MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Methylophaga sp. JAM1 chromosome

Total Repeats: 2062

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017857	AATCC	2	10	935	944	40 %	20 %	0 %	40 %	387125903
2	NC_017857	AAAAT	2	10	1096	1105	80 %	20 %	0 %	0 %	387125904
3	NC_017857	AAGTA	2	10	3442	3451	60 %	20 %	20 %	0 %	387125907
4	NC_017857	TTTCG	2	10	4769	4778	0 %	60 %	20 %	20 %	387125908
5	NC_017857	TCCAG	2	10	9321	9330	20 %	20 %	20 %	40 %	387125915
6	NC_017857	CATCA	2	10	9443	9452	40 %	20 %	0 %	40 %	387125915
7	NC_017857	TAACC	2	10	10919	10928	40 %	20 %	0 %	40 %	387125917
8	NC_017857	CGCTT	2	10	11416	11425	0 %	40 %	20 %	40 %	387125917
9	NC_017857	GCTGA	2	10	11818	11827	20 %	20 %	40 %	20 %	387125917
10	NC_017857	ATCAA	2	10	13208	13217	60 %	20 %	0 %	20 %	387125917
11	NC_017857	TTTCA	2	10	15002	15011	20 %	60 %	0 %	20 %	387125919
12	NC_017857	TCACC	2	10	17044	17053	20 %	20 %	0 %	60 %	387125921
13	NC_017857	ACAGT	2	10	17967	17976	40 %	20 %	20 %	20 %	387125922
14	NC_017857	AGTTA	2	10	20582	20591	40 %	40 %	20 %	0 %	387125923
15	NC_017857	CTTAT	2	10	23019	23028	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017857	CGGCG	2	10	24391	24400	0 %	0 %	60 %	40 %	387125928
17	NC_017857	AGGCC	2	10	24475	24484	20 %	0 %	40 %	40 %	387125928
18	NC_017857	AAAAC	2	10	25345	25354	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017857	TGCAA	2	10	25608	25617	40 %	20 %	20 %	20 %	387125929
20	NC_017857	ACCAA	2	10	25767	25776	60 %	0 %	0 %	40 %	387125929
21	NC_017857	CCGGA	2	10	26035	26044	20 %	0 %	40 %	40 %	387125929
22	NC_017857	CGGCG	2	10	30256	30265	0 %	0 %	60 %	40 %	387125933
23	NC_017857	CTGAA	2	10	30804	30813	40 %	20 %	20 %	20 %	387125933
24	NC_017857	GGTCA	2	10	31571	31580	20 %	20 %	40 %	20 %	387125933
25	NC_017857	ATCAA	2	10	32316	32325	60 %	20 %	0 %	20 %	387125934
26	NC_017857	CCATA	2	10	33380	33389	40 %	20 %	0 %	40 %	387125935
27	NC_017857	TCAAC	2	10	36691	36700	40 %	20 %	0 %	40 %	387125940
28	NC_017857	TGCAT	2	10	36743	36752	20 %	40 %	20 %	20 %	387125940
29	NC_017857	AAGTT	2	10	39232	39241	40 %	40 %	20 %	0 %	387125941
30	NC_017857	AACCG	2	10	40995	41004	40 %	0 %	20 %	40 %	387125941
31	NC_017857	AGCTG	2	10	49672	49681	20 %	20 %	40 %	20 %	387125947
32	NC_017857	CCCTG	2	10	52147	52156	0 %	20 %	20 %	60 %	387125951
33	NC_017857	CTGCC	2	10	52308	52317	0 %	20 %	20 %	60 %	387125952
34	NC_017857	AAACC	2	10	54076	54085	60 %	0 %	0 %	40 %	387125953
35	NC_017857	AACTT	2	10	58240	58249	40 %	40 %	0 %	20 %	387125957
36	NC_017857	TTCCT	2	10	59060	59069	0 %	60 %	0 %	40 %	387125957
37	NC_017857	CAGCA	2	10	59446	59455	40 %	0 %	20 %	40 %	387125958
38	NC_017857	AACGT	2	10	60989	60998	40 %	20 %	20 %	20 %	387125960
39	NC_017857	CACTT	2	10	62817	62826	20 %	40 %	0 %	40 %	387125962
40	NC_017857	AAGTC	2	10	64370	64379	40 %	20 %	20 %	20 %	387125964
41	NC_017857	ACATT	2	10	64422	64431	40 %	40 %	0 %	20 %	387125964
42	NC_017857	GATCT	2	10	67990	67999	20 %	40 %	20 %	20 %	387125966
43	NC_017857	GGTTG	2	10	72355	72364	0 %	40 %	60 %	0 %	387125971
44	NC_017857	GGTGC	2	10	75983	75992	0 %	20 %	60 %	20 %	387125975
45	NC_017857	CCCCA	2	10	76885	76894	20 %	0 %	0 %	80 %	387125975
46	NC_017857	GCCAC	2	10	77037	77046	20 %	0 %	20 %	60 %	387125975
