MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Methylophaga sp. JAM1 chromosome

Total Repeats: 41351

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_017857	CTG	2	6	457778	457783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126339
6002	NC_017857	AAC	2	6	457827	457832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126339
6003	NC_017857	GAT	2	6	457859	457864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126339
6004	NC_017857	AAG	2	6	457926	457931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387126339
6005	NC_017857	CAT	2	6	457982	457987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126339
6006	NC_017857	TGC	2	6	458110	458115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126339
6007	NC_017857	ACT	2	6	458218	458223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126339
6008	NC_017857	ATT	2	6	458452	458457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126340
6009	NC_017857	GTT	2	6	458484	458489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387126340
6010	NC_017857	GAT	2	6	458541	458546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126340
6011	NC_017857	TGG	2	6	458589	458594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126340
6012	NC_017857	CCG	2	6	458610	458615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387126340
6013	NC_017857	TGA	2	6	458753	458758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126340
6014	NC_017857	TTC	2	6	459012	459017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387126341
6015	NC_017857	AGC	2	6	459054	459059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126341
6016	NC_017857	TGA	2	6	459108	459113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126341
6017	NC_017857	TTG	2	6	459118	459123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387126341
6018	NC_017857	TCA	2	6	459288	459293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126341
6019	NC_017857	TGG	2	6	459313	459318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126341
6020	NC_017857	ATG	2	6	459354	459359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126341
6021	NC_017857	CAA	2	6	459419	459424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126341
6022	NC_017857	AGC	2	6	459688	459693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6023	NC_017857	ATC	2	6	459742	459747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6024	NC_017857	TCT	2	6	459840	459845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387126342
6025	NC_017857	ATC	2	6	460220	460225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126342
6026	NC_017857	TGC	2	6	460329	460334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126342
6027	NC_017857	ATT	2	6	460442	460447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126342
6028	NC_017857	GTG	2	6	460502	460507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126342
6029	NC_017857	ACA	2	6	460525	460530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126342
6030	NC_017857	CAT	2	6	460955	460960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126342
6031	NC_017857	TGG	2	6	460961	460966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126342
6032	NC_017857	GCG	2	6	461015	461020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6033	NC_017857	CAC	2	6	461105	461110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6034	NC_017857	AGG	2	6	461117	461122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_017857	CAT	2	6	461155	461160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6036	NC_017857	GGT	2	6	461197	461202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_017857	AAC	2	6	461356	461361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6038	NC_017857	TCC	2	6	461551	461556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6039	NC_017857	CAC	2	6	461601	461606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6040	NC_017857	ACA	2	6	461671	461676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6041	NC_017857	GAG	2	6	461727	461732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_017857	TTG	2	6	461935	461940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387126343
6043	NC_017857	CAC	2	6	461947	461952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126343
6044	NC_017857	GAA	2	6	461970	461975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387126343
6045	NC_017857	CAG	2	6	461979	461984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126343
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6047	NC_017857	GCA	2	6	462275	462280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126344
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6049	NC_017857	GGT	2	6	462385	462390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126344
6050	NC_017857	TGC	2	6	462398	462403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126344
6051	NC_017857	GAT	2	6	462406	462411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126344
6052	NC_017857	GAA	2	6	462415	462420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387126344
6053	NC_017857	CGG	2	6	462513	462518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387126344
6054	NC_017857	ATT	2	6	462765	462770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126344
6055	NC_017857	TGT	2	6	462822	462827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387126344
6056	NC_017857	CAA	2	6	462852	462857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126344
6057	NC_017857	TGA	2	6	462891	462896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126344
6058	NC_017857	TGC	2	6	462957	462962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126344
6059	NC_017857	TGA	2	6	463107	463112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126344
6060	NC_017857	TGG	2	6	463128	463133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126344
6061	NC_017857	CTG	2	6	463153	463158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126344
6062	NC_017857	TGC	2	6	463167	463172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126344
6063	NC_017857	TGT	2	6	463212	463217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387126344
6064	NC_017857	CCA	2	6	463238	463243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126344
6065	NC_017857	TTC	2	6	463304	463309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387126344
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6067	NC_017857	GTT	2	6	463356	463361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_017857	TAA	2	6	463406	463411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_017857	TGA	2	6	463431	463436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_017857	TTA	2	6	463664	463669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126345
6071	NC_017857	CTG	2	6	463797	463802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126345
6072	NC_017857	GTT	2	6	463821	463826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387126345
6073	NC_017857	CTG	2	6	463957	463962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126346
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6075	NC_017857	CTG	2	6	464010	464015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126346
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6083	NC_017857	AGA	2	6	464855	464860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387126346
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6088	NC_017857	CGA	2	6	465775	465780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126347
6089	NC_017857	GAT	2	6	465825	465830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126347
6090	NC_017857	TAG	2	6	465875	465880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126347
6091	NC_017857	ATT	2	6	465925	465930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126347
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6103	NC_017857	ATG	2	6	466777	466782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126348
6104	NC_017857	TCC	2	6	466846	466851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6105	NC_017857	TCA	2	6	466996	467001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6107	NC_017857	GAA	2	6	467044	467049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_017857	TGT	2	6	467120	467125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387126349
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6110	NC_017857	AAG	2	6	467198	467203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387126349
6111	NC_017857	CAA	2	6	467216	467221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126349
6112	NC_017857	GAA	2	6	467284	467289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387126349
6113	NC_017857	TGG	2	6	467321	467326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126349
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6115	NC_017857	TGG	2	6	467363	467368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126349
6116	NC_017857	CAT	2	6	467413	467418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126349
6117	NC_017857	CTG	2	6	467428	467433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126349
6118	NC_017857	AGC	3	9	467447	467455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126349
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