MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Methylophaga sp. JAM1 chromosome

Total Repeats: 2062

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017857	TCAGG	2	10	717832	717841	20 %	20 %	40 %	20 %	387126603
502	NC_017857	AAAAT	2	10	719785	719794	80 %	20 %	0 %	0 %	387126605
503	NC_017857	GAAAA	2	10	722978	722987	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
504	NC_017857	TCAAA	2	10	725989	725998	60 %	20 %	0 %	20 %	387126609
505	NC_017857	GAAGA	2	10	728025	728034	60 %	0 %	40 %	0 %	387126610
506	NC_017857	ATTTT	2	10	729714	729723	20 %	80 %	0 %	0 %	387126612
507	NC_017857	CGGAG	2	10	730376	730385	20 %	0 %	60 %	20 %	387126612
508	NC_017857	ATTAA	2	10	730558	730567	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_017857	AAATC	2	10	731445	731454	60 %	20 %	0 %	20 %	387126614
510	NC_017857	TTGTT	2	10	732179	732188	0 %	80 %	20 %	0 %	387126615
511	NC_017857	TGATC	2	10	733329	733338	20 %	40 %	20 %	20 %	387126615
512	NC_017857	TTTTG	2	10	734128	734137	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
513	NC_017857	ATTCC	2	10	734382	734391	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
514	NC_017857	GAAAA	2	10	735060	735069	80 %	0 %	20 %	0 %	387126616
515	NC_017857	AGTCT	2	10	735869	735878	20 %	40 %	20 %	20 %	387126616
516	NC_017857	AAAAT	2	10	738306	738315	80 %	20 %	0 %	0 %	387126616
517	NC_017857	GATAA	2	10	739328	739337	60 %	20 %	20 %	0 %	387126616
518	NC_017857	CCAAG	2	10	740913	740922	40 %	0 %	20 %	40 %	387126618
519	NC_017857	GTTTG	2	10	742197	742206	0 %	60 %	40 %	0 %	387126619
520	NC_017857	TTAGC	2	10	742471	742480	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
521	NC_017857	GTAAG	2	10	742494	742503	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
522	NC_017857	GGCAA	2	10	743380	743389	40 %	0 %	40 %	20 %	387126620
523	NC_017857	AACTG	2	10	747907	747916	40 %	20 %	20 %	20 %	387126622
524	NC_017857	GCCAG	2	10	754443	754452	20 %	0 %	40 %	40 %	387126626
525	NC_017857	CCAAC	2	10	756010	756019	40 %	0 %	0 %	60 %	387126627
526	NC_017857	TTCGA	2	10	757928	757937	20 %	40 %	20 %	20 %	387126629
527	NC_017857	TGGTT	2	10	760152	760161	0 %	60 %	40 %	0 %	387126630
528	NC_017857	GCTTT	2	10	760220	760229	0 %	60 %	20 %	20 %	387126630
529	NC_017857	GCATC	2	10	764108	764117	20 %	20 %	20 %	40 %	387126634
530	NC_017857	AGATT	2	10	764258	764267	40 %	40 %	20 %	0 %	387126634
531	NC_017857	TTGGC	2	10	764543	764552	0 %	40 %	40 %	20 %	387126635
532	NC_017857	TATTT	2	10	770937	770946	20 %	80 %	0 %	0 %	387126640
533	NC_017857	GTCTG	2	10	772587	772596	0 %	40 %	40 %	20 %	387126642
534	NC_017857	TTATG	2	10	774691	774700	20 %	60 %	20 %	0 %	387126646
535	NC_017857	CAGAG	2	10	775521	775530	40 %	0 %	40 %	20 %	387126648
536	NC_017857	CTGAG	2	10	776436	776445	20 %	20 %	40 %	20 %	387126650
537	NC_017857	GAATG	2	10	778583	778592	40 %	20 %	40 %	0 %	387126652
538	NC_017857	ACTGG	2	10	779322	779331	20 %	20 %	40 %	20 %	387126652
539	NC_017857	CCTGC	2	10	779583	779592	0 %	20 %	20 %	60 %	387126653
540	NC_017857	CTGCG	2	10	781073	781082	0 %	20 %	40 %	40 %	387126655
541	NC_017857	ATCTT	2	10	781175	781184	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
542	NC_017857	CTTTG	2	10	782140	782149	0 %	60 %	20 %	20 %	387126656
543	NC_017857	GGGGC	2	10	782449	782458	0 %	0 %	80 %	20 %	387126657
544	NC_017857	GCACA	2	10	784727	784736	40 %	0 %	20 %	40 %	387126659
545	NC_017857	AAAAC	2	10	785598	785607	80 %	0 %	0 %	20 %	387126661
546	NC_017857	GGCCC	2	10	789720	789729	0 %	0 %	40 %	60 %	387126665
547	NC_017857	AGTTG	2	10	790759	790768	20 %	40 %	40 %	0 %	387126665
548	NC_017857	TCAAT	2	10	794504	794513	40 %	40 %	0 %	20 %	387126668
549	NC_017857	TGCCA	2	10	794598	794607	20 %	20 %	20 %	40 %	387126668
550	NC_017857	AATTA	2	10	795423	795432	60 %	40 %	0 %	0 %	387126668
551	NC_017857	ATTGT	2	10	797862	797871	20 %	60 %	20 %	0 %	387126670
552	NC_017857	GCCTG	2	10	799067	799076	0 %	20 %	40 %	40 %	387126673
553	NC_017857	TTCTC	2	10	800577	800586	0 %	60 %	0 %	40 %	387126674
554	NC_017857	TATGT	2	10	800971	800980	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
555	NC_017857	ATGAA	2	10	802582	802591	60 %	20 %	20 %	0 %	387126676
556	NC_017857	ACTGC	2	10	803132	803141	20 %	20 %	20 %	40 %	387126677
557	NC_017857	AAAGC	2	10	803878	803887	60 %	0 %	20 %	20 %	387126678
558	NC_017857	ATAAA	2	10	805863	805872	80 %	20 %	0 %	0 %	387126678