47	NC_017857	GCCAA	2	10	77192	77201	40 %	0 %	20 %	40 %	387125975
48	NC_017857	CACTC	2	10	77404	77413	20 %	20 %	0 %	60 %	387125976
49	NC_017857	CTCTG	2	10	78098	78107	0 %	40 %	20 %	40 %	387125977
50	NC_017857	TAGTG	2	10	81940	81949	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017857	CAAGC	2	10	84825	84834	40 %	0 %	20 %	40 %	387125984
52	NC_017857	ATTTT	2	10	85245	85254	20 %	80 %	0 %	0 %	387125985
53	NC_017857	AGAAC	2	10	90076	90085	60 %	0 %	20 %	20 %	387125992
54	NC_017857	TCCAA	2	10	92860	92869	40 %	20 %	0 %	40 %	387125994
55	NC_017857	GTTAA	2	10	96262	96271	40 %	40 %	20 %	0 %	387125996
56	NC_017857	CGAGC	2	10	96888	96897	20 %	0 %	40 %	40 %	387125997
57	NC_017857	TGTGC	2	10	97558	97567	0 %	40 %	40 %	20 %	387125998
58	NC_017857	TTTTG	2	10	98195	98204	0 %	80 %	20 %	0 %	387125998
59	NC_017857	TGGTT	2	10	100001	100010	0 %	60 %	40 %	0 %	387126001
60	NC_017857	GCCGA	2	10	103716	103725	20 %	0 %	40 %	40 %	387126005
61	NC_017857	CGATC	2	10	106420	106429	20 %	20 %	20 %	40 %	387126006
62	NC_017857	TGCAT	2	10	108270	108279	20 %	40 %	20 %	20 %	387126008
63	NC_017857	TGAAA	2	10	108301	108310	60 %	20 %	20 %	0 %	387126008
64	NC_017857	CATGG	2	10	108851	108860	20 %	20 %	40 %	20 %	387126009
65	NC_017857	TGCCG	2	10	109350	109359	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
66	NC_017857	CCAAA	2	10	110634	110643	60 %	0 %	0 %	40 %	387126011
67	NC_017857	AGACC	2	10	110709	110718	40 %	0 %	20 %	40 %	387126011
68	NC_017857	GCAAT	2	10	111098	111107	40 %	20 %	20 %	20 %	387126011
69	NC_017857	AACGA	2	10	112095	112104	60 %	0 %	20 %	20 %	387126013
70	NC_017857	CAGAG	2	10	115241	115250	40 %	0 %	40 %	20 %	387126016
71	NC_017857	AGTTC	2	10	115552	115561	20 %	40 %	20 %	20 %	387126016
72	NC_017857	TTTCA	2	10	120633	120642	20 %	60 %	0 %	20 %	387126019
73	NC_017857	CTGAT	2	10	121465	121474	20 %	40 %	20 %	20 %	387126020
74	NC_017857	TCCAG	2	10	122903	122912	20 %	20 %	20 %	40 %	387126021
75	NC_017857	CAATG	2	10	124095	124104	40 %	20 %	20 %	20 %	387126022
76	NC_017857	TCTTT	2	10	124551	124560	0 %	80 %	0 %	20 %	387126023
77	NC_017857	TAATG	2	10	126208	126217	40 %	40 %	20 %	0 %	387126024
78	NC_017857	ATTTT	2	10	128394	128403	20 %	80 %	0 %	0 %	387126025
79	NC_017857	TAAAA	2	10	128647	128656	80 %	20 %	0 %	0 %	387126026
80	NC_017857	GTGAT	2	10	128967	128976	20 %	40 %	40 %	0 %	387126026
81	NC_017857	GACCA	2	10	129581	129590	40 %	0 %	20 %	40 %	387126027
82	NC_017857	CTGGT	2	10	130209	130218	0 %	40 %	40 %	20 %	387126027
83	NC_017857	AAATC	2	10	131949	131958	60 %	20 %	0 %	20 %	387126029
84	NC_017857	CCACA	2	10	137176	137185	40 %	0 %	0 %	60 %	387126033
85	NC_017857	AGCTG	2	10	142091	142100	20 %	20 %	40 %	20 %	387126040
86	NC_017857	GACTG	2	10	143137	143146	20 %	20 %	40 %	20 %	387126041
87	NC_017857	CGAGT	2	10	146778	146787	20 %	20 %	40 %	20 %	387126042
88	NC_017857	TCTGA	2	10	147064	147073	20 %	40 %	20 %	20 %	387126042
89	NC_017857	GCGCA	2	10	147373	147382	20 %	0 %	40 %	40 %	387126042
90	NC_017857	TTGCT	2	10	148279	148288	0 %	60 %	20 %	20 %	387126044
91	NC_017857	TATGC	2	10	149745	149754	20 %	40 %	20 %	20 %	387126044
92	NC_017857	AAGAA	2	10	149780	149789	80 %	0 %	20 %	0 %	387126044
93	NC_017857	TTATC	2	10	153695	153704	20 %	60 %	0 %	20 %	387126049
