MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Methanobacterium sp. SWAN-1 chromosome

Total Repeats: 2252

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015574	AATTT	2	10	1621127	1621136	40 %	60 %	0 %	0 %	333987719
1502	NC_015574	ATAAA	2	10	1626856	1626865	80 %	20 %	0 %	0 %	333987724
1503	NC_015574	GTAAT	2	10	1627477	1627486	40 %	40 %	20 %	0 %	333987725
1504	NC_015574	AATAT	2	10	1628968	1628977	60 %	40 %	0 %	0 %	333987725
1505	NC_015574	AATAT	2	10	1629276	1629285	60 %	40 %	0 %	0 %	333987726
1506	NC_015574	CAATT	2	10	1630847	1630856	40 %	40 %	0 %	20 %	333987727
1507	NC_015574	AAATT	2	10	1631706	1631715	60 %	40 %	0 %	0 %	333987728
1508	NC_015574	TTTTA	2	10	1635293	1635302	20 %	80 %	0 %	0 %	333987732
1509	NC_015574	ATTTT	2	10	1638740	1638749	20 %	80 %	0 %	0 %	333987734
1510	NC_015574	AAATT	2	10	1639874	1639883	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_015574	TTTAT	2	10	1640983	1640992	20 %	80 %	0 %	0 %	333987735
1512	NC_015574	CCCTG	2	10	1641409	1641418	0 %	20 %	20 %	60 %	333987735
1513	NC_015574	TCTGT	2	10	1641914	1641923	0 %	60 %	20 %	20 %	333987736
1514	NC_015574	ATCCA	2	10	1642240	1642249	40 %	20 %	0 %	40 %	333987736
1515	NC_015574	CCAAA	2	10	1644364	1644373	60 %	0 %	0 %	40 %	333987738
1516	NC_015574	GATTT	2	10	1644394	1644403	20 %	60 %	20 %	0 %	333987738
1517	NC_015574	CACTC	2	10	1645895	1645904	20 %	20 %	0 %	60 %	333987739
1518	NC_015574	TTGTT	2	10	1646717	1646726	0 %	80 %	20 %	0 %	333987741
1519	NC_015574	ATTTA	2	10	1647450	1647459	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_015574	TATTT	2	10	1648819	1648828	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_015574	AAATA	2	10	1649370	1649379	80 %	20 %	0 %	0 %	333987743
1522	NC_015574	ATTCC	2	10	1651426	1651435	20 %	40 %	0 %	40 %	333987745
1523	NC_015574	CATCT	2	10	1654226	1654235	20 %	40 %	0 %	40 %	333987747
1524	NC_015574	TGAAG	2	10	1655376	1655385	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_015574	ACAGA	2	10	1656411	1656420	60 %	0 %	20 %	20 %	333987748
1526	NC_015574	ACTAA	2	10	1658915	1658924	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1527	NC_015574	TAATT	2	10	1659102	1659111	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_015574	AGTTC	2	10	1660203	1660212	20 %	40 %	20 %	20 %	333987751
1529	NC_015574	CTATG	2	10	1661311	1661320	20 %	40 %	20 %	20 %	333987752
1530	NC_015574	ACAGG	2	10	1664137	1664146	40 %	0 %	40 %	20 %	333987753
1531	NC_015574	AAAAG	2	10	1664151	1664160	80 %	0 %	20 %	0 %	333987753
1532	NC_015574	ATGGG	2	10	1664178	1664187	20 %	20 %	60 %	0 %	333987753
1533	NC_015574	GAAAT	2	10	1665100	1665109	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_015574	TAATT	2	10	1667965	1667974	40 %	60 %	0 %	0 %	333987759
1535	NC_015574	TTAAA	2	10	1671023	1671032	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_015574	AAATA	2	10	1671273	1671282	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_015574	TACAC	2	10	1671326	1671335	40 %	20 %	0 %	40 %	333987763
1538	NC_015574	CCTCA	2	10	1672395	1672404	20 %	20 %	0 %	60 %	333987764
1539	NC_015574	ACCTT	2	10	1672687	1672696	20 %	40 %	0 %	40 %	333987764
1540	NC_015574	ATTTG	2	10	1674095	1674104	20 %	60 %	20 %	0 %	333987765
1541	NC_015574	TTTCA	2	10	1674647	1674656	20 %	60 %	0 %	20 %	333987766
1542	NC_015574	AATGA	2	10	1676561	1676570	60 %	20 %	20 %	0 %	333987768
1543	NC_015574	CAACA	2	10	1677939	1677948	60 %	0 %	0 %	40 %	333987770
1544	NC_015574	GCAGT	2	10	1677993	1678002	20 %	20 %	40 %	20 %	333987770
1545	NC_015574	AAGGT	2	10	1678248	1678257	40 %	20 %	40 %	0 %	333987770
1546	NC_015574	AATAA	2	10	1678677	1678686	80 %	20 %	0 %	0 %	333987770
