MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Methanoculleus marisnigri JR1 chromosome

Total Repeats: 44466

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_009051	CAC	2	6	284642	284647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126178256
5002	NC_009051	CGT	2	6	284796	284801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5003	NC_009051	TGC	2	6	284826	284831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_009051	TGA	2	6	284971	284976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_009051	GCC	2	6	285002	285007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178257
5006	NC_009051	CGT	2	6	285115	285120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178257
5007	NC_009051	CCG	2	6	285200	285205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178257
5008	NC_009051	GAA	2	6	285217	285222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178257
5009	NC_009051	GTA	2	6	285292	285297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178257
5010	NC_009051	CGT	2	6	285313	285318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178257
5011	NC_009051	GAC	2	6	285355	285360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178257
5012	NC_009051	TCG	2	6	285386	285391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178257
5013	NC_009051	AGG	2	6	285392	285397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178257
5014	NC_009051	TGT	2	6	285459	285464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126178257
5015	NC_009051	TGC	2	6	285566	285571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178257
5016	NC_009051	GCG	2	6	285718	285723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178257
5017	NC_009051	CGG	2	6	285744	285749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178257
5018	NC_009051	CGC	2	6	285808	285813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178257
5019	NC_009051	TCG	2	6	285896	285901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178257
5020	NC_009051	TCG	2	6	285905	285910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178257
5021	NC_009051	GTA	2	6	285994	285999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178257
5022	NC_009051	TCA	2	6	286032	286037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178257
5023	NC_009051	CTC	2	6	286084	286089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178257
5024	NC_009051	AGT	2	6	286155	286160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178257
5025	NC_009051	CGA	2	6	286324	286329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178257
5026	NC_009051	ACC	2	6	286334	286339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126178257
5027	NC_009051	GCC	2	6	286342	286347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178257
5028	NC_009051	CAT	2	6	286357	286362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178257
5029	NC_009051	GCT	2	6	286395	286400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178257
5030	NC_009051	GAA	2	6	286426	286431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178257
5031	NC_009051	GTA	2	6	286456	286461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178257
5032	NC_009051	GCC	2	6	286468	286473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178257
5033	NC_009051	GGA	2	6	286515	286520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178257
5034	NC_009051	GTA	2	6	286591	286596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178257
5035	NC_009051	CGC	2	6	286671	286676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178257
5036	NC_009051	GGT	3	9	286680	286688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126178257
5037	NC_009051	AGG	2	6	286712	286717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178257
5038	NC_009051	CTT	3	9	286744	286752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178257
5039	NC_009051	GAG	2	6	286891	286896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178257
5040	NC_009051	GAA	2	6	286969	286974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_009051	TAC	2	6	287066	287071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5042	NC_009051	CGA	2	6	287203	287208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_009051	GTC	2	6	287262	287267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5044	NC_009051	ATC	2	6	287310	287315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5045	NC_009051	GGA	2	6	287381	287386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_009051	TTC	2	6	287515	287520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5047	NC_009051	TGA	2	6	287650	287655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_009051	TGC	2	6	287723	287728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178258
5049	NC_009051	TCG	2	6	287793	287798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178258
5050	NC_009051	GCA	2	6	287805	287810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178258
5051	NC_009051	GGC	2	6	287840	287845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178258
5052	NC_009051	GCC	2	6	287931	287936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178258
5053	NC_009051	GAG	3	9	288018	288026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178258
5054	NC_009051	ATG	2	6	288029	288034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178258
5055	NC_009051	CGA	2	6	288052	288057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178259
5056	NC_009051	TCG	2	6	288069	288074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178259
5057	NC_009051	GGC	2	6	288101	288106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178259
5058	NC_009051	GAG	2	6	288134	288139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178259
5059	NC_009051	CCT	2	6	288164	288169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178259
5060	NC_009051	ATG	2	6	288191	288196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178259
5061	NC_009051	CAC	2	6	288346	288351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126178259
5062	NC_009051	CGC	2	6	288406	288411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178259
5063	NC_009051	TCG	2	6	288453	288458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178259
5064	NC_009051	CCG	2	6	288496	288501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178259
5065	NC_009051	TAG	2	6	288752	288757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178260
5066	NC_009051	GTC	2	6	288797	288802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178260
5067	NC_009051	CGC	2	6	288814	288819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178260
5068	NC_009051	CGC	2	6	288875	288880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178260
5069	NC_009051	TTG	2	6	288926	288931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126178260
5070	NC_009051	GAT	2	6	288970	288975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178260
5071	NC_009051	GCA	2	6	288996	289001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178260
5072	NC_009051	CAT	2	6	289062	289067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178260
5073	NC_009051	GAG	2	6	289226	289231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_009051	TAA	2	6	289345	289350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_009051	GGT	2	6	289414	289419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_009051	TCG	2	6	289504	289509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5077	NC_009051	GAA	2	6	289584	289589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178261
5078	NC_009051	CTT	2	6	289602	289607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178261
5079	NC_009051	ACG	2	6	289651	289656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178261
5080	NC_009051	GAA	2	6	289766	289771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178261
