MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Methanobacterium sp. SWAN-1 chromosome

Total Repeats: 2252

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015574	TAAAA	2	10	595733	595742	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_015574	TTACA	2	10	596857	596866	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
503	NC_015574	GGAAA	2	10	597206	597215	60 %	0 %	40 %	0 %	333986788
504	NC_015574	TTATT	2	10	597320	597329	20 %	80 %	0 %	0 %	333986788
505	NC_015574	ATTCC	2	10	597399	597408	20 %	40 %	0 %	40 %	333986788
506	NC_015574	TGATT	2	10	597641	597650	20 %	60 %	20 %	0 %	333986788
507	NC_015574	ATCAT	2	10	597818	597827	40 %	40 %	0 %	20 %	333986788
508	NC_015574	TAAAT	2	10	599185	599194	60 %	40 %	0 %	0 %	333986788
509	NC_015574	AATTT	2	10	599196	599205	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_015574	AAAGT	2	10	599474	599483	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
511	NC_015574	AAAGG	2	10	602257	602266	60 %	0 %	40 %	0 %	333986792
512	NC_015574	TGATA	2	10	607128	607137	40 %	40 %	20 %	0 %	333986794
513	NC_015574	AATAA	2	10	607634	607643	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_015574	TAAAA	2	10	609302	609311	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_015574	TTTGT	2	10	609489	609498	0 %	80 %	20 %	0 %	333986796
516	NC_015574	ATTTT	2	10	612086	612095	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_015574	AATGT	2	10	613001	613010	40 %	40 %	20 %	0 %	333986799
518	NC_015574	GAACA	2	10	614774	614783	60 %	0 %	20 %	20 %	333986800
519	NC_015574	TAAAA	2	10	615532	615541	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_015574	ATATT	2	10	615577	615586	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_015574	GCACT	2	10	616289	616298	20 %	20 %	20 %	40 %	333986801
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523	NC_015574	GAGGT	2	10	618047	618056	20 %	20 %	60 %	0 %	333986802
524	NC_015574	TTTAA	2	10	618761	618770	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_015574	GCTCT	2	10	620014	620023	0 %	40 %	20 %	40 %	333986805
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527	NC_015574	AATGG	2	10	620669	620678	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
528	NC_015574	TGTTA	2	10	621696	621705	20 %	60 %	20 %	0 %	333986806
529	NC_015574	CTTCT	2	10	625143	625152	0 %	60 %	0 %	40 %	333986808
530	NC_015574	GTCTG	2	10	625228	625237	0 %	40 %	40 %	20 %	333986808
531	NC_015574	TTACT	2	10	625986	625995	20 %	60 %	0 %	20 %	333986808
532	NC_015574	ATTTC	2	10	626256	626265	20 %	60 %	0 %	20 %	333986808
533	NC_015574	AATTT	2	10	626773	626782	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_015574	ATGCA	2	10	627541	627550	40 %	20 %	20 %	20 %	333986809
535	NC_015574	AAAAT	2	10	628754	628763	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_015574	ATGAG	2	10	629858	629867	40 %	20 %	40 %	0 %	333986811
537	NC_015574	ATAAA	2	10	632009	632018	80 %	20 %	0 %	0 %	333986813
538	NC_015574	AAATT	2	10	632064	632073	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_015574	TTAAA	2	10	632094	632103	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_015574	TGAAC	2	10	632396	632405	40 %	20 %	20 %	20 %	333986814
541	NC_015574	TTTAT	2	10	633717	633726	20 %	80 %	0 %	0 %	333986815
542	NC_015574	TGATT	2	10	634250	634259	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
543	NC_015574	ATGAA	2	10	636293	636302	60 %	20 %	20 %	0 %	333986817
544	NC_015574	TTAAT	2	10	636628	636637	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_015574	AATTC	2	10	636749	636758	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
546	NC_015574	TTTTG	2	10	639316	639325	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
547	NC_015574	GATTT	2	10	639405	639414	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
548	NC_015574	TTGAA	2	10	639568	639577	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
549	NC_015574	ACGAA	2	10	640158	640167	60 %	0 %	20 %	20 %	333986822
550	NC_015574	AAAGG	2	10	640504	640513	60 %	0 %	40 %	0 %	333986822
551	NC_015574	CAAGA	2	10	641735	641744	60 %	0 %	20 %	20 %	333986824
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554	NC_015574	ATTTT	2	10	649026	649035	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_015574	TCCAT	2	10	650874	650883	20 %	40 %	0 %	40 %	333986832
556	NC_015574	GTTCA	2	10	651671	651680	20 %	40 %	20 %	20 %	333986832
557	NC_015574	CTTTT	2	10	651884	651893	0 %	80 %	0 %	20 %	333986832
