MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Repeats of Methylophaga sp. JAM1 chromosome

Total Repeats: 2062

Go To Repeat Summary Page

< Previous 1 2 3 45Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_017857	CACTA	2	10	3039036	3039045	40 %	20 %	0 %	40 %	387128822
2002	NC_017857	ATTGG	2	10	3040334	3040343	20 %	40 %	40 %	0 %	387128822
2003	NC_017857	GACTG	2	10	3044175	3044184	20 %	20 %	40 %	20 %	387128827
2004	NC_017857	AAAAC	2	10	3044276	3044285	80 %	0 %	0 %	20 %	387128827
2005	NC_017857	TTTGG	2	10	3046780	3046789	0 %	60 %	40 %	0 %	387128829
2006	NC_017857	CGGGG	2	10	3048856	3048865	0 %	0 %	80 %	20 %	387128832
2007	NC_017857	TTTGA	2	10	3049494	3049503	20 %	60 %	20 %	0 %	387128833
2008	NC_017857	CCAGC	2	10	3055448	3055457	20 %	0 %	20 %	60 %	387128839
2009	NC_017857	TGCGC	2	10	3056605	3056614	0 %	20 %	40 %	40 %	387128840
2010	NC_017857	AAATC	2	10	3061836	3061845	60 %	20 %	0 %	20 %	387128846
2011	NC_017857	TAAAA	2	10	3062939	3062948	80 %	20 %	0 %	0 %	387128847
2012	NC_017857	ATGCC	2	10	3063395	3063404	20 %	20 %	20 %	40 %	387128848
2013	NC_017857	CAACA	2	10	3063669	3063678	60 %	0 %	0 %	40 %	387128848
2014	NC_017857	GCTGT	2	10	3065402	3065411	0 %	40 %	40 %	20 %	387128850
2015	NC_017857	TGACA	2	10	3066230	3066239	40 %	20 %	20 %	20 %	387128850
2016	NC_017857	GGATC	2	10	3067302	3067311	20 %	20 %	40 %	20 %	387128852
2017	NC_017857	TCACG	2	10	3068787	3068796	20 %	20 %	20 %	40 %	387128852
2018	NC_017857	TCGAC	2	10	3068976	3068985	20 %	20 %	20 %	40 %	387128852
2019	NC_017857	TGGTT	2	10	3070640	3070649	0 %	60 %	40 %	0 %	387128855
2020	NC_017857	GATCA	2	10	3070892	3070901	40 %	20 %	20 %	20 %	387128855
2021	NC_017857	CTTCC	2	10	3075642	3075651	0 %	40 %	0 %	60 %	387128860
2022	NC_017857	ATTTC	2	10	3078718	3078727	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2023	NC_017857	ATTGT	2	10	3083376	3083385	20 %	60 %	20 %	0 %	387128866
2024	NC_017857	CTATA	2	10	3083823	3083832	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2025	NC_017857	ATCTG	2	10	3084310	3084319	20 %	40 %	20 %	20 %	387128868
2026	NC_017857	ATGTC	2	10	3085016	3085025	20 %	40 %	20 %	20 %	387128869
2027	NC_017857	CCCTT	2	10	3085855	3085864	0 %	40 %	0 %	60 %	387128870
2028	NC_017857	CAGAA	2	10	3087653	3087662	60 %	0 %	20 %	20 %	387128872
2029	NC_017857	GCCAT	2	10	3089086	3089095	20 %	20 %	20 %	40 %	387128874
2030	NC_017857	TAGCT	2	10	3094765	3094774	20 %	40 %	20 %	20 %	387128881
2031	NC_017857	GATTT	2	10	3095284	3095293	20 %	60 %	20 %	0 %	387128882
2032	NC_017857	TTAAA	2	10	3099686	3099695	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2033	NC_017857	GGTGT	2	10	3100000	3100009	0 %	40 %	60 %	0 %	387128887
2034	NC_017857	CAACA	2	10	3100385	3100394	60 %	0 %	0 %	40 %	387128887
2035	NC_017857	CCATC	2	10	3100574	3100583	20 %	20 %	0 %	60 %	387128887
2036	NC_017857	GGCAC	2	10	3106425	3106434	20 %	0 %	40 %	40 %	387128896
2037	NC_017857	TCAAT	2	10	3107314	3107323	40 %	40 %	0 %	20 %	387128897
2038	NC_017857	TCCGA	2	10	3107367	3107376	20 %	20 %	20 %	40 %	387128897
2039	NC_017857	TGCAT	2	10	3108595	3108604	20 %	40 %	20 %	20 %	387128898
2040	NC_017857	AACAG	2	10	3110206	3110215	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
2041	NC_017857	ATCTG	2	10	3114396	3114405	20 %	40 %	20 %	20 %	387128904
2042	NC_017857	ATGTC	2	10	3115102	3115111	20 %	40 %	20 %	20 %	387128905
2043	NC_017857	ACCAA	2	10	3116665	3116674	60 %	0 %	0 %	40 %	387128907
2044	NC_017857	CATGA	2	10	3117536	3117545	40 %	20 %	20 %	20 %	387128908
2045	NC_017857	CGCTG	2	10	3118315	3118324	0 %	20 %	40 %	40 %	387128909
2046	NC_017857	CCTGC	2	10	3119588	3119597	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
2047	NC_017857	GACTC	2	10	3120268	3120277	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2048	NC_017857	CCCCG	2	10	3120339	3120348	0 %	0 %	20 %	80 %	387128913
2049	NC_017857	AGTCC	2	10	3121420	3121429	20 %	20 %	20 %	40 %	387128913
2050	NC_017857	AGCTG	2	10	3126717	3126726	20 %	20 %	40 %	20 %	387128918
2051	NC_017857	ATCTG	2	10	3129026	3129035	20 %	40 %	20 %	20 %	387128920
2052	NC_017857	GTGCT	2	10	3129264	3129273	0 %	40 %	40 %	20 %	387128920
2053	NC_017857	ATGTC	2	10	3129732	3129741	20 %	40 %	20 %	20 %	387128921
2054	NC_017857	CGCTT	2	10	3130440	3130449	0 %	40 %	20 %	40 %	387128923
2055	NC_017857	TCGCT	2	10	3131040	3131049	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2056	NC_017857	AAGTA	2	10	3131528	3131537	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2057	NC_017857	CTAAC	2	10	3133019	3133028	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
2058	NC_017857	CGACT	2	10	3133448	3133457	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2059	NC_017857	TTGTT	2	10	3134102	3134111	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2060	NC_017857	TTTAC	2	10	3134899	3134908	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2061	NC_017857	GGGTT	2	10	3135232	3135241	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
2062	NC_017857	CACGA	2	10	3135952	3135961	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding

< Previous 1 2 3 45Next >