MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Methylophaga sp. JAM1 chromosome

Total Repeats: 2062

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017857	GCGGT	2	10	2257792	2257801	0 %	20 %	60 %	20 %	387128051
1502	NC_017857	AGTTT	2	10	2258630	2258639	20 %	60 %	20 %	0 %	387128052
1503	NC_017857	GCTTT	2	10	2259527	2259536	0 %	60 %	20 %	20 %	387128052
1504	NC_017857	TTGTT	2	10	2260802	2260811	0 %	80 %	20 %	0 %	387128052
1505	NC_017857	ATTCA	2	10	2264046	2264055	40 %	40 %	0 %	20 %	387128055
1506	NC_017857	AAGGA	2	10	2264865	2264874	60 %	0 %	40 %	0 %	387128056
1507	NC_017857	GCAAA	2	10	2265560	2265569	60 %	0 %	20 %	20 %	387128057
1508	NC_017857	TCGGA	2	10	2265638	2265647	20 %	20 %	40 %	20 %	387128057
1509	NC_017857	GCAAT	2	10	2268354	2268363	40 %	20 %	20 %	20 %	387128058
1510	NC_017857	ATGGG	2	10	2268768	2268777	20 %	20 %	60 %	0 %	387128059
1511	NC_017857	CTTCG	2	10	2271916	2271925	0 %	40 %	20 %	40 %	387128062
1512	NC_017857	CTTTT	2	10	2272552	2272561	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1513	NC_017857	TGGAT	2	10	2273681	2273690	20 %	40 %	40 %	0 %	387128063
1514	NC_017857	GCGGA	2	10	2274630	2274639	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1515	NC_017857	CCGAT	2	10	2279740	2279749	20 %	20 %	20 %	40 %	387128068
1516	NC_017857	TGAAA	2	10	2279810	2279819	60 %	20 %	20 %	0 %	387128068
1517	NC_017857	GTTTG	2	10	2280327	2280336	0 %	60 %	40 %	0 %	387128068
1518	NC_017857	GCATG	2	10	2281041	2281050	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1519	NC_017857	ACGGC	2	10	2282116	2282125	20 %	0 %	40 %	40 %	387128070
1520	NC_017857	CCTTG	2	10	2283188	2283197	0 %	40 %	20 %	40 %	387128071
1521	NC_017857	GATGA	2	10	2285040	2285049	40 %	20 %	40 %	0 %	387128072
1522	NC_017857	CTTTT	2	10	2286176	2286185	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1523	NC_017857	AAATT	2	10	2287334	2287343	60 %	40 %	0 %	0 %	387128074
1524	NC_017857	CGCAC	2	10	2287932	2287941	20 %	0 %	20 %	60 %	387128074
1525	NC_017857	TGCGC	2	10	2287950	2287959	0 %	20 %	40 %	40 %	387128074
1526	NC_017857	CCATG	2	10	2289360	2289369	20 %	20 %	20 %	40 %	387128075
1527	NC_017857	TGAAT	2	10	2290224	2290233	40 %	40 %	20 %	0 %	387128075
1528	NC_017857	CAGGC	2	10	2292546	2292555	20 %	0 %	40 %	40 %	387128078
1529	NC_017857	CACTG	2	10	2293134	2293143	20 %	20 %	20 %	40 %	387128078
1530	NC_017857	CTTTA	2	10	2293407	2293416	20 %	60 %	0 %	20 %	387128078
1531	NC_017857	ATCTT	2	10	2296857	2296866	20 %	60 %	0 %	20 %	387128079
1532	NC_017857	TCATT	2	10	2299165	2299174	20 %	60 %	0 %	20 %	387128080
1533	NC_017857	TTCCA	2	10	2302497	2302506	20 %	40 %	0 %	40 %	387128082
1534	NC_017857	CTGCG	2	10	2304464	2304473	0 %	20 %	40 %	40 %	387128084
1535	NC_017857	CTGCC	2	10	2304951	2304960	0 %	20 %	20 %	60 %	387128084
1536	NC_017857	GCTGA	2	10	2305233	2305242	20 %	20 %	40 %	20 %	387128084
1537	NC_017857	AAAAC	2	10	2306376	2306385	80 %	0 %	0 %	20 %	387128085
1538	NC_017857	GTCGC	2	10	2307555	2307564	0 %	20 %	40 %	40 %	387128087
1539	NC_017857	ATTGC	2	10	2309873	2309882	20 %	40 %	20 %	20 %	387128089
1540	NC_017857	TGCAT	2	10	2311830	2311839	20 %	40 %	20 %	20 %	387128091
1541	NC_017857	GCTAC	2	10	2311929	2311938	20 %	20 %	20 %	40 %	387128091
1542	NC_017857	TTTTA	2	10	2312027	2312036	20 %	80 %	0 %	0 %	387128091
