MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 megaplasmid

Total Repeats: 2809

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015851	AGG	2	6	44846	44851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783673
502	NC_015851	GCC	2	6	44947	44952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783673
503	NC_015851	GGA	2	6	45282	45287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783673
504	NC_015851	GCG	2	6	45288	45293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783673
505	NC_015851	CTG	2	6	45337	45342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783673
506	NC_015851	CGC	2	6	45389	45394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783673
507	NC_015851	GCG	2	6	45407	45412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783673
508	NC_015851	TCA	2	6	45720	45725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783674
509	NC_015851	GTG	2	6	45762	45767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783674
510	NC_015851	GCC	2	6	45809	45814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783674
511	NC_015851	TCG	2	6	45837	45842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783674
512	NC_015851	GGC	2	6	45852	45857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783674
513	NC_015851	TCA	2	6	45927	45932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783674
514	NC_015851	CAG	2	6	46079	46084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783674
515	NC_015851	TGG	2	6	46150	46155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783674
516	NC_015851	ACG	2	6	46208	46213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783674
517	NC_015851	ACG	2	6	46244	46249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783674
518	NC_015851	AAC	2	6	46476	46481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783675
519	NC_015851	ACG	2	6	46734	46739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783675
520	NC_015851	GTG	2	6	46803	46808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783675
521	NC_015851	GGC	2	6	46874	46879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783675
522	NC_015851	GTG	2	6	46959	46964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783675
523	NC_015851	CAT	2	6	47012	47017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783675
524	NC_015851	GCC	2	6	47046	47051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783675
525	NC_015851	TCG	2	6	47085	47090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783675
526	NC_015851	ATC	2	6	47142	47147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783675
527	NC_015851	CGC	2	6	47189	47194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783675
528	NC_015851	GGC	2	6	47214	47219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783675
529	NC_015851	TTG	2	6	47280	47285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340783675
530	NC_015851	CGC	2	6	47297	47302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783675
531	NC_015851	GCC	2	6	47355	47360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783675
532	NC_015851	GCC	2	6	47391	47396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783675
533	NC_015851	GCC	2	6	47409	47414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783675
534	NC_015851	AGC	2	6	47542	47547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783675
535	NC_015851	TGC	2	6	47658	47663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783676
536	NC_015851	GCC	2	6	47804	47809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783676
537	NC_015851	GCA	2	6	47857	47862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783676
538	NC_015851	GAT	2	6	47893	47898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783676
539	NC_015851	CGG	2	6	47934	47939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783676
540	NC_015851	CAG	2	6	48179	48184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783676
541	NC_015851	CGA	2	6	48214	48219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783676
542	NC_015851	GCG	2	6	48233	48238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783676
543	NC_015851	GCC	2	6	48272	48277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783676
544	NC_015851	GCG	2	6	48336	48341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783676
545	NC_015851	CGC	2	6	48373	48378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783676
546	NC_015851	CAA	2	6	48412	48417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783676
547	NC_015851	TCG	2	6	48426	48431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783676
548	NC_015851	CAG	2	6	48452	48457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783676
549	NC_015851	CGG	2	6	48486	48491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783676
550	NC_015851	CCG	2	6	48775	48780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783676
551	NC_015851	GCC	2	6	48827	48832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783676
552	NC_015851	TCG	2	6	48867	48872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783676
553	NC_015851	CCG	2	6	48886	48891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783676
554	NC_015851	GAA	2	6	48896	48901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783676
555	NC_015851	CTT	2	6	48943	48948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783676
556	NC_015851	CGA	2	6	49027	49032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783676
557	NC_015851	CCG	2	6	49068	49073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783676
558	NC_015851	CGC	2	6	49104	49109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783676
559	NC_015851	TGG	2	6	49230	49235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783676
560	NC_015851	GCG	2	6	49379	49384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783676
561	NC_015851	TCG	2	6	49449	49454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783676
562	NC_015851	GCG	2	6	49557	49562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783676
