MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mannheimia haemolytica M42548

Total Repeats: 33036

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021082	CTC	2	6	36823	36828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482884733
502	NC_021082	TAA	2	6	36889	36894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884733
503	NC_021082	AAT	2	6	36901	36906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884733
504	NC_021082	TGA	2	6	37053	37058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884734
505	NC_021082	AAG	2	6	37239	37244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884734
506	NC_021082	ATT	2	6	37249	37254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884734
507	NC_021082	GAA	2	6	37304	37309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884734
508	NC_021082	CCG	2	6	37541	37546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482884734
509	NC_021082	TTG	2	6	37601	37606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884734
510	NC_021082	ATT	2	6	37643	37648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884734
511	NC_021082	GAA	2	6	37676	37681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884734
512	NC_021082	AGA	2	6	37831	37836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884734
513	NC_021082	TTA	2	6	37865	37870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884734
514	NC_021082	AAT	2	6	38148	38153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884735
515	NC_021082	ATT	2	6	38177	38182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884735
516	NC_021082	ATT	2	6	38263	38268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884735
517	NC_021082	TGG	2	6	38324	38329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482884735
518	NC_021082	ATT	2	6	38331	38336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884735
519	NC_021082	TGA	2	6	38385	38390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884735
520	NC_021082	GCC	2	6	38500	38505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482884735
521	NC_021082	CAA	2	6	38614	38619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884736
522	NC_021082	ACT	2	6	38648	38653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884736
523	NC_021082	TAT	2	6	38736	38741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884736
524	NC_021082	CAC	2	6	38820	38825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884736
525	NC_021082	CCA	2	6	38832	38837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884736
526	NC_021082	TGA	2	6	38852	38857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884736
527	NC_021082	CAC	2	6	38900	38905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884736
528	NC_021082	GGT	2	6	38910	38915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482884736
529	NC_021082	CAA	2	6	38991	38996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884736
530	NC_021082	GCT	2	6	39041	39046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884736
531	NC_021082	ATC	2	6	39142	39147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884736
532	NC_021082	ACC	2	6	39164	39169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884736
533	NC_021082	CAT	2	6	39327	39332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884736
534	NC_021082	ACA	2	6	39363	39368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884736
535	NC_021082	TTG	2	6	39443	39448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884737
536	NC_021082	GAA	2	6	39451	39456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884737
537	NC_021082	CCG	2	6	39468	39473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482884737
538	NC_021082	TAA	2	6	39549	39554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884737
539	NC_021082	TTA	2	6	39595	39600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884737
540	NC_021082	TGA	2	6	39630	39635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884737
541	NC_021082	TGG	2	6	39731	39736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482884737
542	NC_021082	TGA	2	6	39798	39803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884737
543	NC_021082	ATT	2	6	39868	39873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884737
544	NC_021082	TGA	2	6	40032	40037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884737
545	NC_021082	CGG	2	6	40107	40112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482884737
546	NC_021082	CAA	2	6	40384	40389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884737
547	NC_021082	CCA	2	6	40434	40439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884737
548	NC_021082	TCA	2	6	40625	40630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_021082	TAA	2	6	40709	40714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884738
550	NC_021082	TCT	2	6	40783	40788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884738
551	NC_021082	TCT	2	6	40885	40890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884738
552	NC_021082	CTT	2	6	41076	41081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884739
553	NC_021082	TCA	2	6	41111	41116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884739
554	NC_021082	ATC	2	6	41282	41287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_021082	TCT	2	6	41333	41338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_021082	CAC	2	6	41453	41458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884740
557	NC_021082	CGG	3	9	41491	41499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482884740
558	NC_021082	GAC	2	6	41555	41560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482884740
559	NC_021082	GGT	2	6	41615	41620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482884740
560	NC_021082	CAG	2	6	41707	41712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482884740
561	NC_021082	TAA	2	6	41762	41767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884740
562	NC_021082	CCA	2	6	41785	41790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884740
