MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Methanobacterium sp. SWAN-1 chromosome

Total Repeats: 2252

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015574	ATTAT	2	10	1381	1390	40 %	60 %	0 %	0 %	333986244
2	NC_015574	TAGAT	2	10	1545	1554	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015574	TCAAG	2	10	4006	4015	40 %	20 %	20 %	20 %	333986247
4	NC_015574	TCCCT	2	10	4900	4909	0 %	40 %	0 %	60 %	333986247
5	NC_015574	ACAAA	2	10	5472	5481	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_015574	CATAG	2	10	7161	7170	40 %	20 %	20 %	20 %	333986249
7	NC_015574	AGGGC	2	10	7181	7190	20 %	0 %	60 %	20 %	333986249
8	NC_015574	ATGAA	2	10	8641	8650	60 %	20 %	20 %	0 %	333986250
9	NC_015574	TATAT	2	10	11709	11718	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015574	AAGAT	2	10	14647	14656	60 %	20 %	20 %	0 %	333986254
11	NC_015574	ATTTA	2	10	16693	16702	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015574	GAGCG	2	10	17671	17680	20 %	0 %	60 %	20 %	333986259
13	NC_015574	TAATA	2	10	22647	22656	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015574	ATTTA	2	10	23393	23402	40 %	60 %	0 %	0 %	333986263
15	NC_015574	AAGTT	2	10	25854	25863	40 %	40 %	20 %	0 %	333986265
16	NC_015574	TATAA	2	10	26293	26302	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015574	TAAAA	2	10	27797	27806	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015574	TTTAA	2	10	28355	28364	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015574	ATAAA	2	10	28440	28449	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015574	AATTA	2	10	28476	28485	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015574	CATGG	2	10	30099	30108	20 %	20 %	40 %	20 %	333986269
22	NC_015574	AGCAC	2	10	30229	30238	40 %	0 %	20 %	40 %	333986269
23	NC_015574	CCATA	2	10	30961	30970	40 %	20 %	0 %	40 %	333986269
24	NC_015574	CTTTT	2	10	32308	32317	0 %	80 %	0 %	20 %	333986271
25	NC_015574	ATTTA	2	10	33185	33194	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015574	TATCA	2	10	33763	33772	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_015574	TCAAG	2	10	34710	34719	40 %	20 %	20 %	20 %	333986274
28	NC_015574	AAGGT	2	10	35475	35484	40 %	20 %	40 %	0 %	333986274
29	NC_015574	TGGTC	3	15	36854	36868	0 %	40 %	40 %	20 %	333986275
30	NC_015574	ATTTA	2	10	37070	37079	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015574	TCTGT	2	10	38313	38322	0 %	60 %	20 %	20 %	333986277
32	NC_015574	ATTTT	2	10	41070	41079	20 %	80 %	0 %	0 %	333986280
33	NC_015574	GGACT	2	10	44364	44373	20 %	20 %	40 %	20 %	333986282
34	NC_015574	CAACA	2	10	49583	49592	60 %	0 %	0 %	40 %	333986287
35	NC_015574	CTGTT	2	10	49612	49621	0 %	60 %	20 %	20 %	333986287
36	NC_015574	TACGT	2	10	51299	51308	20 %	40 %	20 %	20 %	333986287
37	NC_015574	TACAA	2	10	51482	51491	60 %	20 %	0 %	20 %	333986287
38	NC_015574	CAGTG	2	10	53195	53204	20 %	20 %	40 %	20 %	333986287
39	NC_015574	GCAGT	2	10	53539	53548	20 %	20 %	40 %	20 %	333986287
40	NC_015574	CAGGA	2	10	56415	56424	40 %	0 %	40 %	20 %	333986290
41	NC_015574	GAATG	2	10	57045	57054	40 %	20 %	40 %	0 %	333986290
42	NC_015574	CGGCA	2	10	57875	57884	20 %	0 %	40 %	40 %	333986290
43	NC_015574	ATTTA	2	10	58778	58787	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015574	ACAGA	2	10	59253	59262	60 %	0 %	20 %	20 %	333986291
45	NC_015574	ACCCA	2	10	59263	59272	40 %	0 %	0 %	60 %	333986291
46	NC_015574	AAATC	2	10	60693	60702	60 %	20 %	0 %	20 %	333986291
47	NC_015574	TGTAT	2	10	60836	60845	20 %	60 %	20 %	0 %	333986291
