MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Methanoculleus marisnigri JR1 chromosome

Total Repeats: 44466

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009051	CGA	2	6	27749	27754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126177985
502	NC_009051	GAC	2	6	27795	27800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126177985
503	NC_009051	AGG	2	6	27901	27906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126177985
504	NC_009051	AGC	2	6	27978	27983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126177985
505	NC_009051	ATG	2	6	27985	27990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126177985
506	NC_009051	GCG	2	6	28024	28029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126177985
507	NC_009051	CGC	2	6	28105	28110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126177985
508	NC_009051	CCG	2	6	28263	28268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
509	NC_009051	GTT	2	6	28302	28307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_009051	ATA	2	6	28359	28364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_009051	GAC	2	6	28472	28477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_009051	CGT	2	6	28478	28483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_009051	AGG	2	6	28595	28600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
514	NC_009051	GGA	2	6	28633	28638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126177986
515	NC_009051	CGG	2	6	28663	28668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126177986
516	NC_009051	GAG	2	6	28687	28692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126177986
517	NC_009051	CCG	2	6	28783	28788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126177986
518	NC_009051	CCA	2	6	28816	28821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126177986
519	NC_009051	AGC	2	6	28863	28868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126177986
520	NC_009051	CGG	2	6	28892	28897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126177986
521	NC_009051	GGT	2	6	28915	28920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126177986
522	NC_009051	GCT	2	6	28924	28929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126177986
523	NC_009051	TCG	2	6	28968	28973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126177986
524	NC_009051	CGG	2	6	29003	29008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126177986
525	NC_009051	CGG	2	6	29019	29024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126177986
526	NC_009051	CGA	2	6	29206	29211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126177986
527	NC_009051	CGT	2	6	29237	29242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126177986
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529	NC_009051	GGT	2	6	29287	29292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126177986
530	NC_009051	TCC	2	6	29353	29358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
531	NC_009051	TTG	2	6	29436	29441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_009051	TGT	2	6	29452	29457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_009051	CCG	2	6	29477	29482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
534	NC_009051	GAA	2	6	29557	29562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126177987
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536	NC_009051	GAG	2	6	29606	29611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126177987
537	NC_009051	GAC	3	9	29650	29658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126177987
538	NC_009051	CAC	2	6	29729	29734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126177987
539	NC_009051	TAC	2	6	29765	29770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126177987
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541	NC_009051	GAA	2	6	29791	29796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126177987
542	NC_009051	GAA	2	6	29929	29934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126177987
543	NC_009051	GGA	2	6	29935	29940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126177987
544	NC_009051	GCG	2	6	29994	29999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126177987
545	NC_009051	GCT	2	6	30006	30011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126177987
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550	NC_009051	ACG	2	6	30350	30355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126177988
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552	NC_009051	CGA	2	6	30447	30452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126177988
553	NC_009051	CGG	2	6	30519	30524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126177988
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555	NC_009051	AAC	2	6	30550	30555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126177988
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557	NC_009051	TCG	2	6	30632	30637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126177988
558	NC_009051	GAG	2	6	30773	30778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126177989
559	NC_009051	CTC	2	6	30809	30814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126177989
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