563	NC_021082	CTT	2	6	41803	41808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884740
564	NC_021082	TGT	2	6	41833	41838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884740
565	NC_021082	TCT	2	6	41850	41855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884740
566	NC_021082	TCA	3	9	41862	41870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884740
567	NC_021082	GGT	2	6	41882	41887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482884740
568	NC_021082	CCG	2	6	41917	41922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482884740
569	NC_021082	CAC	2	6	41930	41935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884740
570	NC_021082	GTG	2	6	41940	41945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482884740
571	NC_021082	ATA	2	6	42061	42066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884741
572	NC_021082	ATG	2	6	42080	42085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884741
573	NC_021082	TAA	2	6	42146	42151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884741
574	NC_021082	TTA	2	6	42168	42173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884741
575	NC_021082	AAT	2	6	42188	42193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884741
576	NC_021082	TTC	2	6	42245	42250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884741
577	NC_021082	GCA	2	6	42387	42392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482884741
578	NC_021082	AAT	2	6	42438	42443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884741
579	NC_021082	CAA	2	6	42497	42502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884741
580	NC_021082	CAA	2	6	42508	42513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884741
581	NC_021082	CAA	2	6	42891	42896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884742
582	NC_021082	TAA	2	6	42966	42971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884742
583	NC_021082	TTG	2	6	42974	42979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884742
584	NC_021082	TGT	2	6	43032	43037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884743
585	NC_021082	CAT	2	6	43148	43153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884743
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587	NC_021082	GTA	2	6	43445	43450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884743
588	NC_021082	GTA	2	6	43616	43621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884743
589	NC_021082	TCA	2	6	43707	43712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884743
590	NC_021082	TCA	2	6	43827	43832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884743
591	NC_021082	CAT	2	6	43840	43845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884743
592	NC_021082	ATA	2	6	43860	43865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884743
593	NC_021082	CAC	2	6	43885	43890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884743
594	NC_021082	TTG	2	6	43928	43933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884743
595	NC_021082	ATT	2	6	44006	44011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884743
596	NC_021082	GTC	2	6	44037	44042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884743
597	NC_021082	ATA	2	6	44157	44162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884743
598	NC_021082	GCA	2	6	44253	44258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482884743
599	NC_021082	TTG	2	6	44335	44340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884743
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602	NC_021082	CTT	2	6	44521	44526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884743
603	NC_021082	TTA	2	6	44541	44546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884743
604	NC_021082	AAT	2	6	44625	44630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884743
605	NC_021082	TTG	2	6	44815	44820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884744
606	NC_021082	CGC	2	6	44891	44896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482884744
607	NC_021082	CAG	2	6	44979	44984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482884744
608	NC_021082	GCC	2	6	45094	45099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482884744
609	NC_021082	TGG	2	6	45457	45462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482884744
610	NC_021082	AGT	2	6	45480	45485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884744
611	NC_021082	ATT	2	6	45809	45814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_021082	TTC	3	9	45854	45862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_021082	AGA	2	6	45867	45872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
614	NC_021082	TAA	2	6	45958	45963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884745
615	NC_021082	ATA	2	6	46133	46138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884745
616	NC_021082	AAG	2	6	46253	46258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884745
617	NC_021082	CGG	2	6	46371	46376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482884745
618	NC_021082	GGC	2	6	46671	46676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482884745
619	NC_021082	CGC	2	6	46708	46713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482884745
620	NC_021082	TGA	2	6	46821	46826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884745
621	NC_021082	ATC	2	6	46904	46909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884745
622	NC_021082	AGG	2	6	47030	47035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482884745
623	NC_021082	AAT	2	6	47134	47139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_021082	TAT	2	6	47193	47198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884746
625	NC_021082	TTA	2	6	47220	47225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884746
626	NC_021082	AGC	2	6	47300	47305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482884746
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999	NC_021082	ATT	2	6	79305	79310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884775
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