MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Methanoculleus marisnigri JR1 chromosome

Total Repeats: 44466

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_009051	AGA	2	6	342207	342212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178313
6002	NC_009051	GAG	2	6	342226	342231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178313
6003	NC_009051	CGT	2	6	342292	342297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178313
6004	NC_009051	GTG	2	6	342325	342330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126178313
6005	NC_009051	GAT	2	6	342493	342498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178313
6006	NC_009051	GAT	2	6	342616	342621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178313
6007	NC_009051	GAA	2	6	342643	342648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178313
6008	NC_009051	CGT	2	6	342706	342711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178313
6009	NC_009051	GAC	3	9	342712	342720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178313
6010	NC_009051	CGT	2	6	342747	342752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178313
6011	NC_009051	GCG	2	6	342768	342773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178313
6012	NC_009051	GCC	2	6	342829	342834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178313
6013	NC_009051	GTA	2	6	342990	342995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178314
6014	NC_009051	CTC	2	6	343096	343101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178314
6015	NC_009051	AGG	2	6	343108	343113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178314
6016	NC_009051	CAG	2	6	343131	343136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178314
6017	NC_009051	CAT	2	6	343143	343148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178314
6018	NC_009051	ATG	2	6	343156	343161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178314
6019	NC_009051	GAG	2	6	343231	343236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178314
6020	NC_009051	AGG	2	6	343249	343254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178314
6021	NC_009051	TGA	2	6	343277	343282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178314
6022	NC_009051	CTC	2	6	343302	343307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178314
6023	NC_009051	GAG	2	6	343407	343412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178314
6024	NC_009051	CAT	2	6	343527	343532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178314
6025	NC_009051	AGG	2	6	343660	343665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178314
6026	NC_009051	GCC	2	6	343669	343674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178314
6027	NC_009051	GGC	2	6	343707	343712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178314
6028	NC_009051	TCG	2	6	343733	343738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178314
6029	NC_009051	CGA	3	9	343790	343798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178314
6030	NC_009051	CGA	2	6	343811	343816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178314
6031	NC_009051	CCA	2	6	343934	343939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126178314
6032	NC_009051	AGG	2	6	343955	343960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178314
6033	NC_009051	TCG	2	6	344075	344080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178314
6034	NC_009051	GCG	2	6	344089	344094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178314
6035	NC_009051	CGA	2	6	344111	344116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178314
6036	NC_009051	CCG	2	6	344125	344130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178314
6037	NC_009051	TCA	2	6	344138	344143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178314
6038	NC_009051	TTG	2	6	344165	344170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126178314
6039	NC_009051	CAG	2	6	344196	344201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178314
6040	NC_009051	AGA	4	12	344228	344239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178314
6041	NC_009051	GTT	2	6	344250	344255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126178314
6042	NC_009051	GAA	3	9	344301	344309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178314
6043	NC_009051	TCT	2	6	344312	344317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178314
6044	NC_009051	GTG	4	12	344337	344348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126178314
6045	NC_009051	GAT	2	6	344394	344399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178314
6046	NC_009051	GAT	2	6	344403	344408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178314
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6048	NC_009051	GTT	2	6	344445	344450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126178314
6049	NC_009051	GCC	2	6	344500	344505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178314
6050	NC_009051	GAT	2	6	344559	344564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178314
6051	NC_009051	CCA	2	6	344591	344596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126178314
6052	NC_009051	GCC	2	6	344608	344613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178314
6053	NC_009051	GCG	2	6	344623	344628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178314
6054	NC_009051	CCG	2	6	344680	344685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178314
6055	NC_009051	ACC	2	6	344707	344712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126178314
6056	NC_009051	GTC	2	6	344725	344730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178314
6057	NC_009051	CGA	2	6	344756	344761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178314
6058	NC_009051	AAT	2	6	344770	344775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126178314
6059	NC_009051	AGC	2	6	344785	344790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178314
6060	NC_009051	CGG	2	6	344902	344907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6061	NC_009051	ACG	2	6	344909	344914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6062	NC_009051	TGT	2	6	345088	345093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126178315
6063	NC_009051	GTC	2	6	345134	345139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178315
6064	NC_009051	GTT	2	6	345266	345271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126178315
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6067	NC_009051	GAC	2	6	345607	345612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178316
6068	NC_009051	GAC	2	6	345619	345624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178316
6069	NC_009051	CCG	2	6	345625	345630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178316
6070	NC_009051	GTC	2	6	345700	345705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178316
6071	NC_009051	GCG	2	6	346037	346042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178316
6072	NC_009051	GAC	2	6	346081	346086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178316
6073	NC_009051	TGA	2	6	346116	346121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178316
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6076	NC_009051	GAC	2	6	346294	346299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178316
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6087	NC_009051	GGC	2	6	346661	346666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178317
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6089	NC_009051	CGA	2	6	346882	346887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178317
6090	NC_009051	CGC	2	6	346911	346916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178317
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6092	NC_009051	CGG	2	6	347009	347014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178317
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6098	NC_009051	CTG	2	6	347351	347356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6099	NC_009051	GCC	2	6	347434	347439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178318
6100	NC_009051	GTG	2	6	347455	347460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126178318
6101	NC_009051	ATG	2	6	347542	347547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178318
6102	NC_009051	GAC	2	6	347584	347589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178318
6103	NC_009051	GAA	2	6	347643	347648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178318
6104	NC_009051	CGA	2	6	347655	347660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178318
6105	NC_009051	CGA	2	6	347684	347689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178318
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6108	NC_009051	CGG	2	6	347947	347952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178318
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6111	NC_009051	CCT	2	6	348075	348080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178318
6112	NC_009051	CGC	2	6	348081	348086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178318
6113	NC_009051	GAG	2	6	348205	348210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178318
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6118	NC_009051	TCG	2	6	348544	348549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178319
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6123	NC_009051	CGG	2	6	348824	348829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178319
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6233	NC_009051	GCT	2	6	355617	355622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178325
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6477	NC_009051	CGA	2	6	369732	369737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178339
6478	NC_009051	TCA	2	6	369789	369794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178339
6479	NC_009051	CCT	2	6	369843	369848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178339
6480	NC_009051	CGA	2	6	369849	369854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178339
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