94	NC_017857	ACATG	2	10	155410	155419	40 %	20 %	20 %	20 %	387126050
95	NC_017857	GTGCC	2	10	158068	158077	0 %	20 %	40 %	40 %	387126052
96	NC_017857	TTTCA	2	10	159216	159225	20 %	60 %	0 %	20 %	387126054
97	NC_017857	TTACC	2	10	160391	160400	20 %	40 %	0 %	40 %	387126055
98	NC_017857	ATTGC	2	10	162385	162394	20 %	40 %	20 %	20 %	387126057
99	NC_017857	GCATC	2	10	163329	163338	20 %	20 %	20 %	40 %	387126058
100	NC_017857	TGATC	2	10	164268	164277	20 %	40 %	20 %	20 %	387126058
101	NC_017857	CATAA	2	10	169446	169455	60 %	20 %	0 %	20 %	387126064
102	NC_017857	AATAA	2	10	170031	170040	80 %	20 %	0 %	0 %	387126065
103	NC_017857	TGTTT	2	10	171465	171474	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017857	TTAGA	2	10	171943	171952	40 %	40 %	20 %	0 %	387126067
105	NC_017857	ACCGG	2	10	172981	172990	20 %	0 %	40 %	40 %	387126067
106	NC_017857	TGTGG	2	10	173533	173542	0 %	40 %	60 %	0 %	387126067
107	NC_017857	AACCG	2	10	173904	173913	40 %	0 %	20 %	40 %	387126067
108	NC_017857	CACTG	2	10	174992	175001	20 %	20 %	20 %	40 %	387126068
109	NC_017857	AAATC	2	10	175650	175659	60 %	20 %	0 %	20 %	387126069
110	NC_017857	CAACC	2	10	177474	177483	40 %	0 %	0 %	60 %	387126070
111	NC_017857	CGAAC	2	10	177498	177507	40 %	0 %	20 %	40 %	387126070
112	NC_017857	ATGCC	2	10	178214	178223	20 %	20 %	20 %	40 %	387126070
113	NC_017857	GGCGC	2	10	178632	178641	0 %	0 %	60 %	40 %	387126071
114	NC_017857	TTGAT	2	10	178767	178776	20 %	60 %	20 %	0 %	387126071
115	NC_017857	CCATT	2	10	181011	181020	20 %	40 %	0 %	40 %	387126073
116	NC_017857	TGATA	2	10	182914	182923	40 %	40 %	20 %	0 %	387126074
117	NC_017857	CTGAA	2	10	183188	183197	40 %	20 %	20 %	20 %	387126074
118	NC_017857	TGCTC	2	10	183987	183996	0 %	40 %	20 %	40 %	387126075
119	NC_017857	AGTAA	2	10	184586	184595	60 %	20 %	20 %	0 %	387126076
120	NC_017857	AAAAG	2	10	184634	184643	80 %	0 %	20 %	0 %	387126076
121	NC_017857	AGCCA	2	10	186321	186330	40 %	0 %	20 %	40 %	387126078
122	NC_017857	TGAAC	2	10	187577	187586	40 %	20 %	20 %	20 %	387126079
123	NC_017857	TCATT	2	10	187958	187967	20 %	60 %	0 %	20 %	387126079
124	NC_017857	GATTT	2	10	188794	188803	20 %	60 %	20 %	0 %	387126080
125	NC_017857	TTGAT	2	10	192284	192293	20 %	60 %	20 %	0 %	387126084
126	NC_017857	CAAAT	2	10	192709	192718	60 %	20 %	0 %	20 %	387126084
127	NC_017857	CTGCT	2	10	193585	193594	0 %	40 %	20 %	40 %	387126084
128	NC_017857	AATTC	2	10	193655	193664	40 %	40 %	0 %	20 %	387126084
129	NC_017857	TGTTC	2	10	195656	195665	0 %	60 %	20 %	20 %	387126087
130	NC_017857	TTCAG	2	10	196059	196068	20 %	40 %	20 %	20 %	387126088
131	NC_017857	AGGCC	2	10	196674	196683	20 %	0 %	40 %	40 %	387126088
132	NC_017857	CCAAC	2	10	197131	197140	40 %	0 %	0 %	60 %	387126088
133	NC_017857	TTCGC	2	10	198097	198106	0 %	40 %	20 %	40 %	387126089
134	NC_017857	CTGCG	2	10	198771	198780	0 %	20 %	40 %	40 %	387126089
135	NC_017857	AAGCA	2	10	199527	199536	60 %	0 %	20 %	20 %	387126089
136	NC_017857	TGGTC	2	10	201179	201188	0 %	40 %	40 %	20 %	387126091
137	NC_017857	CCACA	2	10	201949	201958	40 %	0 %	0 %	60 %	387126092
138	NC_017857	GTGTA	2	10	204873	204882	20 %	40 %	40 %	0 %	387126095
139	NC_017857	AAAGC	2	10	205340	205349	60 %	0 %	20 %	20 %	387126095