563	NC_015851	GAA	2	6	49634	49639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783676
564	NC_015851	CGA	2	6	49642	49647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783676
565	NC_015851	TTC	2	6	49730	49735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783676
566	NC_015851	GGC	2	6	49966	49971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783677
567	NC_015851	AGG	2	6	49986	49991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783677
568	NC_015851	GCT	2	6	50041	50046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783677
569	NC_015851	CCG	2	6	50063	50068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783677
570	NC_015851	ATG	2	6	50096	50101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783677
571	NC_015851	CGC	2	6	50255	50260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783678
572	NC_015851	TAT	2	6	50292	50297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340783678
573	NC_015851	AAG	2	6	50349	50354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783678
574	NC_015851	GCT	3	9	50432	50440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783678
575	NC_015851	GCG	2	6	50462	50467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783678
576	NC_015851	ACG	2	6	50473	50478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783678
577	NC_015851	AGG	2	6	50483	50488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783678
578	NC_015851	TCC	2	6	50584	50589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783678
579	NC_015851	TGG	3	9	50835	50843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783679
580	NC_015851	TCG	2	6	50856	50861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783679
581	NC_015851	GAG	2	6	50881	50886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783679
582	NC_015851	CAG	2	6	50937	50942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783679
583	NC_015851	CTC	2	6	50953	50958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783679
584	NC_015851	GGC	2	6	50971	50976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783679
585	NC_015851	GTC	2	6	50998	51003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783679
586	NC_015851	AAT	2	6	51267	51272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340783679
587	NC_015851	GCA	2	6	51307	51312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783679
588	NC_015851	GAT	2	6	51523	51528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783679
589	NC_015851	GCC	2	6	51880	51885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783680
590	NC_015851	CCA	2	6	51895	51900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783680
591	NC_015851	ATA	2	6	51973	51978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340783680
592	NC_015851	GAT	2	6	52083	52088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783680
593	NC_015851	CGA	2	6	52337	52342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783681
594	NC_015851	CAC	2	6	52367	52372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783681
595	NC_015851	GCG	2	6	52577	52582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783682
596	NC_015851	CTG	2	6	52614	52619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783682
597	NC_015851	CGG	2	6	52621	52626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783682
598	NC_015851	GGA	2	6	52676	52681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783682
599	NC_015851	CAT	2	6	52816	52821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783682
600	NC_015851	AGA	2	6	52891	52896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783682
601	NC_015851	CTG	2	6	52908	52913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783682
602	NC_015851	GCC	2	6	52968	52973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783682
603	NC_015851	GAG	2	6	52976	52981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783682
604	NC_015851	TCA	2	6	53028	53033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783682
605	NC_015851	AGA	2	6	53059	53064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783682
606	NC_015851	GCA	2	6	53129	53134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783682
607	NC_015851	TGA	2	6	53236	53241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783682
608	NC_015851	CGC	3	9	53276	53284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783682
609	NC_015851	AGA	2	6	53288	53293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783682
610	NC_015851	ATA	2	6	53376	53381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340783683
611	NC_015851	ATC	2	6	53421	53426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783683
612	NC_015851	TTC	2	6	53493	53498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783683
613	NC_015851	GAT	2	6	53547	53552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783683
614	NC_015851	GCT	2	6	54797	54802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783684
615	NC_015851	CAT	2	6	54864	54869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783684
616	NC_015851	TCA	2	6	54937	54942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783684
617	NC_015851	CGG	2	6	54979	54984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783684
618	NC_015851	ACC	2	6	55069	55074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783684
619	NC_015851	TGG	2	6	55090	55095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783684
620	NC_015851	CGG	2	6	55138	55143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783684
621	NC_015851	TGG	2	6	55159	55164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783684
622	NC_015851	CGC	2	6	55168	55173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783684
623	NC_015851	CTT	2	6	55196	55201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783684
624	NC_015851	TGG	2	6	55491	55496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783684
625	NC_015851	CGA	2	6	55497	55502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783684
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