1547	NC_015574	TGCAT	2	10	1680787	1680796	20 %	40 %	20 %	20 %	333987772
1548	NC_015574	TGGTC	2	10	1680820	1680829	0 %	40 %	40 %	20 %	333987772
1549	NC_015574	CTTAA	2	10	1680881	1680890	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1550	NC_015574	AATAA	2	10	1680973	1680982	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_015574	TATTT	2	10	1682314	1682323	20 %	80 %	0 %	0 %	333987774
1552	NC_015574	TTTCC	2	10	1684767	1684776	0 %	60 %	0 %	40 %	333987777
1553	NC_015574	ATATG	2	10	1686432	1686441	40 %	40 %	20 %	0 %	333987779
1554	NC_015574	AATTC	2	10	1688128	1688137	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1555	NC_015574	ATTCC	2	10	1691268	1691277	20 %	40 %	0 %	40 %	333987784
1556	NC_015574	CAAAA	2	10	1692197	1692206	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1557	NC_015574	AGAAT	2	10	1693071	1693080	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_015574	CTCCA	2	10	1693275	1693284	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1559	NC_015574	TAAAT	2	10	1693383	1693392	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_015574	CAGGC	2	10	1694299	1694308	20 %	0 %	40 %	40 %	333987787
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1562	NC_015574	TTTAC	2	10	1695601	1695610	20 %	60 %	0 %	20 %	333987788
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1564	NC_015574	GAATC	2	10	1696621	1696630	40 %	20 %	20 %	20 %	333987788
1565	NC_015574	TTTAA	2	10	1698138	1698147	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_015574	GCTCA	2	10	1698483	1698492	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1567	NC_015574	TGTGA	2	10	1702527	1702536	20 %	40 %	40 %	0 %	333987790
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1584	NC_015574	TTATT	2	10	1720218	1720227	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_015574	CAATC	2	10	1720874	1720883	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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1589	NC_015574	TTTAA	2	10	1725345	1725354	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_015574	TTTAA	2	10	1725427	1725436	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_015574	TGGTT	2	10	1727498	1727507	0 %	60 %	40 %	0 %	333987809
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1596	NC_015574	AATAA	2	10	1737564	1737573	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_015574	TTAAT	2	10	1739123	1739132	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_015574	AGTTT	2	10	1740372	1740381	20 %	60 %	20 %	0 %	333987820
1599	NC_015574	CCTTT	2	10	1741128	1741137	0 %	60 %	0 %	40 %	333987821
1600	NC_015574	CAATG	2	10	1741963	1741972	40 %	20 %	20 %	20 %	333987822
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1610	NC_015574	TTCCT	2	10	1752795	1752804	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1611	NC_015574	TAAAA	2	10	1752835	1752844	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_015574	CAGTA	2	10	1754729	1754738	40 %	20 %	20 %	20 %	333987834
1613	NC_015574	TCCTC	2	10	1756983	1756992	0 %	40 %	0 %	60 %	333987838
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1616	NC_015574	TTCTT	2	10	1762258	1762267	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1617	NC_015574	ATTAA	2	10	1763689	1763698	60 %	40 %	0 %	0 %	333987847
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1889	NC_015574	AGACT	2	10	2099891	2099900	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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1923	NC_015574	TAATT	2	10	2136150	2136159	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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