MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Methylophaga sp. JAM1 chromosome

Total Repeats: 2062

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017857	ACAGA	2	10	1452503	1452512	60 %	0 %	20 %	20 %	387127312
1002	NC_017857	ATTCA	2	10	1456426	1456435	40 %	40 %	0 %	20 %	387127315
1003	NC_017857	CTGAA	2	10	1457346	1457355	40 %	20 %	20 %	20 %	387127316
1004	NC_017857	ACTGG	2	10	1457998	1458007	20 %	20 %	40 %	20 %	387127316
1005	NC_017857	GGGGC	2	10	1458401	1458410	0 %	0 %	80 %	20 %	387127317
1006	NC_017857	ACTGG	2	10	1459030	1459039	20 %	20 %	40 %	20 %	387127317
1007	NC_017857	AGTTC	2	10	1464197	1464206	20 %	40 %	20 %	20 %	387127322
1008	NC_017857	ATCAA	2	10	1464421	1464430	60 %	20 %	0 %	20 %	387127322
1009	NC_017857	CAGAG	2	10	1464736	1464745	40 %	0 %	40 %	20 %	387127323
1010	NC_017857	CAGTA	2	10	1465123	1465132	40 %	20 %	20 %	20 %	387127323
1011	NC_017857	TTTTG	2	10	1470137	1470146	0 %	80 %	20 %	0 %	387127327
1012	NC_017857	AGTCA	2	10	1470626	1470635	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1013	NC_017857	TTCAG	2	10	1472740	1472749	20 %	40 %	20 %	20 %	387127329
1014	NC_017857	GCGAT	2	10	1473436	1473445	20 %	20 %	40 %	20 %	387127330
1015	NC_017857	TGCGG	2	10	1473665	1473674	0 %	20 %	60 %	20 %	387127330
1016	NC_017857	TCGAC	2	10	1473975	1473984	20 %	20 %	20 %	40 %	387127330
1017	NC_017857	TTTTA	2	10	1478953	1478962	20 %	80 %	0 %	0 %	387127335
1018	NC_017857	CCGGG	2	10	1479049	1479058	0 %	0 %	60 %	40 %	387127335
1019	NC_017857	ATAGG	2	10	1479495	1479504	40 %	20 %	40 %	0 %	387127335
1020	NC_017857	GCAGG	2	10	1480543	1480552	20 %	0 %	60 %	20 %	387127336
1021	NC_017857	TCATC	2	10	1480579	1480588	20 %	40 %	0 %	40 %	387127336
1022	NC_017857	TGCAT	2	10	1481427	1481436	20 %	40 %	20 %	20 %	387127336
1023	NC_017857	TCAAT	2	10	1481710	1481719	40 %	40 %	0 %	20 %	387127336
1024	NC_017857	GAACA	2	10	1482823	1482832	60 %	0 %	20 %	20 %	387127339
1025	NC_017857	AGAAT	2	10	1484427	1484436	60 %	20 %	20 %	0 %	387127340
1026	NC_017857	ACATT	2	10	1484697	1484706	40 %	40 %	0 %	20 %	387127340
1027	NC_017857	TGAAT	2	10	1486640	1486649	40 %	40 %	20 %	0 %	387127341
1028	NC_017857	AACAT	2	10	1489365	1489374	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1029	NC_017857	ATCTG	2	10	1492717	1492726	20 %	40 %	20 %	20 %	387127349
1030	NC_017857	GTGCT	2	10	1492955	1492964	0 %	40 %	40 %	20 %	387127349
1031	NC_017857	ATGTC	2	10	1493423	1493432	20 %	40 %	20 %	20 %	387127350
1032	NC_017857	ATTTC	2	10	1494597	1494606	20 %	60 %	0 %	20 %	387127351
1033	NC_017857	CACGT	2	10	1494623	1494632	20 %	20 %	20 %	40 %	387127351
1034	NC_017857	GTTTT	2	10	1496607	1496616	0 %	80 %	20 %	0 %	387127353
1035	NC_017857	GGCAG	2	10	1500836	1500845	20 %	0 %	60 %	20 %	387127358
1036	NC_017857	ATAAA	2	10	1502742	1502751	80 %	20 %	0 %	0 %	387127360
1037	NC_017857	TGAAA	2	10	1503351	1503360	60 %	20 %	20 %	0 %	387127361
1038	NC_017857	AATTT	2	10	1503915	1503924	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_017857	TCAGT	2	10	1504469	1504478	20 %	40 %	20 %	20 %	387127362
1040	NC_017857	AATGA	2	10	1508888	1508897	60 %	20 %	20 %	0 %	387127366
1041	NC_017857	ATGAT	2	10	1509048	1509057	40 %	40 %	20 %	0 %	387127367