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560	NC_015574	ATTTT	2	10	659542	659551	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_015574	ATTTA	2	10	659673	659682	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_015574	TTTCC	2	10	660577	660586	0 %	60 %	0 %	40 %	333986836
563	NC_015574	TTAAA	2	10	661242	661251	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_015574	TAAAT	2	10	661274	661283	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_015574	ATTTA	2	10	661403	661412	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_015574	CATCT	2	10	662420	662429	20 %	40 %	0 %	40 %	333986838
567	NC_015574	TTATC	2	10	662825	662834	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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569	NC_015574	TTTTA	2	10	665892	665901	20 %	80 %	0 %	0 %	333986842
570	NC_015574	ATAAA	2	10	666449	666458	80 %	20 %	0 %	0 %	333986843
571	NC_015574	TTAAT	2	10	667300	667309	40 %	60 %	0 %	0 %	333986845
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576	NC_015574	AATGG	2	10	672078	672087	40 %	20 %	40 %	0 %	333986849
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579	NC_015574	ATATT	2	10	673818	673827	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_015574	AATGA	2	10	674197	674206	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
581	NC_015574	AATTA	2	10	674228	674237	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_015574	GTAAT	2	10	675399	675408	40 %	40 %	20 %	0 %	333986853
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585	NC_015574	AATTT	2	10	678935	678944	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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589	NC_015574	GGATT	2	10	682868	682877	20 %	40 %	40 %	0 %	333986860
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597	NC_015574	AACTG	2	10	694972	694981	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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599	NC_015574	ATTTA	2	10	698349	698358	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_015574	TTTAA	2	10	699396	699405	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_015574	CTCTT	2	10	699534	699543	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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604	NC_015574	TAATT	2	10	704096	704105	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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609	NC_015574	CAAAT	2	10	705798	705807	60 %	20 %	0 %	20 %	333986885
610	NC_015574	AATTA	2	10	707708	707717	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_015574	AATTA	2	10	707736	707745	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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613	NC_015574	CAATG	2	10	708770	708779	40 %	20 %	20 %	20 %	333986887
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615	NC_015574	GGAAA	2	10	709347	709356	60 %	0 %	40 %	0 %	333986888
616	NC_015574	AATTT	2	10	709601	709610	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_015574	AGGCC	2	10	710132	710141	20 %	0 %	40 %	40 %	333986889
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619	NC_015574	AATTT	2	10	711937	711946	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_015574	TTATT	2	10	712262	712271	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_015574	TCAAA	2	10	712458	712467	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
622	NC_015574	AAATG	2	10	715474	715483	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
623	NC_015574	AATTT	2	10	715582	715591	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_015574	TGATA	2	10	715811	715820	40 %	40 %	20 %	0 %	333986892
625	NC_015574	TTATG	2	10	716662	716671	20 %	60 %	20 %	0 %	333986893
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627	NC_015574	TTATT	2	10	719636	719645	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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631	NC_015574	ATTAT	2	10	723797	723806	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_015574	ATTTA	2	10	724508	724517	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_015574	TTTAA	2	10	726238	726247	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_015574	GTTAC	2	10	728627	728636	20 %	40 %	20 %	20 %	333986901
635	NC_015574	CAGAG	2	10	729125	729134	40 %	0 %	40 %	20 %	333986901
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