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141	NC_017857	CTTTG	2	10	209741	209750	0 %	60 %	20 %	20 %	387126099
142	NC_017857	TGTTC	2	10	210731	210740	0 %	60 %	20 %	20 %	387126100
143	NC_017857	TCAAT	2	10	216765	216774	40 %	40 %	0 %	20 %	387126105
144	NC_017857	TCAGC	2	10	219970	219979	20 %	20 %	20 %	40 %	387126109
145	NC_017857	ATATG	2	10	221567	221576	40 %	40 %	20 %	0 %	387126110
146	NC_017857	CCAAG	2	10	221766	221775	40 %	0 %	20 %	40 %	387126110
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148	NC_017857	CGAGG	2	10	223614	223623	20 %	0 %	60 %	20 %	387126111
149	NC_017857	CTGCC	2	10	224239	224248	0 %	20 %	20 %	60 %	387126112
150	NC_017857	TCCAA	2	10	225259	225268	40 %	20 %	0 %	40 %	387126112
151	NC_017857	TTTTG	2	10	226081	226090	0 %	80 %	20 %	0 %	387126113
152	NC_017857	TTGAA	2	10	227587	227596	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017857	CCTGA	2	10	227826	227835	20 %	20 %	20 %	40 %	387126116
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155	NC_017857	CTAGT	2	10	229203	229212	20 %	40 %	20 %	20 %	387126117
156	NC_017857	GATTT	2	10	233637	233646	20 %	60 %	20 %	0 %	387126121
157	NC_017857	TCAGC	2	10	234063	234072	20 %	20 %	20 %	40 %	387126122
158	NC_017857	TTCAC	2	10	234557	234566	20 %	40 %	0 %	40 %	387126122
159	NC_017857	GACAT	2	10	235364	235373	40 %	20 %	20 %	20 %	387126122
160	NC_017857	GCTTA	2	10	235532	235541	20 %	40 %	20 %	20 %	387126123
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166	NC_017857	GATCA	2	10	242244	242253	40 %	20 %	20 %	20 %	387126131
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173	NC_017857	AAATT	2	10	254946	254955	60 %	40 %	0 %	0 %	387126142
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175	NC_017857	TGGTC	2	10	255830	255839	0 %	40 %	40 %	20 %	387126143
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193	NC_017857	TGTAT	2	10	281904	281913	20 %	60 %	20 %	0 %	387126167
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199	NC_017857	ATAAA	2	10	288698	288707	80 %	20 %	0 %	0 %	387126173
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212	NC_017857	AAGCA	2	10	305737	305746	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
213	NC_017857	ATGCT	2	10	307444	307453	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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241	NC_017857	GGGCG	2	10	359769	359778	0 %	0 %	80 %	20 %	387126253
242	NC_017857	GCACA	2	10	360856	360865	40 %	0 %	20 %	40 %	387126253
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244	NC_017857	CGCGG	2	10	361863	361872	0 %	0 %	60 %	40 %	387126254
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249	NC_017857	GCGAG	2	10	365683	365692	20 %	0 %	60 %	20 %	387126258
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252	NC_017857	TATTC	2	10	369050	369059	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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256	NC_017857	AATAT	2	10	376015	376024	60 %	40 %	0 %	0 %	387126271
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263	NC_017857	AAGCC	2	10	385288	385297	40 %	0 %	20 %	40 %	387126277
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393	NC_017857	CAGGT	2	10	581614	581623	20 %	20 %	40 %	20 %	387126457
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