MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Methanoculleus marisnigri JR1 chromosome

Total Repeats: 44466

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_009051	GAG	3	9	80064	80072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178038
1502	NC_009051	CGA	3	9	80099	80107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178038
1503	NC_009051	AGC	2	6	80113	80118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178038
1504	NC_009051	TGA	2	6	80144	80149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178038
1505	NC_009051	TCG	2	6	80152	80157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178038
1506	NC_009051	AGG	2	6	80242	80247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178038
1507	NC_009051	GAG	2	6	80278	80283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178038
1508	NC_009051	CAT	2	6	80313	80318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178038
1509	NC_009051	CCA	2	6	80414	80419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126178038
1510	NC_009051	CCG	2	6	80513	80518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178038
1511	NC_009051	CCG	3	9	80787	80795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1512	NC_009051	TGC	2	6	80828	80833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_009051	GCG	2	6	80922	80927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_009051	ACC	2	6	80985	80990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1515	NC_009051	TCC	2	6	81062	81067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178039
1516	NC_009051	CAT	2	6	81070	81075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178039
1517	NC_009051	TTC	2	6	81079	81084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178039
1518	NC_009051	TAA	2	6	81201	81206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126178039
1519	NC_009051	GAT	2	6	81228	81233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178039
1520	NC_009051	GCC	2	6	81316	81321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178039
1521	NC_009051	CTT	2	6	81349	81354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178039
1522	NC_009051	GAT	2	6	81379	81384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178039
1523	NC_009051	GTT	2	6	81456	81461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126178039
1524	NC_009051	CCT	2	6	81585	81590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178039
1525	NC_009051	TCA	2	6	81596	81601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178039
1526	NC_009051	CCG	2	6	81635	81640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178039
1527	NC_009051	ATC	2	6	81728	81733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178039
1528	NC_009051	GAT	2	6	81748	81753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178039
1529	NC_009051	TCC	3	9	81797	81805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1530	NC_009051	TCT	2	6	81925	81930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178040
1531	NC_009051	CGC	2	6	82022	82027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178040
1532	NC_009051	GTT	2	6	82068	82073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126178040
1533	NC_009051	AGC	2	6	82157	82162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178040
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1535	NC_009051	CGA	2	6	82323	82328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178040
1536	NC_009051	CGG	2	6	82345	82350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178040
1537	NC_009051	GGC	2	6	82362	82367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178040
1538	NC_009051	TCC	2	6	82422	82427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1539	NC_009051	GGA	2	6	82447	82452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_009051	GTT	2	6	82681	82686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_009051	GCA	2	6	82828	82833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_009051	GAG	2	6	82978	82983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178041
1543	NC_009051	GGT	2	6	82999	83004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126178041
1544	NC_009051	CAT	2	6	83013	83018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178041
1545	NC_009051	GTC	2	6	83040	83045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178041
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1549	NC_009051	GAG	2	6	83465	83470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_009051	CGA	2	6	83498	83503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_009051	GAC	2	6	83598	83603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178042
1552	NC_009051	TCG	2	6	83619	83624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178042
1553	NC_009051	CTG	2	6	83795	83800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178042
1554	NC_009051	GGA	2	6	84004	84009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178042
1555	NC_009051	CTT	2	6	84038	84043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178042
1556	NC_009051	AGA	2	6	84211	84216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178042
1557	NC_009051	TCC	2	6	84387	84392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178043
1558	NC_009051	AGC	2	6	84428	84433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178043
1559	NC_009051	GAG	2	6	84514	84519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178043
1560	NC_009051	GCC	2	6	84572	84577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178043
1561	NC_009051	ATA	2	6	84589	84594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126178043
1562	NC_009051	CTA	2	6	84621	84626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178043
1563	NC_009051	GGT	2	6	84654	84659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126178043
1564	NC_009051	CGG	2	6	84749	84754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178043
1565	NC_009051	TCC	2	6	84786	84791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178043
1566	NC_009051	GGA	2	6	84840	84845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178043
1567	NC_009051	GCA	2	6	84974	84979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178043
1568	NC_009051	AGG	2	6	85001	85006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178043
1569	NC_009051	GAG	3	9	85009	85017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178043
1570	NC_009051	GGC	2	6	85065	85070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1571	NC_009051	TAG	2	6	85239	85244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178044
1572	NC_009051	GAT	2	6	85268	85273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178044
1573	NC_009051	CTG	2	6	85289	85294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178044
1574	NC_009051	CTG	2	6	85373	85378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178044
1575	NC_009051	CGG	2	6	85468	85473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_009051	AGG	2	6	85631	85636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1578	NC_009051	AGA	2	6	85877	85882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_009051	GGC	2	6	85912	85917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_009051	GGA	2	6	86054	86059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178045
1581	NC_009051	GTG	2	6	86133	86138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126178045
1582	NC_009051	AGC	2	6	86187	86192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178045
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1586	NC_009051	AAC	2	6	86535	86540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126178045
1587	NC_009051	GAG	2	6	86676	86681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178045
1588	NC_009051	GGA	2	6	86693	86698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178045
1589	NC_009051	ACT	2	6	86751	86756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178045
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1593	NC_009051	GGA	2	6	87180	87185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178045
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1595	NC_009051	TGT	2	6	87447	87452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126178046
1596	NC_009051	AGC	2	6	87459	87464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178046
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1601	NC_009051	GGC	2	6	87847	87852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_009051	CTG	2	6	87925	87930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_009051	GGA	2	6	87948	87953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_009051	AGG	2	6	87976	87981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_009051	AGC	2	6	88073	88078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_009051	GCG	2	6	88190	88195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_009051	GAG	2	6	88325	88330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_009051	TCG	2	6	88490	88495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178047
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1611	NC_009051	CTG	2	6	88711	88716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178047
1612	NC_009051	GGA	2	6	88728	88733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178047
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1623	NC_009051	CTC	2	6	89741	89746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178048
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1989	NC_009051	GCA	2	6	109082	109087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178069
1990	NC_009051	AGG	2	6	109125	109130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178069
1991	NC_009051	CGG	2	6	109131	109136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178069
1992	NC_009051	CGT	2	6	109237	109242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178069
1993	NC_009051	CGG	2	6	109247	109252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178069
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1998	NC_009051	CTT	2	6	109435	109440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178070
1999	NC_009051	CTT	3	9	109471	109479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178070
2000	NC_009051	TGG	2	6	109514	109519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126178070

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