1042	NC_017857	GTTTT	2	10	1509277	1509286	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_017857	AGCTT	2	10	1510844	1510853	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1044	NC_017857	AACTG	2	10	1511135	1511144	40 %	20 %	20 %	20 %	387127369
1045	NC_017857	TTTAA	2	10	1511579	1511588	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_017857	TGTCA	2	10	1512071	1512080	20 %	40 %	20 %	20 %	387127370
1047	NC_017857	TTATC	2	10	1513221	1513230	20 %	60 %	0 %	20 %	387127370
1048	NC_017857	TAAAA	2	10	1515741	1515750	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_017857	TGAGC	2	10	1516272	1516281	20 %	20 %	40 %	20 %	387127373
1050	NC_017857	TTGGT	2	10	1521403	1521412	0 %	60 %	40 %	0 %	387127379
1051	NC_017857	AGTGA	2	10	1522370	1522379	40 %	20 %	40 %	0 %	387127381
1052	NC_017857	GAAAT	2	10	1526073	1526082	60 %	20 %	20 %	0 %	387127382
1053	NC_017857	GTGAA	2	10	1526801	1526810	40 %	20 %	40 %	0 %	387127383
1054	NC_017857	AAACC	2	10	1530996	1531005	60 %	0 %	0 %	40 %	387127386
1055	NC_017857	TTTGC	2	10	1531057	1531066	0 %	60 %	20 %	20 %	387127386
1056	NC_017857	AACCA	2	10	1536679	1536688	60 %	0 %	0 %	40 %	387127392
1057	NC_017857	ATTCC	2	10	1539157	1539166	20 %	40 %	0 %	40 %	387127395
1058	NC_017857	CTTGA	2	10	1542343	1542352	20 %	40 %	20 %	20 %	387127396
1059	NC_017857	GATTG	2	10	1542620	1542629	20 %	40 %	40 %	0 %	387127397
1060	NC_017857	GCATG	2	10	1542764	1542773	20 %	20 %	40 %	20 %	387127397
1061	NC_017857	GCTTG	2	10	1546201	1546210	0 %	40 %	40 %	20 %	387127400
1062	NC_017857	TGCGC	2	10	1546882	1546891	0 %	20 %	40 %	40 %	387127401
1063	NC_017857	ATGCA	2	10	1547606	1547615	40 %	20 %	20 %	20 %	387127402
1064	NC_017857	GTCAT	2	10	1547621	1547630	20 %	40 %	20 %	20 %	387127402
1065	NC_017857	ATGCC	2	10	1549110	1549119	20 %	20 %	20 %	40 %	387127403
1066	NC_017857	CGGCA	2	10	1549354	1549363	20 %	0 %	40 %	40 %	387127403
1067	NC_017857	CGAAT	2	10	1550404	1550413	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1068	NC_017857	GGTCA	2	10	1551346	1551355	20 %	20 %	40 %	20 %	387127406
1069	NC_017857	CCAAA	2	10	1553629	1553638	60 %	0 %	0 %	40 %	387127408
1070	NC_017857	GGTTG	2	10	1554699	1554708	0 %	40 %	60 %	0 %	387127409
1071	NC_017857	AAAAT	2	10	1556548	1556557	80 %	20 %	0 %	0 %	387127411
1072	NC_017857	TCTGG	2	10	1559829	1559838	0 %	40 %	40 %	20 %	387127414
1073	NC_017857	AACTG	2	10	1561679	1561688	40 %	20 %	20 %	20 %	387127415
1074	NC_017857	CTTTT	2	10	1562530	1562539	0 %	80 %	0 %	20 %	387127417
1075	NC_017857	TGTTT	2	10	1567729	1567738	0 %	80 %	20 %	0 %	387127420
1076	NC_017857	AGATT	2	10	1572239	1572248	40 %	40 %	20 %	0 %	387127425
1077	NC_017857	TATTT	2	10	1573987	1573996	20 %	80 %	0 %	0 %	387127426
1078	NC_017857	TGGTG	2	10	1575940	1575949	0 %	40 %	60 %	0 %	387127428
1079	NC_017857	GCCCA	2	10	1578576	1578585	20 %	0 %	20 %	60 %	387127430
1080	NC_017857	AGCAG	2	10	1578971	1578980	40 %	0 %	40 %	20 %	387127430
1081	NC_017857	CAGAG	2	10	1580095	1580104	40 %	0 %	40 %	20 %	387127430
1082	NC_017857	ATTAT	2	10	1580716	1580725	40 %	60 %	0 %	0 %	387127431
1083	NC_017857	AGCCA	2	10	1585154	1585163	40 %	0 %	20 %	40 %	387127435
1084	NC_017857	GAATG	2	10	1588503	1588512	40 %	20 %	40 %	0 %	387127438