559	NC_017857	GCACC	2	10	806864	806873	20 %	0 %	20 %	60 %	387126681
560	NC_017857	GGTTG	2	10	807008	807017	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
561	NC_017857	TCGCT	2	10	808220	808229	0 %	40 %	20 %	40 %	387126684
562	NC_017857	TGGCG	2	10	810027	810036	0 %	20 %	60 %	20 %	387126685
563	NC_017857	CCGGC	2	10	814121	814130	0 %	0 %	40 %	60 %	387126690
564	NC_017857	TTTCA	2	10	815941	815950	20 %	60 %	0 %	20 %	387126690
565	NC_017857	ATCTG	2	10	818213	818222	20 %	40 %	20 %	20 %	387126691
566	NC_017857	CTTTT	2	10	818700	818709	0 %	80 %	0 %	20 %	387126692
567	NC_017857	CTCGC	2	10	821809	821818	0 %	20 %	20 %	60 %	387126697
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570	NC_017857	AAATG	2	10	827267	827276	60 %	20 %	20 %	0 %	387126701
571	NC_017857	CCAGA	2	10	829172	829181	40 %	0 %	20 %	40 %	387126703
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573	NC_017857	CTGGT	2	10	837565	837574	0 %	40 %	40 %	20 %	387126712
574	NC_017857	TGACC	2	10	838970	838979	20 %	20 %	20 %	40 %	387126713
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576	NC_017857	TTGGT	2	10	840147	840156	0 %	60 %	40 %	0 %	387126714
577	NC_017857	TGATT	2	10	841172	841181	20 %	60 %	20 %	0 %	387126714
578	NC_017857	CGTGA	2	10	843188	843197	20 %	20 %	40 %	20 %	387126715
579	NC_017857	GGGCT	2	10	844860	844869	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
580	NC_017857	CCATG	2	10	845644	845653	20 %	20 %	20 %	40 %	387126719
581	NC_017857	TTTAG	2	10	852475	852484	20 %	60 %	20 %	0 %	387126722
582	NC_017857	ATACT	2	10	852593	852602	40 %	40 %	0 %	20 %	387126722
583	NC_017857	TTCTT	2	10	854281	854290	0 %	80 %	0 %	20 %	387126724
584	NC_017857	CTTTT	2	10	854845	854854	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
585	NC_017857	TTTGT	2	10	855597	855606	0 %	80 %	20 %	0 %	387126725
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588	NC_017857	GCCGT	2	10	857469	857478	0 %	20 %	40 %	40 %	387126727
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591	NC_017857	CCCTG	2	10	860397	860406	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
592	NC_017857	TTCTG	2	10	864656	864665	0 %	60 %	20 %	20 %	387126734
593	NC_017857	AGTGG	2	10	864680	864689	20 %	20 %	60 %	0 %	387126734
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596	NC_017857	GATCC	2	10	866775	866784	20 %	20 %	20 %	40 %	387126735
597	NC_017857	TCATT	2	10	869543	869552	20 %	60 %	0 %	20 %	387126738
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599	NC_017857	TCAGC	2	10	870737	870746	20 %	20 %	20 %	40 %	387126739
600	NC_017857	ACCGT	2	10	872904	872913	20 %	20 %	20 %	40 %	387126742
601	NC_017857	TAATT	2	10	873332	873341	40 %	60 %	0 %	0 %	387126742
602	NC_017857	TACCA	2	10	873650	873659	40 %	20 %	0 %	40 %	387126742
603	NC_017857	GAATG	2	10	874967	874976	40 %	20 %	40 %	0 %	387126744
604	NC_017857	CAGTC	2	10	876142	876151	20 %	20 %	20 %	40 %	387126745
605	NC_017857	CAAAA	2	10	877031	877040	80 %	0 %	0 %	20 %	387126746
606	NC_017857	TTACG	2	10	878907	878916	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
607	NC_017857	TGGAT	2	10	879119	879128	20 %	40 %	40 %	0 %	387126747
608	NC_017857	ACACA	2	10	879492	879501	60 %	0 %	0 %	40 %	387126747
609	NC_017857	GTGTT	2	10	881405	881414	0 %	60 %	40 %	0 %	387126750
610	NC_017857	TTGAT	2	10	882739	882748	20 %	60 %	20 %	0 %	387126751
611	NC_017857	TTAAT	2	10	887412	887421	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_017857	ATCTG	2	10	887680	887689	20 %	40 %	20 %	20 %	387126758
613	NC_017857	AGATC	2	10	888011	888020	40 %	20 %	20 %	20 %	387126758
614	NC_017857	GTTCA	2	10	888994	889003	20 %	40 %	20 %	20 %	387126759
615	NC_017857	GCCAG	2	10	890791	890800	20 %	0 %	40 %	40 %	387126760
616	NC_017857	ACGTT	2	10	892034	892043	20 %	40 %	20 %	20 %	387126761
617	NC_017857	AAACA	2	10	893209	893218	80 %	0 %	0 %	20 %	387126761
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620	NC_017857	GGTAC	2	10	895266	895275	20 %	20 %	40 %	20 %	387126764
621	NC_017857	CTATT	2	10	896176	896185	20 %	60 %	0 %	20 %	387126764
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627	NC_017857	GGGCA	2	10	906838	906847	20 %	0 %	60 %	20 %	387126775
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629	NC_017857	CTTGG	2	10	911498	911507	0 %	40 %	40 %	20 %	387126779
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