48	NC_015574	ATTTT	2	10	61389	61398	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015574	TAAAA	2	10	61440	61449	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015574	CATGC	2	10	62642	62651	20 %	20 %	20 %	40 %	333986293
51	NC_015574	TATAT	2	10	63157	63166	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015574	TTTTA	2	10	63167	63176	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015574	CTTAT	2	10	64148	64157	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_015574	CAATT	2	10	66227	66236	40 %	40 %	0 %	20 %	333986295
55	NC_015574	CCTTG	2	10	67127	67136	0 %	40 %	20 %	40 %	333986295
56	NC_015574	AAGAT	2	10	69944	69953	60 %	20 %	20 %	0 %	333986296
57	NC_015574	TAAGA	2	10	70668	70677	60 %	20 %	20 %	0 %	333986297
58	NC_015574	GACAG	2	10	73536	73545	40 %	0 %	40 %	20 %	333986300
59	NC_015574	TGTAA	2	10	75189	75198	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015574	TTAAT	2	10	75989	75998	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015574	TCTTA	2	10	76047	76056	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_015574	TTTAA	2	10	76609	76618	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015574	TGTAA	2	10	77630	77639	40 %	40 %	20 %	0 %	333986303
64	NC_015574	TTTCA	2	10	78711	78720	20 %	60 %	0 %	20 %	333986304
65	NC_015574	ATTTT	2	10	80257	80266	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015574	TATCG	2	10	80559	80568	20 %	40 %	20 %	20 %	333986306
67	NC_015574	TTCTG	2	10	81029	81038	0 %	60 %	20 %	20 %	333986306
68	NC_015574	TCATT	2	10	88570	88579	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_015574	ATAAG	2	10	89163	89172	60 %	20 %	20 %	0 %	333986312
70	NC_015574	GAAAG	2	10	91268	91277	60 %	0 %	40 %	0 %	333986314
71	NC_015574	TAAAA	2	10	92301	92310	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015574	TTTAT	2	10	93553	93562	20 %	80 %	0 %	0 %	333986316
73	NC_015574	AAAGG	2	10	95064	95073	60 %	0 %	40 %	0 %	333986318
74	NC_015574	TCCTC	2	10	95215	95224	0 %	40 %	0 %	60 %	333986318
75	NC_015574	TTTAT	2	10	95522	95531	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015574	AAATA	2	10	95917	95926	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015574	TTTTA	2	10	96067	96076	20 %	80 %	0 %	0 %	333986320
78	NC_015574	ATGGC	2	10	98487	98496	20 %	20 %	40 %	20 %	333986323
79	NC_015574	TGAAA	2	10	101268	101277	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015574	ATTTA	2	10	101368	101377	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015574	GATAT	2	10	102709	102718	40 %	40 %	20 %	0 %	333986325
82	NC_015574	AGATC	2	10	107111	107120	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_015574	TTCCA	2	10	108486	108495	20 %	40 %	0 %	40 %	333986329
84	NC_015574	TTTAA	2	10	110857	110866	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015574	TTTGT	2	10	111071	111080	0 %	80 %	20 %	0 %	333986333
86	NC_015574	ATTAA	2	10	113443	113452	60 %	40 %	0 %	0 %	333986337
87	NC_015574	TTTTA	2	10	115366	115375	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015574	CTTTA	2	10	117323	117332	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_015574	TTTAC	2	10	117557	117566	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_015574	AAGGA	2	10	119188	119197	60 %	0 %	40 %	0 %	333986341
91	NC_015574	ACTGG	2	10	122897	122906	20 %	20 %	40 %	20 %	333986342
92	NC_015574	CAGGA	2	10	122928	122937	40 %	0 %	40 %	20 %	333986342
93	NC_015574	AAATA	2	10	123576	123585	80 %	20 %	0 %	0 %	333986342
94	NC_015574	AAAAG	2	10	124061	124070	80 %	0 %	20 %	0 %	333986343
95	NC_015574	GGCAC	2	10	125455	125464	20 %	0 %	40 %	40 %	333986344
