAT	2	6	134470	134475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884842
1601	NC_021082	TCA	2	6	134495	134500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884842
1602	NC_021082	ACT	2	6	134516	134521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884842
1603	NC_021082	CTT	2	6	134526	134531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884842
1604	NC_021082	TTG	2	6	134674	134679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884842
1605	NC_021082	TAA	2	6	134779	134784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_021082	ATT	2	6	134815	134820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884843
1607	NC_021082	TTG	2	6	134825	134830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884843
1608	NC_021082	GTT	2	6	134977	134982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884843
1609	NC_021082	ATC	2	6	135006	135011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884843
1610	NC_021082	GAT	2	6	135053	135058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884843
1611	NC_021082	ATA	3	9	135064	135072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884843
1612	NC_021082	AAT	2	6	135108	135113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884843
1613	NC_021082	ACC	2	6	135146	135151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884843
1614	NC_021082	TTG	2	6	135167	135172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884843
1615	NC_021082	TCT	2	6	135189	135194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884843
1616	NC_021082	GCA	2	6	135201	135206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482884843
1617	NC_021082	CAT	2	6	135220	135225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884843
1618	NC_021082	TTC	2	6	135323	135328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884843
1619	NC_021082	TCT	2	6	135390	135395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884843
1620	NC_021082	GCT	2	6	135423	135428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884843
1621	NC_021082	TTC	2	6	135455	135460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884843
1622	NC_021082	TTC	2	6	135587	135592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884843
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1845	NC_021082	ATT	2	6	152420	152425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1980	NC_021082	ATT	2	6	163217	163222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884867
1981	NC_021082	CTC	3	9	163229	163237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482884867
1982	NC_021082	GAA	2	6	163285	163290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884867
1983	NC_021082	ATT	2	6	163485	163490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884867
1984	NC_021082	ATT	2	6	163562	163567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884867
1985	NC_021082	AAC	2	6	163574	163579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884867
1986	NC_021082	CTG	2	6	163901	163906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884867
1987	NC_021082	CAT	2	6	163914	163919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884867
1988	NC_021082	AAG	2	6	164024	164029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884867
1989	NC_021082	ATT	2	6	164385	164390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884868
1990	NC_021082	TAG	2	6	164434	164439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884868
1991	NC_021082	TGA	2	6	164462	164467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884868
1992	NC_021082	GAT	2	6	164601	164606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884868
1993	NC_021082	GCA	2	6	164631	164636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482884868
1994	NC_021082	GCC	2	6	164644	164649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482884868
1995	NC_021082	GCA	2	6	164733	164738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482884868
1996	NC_021082	CCG	2	6	165178	165183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482884869
1997	NC_021082	GGT	2	6	165268	165273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482884869
1998	NC_021082	GTA	2	6	165394	165399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884869
1999	NC_021082	TTC	2	6	165469	165474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884869
2000	NC_021082	CTG	2	6	165488	165493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884869

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