MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 41485

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_015942	TGC	2	6	390002	390007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198595
5502	NC_015942	CGA	2	6	390173	390178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198595
5503	NC_015942	AGC	2	6	390352	390357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198595
5504	NC_015942	CGC	2	6	390369	390374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198595
5505	NC_015942	GAG	2	6	390393	390398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198595
5506	NC_015942	CCG	2	6	390401	390406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198595
5507	NC_015942	CGA	2	6	390500	390505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198595
5508	NC_015942	TGC	2	6	390550	390555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198595
5509	NC_015942	CCA	2	6	390632	390637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198595
5510	NC_015942	ACC	2	6	390643	390648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198595
5511	NC_015942	CGA	2	6	390830	390835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198595
5512	NC_015942	GCG	2	6	390849	390854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198595
5513	NC_015942	GTG	2	6	390855	390860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198595
5514	NC_015942	TGC	2	6	390886	390891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198595
5515	NC_015942	TGC	2	6	390968	390973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198595
5516	NC_015942	AAG	2	6	391014	391019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198595
5517	NC_015942	ACG	2	6	391141	391146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198595
5518	NC_015942	CCG	2	6	391172	391177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198595
5519	NC_015942	CTA	2	6	391205	391210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198595
5520	NC_015942	CGA	2	6	391235	391240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198595
5521	NC_015942	GAA	2	6	391320	391325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198595
5522	NC_015942	GGC	2	6	391364	391369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198595
5523	NC_015942	CTG	3	9	391470	391478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198596
5524	NC_015942	TTG	2	6	391505	391510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198596
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5526	NC_015942	CTG	2	6	391915	391920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198597
5527	NC_015942	GCA	2	6	391984	391989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198597
5528	NC_015942	GAC	2	6	391996	392001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198597
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5532	NC_015942	TGA	2	6	392309	392314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198597
5533	NC_015942	GCC	2	6	392323	392328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198597
5534	NC_015942	TGG	2	6	392366	392371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198597
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5536	NC_015942	ACC	2	6	392660	392665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198597
5537	NC_015942	CTT	2	6	392772	392777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198597
5538	NC_015942	GCC	2	6	392828	392833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198597
5539	NC_015942	CCG	2	6	392847	392852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198597
5540	NC_015942	AGC	2	6	392864	392869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198597
5541	NC_015942	GAC	2	6	392872	392877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198597
5542	NC_015942	GGT	2	6	392889	392894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198597
5543	NC_015942	TGA	2	6	392976	392981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198597
5544	NC_015942	TCT	2	6	393181	393186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198597
5545	NC_015942	GCC	2	6	393229	393234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198597
5546	NC_015942	CTG	2	6	393325	393330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198597
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5550	NC_015942	GGA	2	6	393621	393626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198597
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5552	NC_015942	ACG	2	6	393755	393760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198597
5553	NC_015942	TGC	2	6	393797	393802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198597
5554	NC_015942	GTT	2	6	393906	393911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198597
5555	NC_015942	TGT	2	6	393974	393979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198597
5556	NC_015942	ATT	2	6	393994	393999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198597
5557	NC_015942	AGC	2	6	394346	394351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198597
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5559	NC_015942	CGA	2	6	394470	394475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198597
5560	NC_015942	TCC	2	6	394484	394489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198597
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5562	NC_015942	GAC	2	6	394670	394675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198598
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5579	NC_015942	GCC	2	6	396702	396707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198601
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5582	NC_015942	CGC	2	6	397878	397883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198603
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5584	NC_015942	AAT	2	6	397961	397966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198603
5585	NC_015942	ATA	2	6	397975	397980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198603
5586	NC_015942	GTT	2	6	398084	398089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198603
5587	NC_015942	ATT	2	6	398104	398109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198603
5588	NC_015942	ATC	2	6	398165	398170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198603
5589	NC_015942	ACA	2	6	398250	398255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198603
5590	NC_015942	TGA	2	6	398313	398318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198603
5591	NC_015942	TAA	2	6	398406	398411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198603
5592	NC_015942	TGA	2	6	398449	398454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198603
5593	NC_015942	TAT	2	6	398785	398790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198604
5594	NC_015942	TAT	2	6	398822	398827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198604
5595	NC_015942	TCG	2	6	398863	398868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198604
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5597	NC_015942	GAT	2	6	398943	398948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198604
5598	NC_015942	GGA	2	6	399038	399043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198604
5599	NC_015942	CTA	2	6	399154	399159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198604
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5601	NC_015942	GTC	2	6	399751	399756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198605
5602	NC_015942	ACG	2	6	399803	399808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198605
5603	NC_015942	AGT	2	6	399872	399877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198605
5604	NC_015942	ATG	2	6	399881	399886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198605
5605	NC_015942	TCT	2	6	399919	399924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198606
5606	NC_015942	TGA	2	6	399932	399937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198606
5607	NC_015942	GCA	2	6	400070	400075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198606
5608	NC_015942	TTG	2	6	400126	400131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198606
5609	NC_015942	CAT	2	6	400212	400217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198606
5610	NC_015942	ACG	2	6	400871	400876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198607
5611	NC_015942	ACG	2	6	401007	401012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198607
5612	NC_015942	GAA	2	6	401147	401152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198607
5613	NC_015942	AAG	2	6	401171	401176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198607
5614	NC_015942	GGC	2	6	401192	401197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198607
5615	NC_015942	CTG	2	6	401206	401211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198607
5616	NC_015942	GCA	2	6	401487	401492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198607
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5618	NC_015942	GAT	2	6	401546	401551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198607
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5974	NC_015942	TCT	2	6	434753	434758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198652
5975	NC_015942	GAC	2	6	434898	434903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198652
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