5081	NC_009051	TCC	2	6	289883	289888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178262
5082	NC_009051	GTC	2	6	289906	289911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178262
5083	NC_009051	AGC	2	6	289916	289921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178262
5084	NC_009051	GCG	2	6	290080	290085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178262
5085	NC_009051	GAA	2	6	290119	290124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178262
5086	NC_009051	CAC	2	6	290142	290147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126178262
5087	NC_009051	TGG	2	6	290168	290173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126178262
5088	NC_009051	GCC	2	6	290179	290184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178262
5089	NC_009051	ACA	2	6	290195	290200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126178262
5090	NC_009051	GGC	2	6	290248	290253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178262
5091	NC_009051	TCG	2	6	290258	290263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178262
5092	NC_009051	TGA	2	6	290285	290290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178262
5093	NC_009051	TCT	2	6	290369	290374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178262
5094	NC_009051	TCG	2	6	290405	290410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178262
5095	NC_009051	GAA	2	6	290421	290426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178262
5096	NC_009051	GAG	2	6	290539	290544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178262
5097	NC_009051	ATG	2	6	290557	290562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178262
5098	NC_009051	CGA	2	6	290595	290600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178262
5099	NC_009051	CCT	2	6	290688	290693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178262
5100	NC_009051	AGG	2	6	290729	290734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178262
5101	NC_009051	CGA	2	6	290844	290849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178262
5102	NC_009051	ACT	2	6	290858	290863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178262
5103	NC_009051	CCG	2	6	290996	291001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178262
5104	NC_009051	GCT	2	6	291027	291032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178262
5105	NC_009051	CTC	2	6	291085	291090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178262
5106	NC_009051	GAA	2	6	291249	291254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178262
5107	NC_009051	GAA	2	6	291306	291311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178262
5108	NC_009051	GAC	2	6	291405	291410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178263
5109	NC_009051	TCC	2	6	291462	291467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178263
5110	NC_009051	CAA	2	6	291494	291499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126178263
5111	NC_009051	TCA	2	6	291505	291510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178263
5112	NC_009051	CGA	3	9	291578	291586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178263
5113	NC_009051	TCG	2	6	291652	291657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178263
5114	NC_009051	AGG	2	6	291667	291672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178263
5115	NC_009051	GCG	2	6	291762	291767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178263
5116	NC_009051	CGA	2	6	291947	291952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178263
5117	NC_009051	TCG	3	9	291973	291981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178263
5118	NC_009051	CAT	2	6	291983	291988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178263
5119	NC_009051	ATC	2	6	292023	292028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178263
5120	NC_009051	CTT	2	6	292067	292072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178263
5121	NC_009051	ACG	2	6	292081	292086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178263
5122	NC_009051	GCG	2	6	292094	292099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178263
5123	NC_009051	CGG	2	6	292106	292111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178263
5124	NC_009051	TCA	2	6	292198	292203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178263
5125	NC_009051	GTC	2	6	292215	292220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178263
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5129	NC_009051	ATC	2	6	292536	292541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178263
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5134	NC_009051	TGA	2	6	292915	292920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178263
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5148	NC_009051	ATC	2	6	293964	293969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178264
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5183	NC_009051	ACG	2	6	295696	295701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178264
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5206	NC_009051	TCG	2	6	297398	297403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178267
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5213	NC_009051	GTA	2	6	297821	297826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5215	NC_009051	GGC	2	6	298014	298019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178268
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5220	NC_009051	CCG	2	6	298256	298261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178268
5221	NC_009051	CAA	2	6	298307	298312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126178268
5222	NC_009051	CCA	2	6	298313	298318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126178268
5223	NC_009051	CGA	2	6	298331	298336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178268
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5225	NC_009051	CGA	2	6	298350	298355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178268
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5228	NC_009051	CGA	2	6	298424	298429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178268
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5231	NC_009051	TCG	2	6	298498	298503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178268
5232	NC_009051	GAG	2	6	298513	298518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178268
5233	NC_009051	CCG	2	6	298538	298543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178268
5234	NC_009051	CTC	2	6	298588	298593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178268
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5474	NC_009051	CGG	2	6	313015	313020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178283
5475	NC_009051	TTC	2	6	313041	313046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178283
5476	NC_009051	GTG	2	6	313109	313114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126178283
5477	NC_009051	ATC	2	6	313149	313154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178283
5478	NC_009051	CCG	2	6	313200	313205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178283
5479	NC_009051	GCG	2	6	313245	313250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178283
5480	NC_009051	ATC	2	6	313305	313310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178283
5481	NC_009051	TGC	2	6	313382	313387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178283
5482	NC_009051	TTC	2	6	313539	313544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178283
5483	NC_009051	GGT	2	6	313624	313629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126178283
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5499	NC_009051	GAA	2	6	314845	314850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178284
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