1543	NC_017857	GGTTC	2	10	2313904	2313913	0 %	40 %	40 %	20 %	387128093
1544	NC_017857	GCTTC	2	10	2314726	2314735	0 %	40 %	20 %	40 %	387128093
1545	NC_017857	TCAAT	2	10	2316924	2316933	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1546	NC_017857	TCAAA	2	10	2320481	2320490	60 %	20 %	0 %	20 %	387128100
1547	NC_017857	AGTTG	2	10	2321757	2321766	20 %	40 %	40 %	0 %	387128102
1548	NC_017857	CCAAA	2	10	2322838	2322847	60 %	0 %	0 %	40 %	387128104
1549	NC_017857	CGGTC	2	10	2323441	2323450	0 %	20 %	40 %	40 %	387128104
1550	NC_017857	GAACA	2	10	2323796	2323805	60 %	0 %	20 %	20 %	387128104
1551	NC_017857	CCGAT	2	10	2324495	2324504	20 %	20 %	20 %	40 %	387128105
1552	NC_017857	GCTTC	2	10	2324947	2324956	0 %	40 %	20 %	40 %	387128105
1553	NC_017857	CACCC	2	10	2325033	2325042	20 %	0 %	0 %	80 %	387128105
1554	NC_017857	TGGTG	2	10	2326241	2326250	0 %	40 %	60 %	0 %	387128107
1555	NC_017857	ACTGA	2	10	2327512	2327521	40 %	20 %	20 %	20 %	387128108
1556	NC_017857	TTATT	2	10	2329899	2329908	20 %	80 %	0 %	0 %	387128111
1557	NC_017857	ATTGG	2	10	2329962	2329971	20 %	40 %	40 %	0 %	387128111
1558	NC_017857	TCATT	2	10	2332233	2332242	20 %	60 %	0 %	20 %	387128112
1559	NC_017857	CCTGA	2	10	2332635	2332644	20 %	20 %	20 %	40 %	387128112
1560	NC_017857	CAACT	2	10	2333456	2333465	40 %	20 %	0 %	40 %	387128113
1561	NC_017857	CCATA	2	10	2335085	2335094	40 %	20 %	0 %	40 %	387128115
1562	NC_017857	GCAAT	2	10	2341990	2341999	40 %	20 %	20 %	20 %	387128123
1563	NC_017857	TGTTC	2	10	2343047	2343056	0 %	60 %	20 %	20 %	387128124
1564	NC_017857	CTCAG	2	10	2346105	2346114	20 %	20 %	20 %	40 %	387128127
1565	NC_017857	GGATT	2	10	2346776	2346785	20 %	40 %	40 %	0 %	387128128
1566	NC_017857	TGGAA	2	10	2348018	2348027	40 %	20 %	40 %	0 %	387128129
1567	NC_017857	CAAAG	2	10	2349315	2349324	60 %	0 %	20 %	20 %	387128130
1568	NC_017857	ACACC	2	10	2349611	2349620	40 %	0 %	0 %	60 %	387128130
1569	NC_017857	TGGCT	2	10	2350656	2350665	0 %	40 %	40 %	20 %	387128131
1570	NC_017857	TTTTC	2	10	2351842	2351851	0 %	80 %	0 %	20 %	387128133
1571	NC_017857	ATTTA	2	10	2353313	2353322	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_017857	CGTGT	2	10	2356361	2356370	0 %	40 %	40 %	20 %	387128138
1573	NC_017857	CCTCT	2	10	2356400	2356409	0 %	40 %	0 %	60 %	387128138
1574	NC_017857	AACCA	2	10	2356551	2356560	60 %	0 %	0 %	40 %	387128138
1575	NC_017857	TCGCT	2	10	2358396	2358405	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1576	NC_017857	AAGTA	2	10	2358884	2358893	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_017857	CATCC	2	10	2360202	2360211	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1578	NC_017857	CTAAC	2	10	2360387	2360396	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1579	NC_017857	CGACT	2	10	2360816	2360825	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1580	NC_017857	TTTAC	2	10	2362274	2362283	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1581	NC_017857	GGGTT	2	10	2362626	2362635	0 %	40 %	60 %	0 %	387128140
1582	NC_017857	CACGA	2	10	2363354	2363363	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1583	NC_017857	AATCA	2	10	2365354	2365363	60 %	20 %	0 %	20 %	387128142
1584	NC_017857	CTGCT	2	10	2366363	2366372	0 %	40 %	20 %	40 %	387128143
1585	NC_017857	CTTAC	2	10	2367274	2367283	20 %	40 %	0 %	40 %	387128145
1586	NC_017857	AACCA	2	10	2368324	2368333	60 %	0 %	0 %	40 %	387128146
