MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-SAM-185

Total Repeats: 30843

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_020834	TCA	2	6	497534	497539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335735
6003	NC_020834	CTG	2	6	497580	497585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335735
6004	NC_020834	CTG	2	6	497589	497594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335735
6005	NC_020834	AGT	2	6	497852	497857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335735
6006	NC_020834	ACC	2	6	497941	497946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335735
6007	NC_020834	GTA	2	6	497988	497993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335735
6008	NC_020834	GTT	2	6	498024	498029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335735
6009	NC_020834	TTG	2	6	498316	498321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335735
6010	NC_020834	TCT	3	9	498437	498445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335735
6011	NC_020834	TAT	2	6	498545	498550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_020834	TAT	2	6	498641	498646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_020834	ATC	2	6	498674	498679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6014	NC_020834	ATT	2	6	498718	498723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_020834	TCA	2	6	498725	498730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6016	NC_020834	TAC	2	6	498746	498751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6017	NC_020834	GAA	2	6	498762	498767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_020834	AAG	2	6	498961	498966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335736
6019	NC_020834	ATT	2	6	499081	499086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335736
6020	NC_020834	CTA	2	6	499265	499270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335736
6021	NC_020834	GCA	2	6	499321	499326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335736
6022	NC_020834	TAA	2	6	499347	499352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335736
6023	NC_020834	AAT	2	6	499371	499376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335736
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6025	NC_020834	CGG	2	6	499455	499460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335736
6026	NC_020834	TAA	2	6	499515	499520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335736
6027	NC_020834	CCG	2	6	499570	499575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335736
6028	NC_020834	ATA	2	6	499753	499758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335736
6029	NC_020834	AAT	2	6	499795	499800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335736
6030	NC_020834	CGG	2	6	499811	499816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335736
6031	NC_020834	AGC	2	6	499866	499871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335736
6032	NC_020834	AGC	2	6	499926	499931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335736
6033	NC_020834	AAT	2	6	499932	499937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335736
6034	NC_020834	ACC	2	6	500022	500027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335736
6035	NC_020834	AGT	2	6	500041	500046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335736
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6038	NC_020834	TTG	2	6	500331	500336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335737
6039	NC_020834	CAC	2	6	500505	500510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335737
6040	NC_020834	AGC	2	6	500580	500585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335737
6041	NC_020834	TCA	2	6	500608	500613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335737
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6043	NC_020834	TTG	2	6	500676	500681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335737
6044	NC_020834	CAT	2	6	500702	500707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335737
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6051	NC_020834	CGT	2	6	501407	501412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335737
6052	NC_020834	AAT	2	6	501508	501513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335737
6053	NC_020834	TGG	2	6	501557	501562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335737
6054	NC_020834	TCG	2	6	501712	501717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335737
6055	NC_020834	AGC	2	6	501754	501759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335737
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6057	NC_020834	CGA	2	6	502069	502074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335738
6058	NC_020834	TGA	2	6	502075	502080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335738
6059	NC_020834	ATC	2	6	502119	502124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335738
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6062	NC_020834	ATT	2	6	502367	502372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_020834	AGT	2	6	502443	502448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6069	NC_020834	ATC	2	6	502873	502878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335739
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6072	NC_020834	TCG	2	6	503182	503187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335739
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6079	NC_020834	TAA	2	6	503805	503810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6107	NC_020834	ATG	2	6	506565	506570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335743
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6245	NC_020834	TAA	2	6	519668	519673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335754
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6352	NC_020834	TTC	2	6	528312	528317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335763
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6355	NC_020834	ATT	2	6	528793	528798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6356	NC_020834	AAT	2	6	528802	528807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6357	NC_020834	TTC	2	6	528859	528864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6358	NC_020834	ATA	2	6	528940	528945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6359	NC_020834	TCA	2	6	529001	529006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335764
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6362	NC_020834	TAA	2	6	529142	529147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335764
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