MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Methanoculleus marisnigri JR1 chromosome

Total Repeats: 44466

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_009051	AGA	3	9	315102	315110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_009051	TCC	2	6	315176	315181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178285
5503	NC_009051	CCT	2	6	315198	315203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178285
5504	NC_009051	ACC	2	6	315256	315261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126178285
5505	NC_009051	GTC	2	6	315279	315284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178285
5506	NC_009051	GAG	2	6	315307	315312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178285
5507	NC_009051	CCT	2	6	315351	315356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178285
5508	NC_009051	CGG	2	6	315454	315459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178285
5509	NC_009051	GGA	2	6	315465	315470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178285
5510	NC_009051	TTC	2	6	315517	315522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178285
5511	NC_009051	CGA	2	6	315548	315553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178285
5512	NC_009051	CGG	2	6	315570	315575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178285
5513	NC_009051	ATC	2	6	315625	315630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178285
5514	NC_009051	CAC	2	6	315670	315675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126178285
5515	NC_009051	CGC	2	6	315759	315764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178285
5516	NC_009051	GAA	2	6	315864	315869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178285
5517	NC_009051	GCT	2	6	315942	315947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178285
5518	NC_009051	CGC	2	6	316152	316157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178285
5519	NC_009051	CCG	2	6	316166	316171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178285
5520	NC_009051	GCC	2	6	316200	316205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178285
5521	NC_009051	GAG	2	6	316243	316248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178285
5522	NC_009051	CGA	2	6	316314	316319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178285
5523	NC_009051	CGT	2	6	316347	316352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178285
5524	NC_009051	TGC	2	6	316466	316471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5525	NC_009051	CAG	2	6	316530	316535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178286
5526	NC_009051	CTG	2	6	316538	316543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178286
5527	NC_009051	TCC	2	6	316554	316559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178286
5528	NC_009051	GAG	3	9	316565	316573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178286
5529	NC_009051	TCG	2	6	316597	316602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178286
5530	NC_009051	TCG	2	6	316704	316709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178286
5531	NC_009051	CTC	2	6	316760	316765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178286
5532	NC_009051	CGA	2	6	316783	316788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178286
5533	NC_009051	CTC	2	6	316851	316856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178287
5534	NC_009051	ATG	2	6	316879	316884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178287
5535	NC_009051	GAT	2	6	316932	316937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178287
5536	NC_009051	GCC	3	9	317031	317039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178287
5537	NC_009051	TCC	2	6	317059	317064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178287
5538	NC_009051	CGA	2	6	317099	317104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178287
5539	NC_009051	TGA	2	6	317132	317137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178287
5540	NC_009051	GCC	2	6	317143	317148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178287
5541	NC_009051	GTG	2	6	317182	317187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126178287
5542	NC_009051	TCG	2	6	317239	317244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178287
5543	NC_009051	GGA	2	6	317254	317259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178287
5544	NC_009051	CGA	2	6	317264	317269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178287
5545	NC_009051	GAG	2	6	317370	317375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178287
5546	NC_009051	GAT	2	6	317424	317429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178287
5547	NC_009051	CGT	2	6	317435	317440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178287
5548	NC_009051	CGC	2	6	317579	317584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178287
5549	NC_009051	GTC	2	6	317670	317675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178287
5550	NC_009051	CTA	2	6	317800	317805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5551	NC_009051	GCC	2	6	317862	317867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5552	NC_009051	CCG	2	6	317897	317902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178288
5553	NC_009051	CGG	2	6	318015	318020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178288
5554	NC_009051	CCG	2	6	318092	318097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178288
5555	NC_009051	CAT	2	6	318108	318113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178288
5556	NC_009051	CCG	2	6	318117	318122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178288
5557	NC_009051	TTA	2	6	318316	318321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_009051	TCC	2	6	318378	318383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178289
5559	NC_009051	GGA	2	6	318412	318417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178289
5560	NC_009051	CGG	2	6	318451	318456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178289
5561	NC_009051	CAT	2	6	318475	318480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178289
5562	NC_009051	ACG	2	6	318585	318590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178289
5563	NC_009051	CGC	2	6	318603	318608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178289
5564	NC_009051	CGG	2	6	318637	318642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178289
5565	NC_009051	GGT	2	6	318682	318687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126178289
5566	NC_009051	CCT	3	9	318718	318726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178289
5567	NC_009051	CGA	2	6	318727	318732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178289
5568	NC_009051	GAC	2	6	318775	318780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178289
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5570	NC_009051	TCA	2	6	318882	318887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178289
5571	NC_009051	GAA	2	6	318940	318945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178289
5572	NC_009051	CGC	2	6	318958	318963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178289
5573	NC_009051	GCG	2	6	319059	319064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178289
5574	NC_009051	CGG	2	6	319083	319088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178289
5575	NC_009051	CAT	2	6	319099	319104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178289
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5579	NC_009051	CGA	2	6	319519	319524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178289
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5584	NC_009051	GAC	2	6	319967	319972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178289
5585	NC_009051	GCC	2	6	319978	319983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178289
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5587	NC_009051	CGA	2	6	320053	320058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178289
5588	NC_009051	TAC	2	6	320060	320065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178289
5589	NC_009051	GAG	2	6	320132	320137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178289
5590	NC_009051	ACC	2	6	320271	320276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126178290
5591	NC_009051	CCG	2	6	320291	320296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178290
5592	NC_009051	CGA	2	6	320305	320310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178290
5593	NC_009051	CTC	2	6	320359	320364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178290
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5599	NC_009051	CCT	2	6	320732	320737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178291
5600	NC_009051	GCC	2	6	320829	320834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178291
5601	NC_009051	GCG	2	6	320848	320853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178291
5602	NC_009051	TGA	2	6	320864	320869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178291
5603	NC_009051	GTT	2	6	320889	320894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126178291
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5606	NC_009051	ATC	2	6	321063	321068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5607	NC_009051	ATC	2	6	321078	321083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5608	NC_009051	GGC	2	6	321121	321126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5609	NC_009051	TCG	2	6	321275	321280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178292
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5977	NC_009051	GGT	2	6	340735	340740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126178310
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5980	NC_009051	GCA	2	6	341115	341120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178310
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