1587	NC_017857	GCGAC	2	10	2370287	2370296	20 %	0 %	40 %	40 %	387128149
1588	NC_017857	ATTTA	2	10	2371696	2371705	40 %	60 %	0 %	0 %	387128152
1589	NC_017857	AGCAA	2	10	2372721	2372730	60 %	0 %	20 %	20 %	387128155
1590	NC_017857	AATGA	2	10	2372971	2372980	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_017857	GGCCA	2	10	2374153	2374162	20 %	0 %	40 %	40 %	387128159
1592	NC_017857	TTCAA	2	10	2375922	2375931	40 %	40 %	0 %	20 %	387128163
1593	NC_017857	GTTCC	2	10	2377394	2377403	0 %	40 %	20 %	40 %	387128166
1594	NC_017857	TCAGC	2	10	2379037	2379046	20 %	20 %	20 %	40 %	387128168
1595	NC_017857	AACCA	2	10	2384894	2384903	60 %	0 %	0 %	40 %	387128172
1596	NC_017857	GCCTG	2	10	2387368	2387377	0 %	20 %	40 %	40 %	387128173
1597	NC_017857	GTTCA	2	10	2387964	2387973	20 %	40 %	20 %	20 %	387128173
1598	NC_017857	TACGG	2	10	2389247	2389256	20 %	20 %	40 %	20 %	387128173
1599	NC_017857	TTTTG	2	10	2390692	2390701	0 %	80 %	20 %	0 %	387128173
1600	NC_017857	CATTG	2	10	2390892	2390901	20 %	40 %	20 %	20 %	387128173
1601	NC_017857	TCAGC	2	10	2395395	2395404	20 %	20 %	20 %	40 %	387128180
1602	NC_017857	ACCAA	2	10	2400666	2400675	60 %	0 %	0 %	40 %	387128186
1603	NC_017857	TCCAG	2	10	2403824	2403833	20 %	20 %	20 %	40 %	387128188
1604	NC_017857	ATACG	2	10	2403845	2403854	40 %	20 %	20 %	20 %	387128188
1605	NC_017857	CATCA	2	10	2405179	2405188	40 %	20 %	0 %	40 %	387128189
1606	NC_017857	ATGGC	2	10	2405544	2405553	20 %	20 %	40 %	20 %	387128190
1607	NC_017857	AACGC	2	10	2405974	2405983	40 %	0 %	20 %	40 %	387128191
1608	NC_017857	TATTT	2	10	2406906	2406915	20 %	80 %	0 %	0 %	387128191
1609	NC_017857	CAACG	2	10	2410890	2410899	40 %	0 %	20 %	40 %	387128195
1610	NC_017857	TGGCA	2	10	2411124	2411133	20 %	20 %	40 %	20 %	387128195
1611	NC_017857	AACCG	2	10	2412645	2412654	40 %	0 %	20 %	40 %	387128197
1612	NC_017857	AAACT	2	10	2413643	2413652	60 %	20 %	0 %	20 %	387128199
1613	NC_017857	CTCAT	2	10	2413833	2413842	20 %	40 %	0 %	40 %	387128199
1614	NC_017857	TCATT	2	10	2414347	2414356	20 %	60 %	0 %	20 %	387128199
1615	NC_017857	TCATT	2	10	2416147	2416156	20 %	60 %	0 %	20 %	387128200
1616	NC_017857	GGGAA	2	10	2416867	2416876	40 %	0 %	60 %	0 %	387128201
1617	NC_017857	CGGCT	2	10	2417112	2417121	0 %	20 %	40 %	40 %	387128201
1618	NC_017857	TCAGC	2	10	2417144	2417153	20 %	20 %	20 %	40 %	387128201
1619	NC_017857	ATTGT	2	10	2417941	2417950	20 %	60 %	20 %	0 %	387128202
1620	NC_017857	CACAT	2	10	2420939	2420948	40 %	20 %	0 %	40 %	387128205
1621	NC_017857	CAATA	2	10	2421379	2421388	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1622	NC_017857	AACCA	2	10	2423104	2423113	60 %	0 %	0 %	40 %	387128208
1623	NC_017857	TGGTG	2	10	2425526	2425535	0 %	40 %	60 %	0 %	387128211
1624	NC_017857	CTCTG	2	10	2427356	2427365	0 %	40 %	20 %	40 %	387128213
1625	NC_017857	ACTTT	2	10	2429671	2429680	20 %	60 %	0 %	20 %	387128214
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1997	NC_017857	GTTTA	2	10	3038096	3038105	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1998	NC_017857	TGCAT	2	10	3038267	3038276	20 %	40 %	20 %	20 %	387128820
1999	NC_017857	CCCTA	2	10	3038546	3038555	20 %	20 %	0 %	60 %	387128821
2000	NC_017857	TTTCA	2	10	3038826	3038835	20 %	60 %	0 %	20 %	387128822

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