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1086	NC_017857	TTCGC	2	10	1592691	1592700	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1087	NC_017857	CAAAT	2	10	1594077	1594086	60 %	20 %	0 %	20 %	387127443
1088	NC_017857	AATCA	2	10	1594095	1594104	60 %	20 %	0 %	20 %	387127443
1089	NC_017857	AAGTG	2	10	1595065	1595074	40 %	20 %	40 %	0 %	387127444
1090	NC_017857	GTGAA	2	10	1595230	1595239	40 %	20 %	40 %	0 %	387127445
1091	NC_017857	TTTAT	2	10	1596086	1596095	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_017857	TTTGC	2	10	1597312	1597321	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1093	NC_017857	GGCAA	2	10	1599311	1599320	40 %	0 %	40 %	20 %	387127449
1094	NC_017857	CGGTA	2	10	1600523	1600532	20 %	20 %	40 %	20 %	387127450
1095	NC_017857	GTAAC	2	10	1604140	1604149	40 %	20 %	20 %	20 %	387127454
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1097	NC_017857	CGGCA	2	10	1606449	1606458	20 %	0 %	40 %	40 %	387127457
1098	NC_017857	TGATG	2	10	1606473	1606482	20 %	40 %	40 %	0 %	387127457
1099	NC_017857	TACGC	2	10	1607885	1607894	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1100	NC_017857	ATCAA	2	10	1610644	1610653	60 %	20 %	0 %	20 %	387127461
1101	NC_017857	GTTCC	2	10	1611694	1611703	0 %	40 %	20 %	40 %	387127462
1102	NC_017857	TGTGG	2	10	1611800	1611809	0 %	40 %	60 %	0 %	387127462
1103	NC_017857	GGTTG	2	10	1616426	1616435	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_017857	TAGCG	2	10	1616531	1616540	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1105	NC_017857	GTTGA	2	10	1618823	1618832	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_017857	TTTAA	2	10	1624388	1624397	40 %	60 %	0 %	0 %	387127474
1107	NC_017857	CCGTC	2	10	1624443	1624452	0 %	20 %	20 %	60 %	387127475
1108	NC_017857	TGATG	2	10	1624816	1624825	20 %	40 %	40 %	0 %	387127475
1109	NC_017857	AGCAG	2	10	1625968	1625977	40 %	0 %	40 %	20 %	387127475
1110	NC_017857	GGGCA	2	10	1627375	1627384	20 %	0 %	60 %	20 %	387127476
1111	NC_017857	TCTGC	2	10	1629357	1629366	0 %	40 %	20 %	40 %	387127479
1112	NC_017857	CTGGT	2	10	1630258	1630267	0 %	40 %	40 %	20 %	387127479
1113	NC_017857	GACTG	2	10	1631009	1631018	20 %	20 %	40 %	20 %	387127479
1114	NC_017857	TTGAT	2	10	1632557	1632566	20 %	60 %	20 %	0 %	387127480
1115	NC_017857	ACGAA	2	10	1634846	1634855	60 %	0 %	20 %	20 %	387127482
1116	NC_017857	CAAGG	2	10	1639186	1639195	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1117	NC_017857	CAGGC	2	10	1646608	1646617	20 %	0 %	40 %	40 %	387127489
1118	NC_017857	AAATG	2	10	1649179	1649188	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_017857	GCCGG	2	10	1650575	1650584	0 %	0 %	60 %	40 %	387127495
1120	NC_017857	AATGG	2	10	1651320	1651329	40 %	20 %	40 %	0 %	387127496
1121	NC_017857	GATGG	2	10	1652536	1652545	20 %	20 %	60 %	0 %	387127498
1122	NC_017857	AATAA	2	10	1654323	1654332	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_017857	AAATC	2	10	1663103	1663112	60 %	20 %	0 %	20 %	387127506
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1499	NC_017857	TTATT	2	10	2257090	2257099	20 %	80 %	0 %	0 %	387128049
1500	NC_017857	ATTGA	2	10	2257384	2257393	40 %	40 %	20 %	0 %	387128050

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