96	NC_015574	AAAAT	2	10	128828	128837	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015574	TGTTA	2	10	130475	130484	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015574	TAAAA	2	10	131782	131791	80 %	20 %	0 %	0 %	333986349
99	NC_015574	GGTCT	2	10	133128	133137	0 %	40 %	40 %	20 %	333986350
100	NC_015574	CGGAT	2	10	135574	135583	20 %	20 %	40 %	20 %	333986353
101	NC_015574	ACTAT	2	10	136908	136917	40 %	40 %	0 %	20 %	333986354
102	NC_015574	ATTCC	2	10	137445	137454	20 %	40 %	0 %	40 %	333986355
103	NC_015574	CTCTC	2	10	139703	139712	0 %	40 %	0 %	60 %	333986357
104	NC_015574	ATTTT	2	10	142181	142190	20 %	80 %	0 %	0 %	333986358
105	NC_015574	TAATT	2	10	142907	142916	40 %	60 %	0 %	0 %	333986358
106	NC_015574	GTTTT	2	10	146340	146349	0 %	80 %	20 %	0 %	333986361
107	NC_015574	TGTTT	2	10	146666	146675	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015574	AAGGG	2	10	146925	146934	40 %	0 %	60 %	0 %	333986362
109	NC_015574	GTGAA	2	10	149614	149623	40 %	20 %	40 %	0 %	333986366
110	NC_015574	GTATA	2	10	150546	150555	40 %	40 %	20 %	0 %	333986367
111	NC_015574	AAATG	2	10	151180	151189	60 %	20 %	20 %	0 %	333986367
112	NC_015574	GATCA	2	10	154772	154781	40 %	20 %	20 %	20 %	333986371
113	NC_015574	AATAA	2	10	154938	154947	80 %	20 %	0 %	0 %	333986371
114	NC_015574	AAATG	2	10	156484	156493	60 %	20 %	20 %	0 %	333986373
115	NC_015574	TTGAA	2	10	157134	157143	40 %	40 %	20 %	0 %	333986373
116	NC_015574	TGTTT	2	10	157492	157501	0 %	80 %	20 %	0 %	333986374
117	NC_015574	GTAAG	2	10	157792	157801	40 %	20 %	40 %	0 %	333986374
118	NC_015574	AGGGT	2	10	158562	158571	20 %	20 %	60 %	0 %	333986375
119	NC_015574	TAAAT	2	10	160269	160278	60 %	40 %	0 %	0 %	333986377
120	NC_015574	TTTGG	2	10	161356	161365	0 %	60 %	40 %	0 %	333986378
121	NC_015574	TGATA	2	10	161972	161981	40 %	40 %	20 %	0 %	333986379
122	NC_015574	CTTTT	2	10	162028	162037	0 %	80 %	0 %	20 %	333986379
123	NC_015574	CATAT	2	10	162627	162636	40 %	40 %	0 %	20 %	333986379
124	NC_015574	TTTAA	2	10	164295	164304	40 %	60 %	0 %	0 %	333986380
125	NC_015574	ACTGT	2	10	166183	166192	20 %	40 %	20 %	20 %	333986382
126	NC_015574	ATTTT	2	10	166339	166348	20 %	80 %	0 %	0 %	333986382
127	NC_015574	TTAAA	2	10	166520	166529	60 %	40 %	0 %	0 %	333986382
128	NC_015574	GTTTT	2	10	166886	166895	0 %	80 %	20 %	0 %	333986383
129	NC_015574	CATTT	2	10	167334	167343	20 %	60 %	0 %	20 %	333986383
130	NC_015574	ATATC	2	10	167684	167693	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_015574	GGAAC	2	10	168736	168745	40 %	0 %	40 %	20 %	333986385
132	NC_015574	TTCTT	2	10	171124	171133	0 %	80 %	0 %	20 %	333986389
133	NC_015574	ATTTT	2	10	171182	171191	20 %	80 %	0 %	0 %	333986389
134	NC_015574	TTATA	2	10	173613	173622	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015574	TTTGG	2	10	174908	174917	0 %	60 %	40 %	0 %	333986394
136	NC_015574	TCAAA	2	10	177847	177856	60 %	20 %	0 %	20 %	333986396
137	NC_015574	CCATG	2	10	179662	179671	20 %	20 %	20 %	40 %	333986399
138	NC_015574	TGTAT	2	10	180963	180972	20 %	60 %	20 %	0 %	333986399
139	NC_015574	TTTAA	2	10	181589	181598	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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269	NC_015574	ATTTT	2	10	329324	329333	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
270	NC_015574	GCTTC	2	10	331955	331964	0 %	40 %	20 %	40 %	333986533
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272	NC_015574	ACATG	2	10	333571	333580	40 %	20 %	20 %	20 %	333986535
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