MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Methanobacterium sp. SWAN-1 chromosome

Total Repeats: 2252

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015574	ATTTT	2	10	1105082	1105091	20 %	80 %	0 %	0 %	333987234
1002	NC_015574	AGCAG	2	10	1105809	1105818	40 %	0 %	40 %	20 %	333987235
1003	NC_015574	ATTAT	2	10	1106898	1106907	40 %	60 %	0 %	0 %	333987235
1004	NC_015574	ACTTT	2	10	1109700	1109709	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1005	NC_015574	GAAAA	2	10	1111298	1111307	80 %	0 %	20 %	0 %	333987239
1006	NC_015574	ATTTA	2	10	1111722	1111731	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_015574	AATTT	2	10	1111805	1111814	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_015574	AATAA	2	10	1111886	1111895	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_015574	ATAAA	2	10	1114132	1114141	80 %	20 %	0 %	0 %	333987241
1010	NC_015574	AAAAT	2	10	1114835	1114844	80 %	20 %	0 %	0 %	333987242
1011	NC_015574	TTAAA	2	10	1115452	1115461	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_015574	TTTAA	2	10	1115476	1115485	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_015574	AATAA	2	10	1115606	1115615	80 %	20 %	0 %	0 %	333987244
1014	NC_015574	TTATT	2	10	1118051	1118060	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_015574	ATTTA	2	10	1119623	1119632	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_015574	CAAAG	2	10	1119652	1119661	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1017	NC_015574	TTAAT	2	10	1120978	1120987	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_015574	TCATA	2	10	1121754	1121763	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1019	NC_015574	AAATT	2	10	1122000	1122009	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_015574	TTTTA	2	10	1122130	1122139	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_015574	GTATG	2	10	1122717	1122726	20 %	40 %	40 %	0 %	333987248
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1024	NC_015574	TAATG	2	10	1128258	1128267	40 %	40 %	20 %	0 %	333987254
1025	NC_015574	ACCAA	2	10	1128319	1128328	60 %	0 %	0 %	40 %	333987254
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1027	NC_015574	ATTTA	2	10	1129504	1129513	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_015574	TTTCA	2	10	1129558	1129567	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1029	NC_015574	AAAAG	2	10	1129635	1129644	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_015574	AAACC	2	10	1130201	1130210	60 %	0 %	0 %	40 %	333987255
1031	NC_015574	TAAGA	2	10	1132500	1132509	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_015574	TTTTC	2	10	1134336	1134345	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1033	NC_015574	GTTGT	2	10	1136438	1136447	0 %	60 %	40 %	0 %	333987263
1034	NC_015574	ACCAA	2	10	1136489	1136498	60 %	0 %	0 %	40 %	333987263
1035	NC_015574	ATTTA	2	10	1136823	1136832	40 %	60 %	0 %	0 %	333987264
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1041	NC_015574	CATAT	2	10	1141873	1141882	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1042	NC_015574	TACAG	2	10	1144833	1144842	40 %	20 %	20 %	20 %	333987272
1043	NC_015574	AAAAC	2	10	1146683	1146692	80 %	0 %	0 %	20 %	333987274
1044	NC_015574	AAATT	2	10	1147997	1148006	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_015574	TTAAA	2	10	1149984	1149993	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_015574	TGTAC	2	10	1154457	1154466	20 %	40 %	20 %	20 %	333987277
1047	NC_015574	ATTTC	2	10	1156226	1156235	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1048	NC_015574	TTATA	2	10	1156692	1156701	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_015574	AATAG	2	10	1157908	1157917	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_015574	ACTCT	2	10	1158309	1158318	20 %	40 %	0 %	40 %	333987280
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1052	NC_015574	TATAA	2	10	1160398	1160407	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1056	NC_015574	ATTCA	2	10	1163460	1163469	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1057	NC_015574	GAAAC	2	10	1163979	1163988	60 %	0 %	20 %	20 %	333987286
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1059	NC_015574	TTAAA	2	10	1166692	1166701	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_015574	TGAAA	2	10	1168324	1168333	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_015574	TTTTA	2	10	1168496	1168505	20 %	80 %	0 %	0 %	333987290
1062	NC_015574	TGTTT	2	10	1168586	1168595	0 %	80 %	20 %	0 %	333987290
1063	NC_015574	TTTTG	2	10	1168866	1168875	0 %	80 %	20 %	0 %	333987291
1064	NC_015574	ATTTA	2	10	1169561	1169570	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1076	NC_015574	AATAA	2	10	1181893	1181902	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_015574	AACAA	2	10	1182279	1182288	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1078	NC_015574	CATTT	2	10	1183289	1183298	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1079	NC_015574	TTCTT	2	10	1184116	1184125	0 %	80 %	0 %	20 %	333987304
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1081	NC_015574	TTATT	2	10	1185436	1185445	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1084	NC_015574	ATTTT	2	10	1186795	1186804	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_015574	TAAAA	2	10	1188413	1188422	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1088	NC_015574	TTCTT	2	10	1191638	1191647	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1089	NC_015574	TAATT	2	10	1194547	1194556	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1093	NC_015574	ATTTT	2	10	1197434	1197443	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_015574	CTTTA	2	10	1197613	1197622	20 %	60 %	0 %	20 %	333987318
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1099	NC_015574	TGAGT	2	10	1208169	1208178	20 %	40 %	40 %	0 %	333987329
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1101	NC_015574	TTTAT	2	10	1209781	1209790	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_015574	AGAAA	2	10	1210580	1210589	80 %	0 %	20 %	0 %	333987330
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1104	NC_015574	GAAAT	2	10	1212979	1212988	60 %	20 %	20 %	0 %	333987331
1105	NC_015574	ATTTT	2	10	1213020	1213029	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_015574	ACTGG	2	10	1213124	1213133	20 %	20 %	40 %	20 %	333987332
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1110	NC_015574	ATATG	2	10	1217622	1217631	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_015574	AACAA	2	10	1218846	1218855	80 %	0 %	0 %	20 %	333987337
1112	NC_015574	CATAA	2	10	1219773	1219782	60 %	20 %	0 %	20 %	333987337
1113	NC_015574	TACTA	2	10	1220264	1220273	40 %	40 %	0 %	20 %	333987338
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1118	NC_015574	ATTTA	2	10	1225200	1225209	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_015574	AATAG	2	10	1225568	1225577	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_015574	AATTT	2	10	1226237	1226246	40 %	60 %	0 %	0 %	333987342
1121	NC_015574	ATTTA	2	10	1226449	1226458	40 %	60 %	0 %	0 %	333987343
1122	NC_015574	ATTGG	2	10	1226570	1226579	20 %	40 %	40 %	0 %	333987343
1123	NC_015574	TTAAT	2	10	1227366	1227375	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_015574	TATAA	2	10	1227788	1227797	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_015574	ATTTT	2	10	1230606	1230615	20 %	80 %	0 %	0 %	333987347
1126	NC_015574	ATAAG	2	10	1230910	1230919	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_015574	TAATT	2	10	1231521	1231530	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_015574	AGACA	2	10	1232181	1232190	60 %	0 %	20 %	20 %	333987350
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