MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-SAM-185

Total Repeats: 30843

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_020834	TAC	2	6	452022	452027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335694
5502	NC_020834	TGT	2	6	452146	452151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335694
5503	NC_020834	AAT	2	6	452330	452335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335695
5504	NC_020834	GGT	2	6	452350	452355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335695
5505	NC_020834	TAA	2	6	452486	452491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335695
5506	NC_020834	CGT	2	6	452617	452622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335695
5507	NC_020834	CAA	2	6	452974	452979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5508	NC_020834	TAA	2	6	453037	453042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_020834	ATC	2	6	453146	453151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335696
5510	NC_020834	CTG	2	6	453225	453230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335696
5511	NC_020834	ACC	2	6	453437	453442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335696
5512	NC_020834	GGC	2	6	453510	453515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335696
5513	NC_020834	ACT	2	6	453576	453581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335696
5514	NC_020834	CTA	2	6	453609	453614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335696
5515	NC_020834	GCA	2	6	453633	453638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335696
5516	NC_020834	TCA	2	6	453705	453710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335696
5517	NC_020834	AGT	2	6	453713	453718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335696
5518	NC_020834	CCT	2	6	453751	453756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472335696
5519	NC_020834	CTG	2	6	453761	453766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335696
5520	NC_020834	TTC	2	6	453892	453897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335697
5521	NC_020834	ACC	2	6	453914	453919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335697
5522	NC_020834	TAG	2	6	453991	453996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335697
5523	NC_020834	AAT	2	6	454195	454200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335697
5524	NC_020834	CCA	2	6	454298	454303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335697
5525	NC_020834	CAC	2	6	454401	454406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335697
5526	NC_020834	CTT	2	6	454443	454448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335697
5527	NC_020834	ATT	2	6	454477	454482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335697
5528	NC_020834	ACT	2	6	454585	454590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335697
5529	NC_020834	TAG	2	6	454599	454604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335697
5530	NC_020834	TTG	2	6	454717	454722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335697
5531	NC_020834	TCT	2	6	454940	454945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335697
5532	NC_020834	TTG	2	6	455092	455097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335697
5533	NC_020834	GAT	2	6	455139	455144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_020834	TAA	2	6	455219	455224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_020834	GAA	2	6	455615	455620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335698
5536	NC_020834	TCA	2	6	455688	455693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335698
5537	NC_020834	GAT	2	6	455741	455746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335698
5538	NC_020834	GAA	2	6	455822	455827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335698
5539	NC_020834	GAA	2	6	455849	455854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335698
5540	NC_020834	AGC	2	6	455861	455866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335698
5541	NC_020834	TAA	2	6	455962	455967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335698
5542	NC_020834	TTA	2	6	456128	456133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335698
5543	NC_020834	ATG	2	6	456570	456575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335699
5544	NC_020834	TCC	2	6	456577	456582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472335699
5545	NC_020834	TTG	2	6	456735	456740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335699
5546	NC_020834	ATT	2	6	456902	456907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335699
5547	NC_020834	AGA	2	6	457075	457080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335699
5548	NC_020834	TGA	2	6	457213	457218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335699
5549	NC_020834	AGC	2	6	457261	457266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335699
5550	NC_020834	CTG	2	6	457278	457283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335699
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5552	NC_020834	ATT	2	6	457318	457323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335699
5553	NC_020834	ACC	2	6	457332	457337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335699
5554	NC_020834	GGT	2	6	457391	457396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335699
5555	NC_020834	GAC	2	6	457433	457438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335699
5556	NC_020834	AGT	2	6	457555	457560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335699
5557	NC_020834	AAG	2	6	457572	457577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335699
5558	NC_020834	ATT	2	6	457585	457590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335699
5559	NC_020834	TGG	2	6	457773	457778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335699
5560	NC_020834	GAA	2	6	457856	457861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335699
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5562	NC_020834	AGA	2	6	457909	457914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335699
5563	NC_020834	GTG	2	6	457930	457935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335699
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5589	NC_020834	GGC	2	6	459920	459925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335700
5590	NC_020834	TTG	2	6	460023	460028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335700
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5592	NC_020834	TGG	2	6	460195	460200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335700
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5601	NC_020834	TAG	2	6	461701	461706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335702
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5604	NC_020834	ATT	2	6	462370	462375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_020834	CAA	2	6	462537	462542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335703
5606	NC_020834	ATT	2	6	462594	462599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335703
5607	NC_020834	TTG	2	6	462675	462680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335703
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5609	NC_020834	GAA	2	6	463151	463156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5610	NC_020834	TTG	2	6	463346	463351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335704
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5981	NC_020834	GTG	2	6	495769	495774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335733
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5999	NC_020834	AAT	2	6	497290	497295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6000	NC_020834	TTG	2	6	497431	497436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335735

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