MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Repeats of Methanobacterium sp. SWAN-1 chromosome

Total Repeats: 2252

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_015574	TTTCT	2	10	2245280	2245289	0 %	80 %	0 %	20 %	333988353
2002	NC_015574	TTAAA	2	10	2246300	2246309	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2003	NC_015574	TGTAT	2	10	2249038	2249047	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2004	NC_015574	TGAAA	2	10	2249518	2249527	60 %	20 %	20 %	0 %	333988359
2005	NC_015574	TTTTA	2	10	2250736	2250745	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2006	NC_015574	AATGA	2	10	2251177	2251186	60 %	20 %	20 %	0 %	333988362
2007	NC_015574	GAATT	2	10	2252597	2252606	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2008	NC_015574	CAATG	2	10	2252959	2252968	40 %	20 %	20 %	20 %	333988363
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2010	NC_015574	TTACC	2	10	2254593	2254602	20 %	40 %	0 %	40 %	333988364
2011	NC_015574	TCTCC	2	10	2257406	2257415	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
2012	NC_015574	AATCT	2	10	2259664	2259673	40 %	40 %	0 %	20 %	333988368
2013	NC_015574	ATGAT	2	10	2260348	2260357	40 %	40 %	20 %	0 %	333988368
2014	NC_015574	TATAC	2	10	2260489	2260498	40 %	40 %	0 %	20 %	333988368
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2016	NC_015574	TAAAA	2	10	2261363	2261372	80 %	20 %	0 %	0 %	333988368
2017	NC_015574	AAAGA	2	10	2263119	2263128	80 %	0 %	20 %	0 %	333988370
2018	NC_015574	ATGGT	2	10	2263561	2263570	20 %	40 %	40 %	0 %	333988370
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2022	NC_015574	CATTT	2	10	2271127	2271136	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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2029	NC_015574	TTGGT	2	10	2279625	2279634	0 %	60 %	40 %	0 %	333988392
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2031	NC_015574	AAATA	2	10	2280109	2280118	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2032	NC_015574	ATGGA	2	10	2280316	2280325	40 %	20 %	40 %	0 %	333988393
2033	NC_015574	AAATG	2	10	2281450	2281459	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2034	NC_015574	GTTTA	2	10	2282009	2282018	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2035	NC_015574	GTATC	2	10	2283794	2283803	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2036	NC_015574	TAAAA	2	10	2285930	2285939	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2037	NC_015574	TTCAA	2	10	2286961	2286970	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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2049	NC_015574	TTTTA	2	10	2292200	2292209	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2050	NC_015574	TATTT	2	10	2292297	2292306	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2051	NC_015574	ATATC	2	10	2293184	2293193	40 %	40 %	0 %	20 %	333988404
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2057	NC_015574	AGTTT	2	10	2305967	2305976	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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2108	NC_015574	ATGTC	2	10	2370043	2370052	20 %	40 %	20 %	20 %	333988487
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2110	NC_015574	AAGAT	2	10	2373822	2373831	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2111	NC_015574	CTTAT	2	10	2374659	2374668	20 %	60 %	0 %	20 %	333988493
2112	NC_015574	AATTA	2	10	2379640	2379649	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2131	NC_015574	CATAA	2	10	2403451	2403460	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
2132	NC_015574	TGGTA	2	10	2404326	2404335	20 %	40 %	40 %	0 %	333988519
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2167	NC_015574	AAATT	2	10	2449617	2449626	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2170	NC_015574	AAATT	2	10	2452228	2452237	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2171	NC_015574	CATTC	2	10	2454195	2454204	20 %	40 %	0 %	40 %	333988566
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2250	NC_015574	AACTG	2	10	2542839	2542848	40 %	20 %	20 %	20 %	333988637
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2252	NC_015574	TAATT	2	10	2545466	2545475	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding

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